Ten protokół został opracowany do ilościowej identyfikacji składników mikrośrodowiska guza w resekcjach pacjentów z glejakiem przy użyciu immunohistochemii chromogennej i ImageJ.
Artykuł metodologiczny
Ten protokół został opracowany do ilościowej identyfikacji składników mikrośrodowiska guza w resekcjach pacjentów z glejakiem przy użyciu immunohistochemii chromogennej i ImageJ.
Wraz z rosnącym zainteresowaniem mikrośrodowiskiem guza, postanowiliśmy opracować metodę szczegółowego określania składników mikrośrodowiska w próbkach pobranych od pacjentów glejaka, najbardziej śmiertelnego i inwazyjnego raka mózgu. Metody ilościowe są nie tylko korzystne dla dokładnego opisu chorych tkanek, ale mogą również potencjalnie przyczynić się do dokładniejszego prognozowania, diagnozowania i opracowywania systemów inżynierii tkankowej i zamienników. W glejaku komórki glejowe, takie jak mikroglej i astrocyty, zostały niezależnie skorelowane ze złym rokowaniem na podstawie oceny patologów. Jednak stan tych komórek i innych składników komórek glejowych nie został dobrze opisany ilościowo. Może to być trudne ze względu na duże procesy, które znaczą te komórki glejowe. Ponadto większość analiz histologicznych koncentruje się na całej próbce tkanki lub tylko w obrębie większości guza, w przeciwieństwie do wyznaczania kwantyfikacji na podstawie regionów w wysoce niejednorodnej tkance. W tym miejscu opisujemy metodę identyfikacji i ilościowej analizy populacji komórek glejowych w masie guza i sąsiednich regionach resekcji guza od pacjentów z glejakiem. Użyliśmy immunohistochemii chromogennej do identyfikacji populacji komórek glejowych w resekcjach guza u pacjentów oraz ImageJ do analizy procentowego pokrycia barwienia dla każdej populacji glejowej. Dzięki tym technikom jesteśmy w stanie lepiej opisać komórki glejowe we wszystkich regionach mikrośrodowiska guza glejaka.
Glejak wielopostaciowy (GBM), najczęstszy i najbardziej złośliwy nowotwór mózgu, charakteryzuje się wysoce rozproszoną inwazją od pierwotnej masy guza do otaczającego zdrowego miąższu mózgu1,2. Ta rozproszona inwazja sprawia, że guz jest szczególnie trudny do pełnej resekcji, a atakujące komórki rakowe, które pozostają po terapii, są najczęstszą przyczyną nieuniknionego nawrotu2,3,4. Wcześniej stwierdziliśmy, że hamowanie inwazji komórek glejaka rozlanego jest korzystne terapeutycznie5, jednak niewiele wiadomo o złożonych mechanizmach przyczyniających się do inwazji GBM. Mikrośrodowisko guza, czyli tkanka otaczająca nowotwór, jest zaangażowana w progresję nowotworów w wielu nowotworach6,7. W szczególności mikrośrodowisko guza glejaka jest stosunkowo słabo scharakteryzowane i jest wyjątkowo złożone, składa się z wielu komórek glejowych, takich jak astrocyty, mikroglej i oligodendrocyty, a także macierzy zewnątrzkomórkowej, czynników rozpuszczalnych i czynników biofizycznych. Eksperymentalnie wykazano, że astrocyty i mikroglej zwiększają progresję i inwazję glejaka8,9,10, ale skład wszystkich komórek glejowych w rodzimym mikrośrodowisku ludzkiego mózgu jest nieznany.
Wcześniej pokazaliśmy, że komponenty mikrośrodowiskowe mogą przewidywać przeżycie pacjenta, analizując ilościowo komponenty komórkowe mikrośrodowiska glejaka i włączając nasze analizy do modelu proporcjonalnego ryzyka11. W tym miejscu opisujemy metodę analizy ilościowej służącą do identyfikacji populacji komórek glejowych w masie guza i sąsiednich regionach resekcji guza od pacjentów z glejakiem. Użyliśmy immunohistochemii chromogennej do identyfikacji populacji komórek glejowych i ImageJ do analizy procentowego pokrycia barwienia dla każdej populacji glejowej. Ocena procentowego pokrycia tworzy prosty pomiar do określania różnic morfologicznych komórek, szczególnie tych dotkniętych interakcjami z komórkami nowotworowymi. Wcześniejsze badania nad ilościowym określaniem barwienia histopatologicznego wykorzystują standardowe barwienie, takie jak hematoksylina i eozyna12 lub Masson's trichrome13, które nie wykorzystują specyficzności barwienia immunohistochemicznego opartego na przeciwciałach. Nasza metoda została opracowana w celu bezpośredniego ilościowego określenia populacji glejowych w resekcjach guza u pacjentów z glejakiem, które zamierzamy wykorzystać do wyjaśnienia złożonego mikrośrodowiska glejaka.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Ten protokół identyfikuje składniki komórkowe w próbkach zatopionych w parafinie (FFPE) utrwalonych w formalinie, co jest typowe dla próbek pacjentów klinicznych przechowywanych w banku. Osadzanie parafiny pozwala na najlepsze utrzymanie morfologii komórek i tkanek, a także ma lepszą trwałość skrawków. Dostęp do próbek wykorzystanych do tej analizy uzyskano za pośrednictwem University of Virginia Biorepository and Tissue Research Facility. Próbki pacjentów zostały wybrane przez neuropatologa na podstawie ostatecznej diagnozy glejaka (gwiaździaka, IV stopień wg WHO), który przeszedł resekcje guza na Uniwersytecie Wirginii w latach 2010-2013 i zostały pozbawione identyfikacji przed tą analizą11.
1. Deparafinizacja i ponowne nawodnienie próbki FFPE
UWAGA: Ta część protokołu jest specyficzna dla próbek FFPE. Podczas gdy próbki zatopione w parafinie mogą być bardziej przydatne do tej analizy ze względu na zachowanie morfologii komórek i tkanek, analizę tę można również przeprowadzić w przypadku zamrożonych skrawków. W przypadku stosowania zamrożonych skrawków tę część można pominąć i przejść bezpośrednio do immunohistochemii chromogennej.
2. Pobieranie antygenu
UWAGA: Ta część protokołu jest niezbędna do przerwania mostków metylenowych powstałych podczas utrwalania formaliny w próbkach FFPE i odsłonięcia miejsc antygenowych do wiązania przeciwciał.
3. Immunohistochemia chromogenna
4. Identyfikacja regionów zainteresowania
5. Analiza obrazu
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Na potrzeby tej analizy, dwa obszary zainteresowania w obrębie naszych resekcji guza - masa guza pierwotnego i regiony przyległe, głównie składające się ze zdrowej tkanki z rozproszonymi atakującymi komórkami rakowymi (Rysunek 1A, 1B) - zostały zidentyfikowane przez współpracujących neuropatologów na próbkach pacjentów barwionych hematoksyliną i eozyną. W każdej próbce pacjenta zidentyfikowano dodatnie barwienie astrocytów (Figura 1...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Proponowana przez nas metoda to ilościowe podejście do analizy próbek histologicznych barwionych przy użyciu tradycyjnej immunohistochemii chromogennej. Obecna metodologia tego typu analizy obejmuje podobne protokoły barwienia, po których następuje klasyfikacja przez niezależnych patologów. Metoda ta okazała się niezawodna, jednak w przypadku wielu zastosowań wymagane jest bardziej precyzyjne zrozumienie składu komórkowego, takie jak lepsze zrozumienie heterogeniczności związanej z nowotworami i dokładna rekapitulacja gu...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Autorzy dziękują doktorom Fahadowi Bafakihowi i Jimowi Mandellowi za pobranie i identyfikację próbek od pacjentów, Garrettowi F. Beeghly'emu za pomoc w immunohistochemii, a także Biorepository and Tissue Research Facility, Cardiovascular Research Center Histology Core oraz Biomolecular Analysis Facility na University of Virginia za pomoc w pozyskiwaniu próbek, immunohistochemii i obrazowaniu.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Xylene | Fisher Chemical | X3P | |
| Etanol | |||
| Roztwór demaskujący antygen o wysokim pH | Vector Labs | H-3301 | |
| TBS | |||
| Triton-X | Amresco | 9002-93-1 | |
| Surowica | |||
| Anti-ALDH1L1 | ABCAM | ab56777 | |
| Anty-Iba1 | ABCAM | ab5076 | |
| Białko specyficzne dla anty-oligodendrocytów1 | ABCAM | ab53041 | |
| ImmPRESS anti-goat | Vector Labs | MP-7405 | |
| ImmPRESS Universal (anty-myszy/królika) | Vector Labs | MP-7500 | |
| Nadtlenek wodoru | Sigma Aldrich | 216763 | |
| ImmPACT Podłoże DAB | Vector Labs | SK-4105 | |
| Barwnik hematoksylinowy | ThermoScientific | 72404 | |
| Nośnik montażowy Histochoice | Amresco | H157-475 | |
| Aperio Scanscope | Leica Biosystems | ||
| Image Scanscope | Leica Biosystems | ||
| Super HT PAP Pen | Research Products International | 195506 |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Poproś o pozwolenie na ponowne wykorzystanie tekstu lub ilustracji tego artykułu JoVE
Poproś o pozwolenie