Caenorhabditis elegans (C. elegans) jest dobrym modelem do badania transportu aksonalnego i wewnątrzkomórkowego. W tym miejscu opisuję protokół rejestracji i analizy in vivo transportu aksonalnego i wewnątrzwiciowego u C. elegans.
Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.
Artykuł metodologiczny
Caenorhabditis elegans (C. elegans) jest dobrym modelem do badania transportu aksonalnego i wewnątrzkomórkowego. W tym miejscu opisuję protokół rejestracji i analizy in vivo transportu aksonalnego i wewnątrzwiciowego u C. elegans.
Transport aksonalny i transport wewnątrzwiciowy (IFT) są niezbędne dla morfogenezy i funkcji aksonów i rzęsek. Białka nadrodziny kinezyny i dyneina to silniki molekularne, które regulują odpowiednio transport następczy i wsteczny. Silniki te wykorzystują sieci mikrotubul jako szyny. Caenorhabditis elegans (C. elegans) jest potężnym organizmem modelowym do badania transportu aksonalnego i IFT in vivo. W tym miejscu opisuję protokół obserwacji transportu aksonalnego i IFT u żyjących C. elegans. Przewożony ładunek można wizualizować poprzez znakowanie białek ładunku za pomocą białek fluorescencyjnych, takich jak białko zielonej fluorescencji (GFP). C. elegans jest przezroczysty, a białka ładunkowe znakowane GFP mogą ulegać ekspresji w określonych komórkach pod promotorami specyficznymi dla komórki. Żywe robaki można utrwalić za pomocą mikrogranulek na 10% żelu agarozowym bez zabijania lub znieczulania robaków. W tych warunkach ruch ładunku można bezpośrednio zaobserwować w aksonach i rzęskach żyjących C. elegans bez sekcji. Metodę tę można zastosować do obserwacji dowolnej cząsteczki ładunku w dowolnych komórkach poprzez modyfikację docelowych białek i/lub komórek, w których ulegają one ekspresji. Większość podstawowych białek, takich jak silniki molekularne i białka adaptorowe, które biorą udział w transporcie aksonalnym i IFT, jest konserwatywna w C. elegans. W porównaniu z innymi organizmami modelowymi, mutanty mogą być łatwiej pozyskiwane i utrzymywane u C. elegans. Połączenie tej metody z różnymi mutantami C. elegans może wyjaśnić mechanizmy molekularne transportu aksonalnego i IFT.
Obrazowanie żywych komórek jest niezbędnym narzędziem do analizy transportu wewnątrzkomórkowego. W biologii komórki neuronalnej analizy transportu aksonalnego z obrazowaniem żywych komórek są niezbędne do zrozumienia funkcji neuronów i morfogenezy1. Zaburzenia transportu aksonalnego leżą u podstaw kilku zaburzeń neurodegeneracyjnych2. Białka nadrodziny kinezyny i dyneina przeprowadzają transport aksonalny odpowiednio w przód i w tył1,2.
Rzęski to kolejny przedział komórkowy, w którym sieć mikrotubul i maszyneria transportowa są bardzo rozwinięte3. Maszyneria syntezy białek nie jest zlokalizowana w rzęskach, co oznacza, że białka rzęskowe muszą być transportowane z cytoplazmy do końcówek rzęsek. Kinezyna i dyneina specyficzne dla rzęsek, zwane odpowiednio kinezyną-2 i cytoplazmatyczną dyneiną-2, transportują składniki rzęsek4, w zjawisku zwanym transportem wewnątrzrzęskowym (IFT)5. Upośledzenie IFT powoduje spektrum chorób zwanych ciliopatiami6. W związku z tym analiza mechanizmu IFT za pomocą obrazowania żywych komórek jest wymagana do zrozumienia podstawowych mechanizmów tworzenia i patogenezy rzęsek.
Caenorhabditis elegans (C. elegans) jest dobrym modelem do badania transportu aksonalnego i IFT7,8,9. Do obserwacji IFT, Chlamydomonas jest szeroko stosowany jako organizm modelowy5,6. Ponieważ Chlamydomonas jest organizmem jednokomórkowym, związek IFT ze starzeniem się, funkcjonowaniem neuronów i zachowaniem byłby trudny do przeanalizowania. Ponadto podstawowe techniki genetyczne, takie jak CRISPR/Cas9, nie zostały zastosowane do Chlamydomonas. W organizmach modelowych o wyższym poziomie, takich jak myszy i Drosophila, zakłócenie transportu aksonalnego i IFT często powoduje fenotypy letalne, ponieważ transport aksonalny i IFT są niezbędne dla morfogenezy i homeostazy zwierząt 10,11. W przypadku myszy hodowla komórkowa i transfekcja są zazwyczaj potrzebne do obserwacji transportu aksonalnego i IFT, co wymaga wielu umiejętności i dużo czasu12,13. Ponadto wiele ważnych kontekstów fizjologicznych może zostać utraconych w hodowanych komórkach i liniach komórkowych. Ponieważ układ nerwowy nie jest niezbędny do przetrwania robaków, mutanty C. elegans, u których transport aksonalny lub IFT są zakłócone, często nie są śmiertelne7,9,14. Transport aksonalny i IFT można bezpośrednio obserwować in vivo bez preparacji, ponieważ C. elegans jest przezroczysty i dlatego łatwo jest zaobserwować markery znakowane GFP.
Istnieje kilka protokołów do unieruchamiania C. elegans, takich jak użycie urządzenia mikroprzepływowego15, podkładki agarozowe ze znieczuleniem16, lub mikrogranulki17. Włączenie znieczulenia może zahamować zdarzenia związane z transportem w neuronach15. Wyraźną wadą metody mikroprzepływowej jest to, że przygotowanie urządzenia mikroprzepływowego nie zawsze jest łatwe. Zamiast tego unieruchomienie za pomocą opuszków agarozowych i mikrogranulek jest wygodnym i łatwym sposobem wykonywania obrazowania poklatkowego u C. elegans. Tutaj opisuję ten podstawowy protokół unieruchamiania C. elegans i wizualizacji transportu aksonalnego i IFT in vivo u C. elegans. W porównaniu z innymi metodami, opisana tutaj metoda nie wymaga specjalnego sprzętu i jest znacznie tańsza i łatwiejsza do wykonania.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
1. Przygotowanie próbki
2. Przygotowanie 10% agarozy
UWAGA: Wielu sprzedawców oferuje podobne produkty, takie jak agar, proszki agarowe i agaroza. Użyj agarozy klasy do elektroforezy (moc żelu >1200 g/cm2). Tanie proszki agarowe nie działają, ponieważ powstały żel nie jest wystarczająco silny, aby unieruchomić robaki.
3. Przygotowanie podkładki agarozowej
4. Montaż robaków
UWAGA: Nawet niewielkie ruchy robaków uniemożliwiają dobrą obserwację. Lewaizol był tradycyjnie stosowany w celu zapobiegania przemieszczaniu się robaków na podkładce agarozowej24,25. Jednak lewamizol hamuje receptory neuronalne u C. elegans, a zatem może wpływać na zdarzenia związane z transportem w neuronach15. Użycie opisanych tutaj mikrogranulek polistyrenowych jest dobrą alternatywą17.
5. Obserwacja
UWAGA: Odpowiednie parametry obrazowania (moc lasera, wzmocnienie, binning, itp.) będą się różnić dla każdego systemu mikroskopu i kamery. W tym przypadku używany jest mikroskop szerokokątny wyposażony w skaner konfokalny z wirującym dyskiem i cyfrową kamerę CCD.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Transport aksonalny w neuronie DA9
Wykorzystując linię wyIs251 , można jednocześnie rejestrować anterogradny i retrogradny transport aksonalny GFP::RAB-3 w motoneuronie DA9. Średnia prędkość transportu anterogradnego i retrogradnego w proksymalnym grzbietowym aksonie neuronu DA9 wynosi odpowiednio około 1,8 i 2,6 μm/s22. Liczba poruszających się pęcherzyków wynosi około 0,03 i 0,018 na μm aksonu na s. Zatem podczas 30 s obserwacji 10 ...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Ograniczenia w stosunku do istniejących metod
Opisana tutaj metoda jest zoptymalizowana pod kątem obserwacji szybkich zdarzeń, takich jak transport aksonalny i IFT. W związku z tym unieruchomienie jest bardziej priorytetowe niż dłuższa inkubacja. Chociaż byliśmy w stanie obserwować zdarzenia związane z handlem przez co najmniej 20 minut bez znaczących zakłóceń, ta metoda może nie zawsze być odpowiednia do obserwowania powolnych zdarzeń wymagających dłuższych obserwacji, takich jak wydłużenie aksonów...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Autor nie ma nic do zdradzienia.
Autor bardzo dziękuje dr Asako Sugimoto (Uniwersytet Tohoku) za jej pomocną dyskusję. wyIs251 był hojnym darem od dr Kang Shena (Uniwersytet Stanforda). mnIs17 został dostarczony przez CGC, który jest finansowany przez Biuro Programów Infrastruktury Badawczej NIH (P40 OD010440). Prace te były wspierane przez granty JSPS KAKENHI #17H05010 i #16H06536 oraz fundację Daiichi Sankyo, Fundację Nauki o Mózgu i Fundację Naito.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Szkło przesuwne (76 x 26 mm) | Matsunami | S1111 | |
| Szkło nakrywkowe (22 x 40 mm) | Matsunami | C024401 | |
| Agaroza | Wako | 318-01195 | |
| Mikrokulki polistylenowe 0,1 mikrona | Polysciences | #00876 | |
| Blok grzewczy | TAITEC | 0063288-000 | Mikroskop CTU-mini |
| Mikroskop szerokokątny | Olympus | IX-71 | |
| Skaner z wirującym dyskiem | Skaner konfokalny z wirującym dyskiem | Yokogawa | CSU-X1 |
| Cyfrowa kamera CCD | Hamamatsu Photonics | C10600-10B | ORCA-R2 degitalna kamera CCD |
| Obiektyw obiektywu (x100, NA1.4) | Olympus | UPLSAPO 100XO | |
| Pipeta Pasteura (5 cali) | IWAKI | IK-PAS-5P | |
| Szklana rurka (średnica 1,5 cm x 10,5 cm) | IWAKI | 9820TST15-105NP | |
| TV9211: wyIs251 | Laboratorium Kang Shen | ||
| OTL11: mnIs17 | Ref. 27, 29 | N/A | SP2101 został skrzyżowany wstecznie z typem dzikim 6 razy |
| Mikroskop stereoskopowy | Carl Zeiss | 435064-9000-000 | STEMI 508 |
| Jednostka transluminacji lustra | Carl Zeiss | 435425-9010-000 | |
| drut platynowy (0,2 mm) | Nilaco Corporation | m78483501 | |
| Plastikowa miska 60 mm | Falcon | #351007 | |
| Fidżi | N/ | A N/A | |
| pożywka dla nicieni (NGM) | 1,7% (w/v) agaroza, 50mM NaCl, 0,25% (w/v) pepton, 1 mM CaCl2, 5 mg/ml cholesterolu, 25 mM KH2PO4, 1 mM MgSO4 |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.