$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Niektóre składniki ECM, w tym kolagen typu I, tworzą trójwymiarowe struktury in vivo1. Hodowla na takim trójwymiarowym, żelowym podłożu zapewnia więcej warunków fizjologicznych in vitro niż na dwuwymiarowej, plastycznej powierzchni 1,2,3,4. Opisano liczne protokoły dotyczące metody hodowli żelowej, takie jak stosowanie kolagenu typuI 1,2,3,4,6,7,11, kolagenu typu IV14,15 i Matrigel16. Kolagen typu I jest dobrze zdefiniowanym i szeroko stosowanym materiałem ze względu na jego obfitość i łatwość obsługi. Cechy oczyszczonego kolagenu typu I zależą od gatunku zwierzęcia, wieku i metod oczyszczania 5,17. Kolagen typu I można oczyszczać za pomocą kwasu octowego i/lub proteaz, takich jak pepsyna, papaina i proktaza 5,17. Kolagen rozpuszczalny w kwasach utrzymuje amino-telopeptydy, a kolagen rozpuszczalny w proteazie to rozszczepione amino-telopeptydy 5,17. Zarezerwowana długość amino-telopeptydów zależy od rodzaju proteaz, a obecność telopeptydów wpływa na morfologię włókienek i wytrzymałość żelu 5,17. Lepkość rozpuszczalnych w kwasach włókien kolagenowych jest większa niż kolagenów traktowanych proteazą17. W tym badaniu użyliśmy rozpuszczalnego w kwasach kolagenu bydlęcego typu I. Kolagen rozpuszczalny w pepsynach może być również stosowany w tym protokole hodowli żelu; Jednak siła żelu jest słabsza17. Te różnice w materiałach mogą powodować różnice w zachowaniu komórek, ale obecnie nie są one dobrze poznane.
Protokół hodowli żelowej opisany w tym badaniu jest bardzo prosty. Zgłoszono wiele modyfikacji tej metody. Jedną z możliwych modyfikacji hodowli keratynocytów jest naśladowanie błony podstawnej. Żele kolagenowe typu IV mogą być lepsze do utrzymania struktury substratu przypominającej błonę podstawną in vitro15,18. Jednak do przygotowania żeli kolagenowych typu IV wymagany jest długi okres inkubacji 14,15,18. Zamiast tego mieszanie kolagenu typu IV z żelami kolagenowymi typu I może wytworzyć nowe substraty hodowlane (żele hybrydowe kolagenu typu I/typu IV)19. Te hybrydowe żele są łatwe w obsłudze, wymagają krótkiego czasu żelowania i dają więcej warunków przypominających błonę podstawną dla keratynocytów. W hybrydowych żelach kolagenowych typu I/typu IV keratynocyty przeżywają, tworzą kolonie i indukują końcowe różnicowanie19. Ta hybrydowa metoda ma wszechstronne zastosowanie.
Hodowla na żelu z użyciem kolagenu typu I wpływa na komórki rakowe. W postaci fibrylowej kolagenu typu I aktywacja Akt i wzrost komórek Caco-2 (linia komórkowa raka jelita grubego) są hamowane7. Ponadto wzrost ludzkich komórek czerniaka (M24met) w postaci włókienki zostaje zatrzymany w punkcie kontrolnym G1/S20. Ponadto obserwuje się znaczny wzrost poziomu reaktywnych form tlenu w mysich preadipocytach 3T3-L1 hodowanych na formie fibrylowej. Ponadto proliferacja i migracja komórek są stymulowane w przeciwnych kierunkach przez niewłókniste i fibrylowe formy kolagenu typu I21.