Stosując ECS jako metodologię indukowania neurogenezy, stwierdzamy natychmiastowy wzrost o 260% w tworzeniu nowych neuronów BrdU-dodatnich w hipokampie. W tej puli ostro generowanych neuronów stwierdziliśmy 40% wyczerpanie od pierwszego dnia do trzech miesięcy, przy czym prawie 50% nowo powstałych neuronów przeżywa co najmniej 12 miesięcy po leczeniu10,11. Liczenie neuronów znakowanych BrdU przebiegało według ścisłego schematu próbkowania, w którym cały hipokamp został pocięty na odcinki o grubości 80 μm, a następnie podpróbkowanie co 5sekcji z losowym rozpoczęciem próbkowania między sekcją pierwszą a piątą. Zakładając, że te sekcje są wybierane w sposób systematyczny, jest to ewidentnie doskonała metoda zmniejszania wariancji wyniku końcowego, bez wyczerpującego liczenia1. Ten schemat próbkowania pozwolił nam policzyć neurony BrdU-dodatnie średnio w 12 (8-16) sekcjach hipokampa w każdym mózgu szczura, z końcową precyzją 9-11%.
W przypadku stosowania metody frakcjonowania niezbędna jest znajomość ułamka wysokości przekroju, w którym odbywa się liczenie, ponieważ podczas obróbki histologicznej często dochodzi do kurczenia się i deformacji tkanek14. Rzeczywiście, w tym badaniu zaobserwowaliśmy znaczny spadek grubości. Ponadto należy zauważyć, że może wystąpić różnicowy skurcz tkanek, jak przedstawiono w Dorph-Petersen i wsp. 2001. Jednak tak długo, jak cała struktura będąca przedmiotem zainteresowania jest dostępna do analizy, ograniczenia te nie skutkują odchyleniem całkowitej liczby cząstek, tj. neuronów BrdU-dodatnich. W badaniach, w których szczególnym problemem jest kurczenie się tkanek, zawsze należy stwierdzić, że wyniki uzyskuje się w zdeformowanej tkance. W tym badaniu policzyliśmy wysokość dwugałęzi wynoszącą 10 μm. Przekroje niniejszego badania miały końcową średnią grubość 26 μm, strefę ochronną 5 μm u góry i 11 μm (średnią) strefę ochronną u dołu sekcji. Parametry te są dopuszczalne, ponieważ strefy ochronne powinny mieć w przybliżeniu średnicę cząstki, z której pobierane są próbki.
Po wyznaczeniu GCL/SGZ, dysektory zostały równomiernie losowo rozmieszczone w obrębie wyznaczonego obszaru. Dysektory powinny być ustawione ze stałą długością kroku, która optymalizuje pobieranie próbek i liczenie, aby skutecznie uzyskać szacunki z precyzją określoną przez badacza. Optymalna precyzja jest zwykle osiągana poprzez zliczenie do 150-200 komórek w każdej interesującej strukturze5. W niniejszym badaniu naliczyliśmy średnio 133 (zakres 33-372) neuronów BrdU-dodatnich w każdym hipokampie szczura. Ze względu na niską liczbę komórek u niektórych zwierząt kontrolnych, nasza liczba neuronów BrdU-dodatnich spadła poniżej ogólnie akceptowalnej liczby komórek wymaganej do uzyskania odpowiedniej precyzji, co skutkowało stosunkowo wysokimi wartościami CE w tych przypadkach. Ponieważ jednak uzyskaliśmy wartości CE mniejsze niż połowa wartości CV (patrz sekcja dotycząca reprezentatywnych wyników), dodatkowe pobieranie próbek i liczenie nie było wymagane. Wysokie wartości CV pokazują, że największy udział w obserwowanej zmienności ma zmienność biologiczna. Rzeczywiście, możemy stwierdzić, że średnia liczba neuronów BrdU-dodatnich zliczonych w niniejszym badaniu była wyższa niż to konieczne. Na przykład w jednej grupie szczurów osiągnęliśmy wartość CE na poziomie 9%, a wartość CV zaobserwowaliśmy na poziomie 43%. W tym konkretnym przypadku mogliśmy dążyć do precyzji na poziomie około 20%. Podsumowując, precyzja całkowitej liczby neuronów BrdU-dodatnich w niniejszym badaniu jest wystarczająca, ponieważ ujmuje rzeczywiste efekty leczenia na rzeczywistą liczbę cząstek. Ze względu na dość dużą zmienność biologiczną w niektórych grupach zwierząt, te same szacunki można było uzyskać z akceptowalną precyzją, pomimo mniejszych nakładów wysiłku. Wysokie różnice biologiczne w obrębie grup mogą być zrekompensowane jedynie poprzez zwiększenie liczby zwierząt.
Można argumentować, że złoty standard uzyskiwania dokładnych numerów komórek pociąga za sobą wyczerpujące liczenie wszystkich obiektów zainteresowania. Jednak w większości badań nad mózgiem nie jest to możliwe ze względu na ogromną liczbę komórek. Chociaż opcjonalny frakcjonator jest znacznie bardziej wydajny niż wyczerpujące zliczanie komórek, jest stosunkowo czasochłonny w porównaniu z prostym badaniem przesiewowym różnic w liczbie komórek, które jest preferowane, jeśli dokładna liczba komórek nie jest niezbędna. Z naszego doświadczenia wynika, że różnice przekraczające 20-30% można wykryć wyłącznie za pomocą procedur przesiewowych.
Przy prawidłowym przeprowadzeniu pobierania próbek przy użyciu stereologii opartej na projekcie zapewnia bezstronne i precyzyjne szacunki w efektywny sposób1. Bezstronna właściwość stereologii tworzy oszacowania, które po powtórzeniu przybliżają rzeczywistą średnią populacji i zwiększają odtwarzalność oszacowania21. Na początku należy uzyskać reprezentatywną próbkę całej struktury będącej przedmiotem zainteresowania (w tym badaniu GCL/SGZ hipokampa), co pozwala na oszacowanie w statystycznie ważnym podzbiorze sekcji4. Aby uzyskać odpowiednią liczbę sekcji i sond zliczających, stosujemy SURS, który zmniejsza wariancję w porównaniu z próbkowaniem losowym8. Co więcej, SURS zapewnia, że cząstki będące przedmiotem zainteresowania w strukturze są próbkowane z takim samym prawdopodobieństwem, niezależnie od ich wielkości, kształtu, orientacji i rozmieszczenia w strukturze. W związku z tym badania geologiczne są wysoce zalecane, gdy uzyskanie precyzyjnych i bezstronnych szacunków jest centralnym aspektem projektu.