Wszystkie eksperymenty na zwierzętach zostały zatwierdzone przez Komitet Etyki Zwierząt Uniwersytetu w Melbourne.
Uwaga: Sekwencja, budowa i protokół generowania wektorów adenowirusowych pAd-CMV-Td-Tom, pAd-CMV-GFP i pAd-CAGA12-Luc/Td-Tom zostały wcześniej opisane11,12,13. Wszystkie wektory są dostępne na rynku.
1. Oznaczanie miana wirusa przy użyciu 50% dawki zakaźnej w kulturze tkankowej (TCID50)
- Przygotuj 1 x 106 HEK293A komórek w 10 ml pożywki DMEM + 10% FBS.
- Umieść 100 μl zawiesiny komórkowej w każdym dołku 96-dołkowej płytki do hodowli komórek płaskodennych.
- Przygotować 1 ml roztworu wirusa o rozcieńczeniu 1:100 w kompletnym podłożu. Dodać 11 μl rozcieńczonego wirusa do każdego studzienki w kolumnie 1.
- Wykonać seryjne 10-krotne rozcieńczenia bezpośrednio na płytce 96-dołkowej, mieszając 11 μl rozcieńczonego wirusa ze 100 μl zawiesiny komórek, aż do osiągnięcia końcowego rozcieńczenia 1x10 12. Chociaż na tym etapie komórki nie przylegają, liczba komórek przenoszonych między studzienkami pozostaje stała.
- Odpipetować 11 μl każdego rozcieńczenia do każdej kolumny, zaczynając od najwyższego rozcieńczenia 10:4. Wymieniaj końcówki pipet przy każdym rozcieńczeniu, aby ograniczyć przenikanie się cząstek wirusa.
- Dodać 11 μl kompletnej pożywki wolnej od wirusów do kolumny 12 jako kontrolę ujemną.
- Inkubować płytkę przez 7 - 10 dni w temperaturze 37 °C z 10% CO2 .
- Za pomocą mikroskopu oceń liczbę dołków w każdej kolumnie wykazujących oznaki działania cytopatycznego lub cytotoksycznego. Rozważ dobrze pozytywny, jeśli występują jakiekolwiek oznaki infekcji.
- Oblicz frakcję dołków dodatnich dla każdego rozcieńczenia, korzystając z metody statystycznej Reeda i Muencha (1938)14.
- Oblicz odległość proporcjonalną (PD) za pomocą: (A-50)/(A-B), gdzie A jest odpowiedzią procentową powyżej lub równą 50%, a B jest odpowiedzią procentową poniżej 50%.
- Obliczać TCID50 za pomocą: 10X-PD, gdzie X jest rozcieńczeniem dającym odpowiedź większą niż 50%.
- Oblicz miano wirusa na podstawie następujących metod: 0,69/(0,011 x TCID50) PFU/ml
2. Oznaczanie MOI adenowirusa
- Nasiona 1,0 - 1,5 x 105 komórek MDA-MB-231 z 500 μl pożywki hodowlanej DMEM zawierającej 5% FBS w każdym dołku płytki 12-dołkowej (35% konfluencji komórek, łącznie 6 dołków).
- Oblicz objętości zapasów Ad-CMV-Td-Tom wymagane dla 0, 250, 500, 2500 i 5000 MOI, korzystając z następującego wzoru: MOI = (objętość [μL] x PFU/μL)/liczba komórek. W przypadku Ad-CMV-Td-Tom o mianie 1 x10 10 (PFU/ml) wymagane objętości MOI infekcji wirusowej wynoszą odpowiednio 0, 3,75, 7,5, 37,5 i 75 μl.
- Zakażone komórki objętościami obliczonymi w sekcji 2.2 należy zainfekować je poprzez bezpośrednie pipetowanie zapasów wirusa do studzienek z dokładnym wymieszaniem.
- Umieścić płytkę w inkubatorze w temperaturze 37 °C z 10% CO2 na 24 godziny.
- Usunąć pożywkę z dołków i natychmiast utrwalić komórki 500 μl 10% formaliny przez 5 minut.
- Odessać formalinę ze studzienek i przemyć studzienki jednorazowo 500 μl PBS.
- Wybarwić jądro komórkowe 500 μl roztworu Hoechsta przez 5 minut.
- Usunąć roztwór Hoechst i przemyć studzienki 3 razy 500 μl PBS.
- Zobrazuj sygnał białka Td-Tomato i jądra komórkowego przy użyciu 200-krotnego powiększenia pod mikroskopem fluorescencyjnym. Wzbudz białko Td-Tomato przy 554 nm i barwnik Hoechst przy 352 nm.
- Analizuj obrazy za pomocą ImageJ, aby określić roboczy MOI wymagany do 100% infekcji Td-Tomato15.
3. Transdukcja podwójnego adenowirusa w żywych pojedynczych komórkach
- Nasiona 1,0 - 1,5 x 105 komórek MDA-MB-231 z 500 μl pożywki hodowlanej DMEM zawierającej 5% FBS w każdym dołku płytki 12-dołkowej (35% konfluencji komórek, łącznie 2 dołki).
- Zainfekuj komórki 75 μl Ad-CMV-GFP (miano = 5 x 109 PFU/ml) i 7,5 μl Ad-CAGA 12-Td-Tom (miano = 5 x10 10 PFU/ml), aby uzyskać 2,500 MOI, co może osiągnąć 100% dodatni wynik infekcji.
- Traktuj komórki z lub bez 0,25 μl TGF-β na studzienkę (10 mg / ml w magazynie, 5 ng / μl jako stężenie końcowe) natychmiast po zakażeniu adenowirusem.
- Umieścić płytkę w inkubatorze w temperaturze 37 °C z 10% CO2 na 24 godziny.
- Obrazuj żywe komórki za pomocą mikroskopu fluorescencyjnego z kontrastem fazowym. Wzbudz GFP przy 470 nm i białko Td-Tomato przy 554 nm.
- Napraw komórki i wybarwij jądro komórkowe zgodnie z opisem w krokach 1.6 - 1.9.
- Zobrazuj białko Td-Tomato i barwienie Hoechsta za pomocą mikroskopu fluorescencyjnego. Wzbudzić barwnik Hoechst przy długości fali 352 nm.
- Korzystając z ImageJ, oblicz procent komórek GFP i Td-Tomato-dodatnich15.
4. Żywa sygnalizacja jednokomórkowa w teście gojenia się ran
- Nasiona 4 - 5 x 105 komórek MDA-MB-231 z 1 ml pożywki hodowlanej DMEM zawierającej 5% FBS w każdym dołku płytki 6-dołkowej (50% zbieżności komórek, łącznie 2 dołki).
- Zainfekuj komórki 22,5 μl Ad-CAGA 12-Td-Tom (miano = 5 x 1010 PFU/ml, MOI = 2,500).
- Umieścić płytkę w inkubatorze w temperaturze 37 °C z 10% CO2 na 24 godziny.
- Zdrap dwie skrzyżowane linie na warstwie komórkowej każdej studzienki za pomocą końcówki pipety P200.
- Usuń stare pożywki z dołków i zastąp je 2 ml świeżej 5% pożywki FBS z lub bez 0,5 μl TGF-β na studzienkę (10 mg / ml w magazynie, 5 ng / μl jako stężenie końcowe).
- Umieścić płytkę w inkubatorze w temperaturze 37 °C z 10% CO2 na 5 min i wykonać zdjęcia wybranych obszarów rany przy użyciu 100-krotnego powiększenia na mikroskopie z kontrastem fazowym.
- Umieścić płytkę w inkubatorze w temperaturze 37 °C z 10% CO2 na 24 godziny.
- Zrób zdjęcia zamknięcia rany w tych samych miejscach, co wcześniej.
- Napraw komórki, wybarwij jądro komórkowe zgodnie z opisem w krokach 1.6 - 1.9 i wizualizuj sygnał Td-Tomato w obszarze rany i obszarze bez rany za pomocą 200-krotnego powiększenia pod mikroskopem fluorescencyjnym.
- Określ ilościowo procent komórek Td-pomidorowo-dodatnich w obszarze rany i bez rany za pomocą oprogramowania ImageJ15.
5. Test lucyferazy in vitro
- Przygotować zawiesinę komórek składającą się z 3 - 5 x 104 komórek MDA-MB-231 w 1 ml pożywki DMEM zawierającej 5% FBS.
- Zawiesinę komórek zainfekować 2,5 μl Ad-CAGA12-Luc (miano = 5 x 1010 PFU/mL, MOI = 2,500).
- Zasiać zainfekowane komórki na 96-dołkowej płytce w 3,000 komórek/100 μl/dołk.
- Umieścić płytkę w inkubatorze w temperaturze 37 °C z 10% CO2 na 24 godziny.
- Usunąć stare pożywki z dołków i zastąpić je 100 μl świeżych 5% pożywki FBS z lub bez 0,1 μl TGF-β na studzienkę (1 mg/ml w magazynie, 1 ng/μl jako stężenie końcowe) i w obecności lub bez 0,17 μl inhibitora TGF-β na studzienkę (7 mg/ml w magazynie, 12 ng/μL jako stężenie końcowe) (nowe białko pułapki liganda TGF-β, Chen i wsp., praca niepublikowana).
- Umieścić płytkę w inkubatorze w temperaturze 37 °C z 10% CO2 na 24 godziny.
- Rozmrozić substrat systemu oznaczania lucyferazy i przygotować 1x odczynnik do lizy hodowli komórkowych w wodzie podwójnie destylowanej (DDW).
- Usunąć pożywkę z 96 dołków i poddać lizie studzienki z 50 μl 1x buforu do lizy hodowli komórkowych na lodzie za pomocą wytrząsarki orbitalnej z delikatnym mieszaniem przez 30 minut.
- Przenieść 30 μl lizatu z każdej studzienki do nieprzezroczystej płytki lucyferazy i pozostawić płytkę do ogrzania do temperatury pokojowej.
- W oprogramowaniu luminometru utwórz nowy protokół. Wybierz dla 1 wtryskiwacza z pomiarami przed i po wstrzyknięciu. Ustaw pomiary przed wstrzyknięciem na 1 s zarówno dla opóźnienia pomiaru, jak i czasu integracji. W przypadku pomiaru po wstrzyknięciu należy ustawić objętość wtrysku na 40 μl z opóźnieniem pomiaru wynoszącym 1 s po wstrzyknięciu i czasem integracji 5 s. Potwierdź ustawienia, wybierając przycisk OK.
- Umieść rurkę wtryskiwacza w DDW i kliknij przycisk Wtryskiwacz 1 w ustawieniach Prime, aby wyczyścić rurkę wtryskiwacza przed użyciem. Następnie wyjmij rurkę wtryskiwacza z DDW i umieść ją w powietrzu, a następnie dwa kolejne Primes wtryskiwacza 1, aby wypłukać cały roztwór z rurki. Umieść rurkę wtryskiwacza w podłożu Firefly i ponownie zagruntuj dwukrotnie, aby przygotować podłoże.
- Umieść nieprzezroczystą płytkę lucyferazy z próbkami w luminometrze i wybierz Opcje w oprogramowaniu. Zaznacz interesujące Cię źródła i kliknij przycisk Zastosuj. Naciśnij Start, aby zmierzyć sygnał lucyferazy.
- Po zakończeniu pomiarów wyjmij płytkę i spłucz ją wodą. Odzyskaj pozostały substrat do rurki wtryskiwacza, umieszczając rurkę w powietrzu i zalej wtryskiwacz 1 z powrotem do rurki z substratem świetlika. Umieść rurkę wtryskiwacza w DDW i wykonaj dwa kolejne zapoczątkowania, aby oczyścić rurkę wtryskiwacza z pozostałego podłoża.
6. Przygotowanie komórek do obrazowania sygnalizacji na żywo in vivo
- 48 h przed implantacją nowotworu, nasiona 2 - 3x106 komórek MDA-MB-231 do 175 cm2 kolby (łącznie 10 kolb). Hodowla komórek w 20 ml pożywki DMEM zawierającej 5% FBS w temperaturze 37 °C, 10% CO2 .
- 24 godziny później dodać 300 μl Ad-CAGA12-Luc (miano = 5 x10 10 PFU/ml, MOI = 2,500) do każdej kolby. Trzymaj komórki w kulturze przez kolejne 24 godziny.
- W dniu implantacji należy usunąć stare podłoże i przemyć komórki zakażone adenowirusem jednorazowo 20 ml PBS o pH 7,4. Dodać 2 ml 0,05% trypsyny-EDTA do kolby i lekko potrząsnąć kolbą, aby trypsyna pokryła całą powierzchnię kolby. Umieścić kolbę w inkubatorze w temperaturze 37 °C, 10% CO2 na 3 minuty.
- Ugasić trypsynę, dodając 8 ml pożywki DMEM zawierającej FBS do kolb. Przenieś wszystkie zawiesiny komórek do szklanej butelki z odczynnikiem.
- Policz liczbę komórek za pomocą hemocytometru i przenieś 4,8 x 107 komórek do dwóch probówek wirówkowych o pojemności 50 ml.
- Odwirować komórki przy 400 x g przez 5 minut w temperaturze pokojowej w celu usunięcia trypsyny i ponownego zawieszenia komórek w 720 ml świeżej pożywki FBS-DMEM.
- Przenieść zawiesiny komórek do sterylnej probówki o pojemności 5 ml i dodać 160 μl Matrigel (10% całkowitej zawiesiny matrigelu).
- Utrzymuj komórki na lodzie do momentu implantacji.
7. Implantacja ortotopowa
- Zważ 12 myszy SCID i losowo przydziel myszy do grup kontrolnych i leczonych (6 myszy / grupę).
- Wykonaj implantację w sterylnym biogabinecie, aby utrzymać sterylne środowisko. Znieczulij mysz za pomocą 2,5 - 4,5% izofluranu o natężeniu przepływu tlenu 1 l/min. Umieść mysz na poduszce grzewczej i nałóż kroplę nawilżającej maści do oczu na oba oczy, aby uniknąć uszkodzenia rogówki. Przymocuj mysz do poduszki grzewczej w pozycji leżącej, zachowując znieczulenie, umieszczając pysk w stożku nosowym połączonym z izofluranem.
- O skuteczności znieczulenia świadczy brak reakcji na uszczypnięcie palca u nogi. Zmniejsz dawkę izofluranu do dawki podtrzymującej 1,5 - 2,5% z 1 l/min tlenu w celu przypomnienia o implantacji.
- Oczyść skórę od czwartego sutka po obu stronach do linii środkowej za pomocą bawełnianego wacika zamoczonego w 80% etanolu.
- Znajdź 4. poduszeczkę tłuszczową sutka poprzez badanie palpacyjne i ściśnij poduszeczkę tłuszczową, aby jeszcze bardziej odsłonić tkankę.
- Dobrze wymieszać zawiesinę komórkową, pipetując w górę i w dół. Delikatnie odessać 50 μl mieszaniny komórek do strzykawki insulinowej 27G i wstrzyknąć do poduszeczki tłuszczowej po obu stronach myszy.
- Potwierdź udane wstrzyknięcie, wyczuwając obrzęk poduszeczki tłuszczowej. Delikatnie zwolnij poduszeczkę tłuszczową i umieść mysz z powrotem w klatce.
- Pozostaw klatki na poduszce grzewczej na co najmniej 30 minut, aby myszy odzyskały przytomność, a następnie umieść klatki z powrotem w pomieszczeniu przetrzymywania na 3 dni.
8. Obrazowanie IVIS
- Otwórz oprogramowanie Living Image.
- Zainicjuj system IVIS, klikając przycisk Zainicjuj system IVIS na panelu sterowania. Poczekaj, aż znak temperatury zmieni kolor na zielony.
- Wybierz tryb obrazowania luminescencyjnego na panelu sterowania.
- Włączyć znieczulenie izofluranem do komory i systemu IVIS.
- Znieczulenie myszy za pomocą 2,5 - 4,5% izofluranu z 1 l / min tlenu. Po znieczuleniu należy ustawić izofluran na poziomie 1,5 - 2,5% w celu konserwacji. Wstrzyknąć 150 mg / kg masy ciała D-lucyferyny myszom przez wstrzyknięcie dootrzewnowe (i.p.).
- Natychmiast przenieś myszy do systemu IVIS, umieść je na platformie obrazowania o kontrolowanej temperaturze i umieść ich nos w stożku nosowym.
- Kliknij przycisk Sequence Setup (Ustawienia sekwencji) na panelu sterowania i wybierz opcję Medium Binning.
- Ustaw czas ekspozycji obrazowania w następujący sposób: 10 s, 20 s, 30 s, 60 s i 120 s. Rozpocznij obrazowanie około 3 minuty po wstrzyknięciu lucyferyny i kontynuuj obrazowanie, aż sygnał zacznie spadać (zwykle zajmie to około 20 minut).
- Usuń myszy z IVIS, utrzymując znieczulenie izofluranem przez stożek nosowy i potraktuj myszy 50 μl PBS lub 50 μl inhibitora sygnalizacji TGF-β (50 μg / guz) poprzez wstrzyknięcie do guza.
- Włóż myszy z powrotem do klatki i pozostaw je na poduszce grzewczej na co najmniej 30 minut. Następnie umieść klatkę z powrotem w pomieszczeniu do przechowywania.
- Powtórz procedurę obrazowania IVIS zgodnie z powyższym opisem następnego dnia po zabiegu.
9. Analiza danych
- Otwórz zapisane pliki w oprogramowaniu Living Image.
- Znajdowanie informacji o obrazie za pomocą punktu menu Widok | Informacje o obrazie.
- Wybierz zdjęcia zrobione w podobnym punkcie czasowym z tym samym czasem ekspozycji. Wczytywanie zdjęć jako grupa.
- Usuń zaznaczenie pola Indywidualne w obszarze Image Adjust, aby znormalizować intensywność.
- Wybierz tryb Photon, aby przeanalizować intensywność. Określ ilościowo intensywność sygnału, wybierając przycisk Region of Interest (ROI) w narzędziach ROI.
- Przeciągnij okrąg ROI do obszaru zawierającego sygnał bioluminescencyjny i kliknij przycisk Zmierz, aby uzyskać intensywność sygnału.