$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
W metazoa, napięcie mechaniczne kieruje rozwojem tkanek i homeostazą poprzez regulację niezliczonych procesów komórkowych, takich jak proliferacja, różnicowanie i przeżycie 1,2. Napięcie mechaniczne może powstawać z macierzy zewnątrzkomórkowej lub może być generowane przez przylegające komórki, które pobierają próbki środowiska zewnątrzkomórkowego za pomocą kurczliwej maszynerii aktomiozyny, która ciągnie macierz zewnątrzkomórkową i bada jej sztywność przez cząsteczki wrażliwe na napięcie. W odpowiedzi na napięcie mechanowrażliwe białka adhezyjne ulegają zmianom konformacyjnym, które wyzwalają złożone kaskady sygnałowe. Z kolei te szlaki sygnałowe koordynują mechanoodpowiedź obejmującą proliferację, różnicowanie i przeżycie, która dostosowuje zachowanie komórki do środowiska zewnątrzkomórkowego. Takie procesy można rozliczyć w krótkim okresie czasu (od sekund do minut), aby szybko przekazać je z powrotem do pętli mechanotransdukcji poprzez modyfikację struktur mechanowrażliwych. Na przykład zrosty oparte na integrynie wzmacniają się w odpowiedzi na napięcie poprzez przebudowę cytoszkieletu za pośrednictwem Rho GTPazy 3,4,5. Równolegle, inne szlaki sygnałowe są aktywowane przez godziny i dni, aby kontrolować programy genetyczne, które ostatecznie wpływają na los komórki 6. Podczas gdy wiele badań podkreśliło wpływ sztywności macierzy na determinizm komórek i rozwój choroby 1,2 , dokładne mechanizmy molekularne mechanotransdukcji za pośrednictwem adhezji nadal pozostają nieuchwytne.
Opracowano różne podejścia do badania wpływu sił generowanych przez komórkę lub sił zewnętrznych na zachowanie komórek, w tym systemy przepływu, czujniki transferu energii rezonansu fluorescencji (FRET)-czujniki napięcia 7,8, zgodne podłoża 9, pęsety magnetyczne, pęsety optyczne 10 i mikroskopia sił atomowych (AFM) 11. W tym miejscu przedstawiamy protokół wykorzystujący kulki superparamagnetyczne do scharakteryzowania szlaków mechanotransdukcji w odpowiedzi na siły rozciągające przyłożone do określonych receptorów adhezyjnych. Koraliki superparamagnetyczne to cząstki, które odwracalnie magnetyzują się po umieszczeniu w polu magnetycznym. Po pokryciu ligandem dla określonego receptora, kulki te stanowią potężne narzędzie do badania skutków zastosowania siły zewnątrzkomórkowej. Metoda ta została potwierdzona w kilku badaniach 3,5,12-17 i prezentują zaletę, która znacznie ułatwia analizę biochemiczną na przylegających komórkach. Korzystając z podobnych kulek magnetycznych pokrytych kolagenem, a następnie analizie biochemicznej, wczesne prace wykazały wzrost fosforylacji tyrozyny białek i aktywacji RhoA w odpowiedzi na napięcie 5,18,19. Opisana poniżej metoda została również wykorzystana z kulkami pokrytymi fibronektyną (FN) w celu scharakteryzowania szlaków sygnałowych poniżej napięcia przyłożonego do integryn 3. W tym badaniu Guilluy i in. wykazali, że napięcie aktywuje RhoA poprzez rekrutację dwóch czynników wymiany nukleotydów guaniny (GEF), LARG i GEF-H1, do integracyjnych kompleksów adhezyjnych. Od tego czasu inne badania wykazały, że GEF-H1 jest rekrutowany do kompleksów adhezyjnych w odpowiedzi na napięcie generowane przez komórki przy użyciu różnych metod 20,21, co dowodzi solidności opisanej tutaj metodologii. W rezultacie wykazano, że aktywowany RhoA sprzyja wzmocnieniu przyczepności poprzez przebudowę cytoszkieletu. System ten został również wykorzystany do zbadania napięcia wywieranego na receptory adhezyjne komórka/komórka. Przyłożenie sił do kulek magnetycznych pokrytych zewnątrzkomórkową domeną E-kadheryny indukowało wzrost rekrutacji winkuliny, podobnie jak w przypadku kompleksów adhezyjnych związanych z integryną 12. Collins i współpracownicy zaobserwowali, że przyłożenie napięcia do PECAM-1 sprzyja aktywacji integryny i RhoA 13. Innym podejściem eksperymentalnym wykorzystującym kulki magnetyczne jest badanie napięcia przyłożonego do izolowanych jąder. Używając kulek pokrytych przeciwciałami przeciwko białku otoczki jądrowej nesprin-1, kompleksy otoczki jądrowej oczyszczono, aby pokazać, że są one dynamicznie regulowane w odpowiedzi na napięcie mechaniczne 22. Wyniki te potwierdzają skuteczność tej metody w badaniu szlaków mechanotransdukcji. Co więcej, podczas gdy systemy przepływu lub siły trakcyjnej stymulują ogólne procesy komórkowe, kulki magnetyczne celują w receptor adhezyjny komórki za pomocą ligandów receptorowych 3 lub przeciwciał monoklonalnych przeciwko receptorowi powierzchni komórki 13,15.
Kolejną zaletą tej metody jest izolacja kompleksów adhezyjnych poprzez prostą procedurę oczyszczania powinowactwa do ligandów. Powszechnie wiadomo, że dodanie do komórek kulek pokrytych ligandem wiąże receptory adhezyjne i indukuje rekrutację kilku białek adhezyjnych23. Dalsze przyłożenie sił do kulek magnetycznych pokrytych ligandem przekształca te kompleksy adhezyjne w platformy makromolekularne, które pośredniczą w różnych szlakach sygnałowych zależnych od napięcia4,24. Liza komórek, a następnie zagęszczenie kulek za pomocą magnesu pozwala na odizolowanie platform adhezyjnych. Inne metody stosowane do oczyszczania kompleksów adhezyjnych były już stosowane w komórkach adherentnych. Łączą one chemiczne sieciowanie w celu zachowania interakcji białko-białko oraz etap lizy komórek za pomocą detergentu i przepływu ścinającego lub sonikacji 20,21,25,26,27,28. Ostatnim etapem jest pobranie powstałych brzusznych błon plazmatycznych zawierających kompleksy adhezyjne. W przeciwieństwie do tych metod, kulki magnetyczne pozwalają na większy poziom oczyszczenia kompleksów adhezyjnych komórek poprzez selektywne celowanie w określoną rodzinę receptorów adhezyjnych. Kulki magnetyczne były już używane do oczyszczania kompleksów adhezyjnych w nieprzylegających komórkach przyczepionych do mikrokulek pokrytych ligandem29,30. Opisana poniżej metoda naśladuje sytuacje biologiczne, w których siła jest przykładana przez krótki czas (od sekund do minut). W związku z tym stanowi potężne narzędzie do badania zarówno składu molekularnego oczyszczonych kompleksów adhezyjnych, jak i dalszych szlaków sygnalizacji mechanowrażliwej.
Tutaj prezentujemy szczegółowy protokół eksperymentalny dotyczący użycia kulek magnetycznych do przyłożenia sił rozciągających do adhezji białek powierzchniowych. Stały magnes neodymowy umieszcza się na powierzchni naczynia hodowlanego. Powierzchnia bieguna magnesu jest umieszczona na wysokości 6 mm, tak aby siła działająca na pojedynczy koralik magnetyczny o wielkości 2,8 μm była stała (około 30-40 pN)31. Czas trwania stymulacji napięcia jest określany przez operatora w zależności od interesującej nas cząsteczki i skali czasowej jej aktywacji. Komórki są ostatecznie poddawane lizie, kompleksy adhezyjne są oczyszczane przez separację kulek za pomocą magnesu i przetwarzane są analizy biochemiczne. Protokół ten obejmuje przygotowanie kulek superparamagnetycznych pokrytych ligandem oraz zastosowanie napięcia za pomocą magnesu, a następnie analizy biochemiczne. Dodatkowo przedstawiamy reprezentatywną próbkę danych wykazujących, że napięcie przyłożone do adhezji na bazie integryny indukuje przebudowę adhezji i zmienia fosforylację tyrozyny białek.