$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Trójwymiarowe (3D) systemy hodowli często bardziej odwzorowują odpowiedzi komórkowe in vivo niż tradycyjne dwuwymiarowe (2D) systemy hodowlane, zobacz kilka doskonałych publikacji1,2,3. Jednak wykorzystanie systemów hodowli 3D do pomiaru funkcji komórek było wyzwaniem ze względu na trudności w pobieraniu komórek i dalszym przetwarzaniu próbek. Ta trudność ogranicza pomiar wielu funkcji komórkowych w systemach hodowli 3D. Aby przezwyciężyć tę trudność, potrzebne są nowe techniki, które umożliwią łatwy pomiar funkcji komórek w środowiskach 3D. Jednym ze sposobów zaspokojenia tej potrzeby jest opracowanie materiałów, które nie tylko wspierają hodowlę komórek 3D, ale także zawierają czujniki do pomiaru funkcji komórek. Na przykład kilka systemów hydrożelowych zawiera frakcje rozszczepialne proteazy fluorogennej, aby umożliwić wizualizację aktywności proteazy w środowiskach 3D4,5,6,7. Podczas gdy systemy te były pierwotnie wykorzystywane do obrazowania mikroskopowego, systemy te można również dostosować do użycia w globalnym teście aktywności metaloproteinazy macierzy (MMP) przy użyciu standardowego czytnika płytek, umożliwiając łatwy pomiar funkcji komórki w środowisku 3D8.
MMPs, nadrodzina proteaz cynkowych, odgrywa kluczową rolę w normalnej homeostazie tkanek i w wielu chorobach. MMP degradują i przebudowują macierz zewnątrzkomórkową (ECM), rozszczepiają receptory i cytokiny na powierzchni komórek oraz aktywują inne MMP9,10. MMP odgrywają kluczową rolę w procesach fizjologicznych, takich jak gojenie się ran oraz w chorobach takich jak zapalenie stawów, miażdżyca, choroba Alzheimera i rak (zobacz recenzje w 9,10,11). W przypadku nowotworów wysoki poziom ekspresji MMP jest silnie skorelowany z przerzutami raka i złym rokowaniem12. Co więcej, MMP przyczyniają się do progresji nowotworu, promując inwazję i migrację komórek rakowych, procesy komórkowe, które są z natury zjawiskami 3D13,14. W związku z tym istnieje duże zainteresowanie możliwością pomiaru aktywności MMP w kulturze 3D w wielu kontekstach, w tym w podstawowych badaniach biologicznych i testach przesiewowych leków.
Hydrożele PEG są szeroko stosowane do hodowli komórkowych 3D ze względu na ich wysoką zawartość wody, odporność na adsorpcję białek i przestrajalny charakter. Hydrożele PEG zostały sfunkcjonalizowane wieloma ugrupowaniami w celu kierowania funkcją komórki, takich jak peptydy mimetyczne ECM, takie jak RGD, RLD i IKVAV w celu ułatwienia adhezji komórek lub bezpośredniego wiązania czynników wzrostu, takich jak transformujący czynnik wzrostu-β (TGF-β)15,16. Ostatnio hydrożele PEG zostały sfunkcjonalizowane peptydami czujnikowymi, które umożliwiają również pomiar funkcji komórek5,8. W szczególności zastosowanie systemu hydrożelowego PEG funkcjonalizowanego fluorogennym peptydem degradowalnym MMP umożliwiło pomiar aktywności komórkowej MMP w kulturach 3D za pomocą standardowego czytnika płytek i nie wymagało dalszego przetwarzania. Systemy te są również kompatybilne z innymi pomiarami funkcji komórkowych, w tym aktywności metabolicznej. W tym miejscu opisano protokół pomiaru aktywności MMP komórek hodowanych w hydrożelu 3D PEG funkcjonalizowanym fluorogennym peptydem degradowalnym MMP, a także przedstawiono wyniki demonstrujące wstępne eksperymenty optymalizacyjne potrzebne do zastosowania tego testu. Ludzkie komórki czerniaka (A375) zostały zamknięte w hydrożelach fluorogennych w zakresie gęstości wysiewu w celu określenia odpowiednich gęstości wysiewu, które mieszczą się w zakresie roboczym testu. Po 24 godzinach enkapsulacji zmierzono MMP i aktywność metaboliczną za pomocą standardowego czytnika mikropłytek. Następnie aktywność MMP znormalizowano do aktywności metabolicznej w celu określenia gęstości wysiewu w liniowym zakresie testu. Na koniec obliczono procentowy współczynnik zmienności wewnątrzpłytkowej (% CV) między trzema powtórzeniami, aby odzwierciedlić odtwarzalność uzyskanych wyników. Metoda ta umożliwia prostą i szybką hodowlę komórkową 3D oraz łatwy pomiar aktywności proteazy przy minimalnym przetwarzaniu próbki.