Leki antymitotyczne od dawna stosowane są w schematach chemioterapeutycznych różnych typów guzów litych i często wykazują dużą skuteczność1,2,3. Mechanistycznie rzecz biorąc, leki te zakłócają normalną progresję mitotyczną i sprzyjają zatrzymaniu mitozy w szybko proliferujących komórkach rakowych. Jednak los komórki w odpowiedzi na zatrzymanie mitotyczne jest bardzo zmienny: podczas gdy część komórek przechodzi śmierć komórkową bezpośrednio w wyniku mitozy, inne wychodzą z mitozy i wracają do interfazy jako komórki tetraploidalne (proces określany jako poślizg mitotyczny)4,5,6,7,8. Te komórki interfazowe mogą wykonywać apoptozę, ulegać trwałemu zatrzymaniu cyklu komórkowego, a nawet ponownie wejść w cykl komórkowy4,5,6,7,8,9,10,11. Komórki, które unikają mitotycznej śmierci komórki, wpadając w interfazę, tylko po to, by ponownie wejść w cykl komórkowy po odstawieniu leku, mogą zatem przyczyniać się do ponownego pojawienia się populacji komórek nowotworowych. Co więcej, komórki, które wyślizgują się z mitozy, są tetraploidalne, a tetraploidia jest znana z tego, że sprzyja niestabilności chromosomów, która prowadzi do nawrotu nowotworu12,13,14,15. Zdefiniowanie czynników kontrolujących los komórek w odpowiedzi na leczenie lekami antymitotycznymi ma zatem kluczowe znaczenie dla optymalizacji obecnych terapii.
W tym protokole opisujemy metody bezpośredniej obserwacji i badania losu komórek, które ulegają długotrwałemu zatrzymaniu mitotycznemu w odpowiedzi na lek antymitotyczny paklitaksel. Paklitaksel jest uznanym lekiem klinicznym i okazał się wysoce skuteczny w wielu typach nowotworów, w tym piersi, jajników i płuc16,17,18,19,20. Paklitaksel, który jest alkaloidem roślinnym pochodzącym z kory cisa, stabilizuje mikrotubule i w ten sposób zapobiega ich dynamice21,22. Podczas gdy tłumienie dynamiki mikrotubul przez paklitaksel nie wpływa na progresję cyklu komórkowego od G1 do G2, lek prowadzi do trwałej aktywacji punktu kontrolnego montażu wrzeciona podczas mitozy poprzez utrudnienie przyczepiania kinetochoru do mikrotubul (szczegółowe informacje tutaj23,24)25. W konsekwencji zapobiega się wystąpieniu anafazy w komórkach traktowanych paklitakselem i powoduje przedłużone zatrzymanie mitotyki.
Ten protokół najpierw opisze podejścia do identyfikacji komórek mitotycznych w eksperymentach z obrazowaniem żywych komórek. Mitozę można uwidocznić w przylegających komórkach hodowli tkankowych dzięki dwóm zauważalnym zmianom biologicznym komórki. Po pierwsze, chromosomy stają się silnie zagęszczone bezpośrednio przed rozpadem otoczki jądrowej. Chociaż często można je wykryć za pomocą standardowej mikroskopii z kontrastem fazowym, kondensacja chromosomów może być wyraźniej wykryta za pomocą znaczników fluorescencyjnych, które oznaczają chromosomy (np. znakowane fluorescencyjnie białka histonowe). Po drugie, komórki mitotyczne można również zidentyfikować na podstawie dramatycznych zmian morfologicznych, które wynikają z zaokrąglenia komórek.
Ten protokół pokaże następnie, jak używać metod obrazowania żywych komórek do śledzenia losów komórek doświadczających przedłużonego zatrzymania mitotyki. Komórki zatrzymane w mitozie przechodzą jeden z trzech różnych losów. Po pierwsze, komórki mogą ulec śmierci komórkowej podczas mitozy. Zjawisko to można łatwo zobrazować za pomocą mikroskopii świetlnej, ponieważ obserwuje się, że umierające komórki kurczą się, bledną i/lub pękają. Po drugie, komórki mogą wyjść z mitozy i powrócić z powrotem do interfazy bez segregacji chromosomów lub cytokinezy, procesu określanego jako poślizg mitotyczny. Dekondensacja chromosomów i/lub spłaszczenie komórki mitotycznej łatwo identyfikuje ten proces. Komórki, które wymykają się z mitozy, często mają również nieregularne, wielopłatkowe jądra i często zawierają kilka mikrojąder5. Po trzecie, komórki zatrzymane w mitozie mogą zainicjować anafazę i przejść przez mitozę po długim opóźnieniu. Chociaż jest to rzadkie przy wyższych stężeniach leku, takie zachowanie sugeruje, że zatrzymane komórki mogły spełnić punkt kontrolny zespołu wrzeciona lub że punkt kontrolny zespołu wrzeciona jest częściowo osłabiony lub uszkodzony. Początek anafazy można uwidocznić poprzez segregację chromosomów i późniejszą cytokinezę za pomocą obrazowania żywych komórek.
Opisane zostaną również metody obrazowania żywych komórek do śledzenia losu komórek, które unikają śmierci komórki mitotycznej poprzez proces mitotycznego poślizgu. Komórki, które przechodzą poślizg mitotyczny, albo umierają w kolejnej interfazie, wywołują trwałe zatrzymanie cyklu komórkowego G1, albo ponownie wchodzą w cykl komórkowy, aby zainicjować nową rundę podziału komórki4. Opisane zostanie podejście wykorzystujące system FUCCI (wskaźnik cyklu komórkowego oparty na ubikwitynacji) w celu określenia frakcji komórek, które ponownie wchodzą w cykl komórkowy po poślizgu mitotycznym. FUCCI pozwala na bezpośrednią wizualizację przejścia G1/S i może być używany w połączeniu z długoterminowym obrazowaniem żywych komórek zarówno in vitro, jak i in vivo26,27. System FUCCI wykorzystuje dwa znakowane fluorescencyjnie białka, skrócone formy hCdt1 (licencja chromatyny i czynnik replikacji DNA 1) oraz hGeminina, których poziomy oscylują w zależności od pozycji cyklu komórkowego. hCdt1 (połączony z białkiem czerwonej fluorescencji) jest obecny na wysokich poziomach podczas fazy G1, gdzie działa w celu licencjonowania DNA do replikacji, ale jest ubikwitynowany przez ligazę ubikwityny E3 SCFSkp2 i degradowany podczas faz S / G2 / M, aby zapobiec ponownej replikacji DNA26. Natomiast hGeminina (połączona z zielonym białkiem fluorescencyjnym) jest inhibitorem hCdt1, którego poziomy osiągają szczyt podczas S / G2 / M, ale jest ubikwitynowana przez ligazę ubikwityny E3 APCCdh1 i ulega degradacji pod koniec mitozy i w całej klasie G126. W związku z tym FUCCI zapewnia prosty odczyt fluorescencji fazy cyklu komórkowego, ponieważ komórki wykazują czerwoną fluorescencję podczas G1 i zieloną fluorescencję podczas S / G2 / M. System FUCCI stanowi znaczący postęp w stosunku do innych podejść (takich jak barwienie bromodeoksyurydyny) do identyfikacji komórek proliferacyjnych, ponieważ nie wymaga fiksacji komórek i pozwala na obrazowanie pojedynczych komórek bez konieczności stosowania dodatkowych zabiegów farmakologicznych w celu synchronizacji populacji komórek. Chociaż nie zostało to omówione w tym protokole, opracowano również dodatkowe czujniki żywych komórek do wizualizacji postępu cyklu komórkowego, w tym czujnik helikazy B dla G128, DNA ligase-RFP29 i PCDNA-GFP30 czujniki dla fazy S oraz najnowszy czujnik FUCCI-4, który wykrywa wszystkie etapy cyklu komórkowego31.
Na koniec, opisana zostanie metoda obrazowania żywych komórek do wykrywania pęknięcia otoczki jądrowej. Ostatnie badania wykazały, że otoczki jądrowe komórek rakowych są niestabilne i podatne na pękanie, umożliwiając w ten sposób mieszanie się zawartości nukleoplazmy i cytoplazmy. Zjawisko to, określane mianem pęknięcia jądra atomowego, może sprzyjać uszkodzeniom DNA i stymulacji wrodzonej odpowiedzi immunologicznej32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44. Chociaż podstawowe przyczyny pęknięcia jądra pozostają niew pełni scharakteryzowane, wiadomo, że deformacje struktury jądrowej korelują ze zwiększoną częstością występowania pęknięć jądrowych42. Jednym z dobrze znanych skutków leczenia paklitakselem jest wytwarzanie uderzająco nieprawidłowych struktur jądrowych po mitozie; W związku z tym opisana zostanie metoda wykorzystująca obrazowanie żywych komórek do ilościowego określenia pękania jądra atomowego, a także zbadane, czy leczenie paklitakselem zwiększa częstotliwość pęknięć jądrowych. Rozerwanie jądra można wykryć na podstawie obserwowanego wycieku białka fluorescencyjnego ukierunkowanego na jądro do cytoplazmy (np. tandemowe powtórzenie dimeru RFP połączone z sygnałem lokalizacji jądrowej, TDRFP-NLS). Nieszczelność ta jest wyraźnie widoczna gołym okiem, co umożliwia proste ilościowe określenie zdarzeń pęknięcia.
Ten protokół wymaga mikroskopu epifluorescencyjnego o szerokim polu, który jest wyposażony w zakodowany stolik i oprogramowanie do automatycznego ustawiania ostrości. Zakodowany stolik pozwala na precyzyjny, zautomatyzowany ruch do zdefiniowanych współrzędnych X-Y, podczas gdy oprogramowanie autofokusa utrzymuje ostrość komórek przez cały okres obrazowania. Ponadto protokół ten wymaga sprzętu do utrzymywania komórek w temperaturze 37 °C przy nawilżonej atmosferze 5% CO2 . Można to osiągnąć, zamykając cały mikroskop w obudowie o kontrolowanej temperaturze i atmosferze lub stosując urządzenia typu stage-top, które lokalnie utrzymują temperaturę i środowisko. Obiektyw z kontrastem fazowym używany w tym protokole to plan fluor 10x z aperturą numeryczną 0,30. Jednak obiektywy 20X są również wystarczające do identyfikacji zarówno zaokrąglonych komórek mitotycznych, jak i spłaszczonych komórek interfazowych w jednej płaszczyźnie ogniskowej. W przypadku obrazowania z kontrastem fazowym (zgodnie z opisem w tej metodzie) osłona może być szklana lub plastikowa. Jeśli używana jest mikroskopia kontrastu różnicowego interferencyjnego (DIC), konieczne jest użycie szklanej osłony, aby zapobiec depolaryzacji światła.