Tutaj prezentujemy protokoły odkrywania związków aktywnych w receptorach GABAA, od wiązania po fizjologię i farmakologię.
Artykuł metodologiczny
Tutaj prezentujemy protokoły odkrywania związków aktywnych w receptorach GABAA, od wiązania po fizjologię i farmakologię.
Ten manuskrypt przedstawia krok po kroku protokół badania związków w receptorach kwasu gamma-aminomasłowego typu A (GABAA) i jego wykorzystanie do identyfikacji nowych cząsteczek aktywnych w testach przedklinicznych od receptora rekombinowanego in vitro do ich efektów farmakologicznych na receptory natywne w wycinkach mózgu gryzoni. W przypadku związków wiążących się w miejscu receptora benzodiazepinowego, pierwszym krokiem jest stworzenie pierwotnego badania przesiewowego, które polega na opracowaniu testów wiązania radioligandów na błonach komórkowych eksprymujących główne podtypy GABAA. Następnie, wykorzystując heterologiczną ekspresję receptorów GABAA u gryzoni i ludzi w oocytach Xenopus lub komórkach HEK 293, możliwe jest zbadanie, w testach elektrofizjologicznych, fizjologicznych właściwości różnych podtypów receptorów i właściwości farmakologicznych zidentyfikowanych związków. Przedstawiony zostanie tu układ oocytów Xenopus, począwszy od izolacji oocytów i ich mikroiniekcji różnymi mRNA, aż po charakterystykę farmakologiczną za pomocą dwuelektrodowych zacisków napięciowych. Na koniec opisane zostaną zapisy przeprowadzone w wycinkach mózgu gryzoni, które są wykorzystywane jako wtórny test fizjologiczny do oceny aktywności cząsteczek w ich natywnych receptorach w dobrze zdefiniowanym obwodzie neuronalnym. Wraz z zastosowaniem leku demonstrowane są zapisy zewnątrzkomórkowe wykorzystujące odpowiedzi populacyjne wielu neuronów.
Tutaj prezentujemy protokoły odkrywania związków aktywnych w receptorach GABAA, od wiązania do fizjologii i farmakologii. W poszukiwaniu nowych cząsteczek specyficznych dla receptorów GABAA kluczowe jest jak najdokładniejsze zdefiniowanie podtypu zainteresowania i ocena swoistości nowo zidentyfikowanych związków (np. w celu zapoznania się z przeglądem zob. Rudolph and Knoflach1lub Sieghart2). Typowa ścieżka odkrywania leków i kroki, które należy wykonać, przedstawiono na rysunku 1.
Testy wiążące były i nadal są powszechnie stosowane jako pierwszy krok w odkrywaniu leków. W przypadku receptorów GABAA są one zoptymalizowane pod kątem identyfikacji związków, które wiążą się z miejscem wiązania benzodiazepin receptora, gdzie wiążą się użyteczne terapeutycznie i bezpieczne leki. Inne techniki, wykorzystujące czytnik płytek do obrazowania fluorometrycznego (FLIPR) testy oparte na czerwonym barwniku o potencjale błonowym3, wykrywają związki takie jak barbiturany, które wiążą się z dodatkowymi miejscami, które są mniej pożądane ze względu na ich niepożądany profil skutków ubocznych. Ponadto stosowane barwniki mogą bezpośrednio aktywować receptory GABAA, kwestionując w ten sposób przydatność tych testów do odkrywania leków4. Testy wiązania mogą dostarczyć jedynie dowodów na to, że dany związek może wiązać się z określoną klasą receptorów. Testy in vitro z błonami komórkowymi służą do identyfikacji selektywnych ludzkich ligandów receptora GABAA α5β3γ2. Przejściowo transfekowane komórki HEK293 wyrażające ludzkie receptory GABAA α5β3γ2, α1β3γ2, α2β3γ2 i α3β3γ2 są wykorzystywane do przygotowania błon do tych testów. Działanie ligandów wykrywa się poprzez pomiar scyntylacji [3H]flumazenilu związanego z receptorami błonowymi (hamowanie wiązania [3H]flumazenilu). Główną zaletą tej techniki jest to, że szybkie i skuteczne określenie powinowactwa do wiązania związku w receptorze będącym przedmiotem zainteresowania jest zapewnione w receptorze będącym przedmiotem zainteresowania.
Badania funkcjonalne są niezbędne do oceny funkcjonalnej aktywności związków i zaproponowania fizjologicznego i farmakologicznego wyjaśnienia mechanizmów spowodowanych wiązaniem związków z receptorami. Obecnie powszechnie wiadomo, że funkcjonalne receptory GABAA powstają w wyniku złożenia pięciu podjednostek wokół osi pseudosymetrii utworzonej przez pory jonowe i wynikają ze złożenia pięciu identycznych podjednostek. Większość receptorów GABAA składa się z dwóch lub więcej różnych podjednostek. Na przykład główny receptor GABAA w mózgu składa się z podjednostek α1, β2 i γ2 w stechiometrii odpowiednio 2, 2 i 15,6. Rekonstytucja w systemie gospodarza, takim jak oocyty Xenopus lub komórki HEK293, daje możliwość szybkiego zbadania właściwości farmakologicznych receptorów.
Właściwości farmakologiczne związków są następnie badane za pomocą zapisów zewnątrzkomórkowych w wycinkach mózgu7. Metoda ta pozwala na zbadanie wpływu związków na przekaźnictwo nerwowe i stanowi skuteczny sposób potwierdzenia funkcjonalnego działania związków oznaczanych w heterologicznych systemach ekspresyjnych na poziomie receptorów natywnych w całym środowisku neuronalnym. Neuroprzekaźnictwo GABA-ergiczne można również ocenić na poziomie molekularnym, mierząc wpływ związków na hamujące prądy postsynaptyczne (IPSC)8. Ale zastosowany tutaj protokół oparty na zapisach klamrów krosowych całych komórek w wycinkach mózgu jest bardziej skomplikowany i zapewnia niższą przepustowość.
Na koniec, mocne i słabe strony kaskady badań przesiewowych in vitro używanej do identyfikacji selektywnych ligandów α5β3γ2 są omawiane w perspektywie różnych technik i ich wewnętrznych ograniczeń. Prace te powinny dostarczyć ekspertom i osobom niebędącym ekspertami w dziedzinie receptorów GABAA pomocnego przeglądu kombinacji różnych podejść in vitro stosowanych w celu rozwiązania problemu odkrycia nowych modulatorów tych kanałów jonowych bramkowanych ligandem.
Xenopus laevis są utrzymywane i obchodzone zgodnie z wytycznymi dotyczącymi zwierząt kantonu Genewa.
1. Wiązanie radioliganda



2. Ekspresja receptorów i rejestracje w oocytach Xenopus

3. Rejestracje elektrofizjologiczne w skrawkach mózgu
UWAGA: Przekroje hipokampa szczura są przygotowywane zgodnie z krajowymi i instytucjonalnymi wytycznymi.
Wiązanie:
Test in vitro z użyciem błon komórkowych służy do identyfikacji selektywnych ligandów ludzkich receptorów GABAA α5β3γ2 wiążących się w allosterycznym miejscu BZD receptorów zawierających podjednostkę γ2. Do przygotowania błon do tego testu wykorzystuje się przejściowo transfektowane komórki HEK293 wykazujące ekspresję ludzkich receptorów GABAA α5β3γ2, α1β3γ2, α2β3γ2 oraz α3β3γ2. Efekt potencjalnych ligandów jest wykrywany poprzez pomiar scyntylacji [3H]flumazenilu związanego z receptorami błonowymi (inhibicja wiązania [3H]flumazenilu). Następnie generowane są krzywe wypierania, aby ocenić selektywność związków względem konkretnego receptora GABAA, jak w przykładzie z RO4938581 (Rycina 8). Rycina 9 podsumowuje profile kilku związków referencyjnych, w tym α5 selektywnego negatywnego modulatora allosterycznego receptora GABAA, RO49385819, które zostały opracowane przy użyciu testu wiązania.
Pomiary w Xenopus oocytach:
Ekspresja receptorów GABAA, takich jak heteromer α5β3γ2, generuje silne prądy w odpowiedzi na ekspozycję na GABA. Typowe zapisy metodą voltage clamp, uzyskane w oocycie exprimującym ludzkie białka α5β3γ2 w odpowiedzi na krótkie impulsy GABA (30 s) o stężeniach do 300 µM, przedstawiono na Ryc. 6. W tym eksperymencie różne stężenia GABA rozmieszczono na płytce 96-dołkowej, a odpowiedzi wywoływano poprzez przenoszenie komórki do odpowiedniego dołka. GABA dokładnie wypłukiwano, przywracając komórkę do centralnej komory perfuzyjnej i aplikując roztwór kontrolny poprzez aktywację odpowiedniej pompy perystaltycznej. Sekwencja programu użyta do wyznaczenia krzywej aktywacji stężeń zilustrowana jest na Ryc. 6A. Dane te, uzyskane w pełni automatycznie, obrazują zarówno jakość zapisów możliwych do uzyskania w oocytach Xenopus, jak i wysoki poziom ekspresji receptorów osiągany kilka dni po iniekcji mRNA. Eksperymenty przeprowadzone dla różnych kombinacji receptorów pozwalają wyznaczyć szereg wartości EC50, czyli stężeń GABA niezbędnych do aktywacji połowy receptorów. Przedstawienie wartości EC50 na wykresie radarowym, jak pokazano na Ryc. 10, umożliwia szybkie porównanie właściwości receptorów oraz wpływu składu podjednostek.
Aby zbadać wpływ negatywnego lub pozytywnego modulatora allosterycznego (NAM lub PAM), konieczne jest porównanie odpowiedzi wywołanej impulsem testowym agonisty (GABA), najpierw w warunkach kontrolnych, a następnie w obecności modulatora. Wydajny protokół eksperymentalny do przeprowadzenia takiego doświadczenia przedstawiono na Rysunku 11. W pierwszej kolejności określa się odpowiedź komórki na referencyjne stężenie GABA, a następnie sekwencję powtarza się, aplikując to samo stężenie GABA, a następnie współaplikując GABA wraz z modulatorem. Wykres dwóch nałożonych na siebie odpowiedzi wykazuje w tym przykładzie wyraźne hamowanie spowodowane obecnością modulatora. Ilościowe określenie efektu modulatora można łatwo uzyskać, obliczając stosunek odpowiedzi wywołanej w obecności modulatora do odpowiedzi kontrolnej, a wyniki można przedstawić w formie mapy ciepła (heat plot). Dane przedstawione na Rysunku 12 ilustrują mapę ciepła odpowiadającą pomiarom trzech zestawów danych uzyskanych dla 96 związków.
Po zidentyfikowaniu związków o wystarczającej aktywności, często niezbędne jest sprawdzenie, czy cząsteczki te są aktywne w odniesieniu do innych kombinacji receptorów. W przypadku receptora GABAA zidentyfikowano 19 genów kodujących różne podjednostki i wiadomo, że funkcjonalny receptor może powstać z multimerycznego kompleksu różnych podjednostek (przegląd w Knoflach, Hernandez i Bertrand10). Chociaż wielość podjednostek i ich kombinacji daje ogromny repertuar podtypów receptorów, co mogłoby wymagać przeprowadzenia licznych badań przesiewowych w celu wykluczenia niepożądanej aktywności, często możliwe jest skupienie się w pierwszej kolejności na najpowszechniejszym podtypie, którym w przypadku receptorów GABAA jest skład α1β2γ2. Eksperymenty prowadzone równolegle z ekspresją na przykład α5β3γ2 i α1β2γ2 w tej samej partii oocytów pozwalają na rzetelne porównanie efektów danej cząsteczki. Typowe wyniki uzyskane z trzech komórek dla α5β3γ2 i α1β2γ2 przedstawiono na Rysunku 13, który ilustruje preferencyjną pozytywną modulację jednej z cząsteczek w obrębie α5β3γ2.
Protokół eksperymentalny przedstawiony na Rysunku 11 jest odpowiedni do charakteryzacji aktywności PAM. W tym protokole testowany związek jest aplikowany wspólnie z agonistą w stopniowo zwiększających się stężeniach. Aby uniknąć możliwych efektów kumulatywnych spowodowanych wielokrotną aplikacją do tej samej komórki, dla każdego punktu danych pomiar jest wykonywany na nowej, naiwnej komórce. Pomiar amplitudy odpowiedzi rejestrowanej z samym agonistą, a następnie podczas aplikacji związku, pozwala wyznaczyć stosunek ilościowy określający efekt PAM lub NAM. Typowe wyniki uzyskane dla diazepamu przy receptorach α1β2γ2 oraz α5β3γ2 przedstawiono na Rysunku 14, co wykazuje pozorną wrażliwość α5β3γ2, która w tej kombinacji receptorowej jest około 10-krotnie wyższa. Wartości te są dobrze skorelowane z opublikowanymi danymi11. Ponieważ uważa się, że miejsce wiązania benzodiazepin tworzy interfejs między podjednostką γ2 a przyległą do niej podjednostką α12,13,14, wrażliwość α5β3γ2 sugeruje preferencyjne powinowactwo diazepamu do γ2-α5 nad γ2-α1. Możliwość ekspresji różnych kombinacji receptorowych w połączeniu z efektywną charakteryzacją funkcjonalną otwiera wiele dróg badania determinantów właściwości PAM oraz ich wpływu na efekty fizjologiczne i farmakologiczne.
Przekroje mózgu z obszaru hipokampa:
Doświadczenia z wykorzystaniem przekrojów mózgu szczura z obszaru hipokampa prowadzi się w celu walidacji profilu farmakologicznego związków zidentyfikowanych w badaniach in vitro w natywnym modelu receptorowym. Przeważającymi podtypami receptorów GABAA wyrazzanymi w komórkach piramidowych hipokampa są α1β2/3γ2, α2β2/3γ2 oraz α5β2/3γ2, które wszystkie są modulowane przez benzodiazepiny (BDZs)15. Hamowanie wywołane podwójnym impulsem (paired-pulse inhibition) to paradygmat, który pozwala określić pobudliwość obwodów hipokampa poprzez badanie zmiany odpowiedzi na drugi z dwóch sparowanych bodźców elektrycznych dostarczonych w odstępie 20 ms. Zmiana drugiej odpowiedzi wynika z feedbacku GABAergicznego realizowanego przez interneurony unerwiające warstwę komórek piramidowych16,17,18. Jak pokazano na Rysunku 7, w warunkach kontrolnych druga odpowiedź z dwóch sparowanych bodźców jest hamowana ze względu na inhibicję GABAergiczną. Gdy inhibicja ta zostanie zredukowana poprzez perfuzję przekroju β-CCM, nieselektywnym NAM, druga odpowiedź z dwóch sparowanych bodźców jest hamowana w znacznie mniejszym stopniu. Ten paradygmat doświadczalny jest czuły na związki selektywne wobec receptora GABAA zawierającego podjednostkę α5.

Rysunek 1Strategia przesiewowa. Typowy proces przesiewania leków rozpoczyna się od wysokoprzepustowych badań przesiewowych, w których duże biblioteki związków są analizowane pod kątem konkretnego celu. Po zidentyfikowaniu kandydata wiodącego rozpoczynają się prace z zakresu chemii medycznej. W tej fazie chemicy badają i udoskonalają cząsteczki, wprowadzając modyfikacje strukturalne w celu spełnienia pożądanych kryteriów, takich jak selektywność wobec celu, przenikalność do mózgu, stabilność oraz degradacja. itd. W tej kluczowej fazie niezbędne jest ocenie, czy modyfikacje chemiczne nie zmieniły właściwości cząsteczki, oraz wyłonienie najlepszego kandydata. Kolejnym krokiem jest zidentyfikowanie kilku obiecujących związków i przekazanie ich do następnych etapów, które obejmują badanie bezpieczeństwa oraz tolerancji, itd. Należy zauważyć, że jako test funkcjonalny wskazana jest elektrofizjologia, jednak alternatywnie można zastosować inne metody, w tym testy fluorescencji wapnia lub barwniki wrażliwe na napięcie. Te ostatnie metody są również stosowane w badaniach wysokoprzepustowych jako zamiennik testów wiązania. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 2: Układ płytki 96-dołkowej wykorzystywanej w eksperymentach z wiązaniem. Kolumna 1 służy do pomiarów całkowitego wiązania, a kolumna 2 do pomiarów wiązania nieswoistego. Wiersze A–H wypełniono 4 różnymi związkami w rosnących stężeniach (kolumny 3–12), każdy związek w duplikacie (tj. związek 1 w wierszach A i E, związek 2 w wierszach B i F, itp.), co zostało przedstawione na schemacie za pomocą różnych kolorów. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 3: Mikrowstrzykiwanie z użyciem systemu zautomatyzowanego. (A) Precyzyjny system XYZ, w którym szklana igła do iniekcji wypełniona cieczą zawierającą interesujący plazmid jest automatycznie wprowadzana do oocytów. (B) Ten panel przedstawia 96-dołkową płytkę ze stożkowym dnem, w której (C) oocyty są automatycznie poddawane iniekcji. (D) Ten panel ilustruje zasadę iniekcji. W przypadku iniekcji jądrowej igła wnika w oocyt nieco głębiej niż jądro komórkowe, jak pokazano na panelu B. Następnie igła jest wycofana z jądra (patrz panel C) przed dokonaniem iniekcji (patrz panel D). (E) Aby ocenić jakość iniekcji, igłę można wypełnić barwnikiem, a „przetworzone” oocyty można przeciąć na pół. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 4: Zasada działania zautomatyzowanej metody z dwiema elektrodami w układzie clamp napięciowym. Zasada ta opiera się na przenoszeniu preparatu między dołkami, zamiast aplikacji cieczy w układzie perfuzyjnym. (A) Lewa strona panelu przedstawia układ umożliwiający rejestrację w oocycie Xenopus z dwiema elektrodami i małym koszyczkiem, który utrzymuje kroplę cieczy wokół preparatu podczas przenoszenia z jednej próbki do drugiej. Po prawej stronie pokazano zdjęcie oocytu umieszczonego w koszyczku z dwiema elektrodami. (B) Ten panel przedstawia schematyczną reprezentację zasady rejestracji elektrofizjologicznej w układzie „odwróconym”. (C) Ten panel pokazuje rozmieszczenie oocytu, płytki z substancjami oraz stacji płukania na stole rejestracyjnym. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 5: Rejestracja metodą dwuelektrodowego clampowania napięcia w porównaniu do metody patch-clamp. Typowa rejestracja metodą dwuelektrodowego clampowania napięcia dla oocytów (panel lewy) zestawiona z konfiguracją patch-clamp stosowaną dla linii komórkowej (panel prawy). Należy zwrócić uwagę na różnicę wielkości między oocytami, które mają średnicę około 1 mm, a komórkami o średnicy około 20 µm. W dwuelektrodowym clampowaniu napięcia potencjał błonowy oocytu jest porównywany z pożądanym napięciem podtrzymującym, a różnica sygnału jest wstrzykiwana do elektrody prądowej. W rejestracji patch-clamp przyjmuje się, że rezystancja elektrody patch-clamp jest pomijalna wobec rezystancji błonowej i w związku z tym napięcie narzucone przez wzmacniacz jest wiernie przekazywane na błonę komórkową19. Ilustracja przedstawia perfuzję za pomocą filamenciecie cieczy, w której dwa kanały rurki theta () wypełnione są z jednej strony roztworem kontrolnym, a z drugiej roztworem zawierającym lek20,21. Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 6: Zależność aktywacji od stężenia w ludzkich receptorach α5β3γ2. (A) Sekwencja sterująca systemem zautomatyzowanym składa się z serii ikon i określa protokół eksperymentalny do wyznaczania zależności aktywacji od stężenia. W krokach 1–3, jak pokazano na tym panelu, system przenosi oocyt z płytki do koszyka pomiarowego. W kroku 2 mierzony jest prąd upływu i w przypadku przekroczenia pożądanych kryteriów, komórka jest automatycznie wymieniana (krok 3). Po okresie stabilizacji (krok 4) mierzy się odpowiedź oocytu na referencyjne stężenie GABA (kroki 5 - 8). Do dalszych pomiarów kwalifikowane są oocyty wykazujące prądy większe niż 1 µA. W krokach 11–13 komórka jest poddawana działaniu różnych stężeń GABAA, a proces powtarza się dla pożądanej liczby stężeń (krok 14) i komórek (krok 15). (B) Ten panel przedstawia typowe prądy wywołane serią krótkich aplikacji GABA (30 s) stosowanych w kolejności rosnącej. Czas aplikacji związku zaznaczono paskami. (C) Wykres szczytowego prądu dośrodkowego jako funkcji logarytmu stężenia GABA daje krzywą aktywacji stężeniowej, którą można łatwo dopasować do empirycznego równania Hilla, z krzywą ciągłą, EC50 na poziomie około 11 µM i współczynnikiem Hilla wynoszącym 1,3. Prądy zarejestrowane w 8 komórkach zostały znormalizowane do jedności dla maksymalnej wywołanej odpowiedzi. Paski wskazują standardowy błąd średniej. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tej ryciny.

Rycina 7: β-CCM, NAM receptora GABAA, redukuje hamowanie podwójnym impulsem w skrawkach hipokampa. (A) Ten panel przedstawia schematyczny przekrój skrawka hipokampa szczura. Kolaterale Schaffera (Sch C), wywodzące się z aksonów komórek piramidowych obszaru CA3, rzutują na arboryzację dendrytyczną neuronów piramidowych obszaru CA1. Mikropipety umieszczono w warstwie piramidowej (stratum pyramidale) w celu rejestracji potencjałów populacyjnych (PS) oraz w warstwie promienistej (stratum radiatum) do dendrytycznej rejestracji polowych potencjałów pobudzeniowych postsynaptycznych (epsp). Elektrodę stymulującą umieszczono w obrębie kolateral Schaffera. (B) Ten panel pokazuje PS wywołane przez podwójne bodźce przyłożone za pomocą tej samej elektrody stymulującej w odstępie 20 ms. Odpowiedź populacyjna na drugi bodziec (PS2) ma mniejszą amplitudę niż odpowiedź na pierwszy bodziec (PS1). (C) PS rejestrowano w obecności (czarny słupek) i przy braku (zielony słupek) β-CCM, nieselektywnego NAM receptora GABAA. β-CCM zwiększył amplitudę drugiego PS2, częściowo blokując hamowanie GABAergiczne typu feed-forward. Słupki wskazują standardowy błąd średniej, a symbol *** oznacza, że dane są wysoce istotne przy p <0.01. Proszę kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.
![figure-results-8 Wykres powinowactwa wiązania, % wiązania swoistego vs. Log[RO4938581] dla wielu podtypów receptorów.](/files/ftp_upload/57842/57842fig8.jpg)
Rycina 8: Typowe wyniki wiązania uzyskane w teście konkurencyjnym (hamowania lub wypierania). Na podstawie generowanych krzywych wypierania wiązania można wyznaczyć IC50 oraz Ki. IC50 to stężenie ligandu konkurencyjnego, który wypiera 50% swoistego wiązania radioliganda, a Ki (stała inhibicji leku) to stężenie ligandu konkurencyjnego, który zająłby 50% receptorów w przypadku braku radioliganda. Wartość Ki oblicza się z IC50 przy użyciu równania Chenga-Prusoffa:

Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 9: Przeprowadzono konkurencyjne badania wypierania ligandów wiążących się z głównymi podtypami receptorów GABAA. Powinowactwa (nM) zmierzono przy użyciu testu wiązania [3H]flumazenilu oraz membran z komórek HEK293 przejściowo transfektowanych różnymi kombinacjami podjednostek ludzkiego receptora GABAA. Przedstawienie w formie histogramu wyraźnie ilustruje różnicową wrażliwość zaobserwowaną dla związku RO493851, który wykazał najniższą wartość Ki dla receptorów α5β3γ2. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tej ryciny.

Rysunek 10: Różnicowa wrażliwość receptorów na GABA. Wykres EC50 receptora dla GABA w formie wykresu radarowego oraz przedstawienie domniemanego składu podjednostek stanowią efektywne sposoby porównania roli różnych podjednostek. Należy zauważyć, że wprowadzenie podjednostek γ2 wiąże się ze zmniejszeniem wrażliwości receptora. Prosimy kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 11: Badanie wpływu modulatora. (A) Ten panel przedstawia sekwencję ikon używanych do sterowania zautomatyzowanym systemem. Należy zauważyć, że dwie ikony (A/D) odpowiadają pomiarowi w grupie kontrolnej (zielony) oraz podczas ekspozycji na modulator (czerwony). (B) Ten panel przedstawia typowe prądy zarejestrowane w komórce wykazującej ekspresję receptora GABAA podczas takiej sekwencji. Aby ocenić działanie modulatora, przeprowadzono sekwencję pomiarów, w której najpierw mierzono odpowiedź wywołaną ekspozycją na stałe stężenie GABA (ślad zielony), a następnie ekspozycję najpierw na GABA, a potem na GABA wraz z modulatorem (ślad czerwony). Ustawienie kursorów w kształcie krzyżyka (cyjanowy i niebieski) wyznacza zakres pomiarów, a niebieski krzyżyk wskazuje maksymalną różnicę między dwoma warunkami pomiaru. Stosunek między warunkiem kontrolnym a warunkiem z modulatorem jest automatycznie obliczany przez oprogramowanie analityczne. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 12: Mapa ciepła dla trzech powtórzeń. Ten panel przedstawia mapę ciepła odpowiadającą trzem powtórzeniom efektów modulatorów uzyskanych dla 96 związków w przypadku ludzkich receptorów α5β3γ2 GABAA. Stosunki odpowiedzi testowej do kontrolnej mieszczące się w przedziale od 0,5 do 1,2 uznano za nieistotnie różniące się od kontroli i zostały one przedstawione za pomocą zielonych kropek. Stosunki poniżej 0,5 uznano za reprezentujące efekt inhibicyjny i zostały one przedstawione za pomocą niebieskich kropek. Stosunki powyżej 1,2 uznano za wzmacniające odpowiedź i zostały one przedstawione za pomocą czerwonych kropek. Należy zwrócić uwagę na podobieństwo wzorca pomiędzy trzema niezależnymi pomiarami. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 13: Przesiewy przeciwstawne dla α1β2γ2. (A) Ten panel przedstawia reprezentację domniemanej organizacji podjednostek. Kolejne panele pokazują (B-D) ocenę efektów dodatniego modulatora allosterycznego dla ludzkich receptorów α5β3γ2 oraz (F-H) dla α1β2γ2, przy zastosowaniu porównywalnych stężeń GABA i podobnych stężeń (100 µM) modulatora, co podkreśla specyficzność związku testowanego w tych eksperymentach. (E) Ten panel również przedstawia reprezentację domniemanej organizacji podjednostek. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 14: Wrażliwość na PAM i skład receptorów. Wyznaczenie efektów serii stężeń diazepamu (A-D) dla receptorów α1β2γ2 oraz (E-H) α5β3γ2 wykazuje niemal 10-krotną różnicę w powinowactwie pozornym. Należy również zwrócić uwagę na wpływ składu podjednostek na przebieg czasowy odpowiedzi, z szybszą desensytyzacją w przypadku receptorów α1β2γ2 (patrz np. panele D i H). Zauważmy, że ponieważ receptory α1β2γ2 i α5β3γ2 wykazują różne powinowactwa do GABA (patrz również Rycina 10), stężenie agonisty zostało dostosowane pomiędzy tymi dwoma receptorami, aby znajdowało się w porównywalnym zakresie aktywacji. (I) Ten panel przedstawia wykres krotności wzrostu amplitudy prądu znormalizowanej do jedności w stosunku do warunków kontrolnych. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 15: Plazmid ekspresyjny zawierający promotory T7 i CMV. Te panele przedstawiają plazmid do ekspresji w oocycie Xenopus (prawy górny panel) oraz w linii komórkowej. Prawy dolny panel ilustruje typową komórkę HEK-293 przetransfekowaną plazmidem zawierającym również gen zielonego białka fluorescencyjnego (GFP) wraz z elektrodą do rejestracji metodą patch-clamp. Aby zobaczyć powiększoną wersję tej ryciny, kliknij tutaj.
Opracowanie nowych związków aktywnych w kanale jonowym bramkowanym ligandem, takich jak receptory GABAA , wymaga zastosowania wielu podejść. Zazwyczaj pierwszy etap jest często przeprowadzany przy użyciu testów wiążących; Pomiary te są jednak niewystarczające do scharakteryzowania fizjologicznej aktywności związku lub jego precyzyjnej farmakologii. W szczególności związek, który wiąże się z receptorem, może wzmacniać lub hamować jego funkcję, a nawet nie wywoływać żadnego efektu funkcjonalnego (być cichym) (tj. wiązać się z receptorem bez modyfikowania jego funkcji). W związku z tym do pełnej charakterystyki związku wymagany jest test funkcjonalny.
Testy wiążące:
Główną zaletą testu wiązania jest to, że można go skutecznie przeprowadzić na dużej liczbie próbek, sięgającej kilku tysięcy, oraz że zapewnia powinowactwo do wiązania cząsteczek aktywnych. Jak opisano w niniejszym dokumencie, pierwszy krok polega na ustaleniu metody oceny pożądanych podtypów receptorów. Mianowicie, podczas gdy wiązanie może być prowadzone na receptorach natywnych z frakcji lub całych mózgów, taka metoda uniemożliwi określenie powinowactwa do określonych podtypów receptorów. W związku z tym konieczne jest stosowanie układów rekombinowanych do badania przesiewowego cząsteczek w pożądanym celu. Obecnie przejściowa lub stabilna transfekcja pożądanych podjednostek receptorowych cDNA w liniach komórkowych oferuje wydajną i niezawodną metodę ekspresji podtypów receptorów będących przedmiotem zainteresowania (np. GABAA α5β3γ2). Tradycyjne testy wiązania wykorzystują radioligandy, ale obecnie dostępne są techniki, które pozwalają uniknąć niedogodności związanych z obchodzeniem się z radioaktywnością (np. ilościowe wiązanie ligandów na podstawie fluorescencji).
Wyrażenie funkcyjne w systemie hosta:
Aby uzyskać ekspresję genów w systemie gospodarza, sekwencja kodująca, która jest przedmiotem zainteresowania, musi zostać wprowadzona do plazmidu, który zawiera odpowiednie promotory. Zazwyczaj do syntezy mRNA in vitro stosuje się bakteryjne promotory T7 lub T6. W przypadku ekspresji cDNA transkrypcja genu będącego przedmiotem zainteresowania musi być regulowana przez promotor eukariontowy, taki jak CMV (wirus cytomegalii) lub równoważny. Obecnie dostępnych jest kilka plazmidów, w tym dwa promotory (tj. pUNIV, pCMV-6AC, psf-CMV / T7, pCI-neo, pcDNA), umożliwiające syntezę mRNA in vitro lub ekspresję cDNA, jak pokazano na rysunku 15. Ekspresję receptorów GABAA można wiernie uzyskać zarówno w liniach komórkowych, jak i w oocytach Xenopus . Głównymi zaletami tych ostatnich są brak endogennej ekspresji receptora, prostota manipulacji oraz dostępność zautomatyzowanego systemu do mikroiniekcji i zapisów. Procedury opisane w tym protokole obrazują skuteczność zautomatyzowanego systemu, który pozwala na wstrzyknięcie 96 komórek jajowych w ciągu około 7 minut i nie wymaga umiejętności mikromanipulacji. Biorąc pod uwagę, że pojedynczy jajnik z Xenopus zawiera od 10 000 do 30 000 oocytów, jasne jest, że na jednym preparacie można przeprowadzić dużą liczbę pomiarów komórek. Ponadto, ponieważ ekspresję można przeprowadzić za pomocą iniekcji cDNA, te same plazmidy zawierające interesujące geny, które są opracowywane do eksperymentów wiązania, mogą być wykorzystane do charakterystyki funkcjonalnej bez potrzeby dalszych manipulacji biologii molekularnej.
Biorąc pod uwagę jego duży rozmiar i wysoką ekspresję powierzchniową, pojedynczy oocyt wytwarza liczbę receptorów, która jest w przybliżeniu równoważna zbiegającym się komórkom na szalce Petriego o średnicy 35 mm. Jednak przygotowanie i wstrzyknięcie oocytów stanowi ułamek kosztu linii komórkowej, ponieważ eksperymenty nie wymagają specjalnej pożywki hodowlanej i sterylnych manipulacji. Aktywacja pojedynczego kanału GABAA daje kilka pikoamperów (10-12), a prądy sięgające nawet kilkudziesięciu mikroamperów (10-6) są łatwo rejestrowane w pojedynczym oocycie, co potwierdza jednoczesną aktywność kilku milionów receptorów podczas jednej odpowiedzi.
Pierwszym krokiem w charakterystyce kanałów jonowych bramkowanych ligandem jest często określenie pozornego powinowactwa receptorów. Eksperymenty, które należy przeprowadzić, polegają na zastosowaniu serii krótkich impulsów testowych agonistów i wykreśleniu amplitudy wywołanego prądu lub, w niektórych przypadkach, pola pod krzywą (AUC) w funkcji logarytmu stężenia agonisty. Ponieważ łatwo jest mikrowstrzykiwać plazmidy o różnych stężeniach i proporcjach w tej samej partii oocytów, ten system ekspresji jest szczególnie odpowiedni dla takiej charakterystyki. Co więcej, porównanie poszczególnych partii wykazało wysoki stopień stabilności dla różnych EC50s. Wpływ składu podjednostki na pozorne powinowactwo receptora można łatwo zobrazować za pomocą wykresu pająka, jak pokazano na rycinie 10.
Wyniki dwuelektrodowego zacisku napięciowego uzyskane w oocytach Xenopus są często porównywane z zapisami wykonanymi przy użyciu elektrod patch clamp. Jakkolwiek szczegółowe porównanie tych dwóch systemów wykraczałoby poza zakres niniejszej pracy, można poruszyć kilka kwestii. Podczas gdy klamra punktowa w komórkach oferuje korzyści w charakterystyce biofizycznej z szybkim zastosowaniem leku, jego wymagania są bardziej złożone niż w przypadku zapisów dwuelektrodowych w oocytach Xenopus . Pierwszą i istotną trudnością jest ekspresja danego białka z koniecznością hodowli komórkowej, transfekcji przejściowej lub stabilnej oraz identyfikacja komórek, które wyrażają pożądany konstrukt. Ponadto niezbędne jest zbadanie możliwego udziału ekspresji endogennej w rozważanej komórce. Co więcej, zapis za pomocą zacisku krosowego wymaga wykwalifikowanej osoby przeprowadzenia mikromanipulacji pod mikroskopem o dużym powiększeniu, przy czym osoba ta musi również przeprowadzić odpowiednią analizę podczas eksperymentu, aby ocenić np. jakość uszczelki, opór dostępu itp. Natomiast zapis cęgowy napięciowy z dwiema elektrodami, zwłaszcza przy użyciu zautomatyzowanego systemu elektrofizjologicznego, Nie wymaga żadnych szczególnych umiejętności i może być przeprowadzana przez techników laboratoryjnych.
Przy zakupie zestawu elektrofizjologicznego rozważenie kosztów jest z pewnością ważnym czynnikiem, który należy dokładnie przeanalizować. Na przykład, podczas gdy koszt zautomatyzowanego systemu jest stosunkowo wysoki, bliższe porównanie pokazuje, że instalacja kompletnego zestawu elektrofizjologicznego obejmuje zakup sprzętu, takiego jak dobre mikromanipulatory, soczewka lornetkowa, wzmacniacz, system perfuzyjny i stół antywibracyjny, a także pozyskiwanie danych i przeprowadzanie analizy. Porównanie kosztów między konfiguracją cęgów napięciowych z dwiema elektrodami a konfiguracją z zaciskiem krosowym ujawnia jeszcze dalsze rozbieżności. Co więcej, zautomatyzowany system ma tę zaletę, że jest w pełni zautomatyzowanym sprzętem i działa bez nadzoru w dzień iw nocy.
Właściwości farmakologiczne związku zależą od jego sposobu działania na receptor. Na przykład inhibitory kompetycyjne to cząsteczki, które mogą dostać się do tej samej kieszeni wiążącej lub miejsca ortosterycznego, ponieważ sam agonista powoduje konkurencję. Inhibitory niekonkurencyjne to związki, które hamują receptory poprzez interakcję w innym miejscu, a w przypadku kanału jonowego bramkowanego ligandem, które mogą na przykład wnikać i blokować pory jonowe. Zbadanie różnych mechanizmów interakcji wykraczałoby poza zakres tej pracy, ale dalsze informacje można uzyskać z podręcznika farmakologicznego i/lub z innych prac, takich jak22 Bertranda i Bertranda.
W przypadku modulatorów allosterycznych związek wiąże się w miejscu, które jest odrębne od miejsca ortosterycznego, ale obecność cząsteczki modyfikuje barierę energetyczną między stanem aktywnym a innymi stanami. Dodatnie modulatory allosteryczne (PAM) to związki, które zmniejszają barierę energetyczną ze stanu spoczynku do stanu aktywnego, a tym samym wzmacniają działanie agonisty. Aby scharakteryzować możliwe efekty PAM, konieczne jest zatem określenie, czy narażenie na ten związek wzmacnia odpowiedź na agonistę, a jeśli tak, to w jakim stężeniu. Eksperymenty przedstawione na rycinach 11 i 14 ilustrują protokoły, które mogą być z powodzeniem stosowane do charakterystyki PAM w receptorach GABAA .
W niektórych przypadkach sama ekspozycja na PAM może być wystarczająca do aktywacji receptorów. Taką aktywność można określić poprzez nieznaczną modyfikację przedstawionego tu protokołu eksperymentalnego. Mianowicie, zamiast stosować jednoczesne stosowanie modulatora podczas ekspozycji na GABA, protokół może być zmodyfikowany pod kątem zastosowania najpierw samego związku, a następnie w obecności GABA. Charakterystyka bezpośredniej aktywności agonistycznej zostanie dokonana poprzez określenie amplitudy odpowiedzi wywołanej przez sam związek i porównanie z prądem wywołanym przez GABA.
Eksperymenty przeprowadzone na wycinkach mózgu, takie jak zilustrowane na rycinie 7, są wykorzystywane do potwierdzenia aktywności związku w natywnych receptorach w określonym obwodzie hamującym, zanim przejdą dalej w modelach zwierzęcych i na ścieżce do badań klinicznych. Stosunkowo prosty protokół rejestracji i analizy danych pozwala na klasyfikację wielu związków poprzez ocenę ich różnicowego wpływu modulacyjnego na amplitudę PS. Niespecyficzne działanie związków, które nie są związane z układem GABA, może być również wykrywane (np. gdy obserwuje się zmiany w kształcie PS). Bezpośrednie, GABA-ergiczne neuroprzekaźnictwo można ocenić w tych przypadkach, mierząc wpływ związków na hamujące prądy postsynaptyczne (IPSC) przy użyciu techniki całokomórkowego patch clamp8.
Autorzy, Frédéric Knoflach i Maria-Clemencia Hernandez, są pracownikami firmy farmaceutycznej F. Hoffmann-La Roche AG, 4070 Bazylea, Szwajcaria. Autor Daniel Bertrand jest pracownikiem HiQScreen Sàrl 6, rte de Compois, 1222 Vésenaz Genewa, Szwajcaria, dostarczającym zaplecze do badań przesiewowych firmom farmaceutycznym.
Autorzy dziękują Judith Lengyel, Marii Karg, Grégoire Friz, Rachel Haab i Marie Claire Pflimlin z Roche oraz Tifany Schaer i Deborah Paolucci z HiQScreen za doskonałą pomoc techniczną.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| General equipment | |||
| 96 kombajn komórkowy -(Filtermate 196) | Packard | Do filtracji membran ze związanym radioligandem | |
| Płytka mikromiareczkowa Licznik scyntylacyjny cieczy (Top Count NXT) | Licznik scyntylacji i luminescencji mikropłytek | Packard | |
| Licznik scyntylacyjny cieczy (Beta-Couter 2500 TR) | Fiolka Packard | Licznik scyntylacji i luminescencji | |
| Ciecz handler (Biomek 2000) | Redlica | BeckmanDo przygotowania rozcieńczeń złożonych | |
| Vortex (Vortex Genie 2) | Scientific industries Inc. | Do mieszania złożonych roztworów podstawowych | |
| Homogenizator tkankowy (Polytron PT1200E) | Kinematica AG | Do ponownego zawieszenia preparatów membranowych | |
| Oprogramowanie XLfit5 | Microsoft Excel Dodatek przez IDBS | Oprogramowanie do dopasowywania krzywych | |
| Smart Pull | UniPix-Electrode | Puller | |
| RoboInject | MultiChannel Systems-Automated | Injection (Xenopus Oocytes) | |
| HiClamp | MultiChannel | Systems-Automated | Voltage Clamp (Xenopus Ooocytes) |
| DataMining | MultiChannel | Systems-Data | Oprogramowanie analityczne |
| DataMerger | MultiChannel | Systems-Oprogramowanie | do przetwarzania danych |
| Digidata 1550 | Molecular Devices | System akwizycji danych o niskim poziomie szumów | |
| CyberAmp 380 lub równoważny | Axon Instruments | Programowalny kondycjoner sygnału | |
| Pakiet programów pClamp | Urządzenia | Oprogramowanie do akwizycji i analizy danych oprogramowanie | |
| Stół antywibracyjny | TMC | Aby uniknąć wibracji mikroelektrod | |
| Mikromanipulatory Patchstar | Scientifica | Do precyzyjnego pozycjonowania mikroelektrod w wycinkach mózgu | |
| Sutter Instruments | Do izolowania nagrań od hałasu | ||
| McIlwain Tissue Chopper | Campden Instruments LTD | Do przygotowania plastrów mózgu mikropipeta | |
| ze szkła borokrzemianowego | Warner Instruments | GC150TF-10 | Do rejestrowania potencjałów zewnątrzkomórkowych w wycinkach mózgu |
| Skrętka, elektroda stymulacyjna z drutów platynowo-irydowych | World Precision Instruments | Do stymulacji wycinków mózgu prądem | |
| Generator bodźców do stymulacji sterowanej prądem i napięciem | Systemy wielokanałowe | STG4000 | Dostarcza prąd do elektrody |
| stymulującejPlasticwarePłytka | |||
| mikromiareczkowania z okrągłym dnem | Corning | #3365 | Używana do oznaczania wiązania |
| GF / C z filtrem z włókna szklanego 96-dołkowa mikropłytka z 1,2 i mikro; m Poresize, do testów pobierania komórek za pomocą filtra próżniowego z kolektorem dolewkowym | Packard | #6005174 | używany do testu wiązania |
| 50 ml probówki | Falcon | #352070 | używane do testu wiążącego |
| Probówki Safe-lock 1,5 ml | Eppendorf | #0030 120086 | używane do testu wiązania |
| Probówki Safe-lock 2 mL | Eppendorf | #0030 120094 | używane do testu wiążącego |
| Probówki transportowe 180 mL | Semadeni Europe AG | #3722 | używany do testu wiązania |
| Fiolka z kucykiem Polietylen 6 mL | Perkin Elmer | #6013329 | używany do testu wiązania |
| Top Seal | Perkin Elmer | #60051859 | używany do oznaczania wiązania |
| Kolba obrotowa | Bellco | BELLCO # 1965-00100 | Kolba obrotowa |
| 96 Płytka studzienkowa (stożkowa) | Thermo Scientific Milian | 56368 | Płytka iniekcyjna do oocytów |
| 96 Płytka studzienkowa (płaskie dno) | Corning (Vitaris, Szwajcaria) | 3364-cor | Płytka złożona do szklanej kapilary HiClamp |
| Glass | Hilgenberg (Niemcy) | - | szkło borokrzemianowe 1,2 Średnica zewnętrzna 0,76 ID z preparatem filament |
| RNA | |||
| Ambion mMessage mMachine | Thermo Fisher Scientific | do syntezy in vitro | |
| Chemikalia | |||
| Bufor do oznaczania: KCl 5 mM; CaCl2 1,25 mM; MgCl2 1,25 mM; NaCl 120 mM; Tris 15 mM pH dostosuj z HCl do 7,4; przechowywać do 3 miesięcy w temperaturze 4 stopni Celsjusza. | Używany do oznaczania wiązania | ||
| Bufor do mycia: Tris 50 mM -HCl pH 7,4; przechowywać w temperaturze 4 °C. | Używany do oznaczania wiązania | ||
| Roztwór podstawowy badanych związków 10 mM w DMSO | Używany do oznaczania wiązania | ||
| Flumazenil (RO0151788) 10 mM w DMSO | Używany do oznaczania wiązania | ||
| Diazepam 4 mM w DMSO | Używany do oznaczania wiązania | ||
| [3H]-Flumazenil 60-85 Ci/mmol w etanolu; przechowywać w temperaturze -20 ° C | Służy do oznaczania wiązania | ||
| Microscint 40 | Packard | #6013641 | Służy do wiązania |
| testu Ultima Gold | Perkin Elmer | #6013329 | Służy do oznaczania wiązania |
| MS-222 | Sigma | Sigma # A5040 | MS-222 |
| AB/AM | Sigma | Sigma # A5955 | antybiotyki / leki przeciwgrzybicze |
| Kolagenaza | Sigma | Sigma # C1030 | Kolagenaza typu I |
| Rnaza | Sigma | Sigma # R2020-250 mL | RNaseZAP |
| EndoFree Plasmid maxi Kit | Qiagen | Qiagen # 12362 | |
| Sole do sztucznego płynu mózgowo-rdzeniowego (NaCl, KCl itp.) | Sigma | ||
| Membranes | |||
| Mrożone preparaty błonowe z przejściowych lub stabilnie transfekowanych HEK293 z nadekspresją różnych ludzkich podtypów receptorów GABAA: &alfa; 1β 3γ 2, &alfa; 2β 3γ 2, &alfa; 3β 3γ 2, &alfa; 5β 3γ2. Zobacz Ballard et al. 2009, aby zapoznać się ze szczegółowymi metodami. | Służy do oznaczania wiązania |