Wszechstronnie wykorzystywana, spektroskopia oscylacyjna generowania częstotliwości sumy (SFG) może pomóc w ujawnieniu kolejności konformacyjnej łańcucha i wtórnych zmian strukturalnych zachodzących na granicy faz polimerów i biomakromolekuł.
Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.
Artykuł metodologiczny
Wszechstronnie wykorzystywana, spektroskopia oscylacyjna generowania częstotliwości sumy (SFG) może pomóc w ujawnieniu kolejności konformacyjnej łańcucha i wtórnych zmian strukturalnych zachodzących na granicy faz polimerów i biomakromolekuł.
Jako nieliniowa spektroskopia optyczna drugiego rzędu, spektroskopia oscylacyjna z generowaniem częstotliwości sumy (SFG) jest szeroko stosowana w badaniu różnych powierzchni i interfejsów. Ta nieinwazyjna technika optyczna może dostarczyć lokalnych informacji na poziomie molekularnym z czułością jednowarstwową lub submonowarstwową. Przedstawiamy tutaj eksperymentalną metodologię, w jaki sposób selektywnie wykrywać zakopany interfejs zarówno dla makrocząsteczek, jak i biomakrocząsteczek. Mając to na uwadze, omówiono międzyfazowe struktury drugorzędowe fibroiny jedwabiu oraz struktury wodne wokół modelowego dupleksu oligonukleotydowego o krótkich łańcuchach. Pierwszy z nich wykazuje nakładanie się łańcuch-łańcuch lub efekt przestrzennego uwięzienia, a drugi wykazuje funkcję ochronną przed jonamiCa2+ wynikającymi z chiralnej nadbudowy kręgosłupa wody.
Rozwój spektroskopii oscylacyjnej z generowaniem częstotliwości sumy częstotliwości (SFG) można datować na prace wykonane przez Shen et al. trzydzieści lat temu1,2. Unikalność selektywności międzyfazowej i czułości submonowarstwowej sprawia, że spektroskopia oscylacyjna SFG jest doceniana przez dużą liczbę badaczy w dziedzinach fizyki, chemii, biologii, materiałoznawstwa itp3,4,5. Obecnie przy użyciu SFG badany jest szeroki zakres zagadnień naukowych związanych z powierzchniami i granicami faz, zwłaszcza w przypadku złożonych interfejsów w odniesieniu do polimerów i biomakrocząsteczek, takich jak struktury łańcuchowe i relaksacja strukturalna na zakopanych interfejsach polimerów, drugorzędowe struktury białkowe i międzyfazowe struktury wodne9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26.
Dla powierzchni i interfejsów polimerowych, próbki cienkowarstwowe są zazwyczaj przygotowywane przez powlekanie wirowe w celu uzyskania pożądanych powierzchni lub interfejsów. Problem wynika z zakłóceń sygnału z dwóch interfejsów przygotowanych folii, co prowadzi do niedogodności związanych z analizą zebranych widm SFG27,28,29. W większości przypadków pożądany jest sygnał wibracyjny tylko z jednego interfejsu, folii/podłoża lub folii/drugiego medium. W rzeczywistości rozwiązanie tego problemu jest dość łatwe, a mianowicie eksperymentalnie zmaksymalizować pola świetlne na pożądanym interfejsie i zminimalizować pola świetlne na drugim interfejsie. W związku z tym współczynniki Fresnela lub lokalne współczynniki pola muszą zostać obliczone za pomocą modelu cienkowarstwowego i zweryfikowane w odniesieniu do wyników eksperymentalnych3,9,10,11,12,13,14,15,30.
Mając na uwadze powyższe, niektóre interfejsy polimerowe i biologiczne mogłyby zostać zbadane w celu zrozumienia podstawowej nauki z poziomu molekularnego. Poniżej weźmy jako przykłady trzy zagadnienia międzyfazowe: sondowanie powierzchni poli(2-hydroksyetylometakrylanu) (PHEMA) i zakopanego interfejsu z podłożem9, tworzenie drugorzędowych struktur fibroiny jedwabiu (SF) na powierzchni polistyrenu (PS) i struktur wodnych otaczających modelowy krótkołańcuchowy oligonukleotyd duplex16,21pokażemy, w jaki sposób spektroskopia oscylacyjna SFG pomaga ujawnić międzyfazowe struktury na poziomie molekularnym w związku z podstawową nauką.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
1. Eksperyment SFG
2. Współczynniki Fresnela
(1)
oznacza efektywny tensor nieliniowej podatności drugiego rzędu.
składa się z trzech części: interfejsu pryzmat/polimer, interfejsu polimer/dolne medium (dolne medium obejmuje gaz, ciecz lub ciało stałe) oraz tła nieresonansowego, co przedstawiono w następującym równaniu.
(2)
(3)
(4)
(5)
(6)
(7)
(8)
(9)
(10)
(11)
(12)
(13)
(14)
(15)
(16)
(17)
(18)
(19)
(20)
(21)
(22)
(23)
(24)3. Kombinacja polaryzacji chiralnej SFG
4. Przygotowanie próbek
(25)
oznacza intensywność q-tego modu wibracyjnego,
oznacza częstotliwość rezonansową,
oznacza połowę szerokości połówki maksimum (HWHM), a
oznacza częstotliwość skanowania padającej wiązki IR.Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
W części sekcji protokołu dotyczącej współczynnika Fresnela pokazaliśmy, że teoretycznie możliwe jest selektywne wykrywanie tylko jednego pojedynczego interfejsu w danym czasie. Tutaj, drogą eksperymentalną, potwierdziliśmy, że ta metodologia jest w zasadzie poprawna, co przedstawiono na Rysunku 5 oraz Rysunku 6.
Rysunek 5 przedstawia strukturę zakopanej warstwy międzyfazowej PHEMA po penetracji wod...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Aby zbadać informacje strukturalne na poziomie molekularnym, SFG ma swoje nieodłączne zalety (tj. czułość jednowarstwową lub submonowarstwową i selektywność międzyfazową), które można zastosować do badania różnych granic faz, takich jak granice faz ciało stałe/ciało stałe, ciało stałe/ciecz, ciało stałe/gaz, ciecz/gaz, ciecz/ciecz. Chociaż konserwacja sprzętu i wyrównanie optyczne są nadal czasochłonne, korzyści są znaczące, ponieważ można uzyskać szczegółowe informacje na poziomie molekularnym na powierzchniach i interf...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Nie mamy nic do ujawnienia.
To badanie było wspierane przez Państwowy Program Rozwoju Kluczowych Badań Podstawowych Chin (2017YFA0700500) oraz Narodową Fundację Nauk Przyrodniczych Chin (21574020). Dużym uznaniem cieszyły się również Fundusze na Badania Podstawowe dla Uniwersytetów Centralnych, projekt finansowany przez Priorytetowy Program Akademicki Rozwoju Instytucji Szkolnictwa Wyższego Jiangsu (PAPD) oraz Narodowe Centrum Demonstracyjne Eksperymentalnej Edukacji Inżynierii Biomedycznej (Uniwersytet Południowo-Wschodni).
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| 1,2-dipalmitoilo-sn-glicero-3-fosfocholina (DPPC) | Avanti Polar Lipids, Inc. | 850355P-1g | |
| Bezwodny etanol | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 100092680 | ≥ 99,7% |
| pryzmat CaF2 | Chengdu YaSi Optoelectronics Co., Ltd. | ||
| Chlorek wapnia bezwodny | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10005817 | ≥ 96.0% |
| deuterowany DPPC (d-DPPC) | Avanti Polar Lipids, Inc. | 860345P-100mg | |
| Piekarnik elektromagnetyczny | Zhejiang Supor Co., Ltd | C21-SDHCB37 | |
| Langmuir-Blodgett (LB) koryto | KSV NIMA Co., Ltd. | KN 2003 | |
| Bromek litu bezwodny | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 20056926 | |
| System syntezy Milli-Q | Millipore | Ultraczysta woda | |
| Środek do czyszczenia plazmy | Chengdu Mingheng Science& Technology Co., Ltd | PDC-MG | Czyszczenie plazmą tlenową |
| Poli(2-hydroksyetylometakrylan) (PHEMA) | Sigma-Aldrich Co., LLC. | 192066 MSDS | Mw = 300 000 |
| Polistyren | Sigma-Aldrich Co., LLC. | 330345 MSDS | Mw = 48 kDa i Mn = 47 kDa |
| Kokony | Z Bombyx mori | ||
| Pojedyncza komplementarna nić oligonukleotydu | Nanjing Genscript Biotechnology Co., Ltd. | H03596 | 5'-CGAAGGCTTCCAGCT-3'Pojedyncza |
| nić oligonukleotydu | Nanjing Genscript Biotechnology Co., Ltd. | H04936 | 3¢-koniec zmodyfikowany przez cholesterol-glikol trietylenowy (Chol-TEG) (5¢-GCTTCCGAAGGTCGA-3¢) |
| Węglan sodu bezwodny | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10019260 | ≥ 99.8% |
| Powlekarka spinowa | Instytut Mikroelektroniki Chińskiej Akademii Nauk | KW-4A | Do prezentacji folii ploymer |
| Profilomierz krokowy | Veeco | DEKTAK 150 | Do pomiaru grubości warstwy |
| System spektroskopii oscylacyjnej z generowaniem sumy częstotliwości (SFG) | EKSPLA | Komercyjny pikosekundowy system SFG |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.