Helicobacter pylori to spiralny, Gram-ujemny, ludzki patogen żołądka, obecny we wszystkich populacjach na całym świecie, z wskaźnikami infekcji w krajach rozwijających się szacowanymi na rzędu 80%1. Chociaż większość osób zakażonych H. pylori przechodzi chorobę bezobjawowo, u niektórych rozwijają się poważniejsze choroby, od wrzodów trawiennych po raka żołądka2. Nowotwory związane z H. pylori charakteryzują się głównie złośliwymi zmianami w komórkach nabłonka (GEC) lub tworzeniem pozawęzłowych tkanek limfatycznych w żołądku, co prowadzi odpowiednio do gruczolakoraka żołądka lub chłoniaka tkanki limfatycznej związanej z błoną śluzową (MALT). H. pylori jest wysoce przystosowany do przetrwania w surowej niszy ekologicznej żołądka ze względu na obecność różnych czynników wirulencji i mechanizmów ułatwiających jego przyleganie, wzrost i metabolizm w tej niszy. W szczególności zjadliwe szczepy H. pylori posiadają 40 kb cag Wyspę Patogenicity (cagPAI), która koduje około 30 genów wymaganych do produkcji systemu wydzielania typu 4 (T4SS)3,4. CagSzczepy H. pylori PAI-dodatnie są związane z indukcją wyższych poziomów przewlekłego stanu zapalnego u gospodarza, który został uznany za niezbędny prekursor gruczolakoraka żołądka5.
Modele zwierzęce in vivo, szczególnie myszy, dostarczyły wielu informacji, umożliwiając badaczom zbadanie względnego wpływu czynników gospodarza, bakterii i środowiska na infekcję H. pylori i wynik choroby6. Badania wykazały wcześniej, że przedłużające się zakażenie H. pylori u myszy na tle genetycznym C57BL/6 powoduje rozwój przewlekłego zapalenia żołądka i atrofii gruczołów, które są cechami charakterystycznymi infekcji H. pylori7. Ponadto wykazano, że zakażenie pokrewnym gatunkiem bakterii kotów/psów, H. felis, indukuje tworzenie MALT u myszy z podobną patologią i progresją choroby, jak obserwowano w ludzkim chłoniaku MALT8,9. Najczęściej stosowanym izolatem H. pylori w badaniach kolonizacji myszy jest szczep "Sydney Strain 1" (SS1) sup class<="xref">10, który jest cagPAI+, ale ma niefunkcjonalny T4SS (T4SS−)11. Inne szeroko stosowane szczepy to H. pylori B128 7.13 (cagPAI+/T4SS+)12 i X47-2AL (cagPAI-/T4SS−)13. W przypadku zakażeń H. felis zwykle stosuje się szczep CS1 ("Cat Spiral 1", cagPAI-/T4SS−) 14.
Niniejszym udostępniamy protokół opisujący przygotowanie inokuli Helicobacter do infekcji in vivo, procedurę wewnątrzżołądkowego głębnika myszy, a także metody przetwarzania tkanek do badania zmian histopatologicznych w żołądku. W szczególności w artykule skupimy się na metodach histologicznych stosowanych do wizualizacji kolonizacji bakteryjnej i oceny zmian histopatologicznych, w tym tworzenia MALT, w błonie śluzowej żołądka zakażonych myszy. Niektóre z opisanych tutaj metod mogą być zaadaptowane do badania innych patogenów jelitowych, takich jak S. Typhimurium lub C. rodentium.