Opisany powyżej protokół szczegółowo przedstawia metody zastosowane w pracy Nishimoto i in., 2015. W pracy badano indukcję i inicjację pączków kończyn przednich i tylnych zarodka kurczaka. Wyniki uzyskane po wprowadzeniu nieprzepuszczalnych barier w celu zapobieżenia wzrostowi pączka kończyny przedniej zostały opublikowane wcześniej 1, 2, 9 istnieje jednak tylko jedno badanie opisujące bariery zapobiegające inicjacji pączka kończyny 1Dane dotyczące kończyn tylnych od Nishimoto i wsp., 2015 są tutaj przedstawione jako reprezentatywne wyniki badania ekspresji mRNA po wprowadzeniu bariery.
Ekspresja Tbx4 w LPM nie jest wystarczająca do zainicjowania wzrostu kończyny tylnej:
Ryciny 2B oraz C (Tabela 2) pokazują, że wprowadzenie bariery w stadium 15 (Rycina 2A) (patrz protokół 3.2) prowadzi do braku ekspresji zarówno Fgf10, jak i Fgf8 w regionie pączka kończyny (oznaczonym nawiasem) po operowanej stronie prawej. Porównać z nieoperowaną stroną lewą. Jednakże ekspresja Tbx4 jest obserwowana zarówno w stadium 19, jak i w stadium 23 po stronie operowanej (Rycina 2D oraz E). Wyciągamy wniosek, że sama ekspresja Tbx4 nie jest wystarczająca do zainicjowania wzrostu kończyny tylnej z LPM. Inne badania na kurczętach sugerowały, że ekspresja genu Tbx jest wystarczająca do zainicjowania formowania pączka kończyny przedniej 12, 13.
Rycina 2C' została dołączona, aby zilustrować wygląd bariery osadzonej w regionie nogi embrionu po utrwaleniu. W większości przypadków bariery usuwano przed hybrydyzacją in situ (protokół 4.3).
RA z somytów jest niezbędny w LPM przed indukcją wzrostu pączka kończyny przez Fgf10:
Rysunek 3A przedstawia schemat dodania nasączonego RA koralika dystalnie względem bariery wprowadzonej w stadium 15 (protokół 3.2.1.3). Po tej operacji po operowanej prawej stronie obserwuje się wzrost pączka kończyny (oznaczony gwiazdką), a Tbx4, Fgf10 i Fgf8 ulegają ekspresji w pączku, podobnie jak po kontrolnej lewej stronie (Rysunek 3B, C i D, Tabela 2). Zatem dodanie RA do LPM niweluje efekt bariery i dochodzi do inicjacji pączka kończyny. Wyciągamy wniosek, że w normalnym rozwoju RA z somytów jest niezbędny w LPM, zanim może zostać zainicjowany wzrost pączka kończyny. Powstałe pączki kończyn tylnych są zazwyczaj mniejsze niż te po stronie kontrolnej. Może to wynikać z faktu, że dawka RA w LPM nie jest równoważna sytuacji u typu dzikiego. Jeśli dawka RA jest zbyt wysoka, grzebień ektodermy dystalnej (AER) może zostać skrócony, co skutkuje mniejszymi pączkami 14, 15.
Aby potwierdzić, że RA (pochodzący z somytów) w LPM jest niezbędny do prawidłowej inicjacji pąka kończyny, zastosowano BMS 493, będący odwrotnym agonistą RAR. Kuleczki implantuje się do LPM w obrębie regionu kończyny tylnej w stadium 15 (patrz protokół 3.2.1.4) (Rycina 3E). Ekspresja Fgf10 ulega obniżeniu po aplikacji kuleczek z BMS 493 w LPM, co skutkuje powstaniem mniejszych pąków kończyn tylnych w porównaniu ze stroną kontrolną (Rycina 3F; Tabela 3). Kontrolne kuleczki z DMSO nie powodują tych wad (Ryciny 3G i 3H; Tabela 3). Wady zaobserwowane po aplikacji BMS 493 są łagodniejsze niż te wywołane operacją barierową; t.j. Fgf10 jest nadal eksprimowany, a pąki kończyn powstają. Prawdopodobnie wynika to z faktu, że działanie BMS 493 jest ograniczone lokalnie do obszaru wokół kuleczek i może nie być w stanie zneutralizować całego RA produkowanego przez tkanki osiowe.
Wczesne sygnały osiowe specyfikują komórki LPM, które później wykazują ekspresję Tbx4:
Zbadaliśmy, kiedy LPM nabywa zdolności do ekspresji Tbx4 w obszarze przyszłej formacji kończyny. Najwcześniejszym etapem, na którym można wprowadzić barierę blokującą w późniejszym czasie wzrost pączka kończyny, jest etap 10. Jesteśmy pierwszymi badaczami, którzy opracowali protokół wprowadzania barier na etapach wcześniejszych niż etap 12. Bariery wprowadzone między mezodermą paraksjalną a domniemanym LPM kończyny na etapie 10 (patrz protokół 3.4) blokują tworzenie pączka kończyny oraz ekspresję Tbx4 w LPM formującym kończynę (Ryciny 2F i 2G, Tabela 2), co sugeruje, że sygnał z tkanek osiowych na etapie 10 jest niezbędny do późniejszej ekspresji Tbx4 w LPM kończyny tylnej. Wynik ten należy porównać z Rycynami 2D i E, gdzie późniejsze wprowadzenie bariery pozwala na ustanowienie ekspresji Tbx4. Ponadto sprawdziliśmy, czy tym sygnałem osiowym może być RA, obserwując, czy odwrotny agonista RAR redukuje ekspresję Tbx4. Kuleczka BMS 493 umieszczona w LPM kończyny tylnej na etapie 10 (patrz protokół 3.4.1.3) obniża ekspresję Tbx4 (Ryciny 2H i 2I), podczas gdy kuleczki kontrolne nasączone DMSO nie wpływają na ekspresję Tbx4 (Ryciny 2J i 2K). Wspólnie wyniki te wspierają model, w którym sygnał RA z tkanek osiowych reguluje indukcję kończyn poprzez pozytywną regulację Tbx4 w LPM kończyny tylnej 7.
Śmierć pooperacyjna:
Tabele 1, 2 i 3 zawierają szczegółowe wyniki eksperymentów, w tym liczbę zarodków kurzych, które zginęły po operacji i przed pobraniem próbek. Pewna liczba zgonów jest oczekiwana po mikrochirurgii tego rodzaju. Liczbę zgonów można zminimalizować, upewniając się, że narzędzia są czyste, otwór w jajku ma minimalną wymaganą wielkość, zarodki pozostają bez ochrony w postaci uszczelnienia z taśmy klejącej przez jak najkrótszy czas oraz, w powiązaniu z tym ostatnim punktem, że operacja jest przeprowadzana tak szybko, jak to możliwe. Żadna z tych operacji nie jest szczególnie czasochłonna, jednak zabiegi z wykorzystaniem kuleczek i barier zajmują nieco więcej czasu. Mimo tych środków, operacje przeprowadzone we wczesnych stadiach oraz w regionie skrzydła są bardziej narażone na spowodowanie śmierci. W okolicach regionów formowania kończyn znajdują się duże naczynia krwionośne, a ich przypadkowe przerwanie może doprowadzić do śmierci w wyniku utraty krwi. Zaobserwowaliśmy, że jaja otwarte w stadium 8 lub 9, których zarodki nie zostały poddane operacji, często giną do następnego dnia. W związku z tym jedynym rozwiązaniem tych problemów jest przeprowadzenie dużej liczby eksperymentów.

Rycina 2. Zmiany ekspresji genów markerowych po wprowadzeniu bariery lub kuleczki na poziomie domniemanej kończyny dolnej. (A) Schemat przedstawiający położenie bariery (zielona linia) na poziomie domniemanej kończyny dolnej (somity 26-32) w embrionie w stadium 15. (B-E oraz G) Analiza WISH w operowanych embrionach. Region kończyny jest zaznaczony (nawiasy). (B) Ekspresja Fgf10 nie występuje w operowanej LPM, lecz silna ekspresja jest wykrywana w lewym pączku. (C) Ekspresja Fgf8 nie występuje po stronie operowanej, co sugeruje brak AER. (C') Ten sam embrion przed usunięciem bariery. (D) Tbx4 jest ekspresowany w LPM na tym samym poziomie rostro-kaudalnym co w pączku kontrolnym. (E) Ekspresja Tbx4 jest utrzymana w prawym regionie kończyny mimo braku wzrostu kończyny. (F) Schemat embrionu kurczaka w stadium 10 przedstawiający położenie bariery (zielona linia) na poziomie domniemanej kończyny dolnej. (G) Ekspresja Tbx4 nie występuje w operowanej prawej LPM (nawias). (H) Schemat embrionu kurczaka w stadium 10 przedstawiający położenie kuleczki z BMS 493 (fioletowe koło) na poziomie domniemanej kończyny dolnej. (I) Ekspresja Tbx4 jest obniżona po operowanej prawej stronie po zastosowaniu BMS 493. (J) Schemat embrionu kurczaka w stadium 10 przedstawiający położenie kontrolnej kuleczki z DMSO (szare koło). (K) Tbx4 jest ekspresowany po operowanej prawej stronie na podobnym poziomie co po kontrolnej lewej stronie po zastosowaniu samego DMSO. Rycina została zmodyfikowana na podstawie 7. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tej ryciny.

Rysunek 3. RA zapobiega brakowi pączka kończyny wywołanemu przez wprowadzenie bariery i jest niezbędne w LPM przed wzrostem pączka kończyny dolnej. (A) Schematyczna ilustracja wskazująca położenie bariery (zielona linia) na poziomie domniemaną kończyny dolnej (somity 26-32) oraz kuleczkę nasączoną RA (czerwone koło). (B-D) RA przywraca wzrost pączka kończyny dolnej (oznaczony gwiazdką). (B) Ekspresja Tbx4 występuje w uratowanym pączku kończyny dolnej, podobnie jak po stronie nieoperowanej. (C) Fgf10 wykazuje ekspresję w uratowanym pączku kończyny dolnej, podobnie jak po stronie nieoperowanej. (D) Fgf8 wykazuje ekspresję w AER uratowanego prawego pączka kończyny dolnej. (E) Schemat wskazujący miejsce umieszczenia kuleczek BMS 493 (fioletowe koła) w LPM domniemanej kończyny dolnej zarodków w stadium 15. (F) Ekspresja Fgf10 jest obniżona po operowanej prawej stronie, a pączek kończyny dolnej jest mały po zastosowaniu BMS 493. Kuleczki oznaczono gwiazdkami. (G) Schemat analogiczny do (E), wskazujący położenie kontrolnych kuleczek DMSO (szare koła). (H) Kuleczki DMSO (oznaczone gwiazdkami) nie wpłynęły na ekspresję Fgf10 ani na wielkość pączka kończyny dolnej. Rysunek zmodyfikowano na podstawie 7. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.
| Bariera stadium umieszczona (+ kuleczka) * | Liczba operowanych | Brak skrzydła ** | Skrzydło obecne ** | Liczba martwych |
| Stadium 12-14 | 40 | 24 | 1 | 15 |
| Stadium 8/9 | 65 | 23 | 0 | 42 |
| Stadium 12-13 (kuleczka FGF4) | 41 | 7 (brak kuleczki) | 17 | 17 |
| Stadium 12-13 (kuleczka RA) | 75 | 9 (brak kuleczki) | 32 | 34 |
| Stadium 13 (kuleczka kontrolna) | 5 | 3 | 0 | 2 |
| * Bariery z folii 0.7-1 mm umieszczone między somitami 15-20 a mezodermą płytki bocznej. Kuleczka FGF4 0.35 mg/ml. Kuleczka RA 0.05-0.1 mg/ml. |
| Kuleczka kontrolna DMSO. |
| ** Zarodki kurczęce utrwalone w stadiach 21-23 |
Tabela 1. Wyniki eksperymentu z barierą na poziomie skrzydła i koralikiem.
| Umieszczono barierę przedmiotową (+ koralik) * | Liczba zoperowanych | Brak nogi | Noga obecna ** | Liczba martwych |
| Stopień 12-15 | 43 | 39 | 0 | 4 |
| Etap 10/11 | 23 | 16 | 0 | 7 |
| Stadium 15 (koralik FGF4) | 8 | 0 | 5 | 3 |
| Etap 15 (koralik z RA) | 18 | 0 | 18 | 0 |
| * Bariery z folii o grubości 0,7–1,3 mm umieszczone pomiędzy somytami 26–32 a mezodermą płytki bocznej. Kuleczka z FGF4 o stężeniu 0,35 mg/ml. Kuleczka z RA o stężeniu 0,05–0,1 mg/ml. |
| ** Zarodki kurcząt utrwalone w stadiach 18–24 |
Tabela 2. Wyniki eksperymentu z koralikami i barierą na poziomie nóg.
| Liczba zoperowanych | Mały pączek nogi | Zalążek nogi nieco zbyt mały | Normalny rozmiar pączka nogi | Liczba martwych |
| kulkami BMS 493 | | | | |
| 15 | 12 | 3 | 0 | 0 |
| kulki DMSO | | | | |
| 12 | 0 | 3 | 9 | 0 |
| * 2-3 kuleczki nasączone BMS 493 w stężeniu 5 mg/ml umieszczone w prawym zarodku LPM w stadium 14-15 na poziomie kończyny. |
| ** 2-3 koraliki namoczone w samym DMSO umieszczone w prawym zarodku LPM w stadium 15 na poziomie kończyny. |
| Zarabki kurcząt utrwalone w stadiach 17–19. |
Tabela 3. Wyniki eksperymentu z kuleczkami BMS 493 na poziomie nóg.