ASC są atrakcyjnym źródłem MSCs ze względu na łatwy dostęp do tkanki. Zarówno w przypadku zastosowań klinicznych, jak i badawczych, naukowcy muszą pamiętać o zmienności dawców podczas izolowania i hodowli tych komórek. Z przyczyn, które nie zostały jeszcze wyjaśnione, MSCs od różnych dawców wykazują różne zdolności do namnażania się in vitro, co z kolei wpływa na migrację ASC z eksplantatu tkanki tłuszczowej i zdolność do proliferacji. Podczas gdy zmienność można zaobserwować w czasie potrzebnym do osiągnięcia konfluencji przez ASC wyizolowane z tych bezenzymatycznych eksplantatów, rzadko zdarzało się, aby próbka nie namnażała się in vitro.
Poza zmiennością dawcy, najbardziej prawdopodobnym źródłem niepowodzenia komórek w migracji z tkanki i/lub proliferacji in vitro jest czas, w którym tkanka była przechowywana przed przetwarzaniem. Gdy próbki pozostawiono na >12 godzin przed przetworzeniem lub gdy nie były utrzymywane w stanie wilgotnym między zbiorem a przetwarzaniem, zaobserwowano gorsze tempo migracji i proliferacji. Jedynymi próbkami, które często nie ulegały namnażaniu się, były próbki z plastyki brzucha, które nie były utrzymywane w wilgoci roztworem soli fizjologicznej: w takich przypadkach tkanka w środku bloku tkankowego była często wystarczająco wilgotna, aby można ją było przetworzyć, ale czasami trzeba było ją wyrzucić. Dlatego tak ważne jest, aby tkanka była wilgotna od momentu zbioru do przetworzenia.
W przypadkach, gdy ASC nie są obserwowane na płytce po 1 tygodniu, eksplantaty tkanki tłuszczowej powinny być nadal usuwane z płytek kultur tkankowych, aby nie doszło do martwicy tkanek. Czasami jest zbyt mało komórek, aby można je było łatwo zidentyfikować, ale te kilka komórek będzie zdolnych do ekspansji w systemie hodowlanym. Jeśli komórki nadal nie są obserwowane po 3 tygodniach, izolację należy uznać za nieudaną.
W niektórych przypadkach, szczególnie w przypadku plastyki brzucha, nie jest możliwe uzyskanie prawdziwie aseptycznej próbki ze względu na ograniczenia na arenie chirurgicznej. Jeśli nie jest możliwe użycie sterylnego naczynia do transportu tkanki z sali operacyjnej do okapu z przepływem laminarnym, usunięcie zewnętrznego 1 cm tkanki jest na ogół wystarczające, aby zapobiec skażeniu mikroorganizmami. Jeśli próbka abdominoplastyki jest przymocowana do skóry, skórę można przetrzeć 70% etanolem, aby wysterylizować tę powierzchnię przed zmieleniem tkanki tłuszczowej.
Podczas procesu mielenia bardzo ważne jest, aby tkanka została zmielona na małe, drobne kawałki. Jeśli eksplantaty są zbyt duże, nie będzie wystarczającej powierzchni, aby ASC mogły wydostać się z tkanki na płytkę. Ponadto bardzo ważne jest, aby tkanka nie pozostawała na płytce dłużej niż to konieczne, aby tkanka nie uległa martwicy.
Ograniczeniem tej metody jest zastosowanie enzymu (w opisanym protokole trypsyny) do odłączania ASC podczas procesu hodowli tkankowej. Inne enzymy niepochodzenia zwierzęcego, takie jak Accutase, można zastąpić, aby wyeliminować potrzebę stosowania produktów pochodzenia zwierzęcego, jednak zwiększy to koszt hodowli tkankowej. Między innymi z tego powodu liczne grupy badają niedwuwymiarowe metody hodowli tkankowej, takie jak bioreaktory i systemy oparte na rusztowaniach, w celu zwiększenia potencjału wzrostu MSC przy jednoczesnym zminimalizowaniu konieczności odłączania komórek od ich substratu22.
Przy przenoszeniu ASC do kliniki głównym ograniczeniem metody izolacji eksplantatów jest poleganie na urządzeniu do hodowli tkankowej na poziomie dobrej praktyki produkcyjnej (GMP), którego brakuje wielu ośrodkom medycznym. W takich przypadkach konieczne byłoby zastosowanie którejkolwiek z samodzielnie dostępnych na rynku metod opartych na enzymach lub wirowaniu. Oczekuje się jednak, że w miarę jak urządzenia GMP stają się coraz bardziej rozpowszechnione, efekt ten będzie ograniczony. W międzyczasie, nawet takie ośrodki, w których brakuje urządzeń do hodowli tkankowych GMP, mogą rozważyć zastosowanie metody eksplantacji do badania ASC in vitro: im mniej manipulacji, tym bardziej komórki te są zbliżone do swoich odpowiedników in vivo11.
Metoda ta zapewnia prosty sposób izolowania ASC z tkanki tłuszczowej - zarówno lipoaspiratów, jak i abdominoplastyki - przy braku ostrych enzymów lub etapów wirowania. Podczas gdy początkowa wydajność ASC jest niższa niż w przypadku innych metod, ASC będą się rozmnażać in vitro, minimalizując efekt niższej początkowej wydajności. Brak nadmiernej lub wymuszonej manipulacji sprawia, że ASC izolowane w taki sposób są szczególnie istotne, ponieważ jest mniej pytań (tj. czy obserwowane efekty są spowodowane samymi komórkami, czy też manipulacją komórek podczas procesu izolacji).