Ta metoda szczegółowo opisuje, od początku do końca, procedurę chirurgiczną generowania ortotopowych guzów trzustki przy użyciu minimalnej ilości materiału komórkowego i późniejszą szybką dysocjację powstałych guzów w celu kompleksowej analizy populacji komórek odpornościowych za pomocą cytometrii przepływowej, w tym analizy ex vivo funkcji komórek T.
Gruczolakorak przewodowy trzustki (PDAC) jest agresywnym rakiem, który tylko 8% pacjentów przeżywa 5 lat1. Ponieważ mniej niż 20% pacjentów kwalifikuje się do resekcji chirurgicznej2, świeże próbki pacjentów nie są łatwo dostępne do badań, dlatego modele in vivo dostarczają niezbędnych narzędzi do badania tej choroby. Istnieje wiele mysich modeli PDAC: ortotopowy, podskórny, transgeniczny, dożylny i ksenoprzeszczep pobrany od pacjenta (PDX), szczegółowo opisany tutaj3. Opisany tutaj model ortotopowy pozwala na wstrzyknięcie syngenicznych komórek PDAC do trzustki myszy immunokompetentnych. Można to przeprowadzić w dużych kohortach myszy typu dzikiego lub zmutowanego, a tym samym zapewnia opłacalny i spójny model do porównywania środków terapeutycznych. Co ważne, model ortotopowy zapewnia pokrewne mikrośrodowisko dla wzrostu komórek nowotworowych i przerzutów w naszych rękach i innych4 do klinicznie istotnych miejsc (np. wątroby), co czyni go bardziej istotnym klinicznie niż modele podskórne lub indukowane chemicznie. Guzy ortotopowe wykazują kluczowe cechy PDAC, takie jak silna reakcja desmoplastyczna z dużą ilością fibroblastów i odkładanie się macierzy zewnątrzkomórkowej5. Transgeniczne modele PDAC są złotym standardem modelu mysiego, a najczęściej stosowanym jest model KPC, który wyraża zmutowane KrasG12D/+ i Trp53R172H/+ w specyficznym dla trzustki promotorze Pdx-1-Cre6. Dodatkowe modele KPC i inne modele PDAC in vivo są przeglądane tutaj7. U myszy KPC spontanicznie rozwijają się guzy trzustki z postępem choroby, który wiernie odtwarza cechy ludzkiego PDAC6. Jednak, podobnie jak w przypadku wszystkich modeli transgenicznych, program hodowlany jest kosztowny, progresja guza jest zmienna i dlatego często wymaga dużych kohort myszy. Modele PDX wykorzystują komórki nowotworowe lub fragmenty pochodzące od pacjenta, które są następnie hodowane ortotopowo lub, częściej, podskórnie u myszy z obniżoną odpornością. Modele ksenoprzeszczepów dostarczają użytecznych narzędzi do badań przesiewowych związków terapeutycznych i uwzględniają niejednorodność pacjentów. Nie zapewniają one jednak pełnego mikrośrodowiska odpornościowego, co ogranicza ich zastosowanie8,9.
Po ustaleniu, guzy ortotopowe zazwyczaj potrzebują około 1 miesiąca lub więcej na wzrost (w zależności od użytej linii komórkowej) i tworzą duże guzy, które można łatwo zobrazować za pomocą ultradźwięków lub rezonansu magnetycznego w celu śledzenia postępu i określenia skuteczności leczenia4,5,10. Jednak po wykładniczym wzroście ostatnia faza wzrostu guza może być szybka, więc większość schematów leczenia rozpoczyna się stosunkowo wcześnie (np. 14 dni)11,12. Układ odpornościowy odgrywa kluczową rolę w rozwoju nowotworu, w tym w PDAC, który charakteryzuje się immunosupresyjnym naciekiem guza ze względnym niedostatkiem limfocytów T i częstą obecnością komórek szpikowych13. Wysoka obecność limfocytów T w PDAC zapewnia lepsze rokowanie14,15. Jednak inhibitory immunologicznych punktów kontrolnych, które łagodzą immunosupresję limfocytów T, takie jak anty-CTLA-416 i anty-PD-L117, nie wykazały korzyści klinicznych u pacjentów z PDAC, najprawdopodobniej dlatego, że ogólna reaktywność limfocytów T jest bardzo niska. Jednak czynniki, które pobudzają odpowiedź limfocytów T, takie jak anty-CD40, mogą przezwyciężyć oporność na anty-PD-L1/CTLA-418,19 i szczepienie allogeniczną szczepionką PDAC wydzielającą GM-CSF (GVAX) mogą zwiększyć immunogenność guzów PDAC20, co wskazuje, że wzmocnienie odpowiedzi limfocytów T stanowi ważną drogę terapeutyczną.
Kluczowe dla odpowiedzi przeciwnowotworowej limfocytów T jest rozpoznawanie antygenów pochodzących z nowotworu przez receptor limfocytów T (TCR) i późniejsza produkcja cytotoksycznych cytokin i granulek. Chociaż rozpoznawanie antygenu limfocytów T można określić za pomocą sekwencjonowania TCR, podejście to jest kosztowne i czasochłonne. Jednak kwantyfikacja podzbiorów limfocytów T naciekających nowotwór stanowi dobry wskaźnik odpowiedzi przeciwnowotworowej. Dalsze badania aktywności limfocytów T ex vivo pod kątem degranulacji, produkcji cytokin i innych czynników cytotoksycznych zapewniają głębszą analizę funkcjonalną. Testy te można wykonywać na świeżych próbkach guza, a wiele parametrów funkcji limfocytów T można szybko zmierzyć za pomocą cytometrii przepływowej.
Limfocyty T CD8+ i CD4+ wytwarzają cytokiny, takie jak IFNγ i TNFα, aby wzmocnić odpowiedź immunologiczną21. IFNɣ indukuje regulację MHCI w górę na komórkach docelowych, indukuje różnicowanie i rekrutację komórek odpornościowych oraz wspomaga śmierć komórki. Produkcja IFNγ przez limfocyty T CD8 + jest dobrze scharakteryzowana jako część odpowiedzi przeciwnowotworowej i koreluje z regresją guza22,23. TNFα to kolejna cytokina prozapalna wytwarzana zarówno przez limfocyty T CD8 +, jak i CD4 +. Zwiększa zależną od TCR aktywację i proliferację limfocytów T, wspomagając odpowiedź przeciwnowotworową. Po zaangażowaniu TCR, cytotoksyczne limfocyty T CD8 + mogą ulegać degranulacji, w której wstępnie uformowane lizosomy wydzielnicze zawierające cząsteczki cytotoksyczne są uwalniane do synapsy immunologicznej, powodując degradację komórek docelowych21. Cząsteczki te obejmują perforynę, białko, które wiąże się z błoną komórkową docelową, tworząc pory, które następnie zakłócają integralność błony i umożliwiają dyfuzję21 lub endocytosis24 innych cząsteczek cytotoksycznych, takich jak Granzyme B, bezpośrednio do cytoplazmy komórki docelowej. Granzyme B jest proteazą, która powoduje degradację wielu białek w komórce docelowej, prowadząc do śmierci komórki21. Uwolnienie takich cząsteczek wymaga egzocytozy endosomów na powierzchnię komórki, gdzie marker endosomalny CD107a (znany również jako LAMP-1) jest przejściowo włączony do błony komórkowej25.
Pomiar wydzielania cytokin przez limfocyty T wymaga ich izolacji za pomocą sortowania komórek wspomaganego przepływem lub testów separacji opartych na koralikach, które nie mogą być łatwo przeprowadzone na dużej liczbie próbek jednocześnie. Jednak pomiar cytokin wewnątrzkomórkowych nie wymaga żadnych etapów przed izolacją i może być łatwo wykonany na wielu próbkach jednocześnie, co pozwala na podejście o wyższej przepustowości. Ponieważ cytokiny są szybko wydzielane przez limfocyty T, poziomy wewnątrzkomórkowe mogą być niewykrywalne, a zatem limfocyty T wymagają stymulacji w celu zwiększenia podstawowej produkcji cytokin. Aby ocenić produkcję cytokin sterowanych antygenem, antygen rozpoznany przez TCR musi zostać przedstawiony limfocytowi T przez zaszczepiony APC in vitro. W przypadkach, gdy swoistość antygenu nie jest znana, wymagane jest szerokie podejście do stymulacji. Stymulację TCR można naśladować za pomocą kulek anty-CD3/28, które zapewniają zarówno aktywację TCR, jak i kostymulację, co indukuje produkcję i proliferację cytokin. Jednak bardziej opłacalną alternatywą jest zastosowanie PMA i jonomycyny, które razem szeroko aktywują szlaki sygnałowe, które prowadzą do syntezy i uwalniania cytokin wewnątrzkomórkowych. W szczególności PMA aktywuje kinazę białkową C (PKC), a jonomycyna podnosi wewnątrzkomórkowe jony Ca2+, co prowadzi do zwiększonej sygnalizacji komórkowej. W celu zachowania wewnątrzkomórkowej zawartości cytokin, stymulacja ta może być skutecznie połączona z inhibitorami transportu białek brefeldyną A i monenzyną, które blokują białka w Golgiego, a tym samym zapobiegają uwalnianiu zewnątrzkomórkowemu. Stosowanie PMA/jonomycyny jest dobrze znaną metodą stymulacji limfocytów T i istnieje silna korelacja między cytokinami uwalnianymi zewnątrzkomórkowo i wewnątrzkomórkowymi26. Stymulacja limfocytów T za pomocą PMA i jonomycyny zwiększa również transport lizosomów do błony komórkowej, a zatem CD107a zostaje przejściowo zintegrowany na powierzchni komórki, zanim zostanie ponownie wprowadzony do komórki. Poprzez włączenie przeciwciała anty-CD107a podczas stymulacji, możliwe jest wykorzystanie go jako markera aktywności degranulacji25.
Ta metoda szybko trawi guzy, aby zapewnić zawiesinę jednokomórkową. Na tym etapie poszczególne populacje mogą być bezpośrednio barwione do cytometrii przepływowej lub oczyszczane metodami dalszymi: sortowaniem komórek wspomaganym przepływem lub separacją magnetyczną. Przygotowanie zawiesiny pojedynczej komórki do analizy metodą cytometrii przepływowej umożliwia wysokoprzepustową analizę wielu populacji komórek odpornościowych i ich markerów fenotypowych, zapewniając dokładną kwantyfikację liczby komórek odpornościowych i fenotypu.
Na koniec, opisany tutaj protokół trawienia zapobiega utracie markerów powierzchniowych komórek i utrzymuje żywotność komórek odpornościowych, umożliwiając komórkom odpornościowym przejście dalszych etapów oczyszczania komórek i hodowli zgodnie z wymaganiami. Jednak metoda ta nie została przetestowana pod kątem wyprowadzania komórek nabłonkowych z tego trawienia.