Procedura ta wymaga specjalistycznego przygotowania chirurgicznego nerki do obrazowania dwufotonowego oraz dostępu, co zostało zilustrowane na Rysunku 1. Przedstawione tutaj przygotowanie umożliwia utworzenie pionowej kolumny obrazującej z obiektywem nad nerką przy minimalnych zmianach gęstości, co zapewnia optymalne warunki optyczne dla mikroskopii dwufotonowej, przy jednoczesnym dostępie bocznym dla pipety, poruszanej wyłącznie w wymiarze poziomym (x). Częściowe wysunięcie nerki zapobiega nadmiernemu napięciu szypuły nerkowej i zachowuje przepływ naczyniowy, a konstrukcja niestandardowego wspornika nerki pozwala na realizację dwóch celów: obrazowania i dostępu. Drugim wyzwaniem w tej procedurze jest precyzyjne pozycjonowanie pipety wewnątrz nerki w trzech wymiarach, co wymaga kalibracji układów współrzędnych pipety i stolika. Krytyczny krok tego procesu przedstawiono na Rysunku 2, który ukazuje nanoszenie punktu pipety w kolumnie wodnej mikroskopu dwufotonowego przy wzbudzeniu DAPI. Wprowadzenie do kolumny wodnej i zarejestrowanie współrzędnych pipety względem współrzędnych stolika przed wejściem do nerki jest kluczowe dla zapewnienia precyzyjnego pozycjonowania stereotaktycznego pipety w docelowej przestrzeni Bowmana. Pipeta wchodzi do obrazującej kolumny wodnej z prawej strony. Po włączeniu wzbudzenia DAPI, pokryta czerwonymi kropkami kwantowymi pipeta intensywnie fluorescencyzuje na kolor czerwono-pomarańczowy i może być ostrożnie ustawiona pod środkiem obiektywu. Ponieważ wiązka wzbudzająca przechodzi przez środek obiektywu, pipetę można swobodnie przesuwać do punktu maksymalnej fluorescencji, co gwarantuje jej widoczność w okularze.
Prawidłowe wyciąganie pipet oraz dobór kłębuszków są kluczowe dla powodzenia tego protokołu, co zilustrowano w Rycina 3, Rycina 4, Rysunek 5W Rysunek 3Awidoczna jest prawidłowo dociągnięta szklana mikropipeta pokryta czerwono fluorescencyjnymi kropkami kwantowymi, obrazowana w kolumnie cieczy podczas etapu rejestracji pipety w procedurze. Szerokość końcówki wynosi 6 mikronów. W Rycina 3B, niedokładnie pobranej pipetą objętości 12 µm widoczna jest końcówka. Pipeta ta nie może przebić torebki nerkowej bez spowodowania urazu naczyniowego ze względu na 12 µm średnica i nieregularna powierzchnia końcówki (należy zwrócić uwagę na wiór na górnej krawędzi skosu). W Rycina 3C i 3Dprzedstawiono znaczenie optymalnego ustawienia, a nie samego obrazowania kłębuszka docelowego. Piękny kłębuszek położony blisko powierzchni, zilustrowany w Rycina 3C wykazuje korzystne właściwości obrazowania (ze względu na swoje położenie powierzchniowe w 20 µm poniżej torebki nerkowej), jednak nie nadawałaby się do dostępu za pomocą tej procedury, ponieważ znajduje się zbyt blisko powierzchni, przez co pipeta uderzyłaby w szkiełko nakrywkowe. W Rycina 3D, przedstawiono optymalnie usytuowane kłębuszki. Należy zwrócić uwagę na różną skalę zastosowaną do zilustrowania obu kłębuszków (paski skali są wszystkie 50 µm). Kłębuszki te wydają się mniej wyraźne ze względu na refrakcję spowodowaną głębokością; obraz ten został wykonany przy 70 µm pod torebką nerkową. Boczna krawędź nerki jest 250 µm w prawo, co zapewnia dostęp do obu tych kłębuszków. Podczas procedury dostępu obrazowanie jest ściśle skoncentrowane na kłębuszku docelowym, jak pokazano w Rysunek 4stosuje się akwizycję obrazu co sekundę, co pozwala badaczowi na precyzyjną obserwację rozmieszczenia pipety w przestrzeni Bowmana.
Rysunek 4 przedstawia typowe wprowadzenie do nerki i wynik w postaci końcówki pipety w przestrzeni Bowmana. Na Rysunku 4A średnia projekcja intensywności ze stosu z-stack z widokami ortogonalnymi pokazuje końcówkę pipety w przestrzeni Bowmana. Należy zauważyć obecność czerwonego artefaktu spektralnego końcówki pipety (okrągła kula fluorescencji) wynikającego z niezwykle silnej fluorescencji kropek kwantowych rozmieszczonych na stożkowej sekcji końcówki. Na Rysunku 4B projekcja objętości danych ze stosu z-stack pokazuje kolejną pipetę w przestrzeni Bowmana. Należy zwrócić uwagę, że podczas wprowadzania pipeta pociągnęła torebkę Bowmana w kierunku ruchu, powodując widoczne namiotowanie za końcówką, zgodnie z opisem w protokole.
Na Rysunku 5 przedstawiono wyniki nieudanej procedury, w której pipeta o zbyt dużym otworze pękła na wysokości torebki nerkowej, powodując krwawienie. Pipeta była zbyt tępa; podczas próby przebicia torebki nerkowej, torebka była pchana przed końcówką pipety, aż do momentu pęknięcia. Na tym obrazie torebka nerkowa jest widoczna w zielonej fluorescencji FITC, uwydatniona przez krwawienie podtorebkowe. Sygnał FITC jest widoczny wewnątrz samej pipety, co wskazuje, że krew pod ciśnieniem dostała się do światła pipety. Strzałka wskazuje liczne erytrocyty widoczne w świetle pipety jako ubytki wypełnienia w FITC-dekstranie.
Rysunek 6 przedstawia reprezentatywne widmo masowe uzyskanego aspiratu z przestrzeni Bowmana, białka moczowego myszy 17 (MUP17). Na koniec, Tabela 1 prezentuje przykładowe wyniki pomyślnych procedur aspiracji, wymieniając białka zidentyfikowane za pomocą nanomasowej spektrometrii w aspiracie pobranym w ciągu 6 minut od każdej z 3 myszy. W każdym przypadku obrazowano pipetę podczas jej wycofania z przestrzeni Bowmana; w przestrzeni Bowmana ani w świetle pipety nie zaobserwowano fluorescencji FITC, co wskazuje na brak zanieczyszczenia aspiratu osoczem. Zidentyfikowano 17 białek, głównie o niskiej masie cząsteczkowej, na podstawie minimum 2 unikalnych peptydów na białko. Liczba zliczeń spektralnych jest niska, co jest zgodne z wcześniejszymi szacunkami zawartości białek w filtracie kłębuszkowym; obecne są znane białka filtrowane, takie jak białko wiążące witaminę D (VTDB), albuminy (ALBU) oraz główne białko moczowe 17 (MUP17).

Rycina 1: Częściowa ekstruzja nerki z niestandardowym wspornikiem i unieruchomieniem do dostępu bocznego. Po lewej stronie przedstawiono elementy kolumny obrazującej i wspornika nerki, a w centrum kompletny zespół. Po prawej stronie pokazano preparat nerki przed (powyżej) i po (poniżej) zastosowaniu wspornika. Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 2: Zakończone przygotowanie nerki na etapie rejestracji pipety w protokole. Tutaj wzbudzenie DAPI jest wykorzystywane do pozycjonowania mikropipety w kolumnie wody mikroskopu dwufotonowego. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.

Rysunek 3: Obrazowanie pipet oraz nerki po wstrzyknięciu FITC-dekstranu, demonstrujące kłębki nerkowe odpowiednie i nieodpowiednie do mikropunkcji. A. Dobrze wyciągnięta pipeta z końcówką 6 µm. B. Końcówka tępa, o nierównych krawędziach. C. Ten kłębek nerkowy jest wyraźnie zarysowany, ale znajduje się zbyt blisko szkiełka podstawowego, aby przeprowadzić mikropunkcję. D. Kłębki nerkowe o odpowiednim położeniu. Wszystkie paski skali wynoszą 50 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 4: Prawidłowe wprowadzenie pipety prowadzi do jej umieszczenia w przestrzeni Bowmana – widoki z dwóch różnych procedur. A. Z-stack z projekcjami ortogonalnymi obrazuje końcówkę pipety w przestrzeni Bowmana, przylegającą do kłębuszka nerkowego. Pasek skali: 50 µm. B. Renderowanie objętościowe z z-stacku w podobny sposób obrazuje pipetę w przestrzeni Bowmana, przylegającą do kłębuszka nerkowego. Pasek skali: 100 µm. Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 5: Nieudana procedura spowodowana tępą pipetą, co doprowadziło do przerwania torebki nerkowej i krwawienia do światła pipety. Wewnątrz pipety widoczna jest fluorescencja FITC z wynaczynionej plazmy oraz erytrocyty (strzałka). Strzałka wskazuje erytrocyty widoczne w świetle pipety. Pasek skali wynosi 50 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 6: Widmo masowe głównego białka moczowego 17 (MUP17), uzyskane z analizy nanoscale liquid chromatography/mass spectrometry aspiratu z przestrzeni Bowmana. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.
| Białko | MW (kDa) | Średnia liczba zliczeń spektralnych |
| ACTA_MOUSE | 42 | 2 |
| ACTB_MYSZ | 42 | 1 |
| CLPX_MYSZ | 69 | 2.5 |
| DHSA_MYSZ | 73 | 1 |
| FOLR2_MYSZ | 29 | 1 |
| GBLP_MYSZ | 35 | 1 |
| ALBU_MOUSE | 66 | 6.7 |
| HBA_MYSZ | 15 | 2 |
| HBB1_MOUSE | 16 | 1 |
| MIB1_MYSZ | 110 | 1 |
| MUP17_MYSZ | 21 | 1 |
| PERYFERIE_MYSZY | 54 | 1 |
| RNAS4_MYSZ | 17 | 2 |
| SPTB1_MYSZ | 2 | 1 |
| VIME_MYSZ | 54 | 1 |
| VTDB_MOUSE | 53 | 1 |
Tabela 1: Lista białek zidentyfikowanych w aspiracie z przestrzeni Bowmana u 3 myszy.
Wideo uzupełniające 1: renderowanie objętościowe ze stosu obrazów z-stack, pozyskanych po umieszczeniu pipety w przestrzeni Bowmana, pokazuje końcówkę pipety wewnątrz tej przestrzeni, przylegającą do kłębuszka kapilarnego. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.