$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Sieć neuronowa układu oddechowego pnia mózgu stanowi żyzną dziedzinę do zrozumienia ogólnych cech rytmicznych sieci neuronowych. W szczególności zainteresowanie dotyczy rozwoju oddychania noworodków przez gryzonie i zrozumienia, jak rozwija się rytm oddychania. Można to zrobić przy użyciu podejścia wielopoziomowego, w tym pletyzmografii in vivo całych zwierząt, nagrań nerwów en bloc in vitro oraz nagrań in vitro slice, które zawierają generator rytmu oddechowego. Redukcjonistyczne zapisy in vitro en bloc i slice są korzystną metodą do wykorzystania podczas badania mechanizmów stojących za rytmogenezą oddechową i obwodami neuronalnymi w obszarze pnia mózgu i rdzenia kręgowego rozwijających się gryzoni. Rozwijający się układ oddechowy obejmuje około 40 typów komórek, charakteryzujących się wzorcem zapłonu, w tym komórki centralnego układu oddechowego1,2. Centralna sieć oddechowa obejmuje grupę rytmicznie aktywnych neuronów zlokalizowanych w rdzeniu rostralnym brzuszno-bocznym1,3. Rytmogeneza oddechowa ssaków jest generowana przez autorytmiczną sieć interneuronów nazwaną kompleksem preBötzingera (pBC), która została zlokalizowana eksperymentalnie za pomocą zarówno warstwowych, jak i en bloc preparatów rdzenia mózgowo-rdzeniowego noworodków ssaków3,4,5,6,7,8. Region ten pełni podobną funkcję do węzła zatokowo-przedsionkowego (SA) w sercu i generuje wdechowy system pomiaru czasu do napędzania oddychania. Z pBC rytm wdechowy jest przenoszony do innych obszarów pnia mózgu (w tym do jądra ruchowego podjęzykowego) i rdzeniowych pul motorycznych (takich jak przeponowe neurony ruchowe, które napędzają przeponę)9.
Aktywność rytmiczną można uzyskać za pomocą preparatów en bloc rdzenia kręgowego pnia mózgu lub wycinków z różnych populacji komórek, w tym korzonków nerwowych C3-C5, korzeni nerwowych XII, jądra ruchowego podjęzykowego (XII MN), neuronów przedruchowych podjęzykowych (XII pMN) oraz pBC3,10,11,12. Chociaż te metody gromadzenia danych odniosły sukces w kilku laboratoriach, wiele protokołów nie jest przedstawionych w sposób, który byłby w pełni odtwarzalny dla nowych badaczy wkraczających w tę dziedzinę. Uzyskanie żywotnych i rytmicznie aktywnych preparatów en bloc i plastrów wymaga szczególnej dbałości o szczegóły na wszystkich etapach protokołu rozwarstwiania i krojenia plastrów. Poprzednie protokoły obszernie opisywały różne procedury rejestracji i elektrofizjologii, ale brakowało im szczegółów w najbardziej krytycznej części uzyskania żywej preparatyki tkankowej: wykonaniu sekcji pnia mózgu i rdzenia kręgowego oraz procedury cięcia.
Efektywne uzyskanie rytmicznie aktywnego i zdolnego do wykonywania en bloc lub slice zapisów elektrofizjologii pnia mózgu i rdzenia kręgowego wymaga, aby wszystkie kroki były wykonywane poprawnie, ostrożnie i szybko (zazwyczaj cała procedura związana tutaj może być wykonana w około 30 minut). Punkty krytyczne protokołu elektrofizjologii pnia mózgu i rdzenia kręgowego, które nie zostały wcześniej dobrze opisane, obejmują preparację korzonków nerwowych i procedurę krojenia wibratomu. Protokół ten jest pierwszym, który krok po kroku wizualnie komunikuje sekcję pnia mózgu i rdzenia kręgowego zarówno dla nowych badaczy, jak i ekspertów w tej dziedzinie. Protokół ten dokładnie wyjaśnia również techniki chirurgiczne, punkty orientacyjne i inne procedury, aby pomóc przyszłym badaczom w standaryzacji plastrów i preparatów en bloc, aby zawierały dokładnie takie obwody, jakie są pożądane w każdym eksperymencie. Przedstawione tutaj procedury mogą być stosowane zarówno u nowonarodzonych szczeniąt szczurów, jak i myszy.