$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Analiza ultrastrukturalna skaningowego mikroskopu elektronowego (SEM) i obrazowanie wewnątrzkomórkowe uzupełniają mikroskopię świetlną do trójwymiarowego profilowania prokariontów, roślin i zwierząt. Wysoka rozdzielczość przestrzenna SEM sprawia, że jest to jedna z najbardziej wszechstronnych i wydajnych dostępnych technik badania cech mikrostrukturalnych próbek w skali od nanometra do mikrometra. Wysuszone próbki są przekształcane w struktury kompozycyjne i topograficzne z dużą szczegółowością, co stanowi podstawę do wyciągania prawidłowych wniosków na temat relacji funkcjonalnych1,2,3,4,5,6,7,8,9. Podczas interpretacji obrazów SEM próbek biologicznych dużym wyzwaniem jest rozróżnienie między strukturami natywnymi a artefaktami, które powstają podczas przetwarzania. SEM jest zazwyczaj eksploatowany w bardzo wysokich próżniach, aby uniknąć jakichkolwiek zakłóceń ze strony cząsteczek gazu wpływających na pierwotne, wtórne lub wstecznie rozproszone wiązki elektronów emitowane z próbki10,11. Ponadto materiały biologiczne są podatne na uszkodzenia spowodowane promieniowaniem ze względu na ich słabe lub nieprzewodzące właściwości. Istotne jest, aby próbki załadowane do SEM były całkowicie suche i wolne od wszelkich zanieczyszczeń organicznych, aby wyeliminować ewentualne odgazowanie w środowisku wysokiej próżni10,11. Ponieważ okazy biologiczne składają się w większości z wody, wymagane są dodatkowe techniki przygotowawcze, aby zapewnić zachowanie rodzimych struktur.
Uzyskana rozdzielczość opiera się na optymalizacji metod przygotowania specyficznych dla typów próbek i wykorzystywanych parametrów instrumentalnych. W związku z tym konieczne jest unikanie stosowania uogólnionych etapów przetwarzania dla wszystkich typów tkanek. Niektóre próbki biologiczne będą wymagały mniej rygorystycznego przetwarzania, aby zachować ich strukturę, podczas gdy w przypadku delikatnych rodzajów próbek może być potrzebne więcej czasu i ostrożności, aby uniknąć wprowadzania artefaktów wysuszających, takich jak kurczenie się i zapadanie. Przygotowanie próbki jest krytycznym etapem obrazowania SEM; Na wyniki badań morfometrycznych znaczący wpływ mają procedury przygotowania próbek12,13. Typowymi etapami przygotowania wielu próbek biologicznych są utrwalanie, odwadnianie i powlekanie metalem, takim jak złoto, platyna lub pallad, w celu przekształcenia ich powierzchni w przewodzenie do analizy SEM. Charakter i kombinacja zastosowanych kroków będą się różnić w zależności od rodzaju tkanki i konkretnych celów badania. Nagromadzenie ładunku, wrażliwość na próżnię i uszkodzenie wiązką elektronów stwarzają problemy podczas przetwarzania miękkich, delikatnych próbek biologicznych, co wymaga dodatkowych etapów przetwarzania w celu zachowania natywnej struktury obiektu. Stosowanie konwencjonalnych metod, takich jak wiązanie tetratlenku osmu i odwodnienie, powoduje kurczenie się i zapadanie delikatnych tkanek14,15,16,17. Celem pracy jest opracowanie eleganckich metodologii powstałych poprzez połączenie pomysłów z wcześniejszych badań z modyfikacjami w celu przygotowania i zobrazowania miękkich, delikatnych tkanek (np. zarodków, skorupek jaj malowanych żółwi i kultur grzybów).
Wybór odpowiedniej metody mocowania jest pierwszym najważniejszym krokiem do mikroskopowej analizy próbek biologicznych. Utrwalenie tkanek natychmiast po wyizolowaniu z organizmu jest niezbędne, aby zapobiec zmianom w ich morfologii spowodowanym rozkładem. Skuteczny utrwalacz powinien kończyć procesy komórkowe poprzez szybkie przenikanie komórek i nieodwracalne utrzymywanie efektu, aby ustabilizować strukturę próbki, aby wytrzymać zarówno kolejne etapy przetwarzania, jak i badanie w ramach SEM17,18. Chociaż znanych jest kilka chemicznych i fizycznych metod utrwalania, utrwalanie chemiczne jest częściej stosowane w przypadku próbek biologicznych, aby uniknąć zmian komórkowych spowodowanych autolizą, gniciem i efektami suszenia. W literaturze omówiono wiele utrwalających preparatów chemicznych17,19,20,21,22,23, utrwalacze, które działają poprzez denaturację i koagulację makrocząsteczek biologicznych oraz te, które utrwalają się poprzez kowalencyjne sieciowanie makrocząsteczek. Alkohole są stosowane jako utrwalacze denaturujące, które bardzo słabo zachowują ultrastrukturę i są używane głównie do mikroskopii świetlnej i nie są zalecane do analizy mikroskopem elektronowym. Utrwalacze sieciujące, takie jak formaldehyd, aldehyd glutarowy i tetratlenek osmu, tworzą międzycząsteczkowe i wewnątrzcząsteczkowe sieciowanie między makrocząsteczkami w tkankach, zapewniając doskonałe zachowanie ultrastruktur11,24,25,26. Próbki biologiczne są wrażliwe na temperaturę. Zaleca się, aby temperatura na początku wiązania wynosiła 4 °C, aby zmniejszyć boczną ruchliwość białek błonowych, spowolnić dyfuzję cząsteczek międzykomórkowych i spowolnić tempo fiksacji11. Czas potrzebny do utrwalenia tkanek w dużej mierze zależy od wielkości próbki i szybkości, z jaką utrwalacz dyfunduje i reaguje ze składnikami próbki. Utrwalanie przez noc w 4% paraformaldehydzie lub 3% aldehydzie glutarowym w PBS w temperaturze 4 °C jest preferowaną metodą analizy SEM próbek użytych w tym badaniu ze względu na ich sekwencyjne właściwości penetracyjne, które pozwalają na przetwarzanie mniejszych, delikatnych próbek17,18,19,20,27. Etap po utrwaleniu tetratlenkiem osmu został wyeliminowany nie tylko ze względu na jego toksyczny charakter, ale także stwierdzono, że nie zapewnia on żadnych dodatkowych korzyści w zakresie poprawy jakości obrazu próbek analizowanych w tym badaniu.
Próbki biologiczne zawierają płyny, które zakłócają działanie SEM; dlatego próbki muszą być wysuszone przed włożeniem ich do komory na próbki SEM. Po zapewnieniu odwodnienia rozpuszczalnik musi zostać usunięty z tkanki bez tworzenia artefaktów w próbkach z powodu napięcia powierzchniowego/wysuszenia. Trzy różne metody suszenia były powszechnie stosowane podczas przetwarzania tkanek do obrazowania SEM: suszenie powietrzem, suszenie w punkcie krytycznym i liofilizacja próbek28,29,30,31. Niewiele badań podaje, że wszystkie trzy metody suszenia dają identyczne wyniki z próbkami tkanek zwierzęcych28,29,30,31. Ogólną praktyką stosowaną w przypadku mniejszych próbek jest chemiczne odwadnianie za pomocą rosnących serii stężeń alkoholu i heksametyldisilazanu (HMDS), ale większe próbki są suszone przy użyciu przyrządu do suszenia w punkcie krytycznym (CPD)32. Podczas procesu suszenia w małych wnękach powstają znaczne siły, które są przepuszczane przez próbkę przez granicę faz ciecz/gaz; Może to nawet doprowadzić do całkowitego zawalenia się pustych struktur33. Wszelkie deformacje powstałe w wyniku obróbki mogą być wówczas mylone z natywną cechą strukturalną próbki. W związku z tym należy wyeliminować uogólnione zjawisko przetwarzania i ustandaryzować unikalny proces suszenia dla każdego rodzaju tkanki, zwłaszcza gdy analizowane są delikatne próbki tkanek.
W kilku próbach przeprowadzonych przy użyciu różnych kombinacji wszystkich wyżej wymienionych procesów, ustandaryzowaliśmy metody, które mogą być używane do analizy SEM trzech delikatnych tkanek: embrionów, skorupek jaj malowanych żółwi i kultur grzybów. Biolodzy i morfolodzy rozwojowi opisują normalną i nieprawidłową morfogenezę podczas rozwoju zarodka u reprezentatywnych kręgowców. Badania nad szlakami sygnalizacji genów zależą od morfologicznego opisu nowych struktur. Aby uniknąć nagłych zmian w strukturze zarodka kręgowców podczas analizy SEM, zalecamy suszenie chemiczne po odwodnieniu. Suszenie chemiczne przy użyciu HMDS jest stosunkowo nową metodą suszenia, a zalety obejmują względną szybkość, łatwość użycia, utracone koszty oraz ograniczoną wiedzę specjalistyczną i potrzebny sprzęt9. CPD jest powszechnie stosowaną techniką suszenia polegającą na przepuszczaniu CO2 przez próbki w określonej temperaturze i ciśnieniu. Stwierdziliśmy, że HMDS nadaje się do suszenia miękkich, delikatnych tkanek i umożliwia przetwarzanie większych próbek w porównaniu z suszeniem w punkcie krytycznym, które powodowało rozległe deformacje tkanek embrionalnych. Do przygotowania próbek do obrazowania SEM wykorzystano kilka metod w celu zbadania cech morfologicznych grzybów34. Próbki grzybów są zwykle utrwalane w tetratlenku osmu, a następnie odwadniane etanolem i suszenie w punkcie krytycznym, co może zapewnić zadowalające wyniki, chociaż toksyczne działanie tetratlenku osmu 6,7,35 i utrata materiałów grzybowych podczas zmiany roztworów podczas przetwarzania są wyraźnymi wadami. Technika przygotowania próbek przy użyciu suszenia na powietrzu bez utrwalania była również praktykowana36, ale skutkuje skurczonymi i zapadniętymi strukturami, a obserwacja takich okazów może być łatwo błędnie zinterpretowana podczas charakteryzowania gatunku. Strzępka grzybów traci swoją integralność w kontakcie z cieczami, a równomierne wysuszenie może nie być osiągnięte w celu przywrócenia struktury. Ze względu na ten efekt, liofilizacja jest powszechnie stosowana do suszenia tkanek miękkich, takich jak grzybnia. Liofilizacja sprawdza się dobrze w przypadku czystych materiałów, ale obecność jakichkolwiek soli lub wydzieliny zasłania szczegóły powierzchni, które zostaną zidentyfikowane dopiero na etapie oglądania SEM. Połączyliśmy metodę hodowli szkiełkowej z wiązaniem aldehydu glutarowego i suszeniem w punkcie krytycznym, aby uzyskać szczegóły strukturalne nienaruszonych strzępek i zarodników grzybów. Chociaż suszenie CPD powodowało kurczenie się zarodków, skutkowało to dobrze zachowanymi strukturami grzybni w połączeniu z wiązaniem aldehydu glutarowego. Skorupka jaja ma podstawowe znaczenie dla zarodka jajorodnych, ponieważ nie tylko działa jako osłona ochronna, ale także zapewnia stabilność mechaniczną, przepuszczalność gazów i wody oraz rezerwę wapnia dla rozwijającego się zarodka. Skorupki jaj żółwi słodkowodnych są klasyfikowane jako "sztywne" na podstawie ich struktury, a ze względu na ich dostępność spotkały się z dużym zainteresowaniem biologów1,2,3,4,5,6,7,37, 38.
Szczegółowo opisujemy proste metody łatwego badania skorupek jaj i błon skorupek malowanych żółwi, które można zastosować do każdego gatunku skorupy jaja o sztywnej skorupie. Metodologie przygotowania zostały ocenione na podstawie uzyskanej jakości obrazu i zredukowanych potencjalnych artefaktów.