Pęcznienie GUV
Stosując opisaną tutaj metodę spontanicznego pęcznienia, GUVs składające się z DOPG, eSM i Chol hodowano przez noc w 210 mM sacharozy lub 100 mM NaCl, 10 mM Tris, pH 7.5, co doprowadziło do powstania widocznego agregatu. Odzyskanie agregatu zapewnia wysoką wydajność pęcherzyków. Resuspensja w roztworze pęczniejącym skutkowała symetrycznymi warunkami roztworów po obu stronach błony. Aby stworzyć warunki asymetryczne, agregat resuspendowano odpowiednio w izoosmolarnej sacharozie lub roztworze o wysokim zasoleniu (Rysunek 2). Wynikające z tego rozcieńczenie odpowiada quasi-zewnętrznej wymianie roztworu przy jednoczesnym zminimalizowaniu rozcieńczenia liczby GUVs.
Mapowanie diagramu fazowego GUV za pomocą mikroskopii fluorescencyjnej
Obecność 0,1 mol% specyficznego dla fazy DiIC18 w GUV umożliwiła obserwację ich stanów fazowych za pomocą szerokopolowej mikroskopii fluorescencyjnej. Pęcherzyki wykazujące separację faz S+L obserwowano przy użyciu obiektywu 63x/1,2NA, aby móc rozdzielić drobno ustrukturyzowane domeny o kształcie palców. We wszystkich pozostałych przypadkach stosowano obiektyw 40x/0,6 NA. Aby uniknąć artefaktów podczas wizualnej inspekcji GUV oraz zmaksymalizować powtarzalność, określono kryteria decydujące o tym, które pęcherzyki uwzględnić w analizie stanu fazowego (krok protokołu 3.6).
GUV przygotowane z trójskładnikowych mieszanin DOPG/eSM/Chol o szerokim zakresie stosunków, napęczniałe w sacharozie lub roztworze o wysokim zasoleniu i obserwowane w temperaturze pokojowej, wykazywały homogeniczne fazy Lo lub Ld, rozdział faz Lo+Ld oraz S+L, patrz Rycina 3. Rycina 9 przedstawia przykładowe pęcherzyki z defektami, których nie należy uwzględniać w analizie danych, a także pokazuje sposób identyfikacji pęcherzyków wielowarstwowych.
Ze względu na nieznaną historię, GUV prawdopodobnie wykazują zmienność składu w obrębie partii35. W związku z tym ogólny stan fazowy konkretnego składu określano metodą statystyczną. Populacje GUV o określonym składzie lipidowym przypisywano do stanu fazowego, który dominował w losowej próbce (krok protokołu 3.6). Jednak składniki bliskie obszarowi koegzystencji Lo+Ld często dawały partie, w których dominujący stan fazowy stanowił niewielką większość. W takich niejednoznacznych przypadkach inspekcję wizualną powtarzano na co najmniej trzech niezależnych próbkach. Ułamek pęcherzyków o identycznym stanie fazowym (np. wykazujących separację faz Lo+Ld) obecnych w losowych próbkach uśredniano z liczby prób, co przyjmowano jako wynik końcowy (Rycina 10).
Opisane protokoły pozwoliły na uzyskanie wystarczającego wzrostu GUV w szerokim zakresie różnych proporcji DOPG, eSM i Chol w roztworach o wysokim zasoleniu oraz w roztworach sacharozy. Pod warunkiem zastosowania symetrycznych, jak i asymetrycznych warunków roztworu o wysokim zasoleniu, udało się wyznaczyć rozległe obszary w trójskładnikowym wykresie fazowym (Rycina 11). Różnice w zachowaniu fazowym pęcherzyków zaobserwowane w różnych warunkach roztworu zostały szczegółowo omówione w innym opracowaniu9.
Obserwacje zachowania fazowego po całkowitej wymianie buforu z wykorzystaniem metody mikrofluidycznej
Tworzenie asymetrycznych warunków roztworu poprzez rozcieńczanie prowadzi do pozostania pozostałości roztworu pęczniejącego na zewnątrz. Nasze podejście mikrofluidyczne umożliwia całkowitą wymianę roztworu zewnętrznego. Rysunek 5A przedstawia urządzenie mikrofluidyczne w pełni zmontowane na stole mikroskopu konfokalnego wraz z wylotem fluidycznym i wlotami do kontroli ciśnienia. Probówki są połączone za pomocą metalowych rurek pod kątem 90 °, aby zapewnić miejsce dla obrazowania w świetle przechodzącym z góry.
Do obserwacji wewnątrz urządzenia mikrofluidycznego wykorzystano mikroskop konfokalny z obiektywem imersyjnym wodnym 63x/1.2NA. Podobnie jak w przypadku wcześniejszych obserwacji w objętości, do barwienia błony użyto DiIC18. Podczas obserwacji stanu fazowego GUV uwięzionych w urządzeniu należy uważać, aby nie błędnie zinterpretować danych. Ze względu na bliskość GUV względem słupków, drogi światła wzbudzenia i emisji mogą być częściowo blokowane przez PDMS, co prowadzi do fałszywego wrażenia obecności domen (Rycina 12). W tym przypadku przydatna jest detekcja światła przechodzącego, aby sprawdzić położenie GUV przy słupkach. Ten niepożądany efekt jest szczególnie wyraźny w przypadku małych GUV o średnicy mniejszej niż 10 µm. W takich sytuacjach dane zostały odrzucone. Obraz konfokalny na Rycini 13A pokazuje płaski przekrój pęcherzyka, który przecina domenę Lo obecną na pęcherzyku GUV. W tym przypadku płaskie skany przekroju wykonane powyżej lub poniżej tej sekcji nie wykazałyby domeny ze względu na jej niewielki rozmiar w porównaniu z rozmiarem GUV, co mogłoby doprowadzić do pominięcia domeny i uznania pęcherzyka za znajdujący się w jednorodnym stanie fazowym. Dlatego w celu zbadania całej powierzchni GUV należy zastosować konfokalny z-stack. W przypadku mikroskopii szerokopolowej może to nie być problemem, ponieważ cały pęcherzyk można obrazować jednocześnie.
Na koniec przedstawiono przykłady GUV przed i po wymianie roztworu zewnętrznego, na których wyraźnie widać stany fazowe membran (Rysunek 14). Każde urządzenie posiada 60 komór (każda z parą słupków do wychwytywania pojedynczej GUV), co umożliwia przeprowadzenie dziesiątek eksperymentów na jednym urządzeniu (patrz Rysunek 4). Jednak niektóre GUV mogą zostać utracone podczas wymiany roztworu zewnętrznego. Można to zminimalizować poprzez następujące kroki: 1) Zastosowanie powłoki z albuminy surowicy bydlęcej (BSA) w celu zapobiegania adhezji/pękaniu GUV na słupkach; powlekanie odbywa się poprzez wystawienie ścianek komory na działanie 20 mg/mL BSA przez 60 min i następne płukanie buforem roboczym. Inną cząsteczką adhezyjną, którą można zastosować, jest poly(L-lysine)-graft-poly(ethylene glycol)39. 2) Staranne dopasowanie osmotyczne roztworów wewnętrznego i zewnętrznego, aby uniknąć powstania wiotkich GUV, które mogłyby przejść przez środek słupków, lub pękania GUV. 3) Optymalizacja procedury przygotowania GUV w celu uzyskania pęcherzyków o średnicy większej niż ~8 µm, aby zapobiec ich przechodzeniu przez środek słupków.
Projektowanie i charakterystyka komory z kontrolą temperatury do obserwacji stanów fazowych GUV
Zaprojektowaliśmy prostą komorę przepływową, która posiada przyłącza do zewnętrznego termostatu wodnego (Rysunek 6). Komorę wykonaliśmy poprzez frezowanie bloku aluminium. Generalnie materiał komory nie musi być przewodzący ciepło, ponieważ próbka jest sprzężona z łaźnią wodną za pomocą dolnego szkiełka podstawowego, jak pokazano na Rysunku 6B i 6C.
Niezależnie od dokładnej konstrukcji, należy ocenić wydajność komory. W szczególności sprawdzono liniowość temperatury próbki w stosunku do temperatury ustawionej zewnętrznie, ewentualne systematyczne przesunięcie temperatury oraz gradient temperatury wewnątrz komory. Dwa pierwsze punkty zweryfikowano poprzez bezpośredni pomiar temperatury w komorze za pomocą światłowodowej sondy temperatury (np. FISO FTI-10). Sprawdzono również występowanie gradientu temperatury w zawiesinie GUV. Taki gradient mógłby wynikać z przepływu ciepła na zewnątrz komory. Pomiary temperatury z rozdzielczością przestrzenną można uzyskać za pomocą fluoroforu wrażliwego na temperaturę40, patrz Rysunek 7.
Wykresy danych i dopasowanie w celu wyznaczenia Tmix fazowo rozdzielonych GUV
Wykreślenie frakcji jednorodnych GUV w obserwowanym zakresie temperatur zaowocowało trajektorią punktów danych o kształcie sigmoidalnym. Dane dopasowano do modelu Boltzmanna (sekcja protokołu 6.8), z którego można było wywieść Tmix (Rycina 8).

Rycina 1: Kroki eksperymentalne podczas protokołu spontanicznego pęcznienia (górny panel) wraz z odpowiadającym im etapem wzrostu pęcherzyków (dolny panel). (A) Homogenny film lipidowy zostaje naniesiony na chropowatą płytkę PTFE i osuszony z rozpuszczalnika. (B) Wysuszony film lipidowy jest następnie wstępnie pęczniony w atmosferze nasyconej wodą w zamkniętym pojemniku z wodą, aby ułatwić hydratację dwuwarstwy. Pusta fiolka szklana zawiera płytkę PTFE i pozostaje otwarta podczas tego etapu hydratacji. (C) Wstępnie spęczniony film lipidowy zostaje ostatecznie w pełni hydratowany poprzez dodanie odpowiedniego roztworu pęczniącego na pokrytą lipidami płytkę PTFE wewnątrz szklanej fiolki. Aby uniknąć odparowania, fiolka szklana jest szczelnie zamknięta podczas inkubacji nocnej. Aby zminimalizować różnice w składzie w obrębie jednej partii, wszystkie kroki muszą być wykonywane w temperaturze, w której mieszanina lipidowa jest w pełni mieszalna. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 2: Pozyskiwanie GUV. (A) Osadzona warstwa lipidowa składająca się z DOPG/eSM/Chol w stosunkach molowych 20/60/20 z dodatkiem 0,1 mol% DiIC18 pęczniało w buforze o wysokim zasoleniu, składającym się ze 100 mM NaCl i 10 mM Tris (pH 7,5). Pokrywka szklanego naczynia została dodatkowo uszczelniona folią parafinową. Powiększony obszar zainteresowania zawiera powstały agregat GUV. Jego czerwony kolor wynika z obecności DiIC18. (B) GUV-y pobrano za pomocą przyciętej końcówki pipety. Na tym obrazie agregat został pobrany pipetą wraz z 50 µL roztworu pęczniejącego, które przeniesiono do nowej fiolki. (C) Aby stworzyć asymetryczne warunki roztworu transbłonowego, agregat rozcieńczono w innym izotonicznym roztworze zewnętrznym. W tym przypadku agregat wraz z 50 µL roztwór pęczniejący zawieszono ponownie w 950 µL roztwór sacharozy, co daje 20-krotne rozcieńczenie roztworu pęczniejącego. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 3: Obrazowanie GUV. Obrazy fluorescencyjne w szerokim polu GUV domieszkowanych 0,1 mol% DiIC18 przygotowane i obserwowane w symetrycznych roztworach soli lub sacharozy, składających się z różnych proporcji DOPG, eSM i Chol (w buforze solnym, od lewej do prawej: 40/20/40; 50/20/30; 30/60/10; w sacharozie, od lewej do prawej: 30/30/40; 20/60/20; 40/50/10). Obrazy przedstawiają GUV w różnych (współistniejących) stanach fazowych, ocenionych zgodnie z kryteriami opisanymi w kroku 3.6 protokołu. Obrazowanie pęcherzyków wykonano przy użyciu obiektywu 40X/0.6 NA. Paski skali = 5 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 4: Układ projektu kanału mikroprzepływowego. GUV wnikają do dolnej warstwy przepływowej (kanały obrysowane) poprzez wlot poniżej zbiornika. Filtr blokuje niepożądane zanieczyszczenia przed dostaniem się do urządzenia. Następnie wnikają one do macierzy 60 komór (8 rzędów i 15 kolumn), z których każda zawiera filary do wychwytywania pojedynczych GUV (patrz wstawka). Każda komora może zostać odizolowana za pomocą zaworu pierścieniowego sterowanego przez warstwę kontrolną (wypełnione na czarno kanały) znajdującą się powyżej warstwy przepływowej. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 5: Urządzenie mikrofluidyczne. (A) Fotografia urządzenia mikrofluidycznego używanego do chwytania pojedynczych GUV oraz całkowitej wymiany roztworu zewnętrznego. Etykiety wskazują zbiornik do dodawania roztworów (1), 8 wlotów ciśnienia połączonych z jednostką sterowania ciśnieniem (2) oraz wylot cieczy połączony ze strzykawką i pompą (3). Panel (B) przedstawia jednostkę sterowania ciśnieniem wyposażoną w 8 zaworów, z których każdy reguluje jedną rurkę połączoną z urządzeniem mikrofluidycznym. Tutaj zawory nr 1 i nr 2 są otwarte, a co za tym idzie, odpowiadające im zawory pierścieniowe są zamknięte. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 6: Komora kontroli temperatury. (A) Komora przed montażem. (B) Zmontowana komora (skierowana w górę) z przyklejonymi do góry i do dołu szkiełkami nakrywkowymi o grubości 2 mm. Pomarańczowy gumowy dystans ma wysokość 0,5 mm i jest uszczelniony szkiełkiem nakrywkowym o grubości 0,17 mm w celu obserwacji zamkniętej zawiesiny GUV. Na tym zdjęciu, w celu kalibracji, wstawiono sondę temperatury (brązowe włókno wychodzące z komory po prawej stronie). (C) Końcowy montaż na stoliku mikroskopu odwróconego bez sondy temperatury. Pomarańczowy gumowy dystans jest teraz skierowany w dół. Guma jest wystarczająco lepka, aby utrzymać próbkę na miejscu. Należy zauważyć, że światło może przenikać przez próbkę, co umożliwia obserwacje zarówno w epifluorescencji, jak i w polu jasnym. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 7: Przestrzennie rozdzielcze dane temperaturowe wewnątrz komory obserwacyjnej uzyskane za pomocą pomiarów FLIM barwnika wrażliwego na temperaturę (tutaj: 500 µM Rodaminy B)40. Punkty danych uzyskane w odległości 0, 10, 30, 300 i 400 µm nad dolnym szkiełkiem podstawowym. Czerwone i niebieskie punkty danych zmierzono dla temperatury kąpieli wodnej ustawionej odpowiednio na 30 °C i 12 °C. Czarne punkty danych wskazują kąpiel wodną pozostawioną do wyrównania z temperaturą pokojową. Zaobserwowano niewielkie wahania temperatury w całej komorze, które jednak pozostały poniżej 0.5 °C (szare słupki). Całkowita wysokość komory wynosi około 500 µm zgodnie z grubością dystansera (patrz wyżej). Słupki błędów wskazują odchylenia standardowe. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 8: Wyznaczanie temperatury mieszalności. Wykres przedstawia poszczególne punkty danych dotyczące frakcji jednorodnych (jednofazowych) GUV przygotowanych z DOPG/eSM/Chol w stosunku 30/40/30 z dodatkiem 0,1 mol% DiIC18 z trzech niezależnych próbek losowych (N = 20 - 40). Słupki błędów reprezentują błąd standardowy średniej. Punkty danych dopasowano do modelu Boltzmanna opisanego w kroku 6.8 (ciągła czarna linia), z którego wyznaczono temperaturę mieszania domen Tmix (podążając ciągłą czerwoną linią do osi odciętych) zgodnie z połową maksimum krzywej sigmoidalnej na osi rzędnych (przerywana czarna linia). Wartości początkowe i końcowe (A1 i A2) ustalono odpowiednio na 0 i 1. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.

Rycina 9: Wadliwe pęcherzyki. Przykłady olbrzymich pęcherzyków przygotowanych z mieszaniny 20/60/20 DOPG/eSM/Chol i domieszkowanych 0,1 mol% DiIC18, które nie spełniają kryteriów określonych w kroku 4.2, obrazowane za pomocą szerokopolowej mikroskopii fluorescencyjnej. Zakresy wyświetlania intensywności poszczególnych obrazów były za każdym razem optymalizowane pod kątem intensywności fluorescencji przedstawionego pęcherzyka. Ze względu na obecność dodatkowego materiału błonowego i enkapsulowanych mniejszych pęcherzyków, stan fazowy pęcherzyka na zdjęciu (A) nie może zostać jednoznacznie określony. Wygląd tego olbrzymiego pęcherzyka nie pozwala na przeprowadzenie wiarygodnej wizualnej oceny lamelarności. Panel (B) przedstawia pęcherzyk, którego wnętrze jest wypełnione materiałem błonowym. W konsekwencji sygnał fluorescencyjny zewnętrznej błony pęcherzyka nakłada się na sygnał wewnętrzny, co uniemożliwia wizualizację lamelarności i potencjalnych domen. (C) Intensywności fluorescencji trzech różnych olbrzymich pęcherzyków pokazane są w bezpośrednim porównaniu w tym samym zakresie intensywności wyświetlania. Obraz ten pokazuje, że olbrzymie pęcherzyki wielolamelarne (1, 2) można zidentyfikować po zwiększonym sygnale fluorescencyjnym w porównaniu do GUV (3). W tym przypadku zarówno wielolamelarne, jak i jednolamelarne olbrzymie pęcherzyki wykazują rozdział faz Lo+Ld. Pęcherzyki na wszystkich obrazach były obrazowane za pomocą obiektywu 40x/0,6 NA. Paski skali = 5 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 10: Odsetek GUV z separacją faz Lo+Ld uśredniony z co najmniej trzech niezależnych prób. Pęcherzyki składały się z mieszaniny 30/40/30 DOPG/eSM/Chol, bliskiej granicy regionu współistnienia Lo+Ld. Słupki błędów dla symetrycznych warunków z sacharozą ilustrują rozrzut między partiami. Opis osi rzędnych określa roztwory wewnątrz/na zewnątrz pęcherzyków; sucrose: 210 mM sacharozy; salt: 100 mM NaCl, 10 mM Tris, pH 7.5; Słupki błędów oznaczają odchylenia standardowe. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.

Rysunek 11: Diagram fazowy GUV przygotowanych z DOPG, eSM i Chol, sporządzony dla różnych warunków roztworu przy użyciu 210 mM sacharozy (sucrose) oraz 100 mM NaCl, 10 mM Tris, pH 7.5 (salt). Stany fazowe GUV badano w układach sacharoza/sacharoza (A; górna sekcja), sacharoza/sól (wewnątrz/na zewnątrz) (A; dolna sekcja wielokątna), sól/sól (B; górna sekcja) oraz sól/sacharoza (B; dolna sekcja wielokątna). Schematy ilustrują dominujący wzór domen w zaznaczonych sekcjach oraz odpowiadające im warunki roztworu. Stany fazowe pęcherzyków przedstawione w dolnych sekcjach wielokątnych zaobserwowano w asymetrycznych warunkach roztworu po 20-krotnym rozcieńczeniu GUV. Adaptacja z referencji9. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 12: Artefakty w uwięzionych GUV. Przykład małego GUV, w którym widoczna jest fałszywa domena wynikająca z bliskiego sąsiedztwa słupków (DOPG/eSM/Chol 60/20/20). Obraz w świetle przechodzącym (pole jasne) ukazujący słupki (szare) jest nałożony na konfokalny obraz fluorescencyjny GUV (pomarańczowy). W obrazie w polu jasnym widoczne jest tworzenie przez słupki wzoru interferencyjnego. Sygnał fluorescencji w pobliżu słupków (po prawej) jest osłabiony, co stwarza wrażenie separacji faz. Pasek skali = 5 µm.

Rycina 13: Przykłady dwóch różnych GUV schwytanych przez słupki PDMS, w których wyraźnie widoczne są stany fazowe. (A) Pęcherzyk z separacją faz Lo + Ld wykonany z DOPG/eSM/Chol 60/20/20. (B) Pęcherzyk wykonany z 40/30/30 wykazujący jednofazowość Ld lub Lo. W celu potwierdzenia braku domen (poza ogniskową) zbadano konfokalny stos obrazów z (z-stack) całego pęcherzyka. Krawędzie słupków są widoczne po prawej stronie obrazów (szare). Pasek skali = 5 µm.

Rysunek 14: Wynikowe zachowanie fazowe po całkowitej wymianie płynu za pomocą urządzenia mikrofluidycznego. Przedstawiono ten sam GUV przed i po wymianie roztworu dla (A) przejścia z symetrycznego układu sól/sól (wewnątrz/zewnątrz) na sól/sucroza (wewnątrz/zewnątrz) (DOPG/eSM/Chol 60/20/20, pasek skali 2 µm) oraz (B) przejścia z symetrycznego układu sucroza/sucroza (wewnątrz/zewnątrz) na sucroza/sól (wewnątrz/zewnątrz) (DOPG/eSM/Chol 30/40/30, pasek skali = 3 µm). Dostosowano z referencji9.