W niniejszej pracy opisano metodę generowania systemów modelowych komórek raka prostaty opornych na docetaksel, która pozwala na badanie mechanizmów przyczyniających się do nabycia fenotypu chemooporności. Chociaż podejście to jest wysoce wiarygodne i powtarzalne, należy wziąć pod uwagę pewne potencjalne ograniczenia. Ponieważ tylko niewielka część masowej populacji komórek będzie wykazywać chemooporność28, zaleca się rozpoczęcie od dużej populacji komórek (zwykle podajemy 20 kolb po 150 cm2, co stanowi około 1,2 x 108 komórek). Aby zapewnić powodzenie procedury, należy rozważyć kluczowe etapy protokołu. Po pierwsze, bardzo ważne jest, aby używać tego samego świeżo przygotowanego wywaru Docetakselu do długotrwałego stosowania (10 mM porcji wyjściowych może być używane przez lata, jeśli są prawidłowo przechowywane w temperaturze -80 °C). Niewielkie zmiany w podwielokrotności docetakselu mogą mieć wpływ na wyniki IC50, czas wytwarzania linii komórkowej i wyniki tworzenia kolonii. Po drugie, ważne jest, aby rozpocząć protokół określający IC50 w każdej pojedynczej linii komórkowej, ponieważ przy użyciu nowej partii komórek mogą wystąpić różnice. Po trzecie, konieczne jest monitorowanie skuteczności leczenia farmakologicznego poprzez częste sprawdzanie komórek pod mikroskopem, aby można było szybko wykryć i skorygować wszelkie błędy. Na koniec zalecamy, aby zawsze mieć zapas etapów pośrednich na wypadek zanieczyszczenia lub nieoczekiwanych problemów, które mogą wpłynąć na żywotność komórek w trakcie trwania protokołu. Co ważne, nasz protokół ma na celu wygenerowanie modeli oporności na leki poprzez wystawienie komórek raka prostaty na działanie wysokich dawek docetakselu przez 72 godziny, po których następują długie okresy rekonwalescencji, a nie niższe stałe stężenia leku, próbując naśladować najlepszy scenariusz kliniczny zgłoszony w leczeniu raka prostaty za pomocą tego taksanu15,16.
Dodatkowo należy zauważyć, że ogniwa lekooporne wykazują dużą plastyczność, co może prowadzić do postępującej w czasie utraty nabytych właściwości oporności. Dlatego nie zaleca się przedłużania stosowania tych komórek na więcej niż 2-3 miesiące w hodowli. Jeśli potrzebne jest stałe zasilanie, zaleca się ciągłe wytwarzanie nowych partii odpornych ogniw. Jeśli jednak partie komórek były hodowane przez dłuższy czas, testy tworzenia kolonii i qPCR można zastosować do ponownej oceny ich odporności. Inną alternatywą jest zwiększenie słabnącej odporności poprzez traktowanie komórek wysoką dawką docetakselu przez 72 godziny (500-1000 nM). Po okresie rekonwalescencji trwającym od jednego do dwóch tygodni fenotyp można ponownie przetestować za pomocą qPCR i testów tworzenia kolonii. Możliwe jest również, choć nie jest to zalecane, przechowywanie podwielokrotności traktowanych komórek w ciekłym azocie (w FBS, 10% DMSO). Należy pamiętać, że po cyklu zamrażania i rozmrażania fenotyp chemooporności powinien być zawsze ponownie oceniany za pomocą wyżej wymienionych metod.
Pomimo tych zastrzeżeń, my28,29 i inni 30,31,32,33 byliśmy w stanie z powodzeniem zastosować te systemy modelowe do identyfikacji kluczowych nowych mechanizmów komórkowych i molekularnych prowadzących do zwiększonej zdolności inicjowania nowotworu, przeżycia komórek i agresywności w komórkach opornych na docetaksel. Korzystając z tych systemów modelowania komórek rakowych, odkryliśmy, że komórki wykazujące niezróżnicowany fenotyp, charakteryzujący się brakiem markerów różnicowania nabłonka i prostaty oraz nadekspresją docelowych szlaków sygnałowych rozwojowych (Notch i Hedgehog), przeżywają ekspozycję na chemioterapię28. W drugim badaniu, wykorzystując te modele wraz z publicznie dostępnymi zestawami danych genów pacjenta24,25, odkryliśmy, że pionierski czynnik transkrypcyjny GATA2 jest wysoce nadeksprymowany w przerzutowych, opornych na chemioterapię komórkach raka prostaty. GATA2 zwiększa przeżywalność komórek poprzez bezpośrednią aktywację zależnej od IGF2 sieci sygnalizacyjnej kinazy29. Warto zauważyć, że badania te pomogły zidentyfikować nowe kluczowe role GATA2 w agresywności zaawansowanego raka gruczołu krokowego z przerzutami34.
Rozwój oporności na leki jest problemem, który nie ogranicza się do docetakselu i raka prostaty, ponieważ jest on powszechny wśród wielu innych rodzajów nowotworów leczonych szeroką gamą leków chemioterapeutycznych. Rzeczywiście, obowiązują podobne ograniczenia w dostępności modeli eksperymentalnych i można sobie wyobrazić, że nasz protokół może zostać dostosowany do badania innych typów nowotworów i ich odpowiednich mechanizmów chemooporności.
Generacja komórek opornych na docetaksel, opisana w niniejszym protokole, może być wykorzystana jako funkcjonalne narzędzie do identyfikacji nowych, istotnych molekularnych i komórkowych mechanizmów chemooporności. Otwiera to drzwi do znalezienia nowych celów, na których może opierać się opracowanie nowych metod leczenia wysoce złośliwego raka prostaty, po raz kolejny przesuwając granice tego, co wiemy o tej chorobie i o tym, jak leczymy jej pacjentów.