Tutaj demonstrujemy procedurę specyficznej dla typu komórki ekspresji ATeam1.03YEMK, opartego na FRET, genetycznie kodowanego nanoczujnika14, do pomiaru zmian poziomów ATP w astrocytach lub neuronach w organotypowych kulturach warstw tkanki mózgu myszy15. W przykładowych nagraniach pokazujemy, że wzrost stężenia potasu w zewnątrzkomórkach nie powoduje zmiany stężeń ATP w neuronach, podczas gdy poziomy astrocytarnego ATP rosną w odpowiedzi na tę manipulację. Co więcej, nasze wyniki pokazują, że po zahamowaniu metabolizmu komórkowego stosunek ATeam1.03YEMK FRET gwałtownie spada w obu typach komórek, co wskazuje na szybki spadek wewnątrzkomórkowego ATP.
Ekspresja ATeam1.03YEMK w organotypowych kulturach plastrów wymaga utrzymania tkanki w kulturze w kontrolowanych warunkach przez co najmniej 7-10 dni. Alternatywnie, ATeam1.03YEMK może być również stosowany do pomiaru ATP w ostro izolowanych wycinkach tkanki mózgowej oraz w nerwach wzrokowych myszy13,15. Pomiary w ostro izolowanej tkance wymagają jednak generacji transgenicznych zwierząt lub stereotaktycznego zastosowania wektorów wirusowych do mózgu, co wiąże się z eksperymentami na zwierzętach i ścisłymi protokołami opieki nad zwierzętami. W związku z tym ekspresja ATeam1.03YEMK w organotypowych kulturach warstwowych tkanek stanowi użyteczną i cenną alternatywę 22,23. Od wielu lat organotypowe kultury warstwowe tkanek służą jako uznany system modelowy do badania właściwości neuronalnych, łączności i rozwoju 24,25,26. Nie tylko utrzymują one ogólną architekturę tkanek i laminację (ryc. 1), ale także posiadają preferencyjne właściwości kultur komórkowych, takie jak doskonała dostępność i bezpośrednia kontrola warunków eksperymentalnych. Organotypowe kultury warstw tkanek są również rutynowo wykorzystywane do ekspresji obcych genów za pomocą wektorów wirusowych27. Doniesiono, że kilka typów wektorów wirusowych dostarcza transgeny do tkanki mózgowej16,28. Wektory adenowirusowe indukują wysoką ekspresję w komórkach glejowych, ale nie w neuronach hipokampa16 i mogą generować reaktywność glejową17. Wektory wirusowe związane z adenowirusami, takie jak stosowane w tym artykule, pojawiają się jako dobra alternatywa15, a ich skuteczność wykazano również in vivo29.
Chociaż są one wykorzystywane głównie do badania właściwości neuronalnych, ostatnie badania wykazały, że organotypowe kultury warstw tkanek mogą być również wykorzystywane do analizy astrocytów. Wyhodowane wycinki są zwykle pokryte warstwą reaktywnych astrocytów19,30 (ryc. 5), ale astrocyty wykazują bardziej natywną, niereaktywną morfologię i cytoarchitekturę w głębszych warstwach19,30 (ryc. 5). W niniejszej pracy opisano procedurę mechanicznego usuwania zewnętrznej blizny glejowej, która skutkuje lepszą dostępnością doświadczalną i optyczną astrocytów natywnych w obrębie właściwych organotypowych warstw tkankowych. Co więcej, jego usunięcie poprawia skuteczność ekspresji w głębszych warstwach plastrów organotypowych; jeśli blizna glejowa nie zostanie usunięta, transdukcja przez AAV może być ograniczona do powierzchownych warstw komórek.
Podczas przeprowadzania eksperymentów na wycinkach tkanek należy wziąć pod uwagę kilka zewnętrznych czynników mechanicznych. Zmiana prędkości perfuzji w kąpieli może indukować ruchy całego preparatu i/lub wywoływać zmiany ostrości, powodując sztuczne przejściowe zmiany sygnału czujnika. Co więcej, doniesiono, że zarówno astrocyty, jak i neurony reagują na deformacje mechaniczne, takie jak narzucone przez wysokie szybkości perfuzji32,33. W naszych rękach zastosowanie niezawodnej pompy perystaltycznej wraz z utrzymywaniem małych i stabilnych objętości soli fizjologicznej między tkanką a obiektywem (łąkotką) skutkuje stabilnym sygnałem FRET w warunkach wyjściowych przy zastosowanej tutaj prędkości perfuzji (1,5-2,5 ml/min; Rysunek 8).
W niniejszym badaniu wykazaliśmy również, że obrazowanie oparte na FRET za pomocą ATeam1.03YEMK może być stosowane do monitorowania poziomów ATP w neuronach i astrocytach. Alternatywnym sposobem wprowadzonym wcześniej do pomiaru komórkowego ATP jest tzw. test lucyferyna-lucyferazy 34,35,36,37. Podejście to opiera się jednak na obrazowaniu bioluminescencji i zapewnia jedynie raczej niską rozdzielczość czasową i przestrzenną, częściowo ze względu na wysoki poziom szumów tła. Inną metodą rutynowo stosowaną w ostatnich latach było obrazowanie zmian wewnątrzkomórkowego stężenia magnezu za pomocą wrażliwego na jony fluoroforu magnezu 38,39,40. Podejście to odnosi się do obserwacji, że spożycie ATP powoduje uwolnienie jego kofaktora magnezu. Obrazowanie z użyciem zieleni magnezowej zapewnia zatem jedynie wtórne oszacowanie zmian poziomów ATP. Co więcej, zieleń magnezowa jest również wrażliwa na zmiany wewnątrzkomórkowego wapnia, co wprowadza kolejną trudność przy interpretacji wyników uzyskanych tą metodą.
Niedawny rozwój genetycznie kodowanych nanoczujników do bezpośredniego obrazowania metabolitów komórkowych stanowił zatem duży krok naprzód11,12. Wygenerowano kilka różnych czujników, które można wykorzystać do pomiaru wewnątrzkomórkowego ATP 36,41,42,43. Należą do nich ratiometryczny fluorescencyjny wskaźnik ATP "QUEEN"41, a także PercevalHR, który wykrywa stosunek ATP:ADP42. O ile ta ostatnia sonda jest cennym narzędziem do badania stanu energetycznego komórek, o tyle wymaga jednoczesnego pomiaru zmian pH42.
ATeam to nanosensor, w którym istnieje kilka wariantów, które – między innymi – różnią się powinowactwem do wiązania ATP14. In vitro ATeam1.03YEMK wykazuje Kd 1,2 mM w temperaturze 37 °C, co jest zbliżone do komórkowych poziomów ATP określonych w różnych typach komórek neuronalnych, od podwzgórza i móżdżku34 do hipokampa 37,44,45. W pomiarach kuwetowych obniżenie temperatury o 10 °C spowodowało znaczny spadek powinowactwa wiązania ATeam1.03YEMK do ATP, co sugeruje, że może nie być idealny do obrazowania komórkowego w temperaturze pokojowej14. Nasze wcześniejsze badaniewykazało jednak, że zachowanie i odpowiedź ATeam1.03YEMK wyrażanego w neuronach i astrocytach na różne manipulacje jest podobna w temperaturze zbliżonej do fizjologicznej i pokojowej, co wskazuje, że czujnik umożliwia wiarygodne określenie wewnątrzkomórkowych poziomów ATP w obu warunkach. Ponadto nasze poprzednie eksperymenty dotyczyły wrażliwości na pH ATeam1.03YEMK wyrażanego w komórkach15, wykazując, że jest on niewrażliwy na zmiany wewnątrzkomórkowego pH o około 0,1-0,2 jednostki pH. Jeśli Kd w niskim zakresie mM jest problemem, można zastosować alternatywne warianty ATeam14, w tym warianty ATeam z przesunięciem ku czerwieni ("GO-ATeam")43.
Nasze eksperymenty z użyciem ATeam1.03YEMK pokazują, że wzrost zewnątrzkomórkowego stężenia potasu tylko o kilka mM (od 3 do 8 mM) powoduje przejściowy wzrost stosunku ATeam1,03YEMK w astrocytach w organotypowej kulturze warstwowej. Obserwacja ta potwierdza wcześniejsze badania15,46 i jednoznacznie wskazuje, że astrocyty reagują na uwalnianie potasu przez aktywne neurony wzrostem ich produkcji ATP, najprawdopodobniej w wyniku stymulacji odpowiednio Na+/K+-ATPazy i kotransportera Na+/HCO 3-47,48. W przeciwieństwie do tego, neurony nie wykazały odpowiedzi, co jest zgodne z wcześniejszymi pracami15. Oba typy komórek jednak szybko i silnie zareagowały na hamowanie glikolizy komórkowej i oddychanie mitochondrialne, jak wykazano powyżej15. W warunkach niedokrwienia chemicznego współczynniki ATeam FRET spadły do nowego stabilnego poziomu, co wskazuje na nominalne wyczerpanie komórkowego ATP. Ten ostatni wynik sugeruje, że zarówno neurony, jak i astrocyty wykazują odpowiednie zużycie ATP również w warunkach stanu stacjonarnego, bez dodatkowej stymulacji przez aktywację synaps lub zastosowanie neuroprzekaźników. Podsumowując, dochodzimy do wniosku, że obrazowanie oparte na fret za pomocą genetycznie kodowanych nanoczujników, w tym ATeam1.03YEMK, zapewni cenne podejście do wyjaśnienia procesów komórkowych, które są odpowiedzialne za zmiany wewnątrzkomórkowych poziomów ATP i komórkowego zużycia ATP w różnych warunkach.