Zegary okołodobowe pomagają organizmom przystosować się do okresowych zmian środowiskowych generowanych przez 24-godzinny obrót Ziemi. Powiązane pętle transkrypcyjno-translacyjnego sprzężenia zwrotnego często leżą u podstaw molekularnej maszynerii zegarów okołodobowych u różnych gatunków1. Obwód okołodobowego rozrusznika serca, składający się z neuronów zawierających zegar, integruje informacje o porze dnia przekazywane przez sygnały środowiskowe, takie jak cykle światła/ciemności (LD) i temperatury, aby koordynować rytmy mnóstwa codziennych procesów fizjologicznych i behawioralnych2,3. Koordynacja rytmów molekularnych z wejściami i wyjściami neuronów jest niezwykle ważna dla działania obwodu okołodobowego, ale pozostaje tylko częściowo poznana.
U Drosophila, w sercu zegara molekularnego, heterodimer CLOCK/CYCLE (CLK/) aktywuje transkrypcję okresu (per) i bezczasowości (tim). PER i TIM tworzą kompleks i dostają się do jądra, gdzie hamują aktywność transkrypcyjną CLK/, a w konsekwencji własną transkrypcję. Regulacje potranskrypcyjne i potranslacyjne powodują opóźnienia między transkrypcją za pośrednictwem CLK/a represją przez PER/TIM, zapewniając generowanie około 24-godzinnych oscylacji molekularnych1,3,4. Około 150 neuronów zawierających te zegary molekularne tworzy obwód kontrolujący okołodobowe zachowanie dorosłych muszek5. Znacznie prostszy, ale w pełni funkcjonalny obwód okołodobowy składający się z 3 grup neuronów zegarowych - 5 brzusznych neuronów bocznych (LNvs; 4 PDF-dodatnie LNv i jeden PDF-ujemny LNv, patrz poniżej), 2 neurony grzbietowe 1s (DN1s) i 2 neurony grzbietowe 2s (DN2s) - jest obecny w mózgu larwy 6,7.
Prosty larwalny obwód okołodobowy stanowi doskonały model do badania interakcji między komunikacją międzyneuronalną a mechanizmem molekularnym. Korzystając z naszego nowo opracowanego fluorescencyjnego reportera PER-TDT, który naśladuje poziomy białka PER i jego subkomórkową lokalizację, staraliśmy się scharakteryzować dynamikę mechanizmu zegarowego w różnych podgrupach neuronów zegarowych w obwodzie okołodobowym larw 8. Ponadto, znając kluczową rolę czynnika dyspersyjnego pigmentu neuropeptydowego (PDF) wytwarzanego przez 4 LNvs w regulacji rytmów okołodobowych na poziomie neuronalnym9,10,11, chcieliśmy zbadać bezpośredni wpływ PDF na zegary molekularne. W tym celu opracowaliśmy metodę monitorowania okołodobowych rytmów ekspresji genów w eksplantacji mózgu larw przez wiele dni za pomocą poklatkowej mikroskopii konfokalnej. Protokół został również dostosowany do testów farmakologicznych w celu zbadania wpływu PDF lub innych związków na poziom PER-TDT. W związku z tym adaptacja polega na udostępnieniu hodowli eksplantatów mózgu do stosowania leków, zwiększeniu rozdzielczości czasowej i obrazowaniu przez krótszy czas.
Hodowla ex vivo mózgów Drosophila o różnych stadiach rozwojowych została wcześniej ustalona12,13,14,15,16,17,18. Podczas gdy protokoły te były używane do obrazowania różnych zjawisk biologicznych, niektóre z nich nie są kompatybilne z obrazowaniem w rozdzielczości pojedynczej komórki lub nie wspierają hodowli przez więcej niż kilka godzin. Alternatywne metody wykonywania długoterminowego obrazowania na żywo neuronów okołodobowych u Drosophila obejmują bioluminescencyjne obrazowanie rytmów molekularnych19,20,21 oraz obrazowanie fluorescencyjne wskaźnika wapnia za pomocą mikroskopii arkuszowej22,23. Chociaż obrazowanie bioluminescencyjne może osiągnąć wyższą rozdzielczość czasową, a mikroskopia arkuszy świetlnych może być przystosowana do obrazowania in vivo, są one ograniczone pod względem rozdzielczości przestrzennej i wymagają specjalistycznych systemów mikroskopowych.
Opisana tutaj metoda jest dostosowana do wizualizacji sygnałów fluorescencyjnych w całej kulturze mózgu w rozdzielczości pojedynczej komórki przez wiele dni. Ta łatwa i wszechstronna metoda może zostać zaadaptowana do obrazowania mózgów dorosłych much oraz do eksperymentów farmakologicznych w celu zbadania wielu różnych problemów w neurobiologii Drosophila.