$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Oświadczenie etyczne:
Instytucjonalny Komitet ds. Opieki i Wykorzystania Zwierząt (IACUC) przy North Carolina State University College of Veterinary Medicine (NCSU) zatwierdził to badanie. Polityka NCSU dotycząca opieki nad zwierzętami i ich użytkowania stosuje standardy i wytyczne określone w ustawie o dobrostanie zwierząt i ustawie o przedłużeniu badań zdrowotnych z 1985 r. Obiekty zajmujące się zwierzętami laboratoryjnymi w NCSU przestrzegają wytycznych zawartych w Przewodniku dotyczącym opieki nad zwierzętami laboratoryjnymi i ich użytkowania. Stan zdrowia zwierząt był oceniany codziennie, a zwierzęta w stanie agonalnym były humanitarnie uśmiercane przez uduszenie CO2 , a następnie zastosowanie środków wtórnych. Podczas tego badania przeszkoleni technicy zwierząt lub weterynarz przeprowadzili hodowlę zwierząt w placówce akredytowanej przez AAALAC.
1. Podawanie antybiotyku cefoperazonu w wodzie pitnej w celu uzyskania podatności na kolonizację i chorobę C. difficile
UWAGI: 5- do 8-tygodniowe myszy C57BL / 6 WT (samice i samce) zakupiono i poddano kwarantannie przez 1 tydzień przed rozpoczęciem podawania antybiotyku. Po kwarantannie myszy zostały umieszczone w autoklawie z jedzeniem, ściółką i wodą. Zmiany koszyka były wykonywane co tydzień przez personel laboratoryjny w okapie z przepływem laminarnym.
- Przygotować cefoperazon (0,5 mg/ml) w sterylnej wodzie destylowanej na 7 dni przed docelowym dniem próby prowokacyjnej (ryc. 1).
- Napełnij autoklawowane butelki z wodą cefoperazonową (0,5 mg/ml) i umieść je w każdej klatce dla myszy.
UWAGA: Świeżo przygotowana woda z cefoperazonu powinna być przygotowywana i wymieniana co 2 dni przez okres 5 dni, jak opisano w krokach 1.1 i 1.2. Zaleca się prawidłowe usuwanie wody cefoperazone zgodnie z instytucjonalnymi wytycznymi dotyczącymi ochrony środowiska, zdrowia i bezpieczeństwa.
- Po 5 dniach przyjmowania cefoperazonu należy wymienić butelki na autoklawowane butelki wypełnione sterylną wodą destylowaną. Podawaj myszom tę wodę pitną na czas trwania eksperymentu.
2. Przygotowanie inokulum zarodników C. difficile i zgłębnik jamy ustnej myszy
UWAGA: Przed rozpoczęciem upewnij się, że następujące elementy są umieszczone w komorze beztlenowej na co najmniej 24 godziny: 1x sól fizjologiczna buforowana fosforanami (PBS; patrz Materiały), płytki taurocholatu cycykleryny cefoksytyny fruktozy (TCCFA) (patrz Materiały i plik dodatkowy) oraz sterylny rozsiewacz w kształcie litery L.
UWAGA: Myszy zarażone zarodnikami C. difficile powinny być trzymane w obiekcie dla zwierząt o poziomie bezpieczeństwa biologicznego 2.
- Otrzymać zapas przetrwalników C. difficile pożądanego szczepu (w tym przypadku R20291), który został przygotowany wcześniej i przechowywany w temperaturze 4 °C w sterylnej wodzie21,22. Określ liczbę tych zarodników przed użyciem.
- Na podstawie znanego stężenia (zarodniki/ml) szczepu przetrwalników, obliczyć pożądane rozcieńczenie, aby uzyskać10-5 zarodników na 25 μl. Upewnij się, że objętość inokulum jest wystarczająca do zaszczepienia wszystkich myszy w eksperymencie (25 μl na mysz), do przeprowadzenia liczenia inokulum (około 30 μl) i do uwzględnienia błędu pipetowania.
- Odwiruj oryginalny zapas zarodników C. difficile. Następnie ponownie zawiesić obliczoną objętość (z kroku 2.2) oryginalnego wywaru zarodników C. difficile w sterylnej wodzie w zakręcanej probówce do mikrowirówki. Wykonaj to tlenowo w okapie z przepływem laminarnym. Zidentyfikuj tę rozcieńczoną mieszaninę jako "inokulum zarodników".
- Umieść inokulum zarodników w łaźni wodnej o temperaturze 65 °C i podgrzewaj przez 20 min.
UWAGA: Ten krok zapewni, że po obróbce cieplnej pozostaną tylko aktywne zarodniki C. difficile.
- Do okapu z przepływem laminarnym weź 50 μl podgrzanego inokulum zarodników, umieść je w sterylnej probówce do mikrowirówek i przelej do komory beztlenowej23. Użyj tej próbki do wyliczania zarodników.
- W kapturze z przepływem laminarnym załaduj pozostały podgrzany inokulum zarodników do 1-mililitrowej strzykawki przymocowanej do sterylnej igły żołądkowej zakończonej gruszką. Użyj ręcznego krokowca strzykawkowego, aby zapewnić dokładne i szybkie powtarzanie dawkowania między myszami. Upewnij się, że igła do zgłębnika jest wypełniona podgrzanym inokulum zarodników przed użyciem.
UWAGA: Nowa sterylna igła do głębka dla każdej myszy nie jest wymagana. Jeśli jednak podaje się różne dawki zarodników C. difficile, dla każdej dawki zaleca się nową igłębnik.
UWAGA: Zarodniki C. difficile są wysoce odporne na tradycyjne środki dezynfekujące. Dlatego konieczne jest stosowanie sporobójczego środka dezynfekującego, takiego jak #62 Perisept Sporicidal Disinfectant. Producent zaleca 2-minutowy czas kontaktu w celu zniszczenia zarodników C. difficile.
- Zgłębnik każdej myszy za pomocą 25 μl inokulum zarodników. Każdą mysz należy delikatnie powstrzymać, chwytając zwierzę za luźną skórę szyi i grzbietu, aby unieruchomić głowę. Za pomocą palca wskazującego dodatkowo unieruchamić głowę zwierzęcia i wydłużyć przełyk. Upewnij się, że zwierzę nie wokalizuje ani nie wykazuje innych oznak niepokoju podczas krępowania.
UWAGA: Całkowita objętość podawana myszom przez zgłębnik nie powinna przekraczać 10 ml/kg masy ciała (0,1 ml/10 g).
- Utrzymuj mysz w pionowej, pionowej pozycji i delikatnie wsuń igłębkę w bok ust. Skieruj igłębnik wzdłuż podniebienia i powoli wsuń igłębnik do przełyku.
UWAGA: Jeśli napotkasz jakikolwiek opór, igła do wbijania w zgłębnik może wchodzić w tchawicę i dlatego NIE należy jej przesuwać, ale raczej natychmiast usunąć i ponownie położyć.
- Po tym, jak igła do zgłębnika znajdzie się mniej więcej w połowie drogi do przełyku, wstrzyknąć 25 μl podgrzanego inokulum zarodnikowego i delikatnie wyjąć igłębnik z przełyku.
UWAGA: Mocne przesuwanie igły do zgłębnika może prowadzić do pęknięcia przełyku lub żołądka. Dlatego, jeśli napotkasz opór podczas przesuwania igły do zgłębnika, najlepiej natychmiast wyjąć igłębnik i zmienić jego położenie.
- Zwierzę należy umieścić z powrotem w klatce i obserwować, czy nie ma kaszlu lub objawów niewydolności oddechowej, ponieważ może to wskazywać na niezamierzone podanie tchawicy lub aspirację podgrzanego inokulum przetrwalników.
UWAGA: Myszy są wyjątkowo podatne na C. difficile po leczeniu antybiotykami; Dlatego niezbędne są środki ostrożności zapobiegające zanieczyszczeniu krzyżowemu między klatkami. Jest to szczególnie ważne w przypadku myszy leczonych antybiotykami, ale nieleczonych jako kontrolnych.
- Po zaszczepieniu wszystkich myszy, umieść pozostały podgrzany inokulum zarodników w sterylnej probówce mikrowirówkowej i przełóż go do komory beztlenowej w celu zliczenia zarodników.
- W celu zliczenia podgrzanego inokulum zarodnikowego (od kroku 2.4) i pozostałego podgrzanego inokulum zarodnikowego z zgłębnikami, należy wykonać seryjne rozcieńczenia każdego inokulum w stosunku 1:10 w 1x PBS. Zaleca się wykonanie i podanie na talerzu 4 - 5 rozcieńczeń (tj. 10-1 do 10-5).
- Stosując technikę aseptyczną, przenieść 100 μl każdego seryjnego rozcieńczenia na pojedynczą płytkę TCCFA.
- Za pomocą sterylnego rozsiewacza w kształcie litery L równomiernie rozprowadź rozcieńczenie nałożone na podłoże na płytce. Nawet rozprowadzenie rozcieńczonego inokulum jest niezbędne do dokładnego zliczenia zarodników.
- Inkubować płytki beztlenowo przez 24 godziny w temperaturze 37 °C. Po 24 godzinach można policzyć jednostki tworzące kolonie (CFU) C. difficile, aby uzyskać dawkę infekcyjną podawaną myszom w objętości 25 μl (0,025 ml) (patrz plik uzupełniający "Przykładowe obliczenia"). Kolonie C. difficile są płaskie i bladożółte, mają nieregularne krawędzie i wygląd szlifowanego szkła24,
UWAGA: Granica wykrywalności dla oznaczania liczby bakterii wynosi 102 jtk.
3. Monitorowanie utraty masy ciała myszy i klinicznych objawów choroby podczas infekcji C. difficile
- Zważyć zwierzęta przed i po 5-dniowej kuracji antybiotykami cefoperazonu, po 2-dniowej rekonwalescencji po antybiotykach (dzień 0), a następnie przez cały czas trwania eksperymentu.
UWAGA: Uzyskuj ciężary o stałej porze każdego dnia. Masy uzyskane w dniu próby prowokacyjnej (dzień 0) powinny być użyte jako początkowa masa wyjściowa do porównania w całym zakażeniu C. difficile.
- Umieść wagę cyfrową w szafie bezpieczeństwa biologicznego. Umieść sterylną plastikową zlewkę na wadze i staruj wagę plastikowej zlewki. Następnie delikatnie podnieś mysz za podstawę ogona i umieść ją w plastikowej zlewce.
- Umieść zlewkę z powrotem na wadze. Najedź dłonią na górną część zlewki, aby upewnić się, że mysz nie ucieknie. Uzyskanie stabilnej wagi może zająć 2-3 sekundy. Następnie delikatnie umieść mysz z powrotem w klatce. Zapisz tę wagę i powtórz proces dla każdej myszy w tej klatce.
UWAGA: Konieczne jest podjęcie środków ostrożności w celu zapobieżenia zanieczyszczeniu krzyżowemu między koszykami podczas uzyskiwania masy. Każda klatka myszy powinna mieć własną plastikową zlewkę do ważenia. Plastikowe zlewki należy dezynfekować środkiem sporobójczym między każdym użyciem i przykrywać sterylną folią aluminiową.
- Monitoruj prowokowane zwierzęta dwa razy dziennie (co najmniej) pod kątem objawów klinicznie ciężkiej infekcji C. difficile, w tym letargu, utraty apetytu, biegunki i zgarbionej postawy.
- Humanitarna eutanazja zwierząt, które tracą 20% swojej początkowej wyjściowej masy ciała i/lub rozwijają się ciężkie objawy kliniczne zakażenia C. difficile (wymienione w kroku 3.3).
UWAGA: Myszy, które wykazują kliniczne objawy zakażenia C. difficile, powinny być ważone w razie potrzeby podczas eksperymentu, aby upewnić się, że nie straciły 20% swojej początkowej wyjściowej masy ciała. We wczesnych punktach czasowych eksperymentu może to oznaczać pomiary dwa razy dziennie.
4. Oznaczanie liczby bakterii C. difficile na podstawie kału myszy i zawartości jelita ślepego
UWAGA: Przed rozpoczęciem upewnij się, że następujące elementy zostały umieszczone w komorze beztlenowej na co najmniej 24 godziny: 1x PBS (patrz Materiały), płytki TCCFA (patrz Materiały), sterylny rozsiewacz w kształcie litery L oraz sterylne probówki do mikrowirówek i/lub płytki PCR do rozcieńczeń.
- Pobieranie próbek do oznaczania liczby C. difficile
UWAGA: Przed uzyskaniem kału lub zawartości jelita ślepego należy zważyć sterylne probówki do mikrowirówek na wadze analitycznej. Zapisz masę probówki z boku tuby, zaokrąglając do czterech miejsc po przecinku (np. 0,9864 g). Oznacz tę masę jako "wagę probówki". Każdą pobraną próbkę należy umieścić w sterylnej, zważonej probówce do mikrowirówki.
- Sterylne zbieranie mysich odchodów
- Delikatnie przytrzymuj każdą mysz, chwytając zwierzę za luźną skórę szyi i grzbietu, aby unieruchomić głowę. Użyj małego palca, aby delikatnie przytrzymać ogon zwierzęcia, odsłaniając w ten sposób odbyt. Upewnij się, że zwierzę nie wokalizuje ani nie wykazuje innych oznak niepokoju podczas krępowania.
- Trzymaj sterylną, zważoną probówkę do mikrowirówki bezpośrednio pod odbytem zwierzęcia. Konieczne jest, aby rurka nie stykała się bezpośrednio z myszą.
- Gdy zwierzę się wypróżnia, zbierz granulki kału do probówki. Trzymaj probówkę w temperaturze pokojowej, aż wszystkie próbki kału zostaną zebrane. Mysz może potrzebować kilku minut, aby się wypróżnić, co wymaga powtórnych prób zebrania kału.
- Zważyć probówki zawierające kał na wadze analitycznej. Zapisz wagę tuby, zaokrąglając do czterech miejsc po przecinku (np. 1,0021 g). Oznacz uzyskaną masę jako "końcową masę rury".
- Bezpośrednio po pobraniu kału należy przekazać próbki kału do komory beztlenowej w celu zliczenia bakterii.
- Sterylne pobieranie zawartości jelita ślepego myszy w czasie sekcji zwłok
- Po humanitarnej eutanazji przez uduszenie CO2 , a następnie zastosowaniu środków wtórnych, należy przeprowadzić sekcję zwłok w celu uzyskania jelita ślepego25. Jelito ślepe to duża, przecinkowata część przewodu pokarmowego.
- Umieść jelito ślepe na sterylnej plastikowej szalce Petriego. Użyj jednorazowego, sterylnego ostrza skalpela nr 10, aby rozciąć jelito ślepe od ślepego końca torebki, aby odsłonić zawartość jelita ślepego.
- Delikatnie usuń zawartość jelita ślepego, lekko uciskając ostrzem skalpela i przesuwając zawartość w kierunku naciętej części jelita ślepego.
UWAGA: Należy zachować ostrożność, aby nie naruszyć tkanki jelita ślepego, która zostanie przekazana do badania histopatologicznego.
- Umieść zawartość jelita ślepego w sterylnej, zważonej probówce do mikrowirówki natychmiast po pobraniu. Tylko około 10 mg zawartości jelita ślepego jest potrzebne do oznaczenia liczby bakterii.
- Zważyć probówki zawierające zawartość jelita ślepego na wadze analitycznej. Zapisz wagę tuby, zaokrąglając do czterech miejsc po przecinku (np. 1,0021 g). Oznacz uzyskaną masę jako "końcową masę rury".
- Próbki zawartości jelita ślepego należy przekazać do komory beztlenowej w celu oznaczenia liczby bakterii.
- Oznaczanie liczby bakterii C. difficile
- Obliczyć końcową masę zawartości (kału lub jelita ślepego), która zostanie policzona dla C. difficile. Wykonano to, odejmując "końcową wagę rury" od "wagi rury".
- Obliczyć rozcieńczenie zawartości w stosunku 1:10 do 1X PBS i odpowiednio zawiesić. W przypadku granulek kału należy użyć końcówki pipety, aby delikatnie rozbić osad na roztwór (patrz plik uzupełniający "Przykładowe obliczenia").
- Zawiesiny próbek należy inkubować beztlenowo w temperaturze pokojowej przez 30 minut, pozwalając zawartości na opadanie.
- Wykonać seryjne rozcieńczenia dla każdej próbki w 1x PBS w celu wyliczenia jtk na g zawartości (kał lub kał). Wykonaj to beztlenowo.
- Stosując technikę aseptyczną, przenieść 100 μl każdego seryjnego rozcieńczenia na płytki TCCFA. Za pomocą sterylnego rozsiewacza w kształcie litery L rozprowadź nałożony rozcieńcz na podłoże, aby równomiernie rozprowadzić go na płytce. Równomierne rozprowadzenie rozcieńczenia jest niezbędne do dokładnego zliczenia kolonii.
- Inkubować płytki beztlenowo przez 24 godziny w temperaturze 37 °C. W tym czasie należy wyliczyć kolonie C. difficile, aby uzyskać CFU na g zawartości (kał lub jelito ślepe). Kolonie C. difficile są płaskie i bladożółte, mają nieregularne krawędzie i wygląd szlifowanego szkła24,
UWAGA: Protokół ten może być używany do wyliczania C. difficile z innej zawartości przewodu pokarmowego u myszy, w tym zawartości jelita krętego i okrężnicy. Płytki PCR mogą być używane do wykonywania seryjnych rozcieńczeń.
5. Test cytotoksyczności komórek Vero w celu ilościowego określenia cytotoksyczności toksyny C. difficile
UWAGA: Zaleca się, aby test ten został przeprowadzony po ukończeniu modelu mysiego na próbkach pobranych podczas sekcji zwłok i przechowywanych w temperaturze -80 °C. Techniki aseptycznej hodowli komórkowej są niezbędne do zapobiegania zanieczyszczeniu komórek Vero podczas tego testu. Wykonanie tego protokołu trwa 2 dni. Cały kał i zawartość jelitowa wykorzystana w tym teście muszą być przechowywane w zważonej, sterylnej probówce do mikrowirówki (oznaczonej "wagą probówki", patrz sekcja powyżej). Ostateczna masa probówki (wraz z zawartością) jest mierzona za pomocą wagi analitycznej z dokładnością do czterech miejsc po przecinku (patrz sekcja powyżej). Do tego testu zaleca się użycie pipety wielokanałowej.
UWAGA: Przed rozpoczęciem upewnij się, że dostępne są następujące elementy: Vero Cells, modyfikacja pożywki Eagle (DMEM) firmy Dulbecco 1x z 10% inaktywowaną termicznie płodową surowicą bydlęcą (FBS) i 1% pożywką penicyliny/streptomycyny (oznaczoną jako "pożywka DMEM 1x; " patrz Materiały i plik uzupełniający), 0,25% trypsyna-EDTA, 1x PBS, 0,4% błękit trypanowy, 96-dołkowa płytka z płaskim dnem do hodowli komórkowych, 96-dołkowa płytka filtracyjna, Clostridium difficile Toksyna A (podwielokrotność w 3 μl przy 1 μg/μl w ultraczystej wodzie i przechowywać w temperaturze -80 °C), antytoksyna Clostridium difficile, arkusz roboczy (do obliczeń i map płytowych; patrz pliki uzupełniające).
UWAGA: Podczas tego testu należy zachować ostrożność w przypadku narażenia personelu na C. difficile i jego toksynę.
- Dzielenie komórek Vero (dzień 1)
- Podgrzej DMEM 1x pożywka, 0,25% trypsyny-EDTA i 1x PBS w łaźni wodnej o temperaturze 37 °C.
- Pobrać kolbę komórek Vero z inkubatora do hodowli komórkowych (37 °C i 5% CO2 ) i umieścić ją w sterylnym okapie do hodowli komórkowych o przepływie laminarnym. Użyj 70% etanolu, aby wytrzeć maskę i sprzęt przed użyciem. Za pomocą pipety serologicznej odessać pożywkę z kolby do hodowli tkankowej, aby usunąć ją z komórek Vero i wyrzucić do pojemnika na odpady.
- Przepłukać komórki Vero 5 ml 1x PBS (wstępnie podgrzanego) w kolbie do hodowli tkankowej. Odessać PBS i wyrzucić go do pojemnika na odpady.
- Dodać 5 ml 0,25% trypsyny-EDTA do kolby do hodowli tkankowej. Czas kontaktu wynosi 2 - 3 minuty. W tym czasie obserwuj, jak komórki zaczynają schodzić z powierzchni kolby. Delikatnie kołysz kolbą kultur tkankowych na boki, aby poluzować komórki Vero.
- Po czasie kontaktu z Trypsin-EDTA, natychmiast dodać 5 ml pożywki DMEM 1x do kolby do hodowli tkankowej. To zneutralizuje Trypsynę-EDTA. Użyj tego roztworu, aby delikatnie zmyć wszelkie nieprzyłączone komórki Vero z tylnej części kolby. Następnie za pomocą pipety serologicznej przenieś tę mieszaninę do stożkowej probówki o pojemności 15 ml.
- Odwirować komórki Vero w stożkowej probówce przez 5 minut w temperaturze 180 x g i temperaturze 25 °C. Upewnij się, że wirówka jest odpowiednio zrównoważona. Po odwirowaniu obserwuj widoczne osady komórek Vero na dnie stożkowej probówki. Uważaj, aby nie zakłócić tego granulatu. Odessać supernatant ze stożkowej rurki i wyrzucić go.
- Ponownie zawiesić komórki Vero w 3 ml pożywki DMEM 1x.
- Liczenie komórek Vero
- Dodać 100 μl zawiesiny komórek Vero (wykonanej w kroku 5.1.7) do 100 μl 0,4% błękitu trypanowego. Delikatnie wymieszaj, pipetując roztwór w górę i w dół.
- Dodać 10 μl tej mieszaniny do każdej komory hemocytometru.
- Policz liczbę żywotnych komórek w czterech kwadrantach hemocytometru. Martwe komórki Vero przyjmą błękit trypanowy, a tym samym zostaną zabarwione na niebiesko (komórek tych nie należy liczyć). Zapisz te liczby w dostarczonym "Arkuszu komórkowym Vero".
- Zsumuj całkowitą liczbę żywotnych komórek Vero we wszystkich czterech kwadrantach i oblicz średnią. Pomnóż przez współczynnik rozcieńczenia, który wynosi 2, ponieważ 100 μl komórek znajduje się w sumie 200 μl cieczy.
- Pomnóż przez współczynnik korekcyjny, aby uzyskać "liczbę komórek/ml". Podczas korzystania z hemocytometru współczynnik korekcyjny wynosi zawsze 104. Pomnóż przez całkowitą objętość, aby uzyskać "całkowitą liczbę komórek".
- Określanie liczby studzienek wymaganych dla każdego eksperymentu
UWAGA: Pojedyncza próbka (kał lub zawartość jelit) wymaga wykonania 24 oddzielnych studzienek w dwóch egzemplarzach. Wymagane jest stężenie 105 komórek Vero na studzienkę (całkowita objętość 90 μl).
UWAGA: Jeśli ktoś pragnie inkubować 96-dołkowe płytki z komórek Vero przez noc w temperaturze 37 °C, zaleca się stężenie 103 komórek Vero na studzienkę, aby uwzględnić wydłużony czas inkubacji. Obliczenia w arkuszu Vero Cell musiałyby zostać dostosowane, aby uwzględnić tę zmianę.
- Określ liczbę studzienek, które można wykorzystać, w oparciu o ilość dostępnych komórek Vero (z kroku 5.2; użyj dostarczonego arkusza komórek Vero).
- Określ objętość zawiesiny komórek Vero potrzebną do wypełnienia liczby pożądanych dołków (na podstawie liczby badanych próbek). Upewnij się, że dodano dodatkowy objętość w celu uwzględnienia błędu pipetowania (użyj dostarczonego arkusza Vero Cell).
- Rozcieńczyć zawiesinę komórek Vero (otrzymaną w kroku 5.1.7) w pożywce DMEM 1x, aby uzyskać objętość wymaganą do eksperymentu.
- Wysiewanie komórek Vero do 96-dołkowej płytki do hodowli komórkowej
- Korzystając z ponownego zawieszenia komórek Vero z kroku 5.3.2, użyj pipety wielokanałowej, aby dodać 90 μl zawiesiny komórek Vero do każdego dołka 96-dołkowej płytki z płaskim dnem do hodowli komórek.
- Inkubować płytkę z komórkami Vero w inkubatorze do hodowli komórkowych w temperaturze 37 °C i 5% CO2 przez co najmniej 4 godziny przed dodaniem toksyny (próbek) do studzienek. Ten czas inkubacji pozwoli komórkom Vero przylegać do dna każdej studzienki.
- Tworzenie roztworów podstawowych z próbek (kał lub zawartość jelitowa)
UWAGA: Wszystkie próbki powinny mieć "wagę probówki" i "końcową masę probówki" zmierzoną za pomocą wagi analitycznej. Użyj arkusza Vero Cell do obliczeń.
- Oblicz wagę zawartości. Przelicz g na mg, a następnie mg na μl. Obliczyć końcową całkowitą liczbę μl roztworu potrzebną do uzyskania rozcieńczenia w stosunku 1:10 w 1x PBS. Obliczyć całkowitą ilość 1x PBS do dodania do próbki.
- Dodać całkowitą objętość 1x PBS (obliczoną powyżej) do próbki. Wykonaj to w sposób tlenowy i aseptyczny. W przypadku granulek kału użyj końcówki pipety, aby delikatnie rozbić osad w roztworze.
- Próbki należy wirować, a następnie odwirowywać je przy stężeniu 3,522 x g przez 5 minut w temperaturze pokojowej. Upewnij się, że wirówka jest odpowiednio zbalansowana. Należy uważać, aby nie zakłócić osadu i ponownie zawiesić próbkę w roztworze.
UWAGA: W kroku 5.5.3, jeśli przetwarzanych jest tylko kilka próbek, zawartość można wysterylizować, przepuszczając ją przez pojedynczy filtr 0,22 μm zamiast przy użyciu 96-dołkowej płytki filtracyjnej. Niektóre próbki mogą wymagać wielu filtrów, aby wysterylizować całą zawartość objętości przy użyciu tej techniki.
- Wysterylizuj mieszaninę próbka/PBS, pobierając 150 μl supernatantu i umieszczając go w oddzielnych studzienkach na 96-dołkowej płycie filtracyjnej. Umieść płytkę filtracyjną bezpiecznie na 96-dołkowej płytce z płaskim dnem do hodowli komórkowych, tak aby zawartość przefiltrowała się do tej płytki.
- Odwirować stos płytek filtracyjnych/płytek do hodowli komórkowych o masie 431 x g przez 5 minut w temperaturze pokojowej. Upewnij się, że wirówka jest odpowiednio wyważona i że płytka filtracyjna/płytka do hodowli komórkowej są ściśle wyrównane i nie przesuwają się podczas wirowania.
UWAGA: Ta przefiltrowana zawartość to zapas 10-1, który zostanie wykorzystany w płytkach rozcieńczających.
- Umieść płytkę z przefiltrowanymi próbkami na lodzie.
- Tworzenie płytki rozcieńczającej #1
UWAGA: Płytka rozcieńczająca #1 (DP#1) będzie wymagała 6 dołków na próbkę, w tym kontroli dodatnich (C. difficile Toxin A) i ujemnych (1x PBS) (patrz układ DP#1 w arkuszu Vero Cell).
- Aby przygotować kontrolę pozytywną (toksyna C. difficile A) do tego testu, należy otrzymać 3 μl podwielokrotności (1 μg/μl) w temperaturze -80 °C i dodać 297 μl ultraczystej wody, uzyskując końcowe stężenie 0,01 μg/μl. Umieścić na lodzie.
- Oznaczyć studzienki ich rozcieńczeniami (10-1 do 10-6) dla każdej próbki i wskazać kontrole dodatnie i ujemne (patrz układ DP#1).
- Dodaj odpowiednie ilości 1x PBS do każdej studzienki. W studzienkach 10-1 nie dodaj PBS. W przypadku 10-2 do 10-6 dołków dodać 90 μl 1x PBS.
- Dodać odpowiednie ilości próbek do każdego dołka. Do studzienek 10-1 dodać 100 μl podstawki 10-1 dla każdej próbki (patrz krok 5.5.7 z płytki filtracyjnej). W przypadku studzienek od 10-2 do 10-6 należy wykonać seryjne rozcieńczenia; Zacznij od pobrania 10 μl z dołka 10-1 i dodania go do dołka 10-2. Kontynuować seryjne rozcieńczenia aż do rozcieńczenia 10-6.
- Przykryj płytkę DP#1 przezroczystą plastikową uszczelką samoprzylepną i umieść ją na lodzie.
- Tworzenie płytki rozcieńczającej #2
UWAGA: Płytka rozcieńczająca (DP#2) będzie wymagała 2 torów po 6 dołków dla każdej próbki, w tym kontroli dodatnich i ujemnych (patrz układ DP#2 w arkuszu Vero Cell).
- Oznaczyć studzienki ich rozcieńczeniami (10-1 do 10-6) dla każdej próbki i wskazać kontrole dodatnie i ujemne (patrz układ DP#2). Oznacz studzienki nazwą próbki (oznaczoną jako "studzienki na próbki") lub nazwą próbki antytoksyną (oznaczoną jako "studzienki antytoksynowe").
- Oblicz ilość antytoksyny wymaganą do tego testu. UWAGA: Antytoksyna jest 25-krotnym roztworem podstawowym, który należy rozcieńczyć w stosunku 1:25 w 1x PBS. Umieść przygotowany roztwór antytoksyny 1x na lodzie.
- W przypadku "studzienek na próbki" dodać 20 μl 1x PBS do każdej studzienki na wszystkie rozcieńczenia (10-1 do 10-6) tej próbki. W przypadku "studzienek antytoksynowych" dodać 20 μl 1x antytoksyny do każdej studzienki na wszystkie rozcieńczenia (10-1 do 106) tej próbki.
- Przenieś 20 μl rozcieńczonej próbki do studzienek z DP#1 do wyznaczonych dołków na DP#2 dla rzędów 1 - 6 i rzędów 7 - 12 (patrz układ DP#2 w arkuszu Vero Cell). Delikatnie wymieszać roztwór, pipetując w górę i w dół.
- Przykryj DP#2 przezroczystą plastikową uszczelką samoprzylepną i pozostaw na 40 minut inkubacji w temperaturze pokojowej. Ta inkubacja ma na celu umożliwienie antytoksynie związania się, a tym samym inaktywacji i neutralizacji toksyny C. difficile.
- Po inkubacji dodaj 10 μl mieszaniny z DP#2 do odpowiednich studzienek komórek Vero (patrz układ płytki komórkowej Vero na arkuszu komórek Vero). Delikatnie wymieszaj roztwór, pipetując w górę i w dół, uważając, aby nie naruszyć komórek Vero, które są przyklejone do dolnej powierzchni studzienek.
- Inkubować płytkę komórkową Vero przez noc w inkubatorze do hodowli komórkowych w temperaturze 37 °C i 5% CO2 .
- Oceń komórki Vero pod kątem zaokrąglenia za pomocą mikroskopu świetlnego (dzień 2)
UWAGA: Przypomnijmy, że współczynnik rozcieńczenia zmienia się o współczynnik 10 podczas dodawania mieszanin próbek do płytki komórkowej Vero (np. 10-3 wynosi teraz 10-4). Studnie, w których obecna jest antytoksyna, powinny mieć niewiele lub nie zauważyć zaokrąglenia komórek Vero. Zaokrąglenie komórek Vero (cytotoksyczność) zostanie odnotowane w próbkach zawierających toksynę C. difficile. Jeżeli aktywność cytotoksyczna zostanie zneutralizowana w rozcieńczeniu zawierającym próbkę i antytoksynę, potwierdza się obecność toksyny C. difficile powodującej cytotoksyczność komórek Vero.
- Zbadaj zaokrąglenie komórek Vero za pomocą mikroskopu świetlnego przy 200-krotnym powiększeniu. W przypadku studzienek na próbki (w tym kontroli dodatniej) należy odnotować rozcieńczenie studzienki, w której jako ostatnia odnotowano zaokrąglenie komórek Vero na poziomie 80%.
- Obliczyć miano cytotoksyczne, które definiuje się jako odwrotność największego rozcieńczenia, które spowodowało zaokrąglenie 80% komórek Vero na g próbki. Na przykład, jeśli najwyższe rozcieńczenie wynosi 10-5, to współczynnik rozcieńczenia wyniesie 10-6 dla tej próbki. Zatem logarytm [końcowy współczynnik rozcieńczenia]/g próbki byłby log[106], co daje odwrotne miano 6,
UWAGA: Komórki Vero muszą przejść co najmniej 3 - 4 pasaże i nie więcej niż 30 pasaży przed ich użyciem w tym teście26.