Badania nad komórkami macierzystymi z wykorzystaniem jajników Drosophila znacznie się rozszerzyły od czasu pierwszej dokumentacji niszy komórek macierzystych1,2,3,4. Po opracowaniu narzędzi genetycznych do śledzenia linii, sekcje jajników Drosophila są powszechnie stosowane do badania linii komórek macierzystych i szlaków sygnałowych, które regulują utrzymanie, proliferację i los komórek macierzystych w niszy komórek macierzystych. Wiedza na temat tych szlaków sygnałowych może dostarczyć informacji na temat potencjalnych przyczyn nowotworów, które wywodzą się z nieprawidłowej aktywności komórek macierzystych5,6,7. Niedawno wykazano również, że somatyczne komórki macierzyste w jajniku Drosophila, znane jako pęcherzykowe komórki macierzyste (FSC), bardzo przypominają jelitowe komórki macierzyste ssaków w wielu aspektach ich organizacji8. Z tego powodu jajniki Drosophila są bardzo użytecznym systemem modelowym do badania zachowania komórek macierzystych.
Podczas gdy larwalne i dorosłe jajniki dostarczają wskazówek odpowiednio do wczesnego rozwoju komórek macierzystych i końcowej organizacji komórek macierzystych w niszy, jajnik poczwarki jest strukturą pośrednią, w której linia zarodkowa i komórki somatyczne reorganizują się i ustalają swoją tożsamość9,10. Chociaż w kilku badaniach analizowano aspekty rozwoju tkanek w jajniku poczwarki10,11,12,13, pozostają pytania dotyczące różnicowania i organizacji przestrzennej typów komórek jajnika podczas rozwoju poczwarki. W szczególności w tym okresie następuje specyfikacja FSC. Protokół ten przedstawia metodę preparowania i barwienia jajników poczwarki w pożądanych punktach czasowych - technikę, która może być wykorzystana w eksperymentach z biegiem czasu, które szczegółowo analizują rozwój jajnika poczwarki od larwy do stadium dorosłego.
Aby uwzględnić mały rozmiar, przezroczystość i niedostępność jajnika poczwarki w obrębie odwłoka poczwarki, protokół ten wykorzystuje narzędzia, takie jak specjalnie wykonana pipeta Pasteura z cienką końcówką do usuwania tkanki tłuszczowej z brzucha, która utrudnia dostęp przeciwciał do jajników. Przezroczyste, komorowe szkło nakrywkowe używane podczas barwienia przeciwciałami zapewnia lepszą widoczność poczwarek i łagodniejszą platformę do kołysania jajników na "Nutatorze". W oparciu o protokół sekcji jajników larwalnych autorstwa Maimona i Gilboa14, w początkowych etapach procedury barwienia zastosowano stosunkowo wysokie stężenie Triton X-100, aby zmaksymalizować przepuszczalność błony komórkowej i dostęp przeciwciał do komórek jajnika.