$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Konwencjonalne dwuwymiarowe (2D) badania nad hodowlą komórek znacząco przyczyniły się do badań nad rakiem. Obecnie naukowcy skłaniają się ku trójwymiarowym (3D) testom hodowli komórkowych, aby lepiej naśladować warunki in vivo1. Hodowla komórek nowotworowych 3D dokładniej odzwierciedla złożone mikrośrodowisko guza pod względem interakcji komórka-komórka i komórka-macierz, profili ekspresji genów, wrażliwości leku i aktywności szlaku sygnałowego2,3.
W badaniach nad rakiem wykorzystuje się kilka modeli hodowli komórek 3D, takich jak eksplantacja tkanki nowotworowej, guz na chipie i sferoidy guza wielokomórkowego3,4. Sferoidy wielokomórkowe guzów są obecnie szeroko stosowane, ponieważ naśladują kilka cech warunków in vivo w ludzkich nowotworach1,5. Gdy średnica sferoidy jest większa niż 500 μm, ma nawet obszary niedotlenione i nekrotyczne centrum, reprezentujące w ten sposób sytuację guza in vivo2.
Wiele syntetycznych (np. polidimetylosiloksan) i zwierzęcych (np. kolagen z ogona szczura typu I i matryca pochodząca z mięsaka myszy, Matrigel, określana jako MSDM) zostało opracowanych do testów hodowli komórkowych 3D3,6,7,8. Do tej pory żadna z dostępnych na rynku matryc nie pochodziła z ludzkiej tkanki nowotworowej. W związku z tym brakuje im cech mikrośrodowiska ludzkiego nowotworu, które ma znaczący wpływ na procesy inwazji komórek nowotworowych8.
Myogel (matryca pochodząca z ludzkiego mięśniaka, określana jako HMDM) jest pobierana z tkanki guza mięśniaka gładkokomórkowego ludzkiej macicy9. Wykazano, że zawartość białka w HMDM różni się znacznie od zawartości MSDM. W rzeczywistości 66% białek HMDM różni się od białek MSDM. Z drugiej strony, niektóre białka, takie jak lamina, kolagen typu IV, proteoglikany siarczanu heparanu, nidoken i naskórkowy czynnik wzrostu, są obecne w obu matrycach10. Dodatkowo mysz różni się od człowieka zawartością enzymów, przy czym ludzie mają o 78 mniej proteaz niż myszy11.
Fibryna jest powszechnie stosowana samodzielnie lub w połączeniu z innymi materiałami jako materiał na rusztowania12. W testach hodowli komórkowych 3D dostępny na rynku ludzki fibrynogen i trombinę są łączone w celu utworzenia hydrożelu fibrynowego12.
Ten protokół opisuje ulepszenie wcześniej wprowadzonego testu 3D na inwazję sferoidów nowotworów7. Ten nowy protokół stosuje macierz pochodzącą z ludzkiego guza zamiast macierzy nowotworowej pochodzącej od myszy. Obejmuje również techniki obrazowania i analizy z wykorzystaniem oprogramowania ilastik i Fiji ImageJ. Protokół ten może być wykorzystany do oznaczania sferoidalnego kilku różnych litych linii komórek rakowych. Jest to biologicznie istotne narzędzie do opracowywania nowych terapii przeciwnowotworowych oraz do badania wpływu określonych cząsteczek na inwazję komórek nowotworowych.