Ten protokół szczegółowo opisuje, jak implementować i wykonywać zapisy fotometryczne z wieloma włóknami, jak korygować artefakty niezależne od wapnia, oraz ważne kwestie dotyczące obrazowania fotometrycznego dwukolorowego.
Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.
Artykuł metodologiczny
Ten protokół szczegółowo opisuje, jak implementować i wykonywać zapisy fotometryczne z wieloma włóknami, jak korygować artefakty niezależne od wapnia, oraz ważne kwestie dotyczące obrazowania fotometrycznego dwukolorowego.
Rejestrowanie aktywności grupy neuronów w swobodnie poruszającym się zwierzęciu to trudne przedsięwzięcie. Co więcej, w miarę jak mózg jest dzielony na coraz mniejsze podgrupy funkcjonalne, kluczowe staje się rejestrowanie z projekcji i/lub genetycznie zdefiniowanych subpopulacji neuronów. Fotometria światłowodowa to dostępne i skuteczne podejście, które może przezwyciężyć te wyzwania. Dzięki połączeniu metodologii optycznej i genetycznej, aktywność neuronalna może być mierzona w głębokich strukturach mózgu poprzez ekspresję genetycznie kodowanych wskaźników wapnia, które przekształcają aktywność neuronalną w sygnał optyczny, który można łatwo zmierzyć. Obecny protokół szczegółowo opisuje elementy systemu fotometrii wielowłóknowej, sposób uzyskiwania dostępu do głębokich struktur mózgu w celu dostarczania i gromadzenia światła, metodę uwzględniania artefaktów ruchu oraz sposób przetwarzania i analizy sygnałów fluorescencyjnych. Protokół szczegółowo opisuje rozważania eksperymentalne podczas wykonywania obrazowania jedno- i dwukolorowego, z jednego lub wielu wszczepionych światłowodów.
Zdolność do korelowania reakcji neuronalnych z konkretnymi aspektami zachowania zwierzęcia jest kluczowa dla zrozumienia roli, jaką odgrywa określona grupa neuronów w kierowaniu lub reagowaniu na działanie lub bodziec. Biorąc pod uwagę złożoność zachowań zwierząt, z niezliczonymi stanami wewnętrznymi i bodźcami zewnętrznymi, które mogą wpływać nawet na najprostsze działania, nagrywanie sygnału z rozdzielczością pojedynczej próby wyposaża badaczy w narzędzia niezbędne do pokonania tych ograniczeń.
Fotometria światłowodowa stała się techniką wybieraną przez wielu badaczy w dziedzinie neuronauki systemowej ze względu na jej względną prostotę w porównaniu z innymi technikami rejestracji in vivo, wysoki stosunek sygnału do szumu oraz możliwość nagrywania w różnych paradygmatach behawioralnych1,2,3,4,5,6,7,8. W przeciwieństwie do tradycyjnych metod elektrofizjologicznych, fotometria jest podejściem optycznym najczęściej stosowanym w połączeniu z genetycznie kodowanymi wskaźnikami wapnia (GECIs, seria GCaMP)9. GECI zmieniają swoją zdolność do fluorescencji w zależności od tego, czy są związane z wapniem, czy nie. Ponieważ wewnętrzne stężenie wapnia w neuronach jest bardzo ściśle regulowane, a kanały wapniowe bramkowane napięciem otwierają się, gdy neuron wystrzeliwuje potencjał czynnościowy, przejściowe wzrosty wewnętrznego stężenia wapnia, które powodują przejściowy wzrost zdolności GECI do fluorescencji, mogą być dobrym wskaźnikiem zastępczym dla neuronalnego wypalania9.
W przypadku fotometrii światłowodowej, światło wzbudzenia jest kierowane cienkim, wielomodowym światłowodem do mózgu, a sygnał emisyjny jest zbierany z powrotem przez ten sam światłowód. Ponieważ te włókna światłowodowe są lekkie i podatne na zginanie, zwierzę może poruszać się w dużej mierze bez przeszkód, dzięki czemu technika ta jest zgodna z szeroką gamą testów i warunków behawioralnych. Niektóre warunki, takie jak szybkie ruchy lub wygięcie światłowodowego poza promień, przy którym może on utrzymać całkowite odbicie wewnętrzne, mogą wprowadzać artefakty sygnału. Aby odróżnić sygnał od szumu, możemy wykorzystać właściwość GCaMP znaną jako "punkt izobestyczny". Krótko mówiąc, w przypadku GCaMP, gdy długość fali światła wzbudzenia jest przesuwana w lewo, jego emisja w stanie związanym z wapniem maleje, a emisja w stanie niezwiązanym z wapniem nieznacznie wzrasta. Punkt, w którym względna intensywność tych dwóch emisji jest równa, nazywa się punktem izobestycznym. Gdy GCaMP jest wzbudzany w tym punkcie, na jego emisję nie mają wpływu zmiany wewnętrznych stężeń wapnia, a zmienność sygnału jest najczęściej spowodowana tłumieniem sygnału wynikającym z nadmiernego wygięcia patchcordu światłowodowego lub ruchu tkanki nerwowej względem wszczepionego włókna.
Elektrofizjologia jednojednostkowa jest nadal złotym standardem dla swobodnie poruszających się nagrań in vivo ze względu na rozdzielczość pojedynczej komórki i pojedynczego skoku. Jednak określenie tożsamości molekularnej rejestrowanych komórek może być trudne, a analiza post-hoc może być dość pracochłonna. Chociaż fotometria światłowodowa nie ma rozdzielczości pojedynczej komórki, pozwala naukowcom zadawać pytania, na które nie można odpowiedzieć tradycyjnymi technikami. Łącząc strategie wirusowe ze zwierzętami transgenicznymi, ekspresja GECI może być kierowana do genetycznie zdefiniowanych typów neuronów w celu rejestrowania aktywności neuronalnej zdefiniowanej przez populację lub projekcję, co można wykonać poprzez monitorowanie sygnału wapniowego bezpośrednio na końcach aksonów10,11. Co więcej, poprzez wszczepienie wielu kaniul światłowodowych, możliwe jest jednoczesne monitorowanie aktywności neuronalnej z kilku obszarów mózgu i ścieżek w tym samym zwierzęciu12,13.
W tym manuskrypcie opisujemy technikę fotometrii jedno- i wielowłóknowej, jak korygować artefakty niezależne od wapnia oraz szczegółowo opisujemy, jak wykonywać nagrania mono- i dwukolorowe. Podajemy również przykłady typów pytań, które można zadawać, oraz ich rosnący poziom złożoności (patrz Rysunek 1). Konfiguracja fotometrii światłowodowej dla nagrań wielowłóknistych wyszczególnionych w tym protokole może być zbudowana przy użyciu listy materiałów znajdującej się na stronie https://sites.google.com/view/multifp/hardware (Rysunek 2).
Istotne jest, aby system był przystosowany zarówno do długości fali wzbudzenia 410 nm, jak i 470 nm dla niezależnej od wapnia i zależnej od wapnia emisji fluorescencji z GCaMP6 lub jego wariantów. W przypadku niestandardowych konfiguracji lub jeśli nie ma dostępnego oprogramowania do uruchomienia systemu, można użyć bezpłatnego programu Bonsai (http://www.open-ephys.org/bonsai/) o otwartym kodzie źródłowym. Alternatywnie, fotometrię światłowodową można uruchomić za pomocą MATLAB (np. https://github.com/deisseroth-lab/multifiber)12 lub innego języka programowania14. Oprogramowanie i sprzęt systemu powinny umożliwiać manipulowanie zarówno diodami LED 410 nm, jak i 470 nm, a także kamerą, ekstrakcję obrazów (Rysunek 2) oraz obliczanie średniej intensywności fluorescencji w obszarach zainteresowania (ROI) narysowanych wokół włókien na obrazach. Wyjściem powinna być tabela średnich wartości natężenia zarejestrowanych za pomocą diod LED 470 nm i 410 nm z każdego włókna w krosowym. Podczas wykonywania eksperymentów z wieloma włóknami, wiązki włókien 400 μm mogą ograniczać ruch myszy. W takich przypadkach zalecamy użycie krosowych o średnicy 200 μm, które zapewniają większą elastyczność. Możliwe jest również użycie mniejszych atrap podczas szkolenia myszy.
Kluczowe jest to, aby móc wyodrębnić punkty czasowe dla interesujących zdarzeń podczas akwizycji fotometrii światłowodowej. Jeśli system nie zapewnia wbudowanego systemu do integracji TTL dla określonych zdarzeń, alternatywną strategią jest przypisanie znacznika czasu do poszczególnych punktów czasowych zarejestrowanych w celu dostosowania do określonych czasów i zdarzeń podczas eksperymentu. Znakowanie czasem można wykonać za pomocą zegara komputerowego.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Wszystkie eksperymenty zostały przeprowadzone zgodnie z wytycznymi Institutional Animal Care and Use Committees Uniwersytetu Kalifornijskiego w San Diego oraz Canadian Guide for the Care and Use of Laboratory Animals i zostały zatwierdzone przez Université Laval Animal Protection Committee.
1. Ustawienie osi optycznej między kamerą CMOS (complementary metal oxide semiconductor) a pojedynczym lub rozgałęzionym kablem patchcord
2. Wyznaczenie obszarów zainteresowania (ROI) wokół włókien do pomiaru średniej intensywności fluorescencji
3. Przygotowanie areny rejestracyjnej
4. Rejestracje in vivo
UWAGA: Procedura implantacji kaniuli z włókna optycznego do eksperymentów z fotometrii włókna jest identyczna z procedurą dla optogenetyki opisaną w pracy Sparta et al15. Zalecamy stosowanie cementu dentystycznego (patrz Tabela materiałów), który zapewnia solidne zakotwiczenie nakładki na głowę do kości czaszki. Cement dentystyczny będzie szczególnie użyteczny w przypadkach, w których nie można zastosować śrub mocujących.
5. Analiza danych z fotometrii włóknistej
UWAGA: Jest to metoda analizy danych, która sprawdza się w większości pomiarów. Można jednak zastosować alternatywne podejścia. Przykładowy kod do analizy danych znajduje się tutaj: https://github.com/katemartian/Photometry_data_processing.



6. Symultaniczne rejestracje dwukolorowe
7. Analiza danych dwukolorowych
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Neuronalne korelaty reakcji behawioralnych mogą różnić się w zależności od wielu czynników. W tym przykładzie zastosowano fotometrię włóknistą in vivo w celu pomiaru aktywności zakończeń aksonalnych z bocznej części podwzgórza (LHA), które kończą się w bocznej habenuli (LHb). Myszy typu dzikiego otrzymały wstrzyknięcie wirusa adeno-związanego (AAV) kodującego GCaMP6s (AAV-hSyn-GCaMP6s) do LHA, a następnie wszczepiono włókno optyczne z końcówką umieszczoną bezpośrednio nad LHb (Rysunek 4
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Fotometria światłowodowa jest dostępnym podejściem, które pozwala naukowcom rejestrować dynamikę wapnia w określonych populacjach neuronów u swobodnie poruszających się zwierząt. Metodę tę można łączyć z szeroką gamą testów behawioralnych, w tym z zadaniami "wymagającymi ruchu", takimi jak testy wymuszonego pływania2, warunkowanie strachu18, interakcje społeczne 1,4 i inne 7,8,19,20
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Sage Aronson jest dyrektorem generalnym i założycielem firmy Neurophotometrics Ltd., która sprzedaje wielowłóknowe systemy fotometryczne.
Ta praca została wsparta grantem od Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC: RGPIN-2017-06131) dla C.P. C. P. jest FRSQ Chercheur-Boursier. Dziękujemy również Plateforme d'Outils Moléculaires (https://www.neurophotonics.ca/fr/pom) za produkcję wektorów wirusowych wykorzystanych w tym badaniu.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Śruba z walcowym ze stali nierdzewnej 1/4"-20, śruba z walcowym 1" długa | SH25S100 | ||
| 1/4"-20 ze stali nierdzewnej, | SH25S050 | a | |
| /4"-20 ze stali nierdzewnej, śruba z walcowym o długości 3/8" | SH25S038 | ||
| 1000 i mikro; m, 0.50 NA, SMA-SMA światłowodowy | Thorlabs | M59L01 | |
| Słupek optyczny 12.7 mm | Thorlabs | TR30/M | |
| 12.7 mm Uchwyt na słupek cokołowy | Thorlabs | PH20EM | |
| 15 V, 2.4 A Zasilacz ze złączem Jack 3.5 mm do T-Cube | Thorlabs | KPS101 | |
| Obiektyw 20x | Thorlabs | RMS20X | #10 na rysunku 2, #11 na rysunku 5 |
| 30 mm Cage Cube z mocowaniem filtra dichroicznego | Thorlabs | CM1-DCH/M | #8-9 na rysunku 2, #8-10 na rysunku 5 |
| Soczewki doryckie | LED 405 nm | CLED_405 | #2 na rysunku 2 |
| Filtr pasmowo-przepustowy 410 nm | Thorlabs | FB410-10 | #5 na rysunku 2; #7 na rysunku 5 |
| 465 nm. | Soczewki LED Doric | CLED_465 | #1 na rysunku 2 |
| Filtr pasmowo-przepustowy 470 nm | Thorlabs | FB470-10 | #4 na rysunku 2; #6 na rysunku 5 |
| Filtr pasmowo-przepustowy 560 nm | Semrock | FF01-560/14-25 | #5 na rysunku 5 |
| Soczewki LED Doric | 560 nm | CLED_560 | #1 na rysunku 3 |
| 5-osiowy kinematyczny montaż | Thorlabs | K5X1 | #11 na rysunku 2, #12 na rysunku 5 |
| Achromatyczny dublet | Thorlabs | AC254-035-A-ML | #7 na rysunku 2 |
| Adapter do kolimatora 405 | Thorlabs | AD11F | #3 na rysunku 2; #4 na rysunku 5 |
| Adapter do regulowanego kolimatora | Thorlabs | AD127-F | #3 na rysunku 2; #4 na rysunku 5 |
| Aluminiowa płytka stykowa | Thorlabs | MB1824 | |
| Widelec zaciskowy | Thorlabs | CF125 | |
| Łącznik sześcienny | Thorlabs | CM1-CC | |
| Dual 493/574 dichroiczny | Semrock | FF493/574-Di01-25x36 | #10 na rysunku 5 |
| Filtr emisji dla GCaMP6 | Semrock | FF01-535/22-25 | #6 na rysunku 2 |
| Obudowa z czarnymi panelami z płyty pilśniowej | Thorlabs | XE25C9 | |
| Zewnętrznie gwintowana zaślepka SM1 do obróbki | ślimaków | ||
| Szybkowymienny uchwyt filtra rurki obiektywu SM1 | Thorlabs | SM1QP | #4-6 na rysunku 2, #5-7 na rysunku 5 |
| Naprawiono kolimator dla światła 405 nm | Thorlabs | F671SMA-405 | #3 na rysunku 2; #4 na rysunku 5 |
| Stały kolimator dla światła 470 i 560 nm | Thorlabs | F240SMA-532 | #3 na rysunku 2; #4 na rysunku 5 |
| Zielony filtr emisji | Semrock | FF01-520/ 35-25 | In rozdzielacz wiązki światła |
| Kamera CMOS USB 3.0 o wysokiej rozdzielczości | Thorlabs | DCC3260M | #13 na rysunku 2, #15 na rysunku 5 |
| Rozdzielacz wiązki światła | Neurofotometria | SPLIT# | 14 na rysunku 5 |
| Lustro dichroiczne długoprzepustowe, 425 nm Cutoff | Thorlabs | DMLP425R | #8 na rysunku 2, #9 na rysunku 5 |
| Lustro dichroiczne długoprzepustowe, 495 nm Cutoff | Semrock | FF495-Di03 | #9 na rysunku 2, #8 na rysunku 5 |
| Cement dentystyczny Metabond | C& B | ||
| M8 - M8 | Soczewki Doryckie | Cable_M8-M8 | |
| Kaniule światłowodowe | Soczewki Doryckie | Należy określić, że będą one używane do eksperymentów fotometrycznych wymagających niskiej autofluorescencji | |
| Patchcordy światłowodowe | Soczewki doryckie | Należy określić, że będą one wykorzystywane do eksperymentów fotometrycznych wymagających niskiej autofluorescencji | |
| Czerwony filtr emisyjny | Semrock | FF01-600/37-25 | Rozdzielacz wiązki światła T7 |
| LabJack | LabJack | ||
| T-cube Sterownik LED | Thorlabs | LEDD1B | |
| I/O USB 3.0, Hirose 25, do DCC3240 | Thorlabs | CAB-DCU-T3 |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.