Łatwa i elastyczna metoda mikrorozcieńczania bulionu do badania związków przeciwgrzybiczych i ekstraktów.
Artykuł metodologiczny
* These authors contributed equally
Łatwa i elastyczna metoda mikrorozcieńczania bulionu do badania związków przeciwgrzybiczych i ekstraktów.
Infekcje grzybicze stały się ważnym stanem chorobowym w ostatnich dziesięcioleciach, ale liczba dostępnych leków przeciwgrzybiczych jest ograniczona. W tym scenariuszu konieczne jest poszukiwanie nowych leków przeciwgrzybiczych. Przedstawiony tutaj protokół szczegółowo opisuje metodę badania peptydów pod kątem ich właściwości przeciwgrzybiczych. Opiera się na teście wrażliwości na mikrorozcieńczenie bulionu z wytycznych Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) M27-A3 z modyfikacjami dostosowanymi do badań peptydów przeciwdrobnoustrojowych jako potencjalnych nowych środków przeciwgrzybiczych. Protokół ten opisuje funkcjonalny test do oceny aktywności związków przeciwgrzybiczych i może być łatwo zmodyfikowany w celu dopasowania do dowolnej klasy badanych cząsteczek. Ponieważ testy są wykonywane na 96-dołkowych płytkach przy użyciu małych objętości, badanie przesiewowe na dużą skalę można przeprowadzić w krótkim czasie, zwłaszcza jeśli przeprowadza się je w warunkach automatyzacji. Procedura ta ilustruje, w jaki sposób ustandaryzowany i regulowany protokół kliniczny może pomóc w poszukiwaniu nowych cząsteczek w celu poprawy terapii chorób grzybiczych.
Infekcje grzybicze stały się ważnym problemem medycznym w ostatnich dziesięcioleciach, znacznie wzrosły, głównie z powodu wzrostu liczby osób z obniżoną odpornością, takich jak osoby poddawane leczeniu raka oraz osoby żyjące z HIV/AIDS lub przeszczepionymi organami1,2. Jednak bardzo ograniczony wachlarz dostępnych leków przeciwgrzybiczych i rosnąca liczba doniesień o oporności grzybów na nie przyczyniają się do poważnych problemów związanych z terapią grzybic układowych3.
Potencjalnym źródłem nowych związków przeciwgrzybiczych są peptydy przeciwbakteryjne (AMP), małe peptydy kationowe wytwarzane przez wiele organizmów jako część ich wrodzonej odpowiedzi immunologicznej na infekcję4. Niemniej jednak metoda przesiewowa mająca na celu przetestowanie tych związków pod kątem patogenów grzybowych nie jest ustandaryzowana. Do oceny aktywności przeciwgrzybiczej AMP zastosowano różne procedury, czasami dla tego samego mikroorganizmu modelowego5,6,7. Różnice te oraz brak szczegółów w niektórych protokołach komplikują porównania między związkami i utrudniają odtwarzalność.
Jednym ze sposobów standaryzacji testowania nowych kandydatów na leki jest przestrzeganie wytycznych używanych do definiowania podatności na leki przeciwgrzybicze w warunkach klinicznych, takich jak wytyczne Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) M27-A3. Jednak te testy wrażliwości na leki przeciwgrzybicze są zbyt restrykcyjne i nie uwzględniają różnic w metabolizmie u różnych gatunków, ponieważ zostały ustalone tylko dla kilku wybranych środków. Na przykład nie uwzględniają potrzeb metabolicznych drożdży niefermentujących.
Ten protokół pozwala na ocenę aktywności potencjalnych związków przeciwgrzybiczych i jest tutaj stosowany do poszukiwania peptydów przeciwgrzybiczych. Opiera się na teście wrażliwości na mikrorozcieńczenie bulionu z wytycznych CLSI M27-A3 z modyfikacjami optymalizującymi badania przesiewowe nowych związków8,9. Zmiany te pozwalają na użycie niewielkich ilości związku, zmian temperatury lub początkowego inokulum oraz różnych pożywek w celu optymalnego wzrostu przed testem, przy jednoczesnej standaryzacji wyników z użyciem referencyjnych leków przeciwgrzybiczych jako kontroli. Metoda ta, przy użyciu wielodołkowych płytek hodowlanych, umożliwia szybkie i niezawodne przesiewanie dużej liczby związków.
Ze względu na swoją nieodłączną elastyczność, ten protokół może być używany z różnymi klasami chemicznymi związków i przeciwko innym mikroorganizmom, z niewielkimi adaptacjami.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
1. Rozwiązania i media
2. Warunki wzrostu inokulum grzybów
3. Peptydy (nieznany czynnik)
4. Referencyjne leki przeciwgrzybicze (kontrole pozytywne)
5. Test przeciwgrzybiczy
UWAGA: Testy przeciwgrzybicze in vitro są przeprowadzane na podstawie testu wrażliwości na mikrorozcieńczenie bulionu według wytycznych Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) M27-A3 z pewnymi modyfikacjami.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
MIC jest zdefiniowany jako najniższe stężenie związku przeciwdrobnoustrojowego, które całkowicie hamuje widoczny wzrost grzybów pod koniec okresu inkubacji. Ponieważ celem tego protokołu jest posiadanie szybkiej metody badania przesiewowego potencjalnych środków przeciwgrzybiczych, każda studzienka z przezroczystym podłożem podobnym do studzienek ślepych jest uważana za wynik pozytywny, podczas gdy każda studzienka o zmętnieniu analogicznym do studzienek ujemnych/kontrolnych wzrostu jest ...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Testy mikrorozcieńczeń mogą analizować potencjalną aktywność przeciwgrzybiczą związku docelowego przy użyciu niewielkich ilości związku, a jednocześnie testować go w zakresie stężeń. W związku z tym protokół ten jest zalecany jako pierwszy krok w badaniach przesiewowych pod kątem potencjalnych nowych związków przeciwgrzybiczych. Przedstawiony tutaj protokół opiera się na protokole M27-A3, początkowo zaprojektowanym w celu pomocy w wyborze terapii przeciwgrzybiczej w klinikach i może być dostosowany do wielu nowych związk...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Autorzy nie mają nic do ujawnienia.
Dziękujemy CAPES-Brazil, CNPq-Brazil, FAP/DF za wsparcie finansowe. Jesteśmy wdzięczni dr Hugo Costacie Paesowi za korektę manuskryptu.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Pożywki i odczynniki | |||
| RPMI 1640 pożywka z l-glutaminą, bez wodorowęglanu sodu | Thermo Fisher | 31800-022 | |
| Kwas 3-(N-morfolino)propanosulfonowy (MOPS) (o que a gente usa tem um só dio, completa o nome dele please) | Sigma-Aldrich | Użyj do buforowania 2X RPMI medium | |
| Chlorek sodu (NaCl) | Dinâ mika | 1528-1 | 137 mM do soli fizjologicznej buforowanej fosforanami (PBS) |
| Chlorek potasu (KCl) | J.T.Baker | 3040-01 | 2,7 mM do soli fizjologicznej buforowanej fosforanami (PBS) |
| Fosforan sodu dwuzasadowy (Na2HPO4) | Sigma-Aldrich | V000129 | 10 mM do soli fizjologicznej buforowanej fosforanami (PBS) |
| Diwodorofosforan potasu (KH2PO4) | Sigma-Aldrich | 60230 | 2 mM do soli fizjologicznej buforowanej fosforanami (PBS) |
| BD Difco Sabouraud bulion dekstrozowy | BD | 238230 | |
| BD Difco Sabouraud Agar dekstrozowy | BD | 210950 | |
| Glicerol | Sigma-Aldrich | V000123 | 35% dla (soluç ã o de estoque? Criopreservaç ã o?) |
| Sterylna woda | Para diluiç ã o das drogas na diluiç ã o seriada | ||
| Leki przeciwgrzybicze | |||
| Amphotericin B | Sigma-Aldrich | A2942 | |
| Flukonazol | Sigma-Aldrich | F8929 | |
| Caspofungin | Sigma-Aldrich | PHR1160 | |
| Plastics | |||
| 50 mL probówka | stożkowaSarstedt | 62.547.254 | |
| Naczynie Petri | J.Prolab | 0304-5 | |
| 96 dołkowa płytka | Corning | 3595 | |
| Zbiornik na sterylny roztwór | KASVI | K30-208 | Służy do pipetowania roztworów za pomocą wielokanałowego pipetu |
| Sprzęt i inne materiały | |||
| Mikroskop optyczny | Nikon | E200MV | |
| Wirówka | Thermo Fisher | MegaFuge 16R | |
| Inkubator | Ethik Technology | 403-3D Zestaw | na 37° |
| C Shaker | New Brunswick Scientific | Excella E25 | Ustawiony na 37° C, 200 RPM |
| Komora zliczania komórek, Neubauer | BOECO Niemcy | BOE 13 | |
| Pipeta wielokanałowa | HTL | 5123 |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Poproś o pozwolenie na ponowne wykorzystanie tekstu lub ilustracji tego artykułu JoVE
Poproś o pozwolenie