Zaburzenia neurorozwojowe człowieka, takie jak małogłowie, mogą być słabo zbadane na modelach zwierzęcych ze względu na fakt, że ludzkie mózgi mają wydłużoną powierzchnię korową, co jest unikalną cechą różniącą się od zwierząt innych niż ludzie.
Ten aspekt sprawia, że rozwój ludzkiego mózgu jest złożonym procesem, który nie może być wystarczająco zbadany w systemie hodowli komórkowych in vitro 2D. Nowe techniki hodowli 3D umożliwiają generowanie organoidów podobnych do tkanek z indukowanych pluripotencjalnych komórek macierzystych (iPSC). Różnicowanie in vitro pluripotencjalnych komórek macierzystych w hodowli zawiesinowej 3D pozwala na tworzenie różnych typów komórek w odpowiednim czasie i w sposób specyficzny dla regionu, dając początek zorganizowanej, warstwowej tkance1,2,3. Dzięki laboratoriom, które były pionierami technologii hodowli 3D i zdemistyfikowały złożoność tworzenia narządów, zaczynając od komórek macierzystych, opracowaliśmy solidną metodę generowania organoidów mózgowych, aby nakreślić wczesne zdarzenia rozwoju ludzkiego mózgu i modelować mikrocefalię in vitro1,2,3. Warto zauważyć, że zaadaptowaliśmy oryginalną metodę opracowaną przez Lancastera i wsp. do generowania organoidów mózgowych1. Metoda ta została zmodyfikowana zgodnie z naszymi wymaganiami eksperymentalnymi.
Celem badania przeprowadzonego przez Gabriela i wsp. było przeanalizowanie komórkowych i molekularnych mechanizmów utrzymania nerwowych komórek macierzystych podczas rozwoju mózgu. W tym celu przeprowadzono badanie mechanistyczne, analizując neuronalne komórki progenitorowe (NPC) w organoidach mózgowych 3D pochodzących od pacjenta z małogłowiem4. Ten pacjent był nosicielem mutacji w CPAP, konserwatywnym białku centrosomalnym wymaganym do biogenezy centrosomów5. Powszechnie akceptowaną hipotezą jest to, że małogłowie jest wynikiem wyczerpania puli NPC, a to może być spowodowane albo śmiercią komórki, albo przedwczesnym różnicowaniem1,6,7,8,9.
Analizując strefy komorowe (VZ) organoidów mózgowych mikrocefalii, wykazano, że znaczna liczba NPC ulega asymetrycznemu podziałowi komórek, w przeciwieństwie do organoidów mózgowych pochodzących od zdrowego dawcy4. Szeroko zakrojone analizy mikroskopowe i biochemiczne mikrocefalicznych organoidów mózgowych ujawniły nieoczekiwaną rolę CPAP w terminowym demontażu rzęsek4. W szczególności zmutowany CPAP jest związany z opóźnionym rozpadem rzęsek i opóźnionym ponownym wejściem w cykl komórkowy, co prowadzi do przedwczesnego różnicowania NPCs4. Wyniki te sugerują rolę rzęsek w małogłowie i ich udział w neurogenezie i kontroli wielkości mózgu10.
Pierwsza część tego protokołu to opis trzyetapowej metody generowania jednorodnych organoidów mózgowych. Jak wspomniano wcześniej, oryginalny protokół Lancaster został zaadaptowany i zmodyfikowany zgodnie z naszym celem1. Po pierwsze, ludzkie iPSC są hodowane w określonych warunkach wolnych od karmnika na matrycy Engelbreth-Holm-Swarm (EHS). Ten krok pozwala uniknąć zmian w zależnych od karmiciela pluripotencjalnych kulturach komórek macierzystych. W tym protokole indukcja różnicowania neuronalnego w celu utworzenia nabłonka nerwowego rozpoczyna się bezpośrednio od iPSC. Pomijając etap tworzenia ciała zarodkowego (EB), różnicowanie neuronalne przebiega w bardziej kontrolowany i ukierunkowany sposób. Takie podejście ogranicza spontaniczne i nieukierunkowane tworzenie się innych warstw rozrodczych, takich jak mezoderma i endoderma. Dzięki zastosowaniu tego protokołu, neurosfery zawierające rozety nerwowe mogą zostać pobrane w 5 dniu w celu osadzenia matrycy EHS i hodowli zawiesiny stacjonarnej. Pożywka organoidowa używana w trzecim etapie naszego protokołu jest uzupełniana o dorsomorfinę i SB431542. Dorsomorfina jest małocząsteczkowym inhibitorem białka morfogennego kości (BMP) i hamuje SB431542 szlak sygnałowy TGFβ/aktywina/węzłowy. Połączenie tych czynników może promować różnicowanie neuronów skuteczniej niż sam kwas retinowy11,12,13,14.
Łącznie, te modyfikacje umożliwiają powtarzalne generowanie organoidów mózgowych, z minimalnymi różnicami między organoidami. Co ważne, metoda ta została zastosowana do solidnego generowania mikrocefalicznych organoidów mózgowych z iPSC pacjentów, które przenoszą mutacje w genach wpływających na centrosomy i dynamikę cyklu komórkowego.
Druga część tego protokołu zawiera instrukcje dotyczące przygotowania organoidów mózgowych do analizy i interpretacji wad komórkowych w małogłowie. Obejmuje to utrwalanie, kriosekcję, barwienie immunofluorescencyjne i konfokalną analizę mikroskopową. Protokół ten dostarczy czytelnikowi szczegółowego opisu oczekiwanych wyników oraz wskazówek dotyczących interpretacji.