Badania biologiczne często wymagają efektywnego fenotypowania, co często wiąże się z pewnego rodzaju analizą histologiczną1-3. Potrzeba ta jest jeszcze bardziej widoczna w przypadku ambitnych projektów mających na celu zakłócenie każdego genu w genomie myszy4. Te analizy histologiczne mogą obejmować zarówno ocenę morfologii komórek i/lub cech anatomicznych, jak i mapowanie ekspresji określonych genów lub białek w poszczególnych komórkach. W rzeczywistości jednym z podstawowych wkładów histologii w dziedzinę genomiki jest zdolność do powiązania określonego sygnału molekularnego z określonym regionem lub typem komórki.
Tradycyjne metody histologii, szczególnie dla tkanek mięśniowo-szkieletowych, są często czasochłonne i pracochłonne, czasami wymagają tygodni na utrwalenie, odwapnienie, przecięcie, zabarwienie i zobrazowanie próbki, a następnie analizę obrazów poprzez ludzką interpretację. Analiza wielu sygnałów molekularnych, czy to za pomocą immunohistochemii, hybrydyzacji in situ, czy specjalnych barwień, wymaga wielu sekcji, a nawet wielu próbek, aby działały prawidłowo. Ponadto te wielokrotne odpowiedzi nie mogą być kolokowane w tej samej komórce, a czasami nie mogą być kolokalizowane w określonym regionie w danej próbce. W miarę jak dziedzina genomiki i epigenomiki wkracza w erę cyfrową, dziedzina histologiczna również musi podążać za nimi, aby zapewnić wydajną, wysokowydajną i zautomatyzowaną analizę różnych sygnałów molekularnych w ramach jednego odcinka histologicznego.
Rzeczywiście, istnieje zapotrzebowanie na ulepszone techniki histologiczne, które mogą kojarzyć wiele sygnałów molekularnych z konkretnymi komórkami w danym próbce. Niedawno opublikowaliśmy nową, wysokoprzepustową metodę kriohistologiczną do oceny kilku miar odpowiedzi w danym odcinku ze zmineralizowanej tkanki5-14. Proces polega na ustabilizowaniu kriosekcji za pomocą zamrożonej kriotaśmy, sztywnym przyklejeniu zaklejonej taśmy do szkiełka mikroskopowego oraz przeprowadzeniu kilku rund barwienia i obrazowania na każdej sekcji. Te rundy obrazów są następnie wyrównywane ręcznie lub za pomocą automatyzacji komputerowej przed analizą obrazu (rysunek 1). W tym miejscu przedstawiamy szczegółowe protokoły tego procesu i podajemy przykłady, w których techniki te poprawiły nasze zrozumienie różnych procesów biologicznych.