Tradycyjne protokoły transformacji kukurydzy są zgodne z paradygmatem izolowania niedojrzałych zarodków zygotycznych w celu wytworzenia transgenicznej tkanki kalusa, która jest regenerowana w płodne rośliny 4,6. Chociaż jest to skuteczne, protokoły oparte na kalusach mogą być czasochłonne, a proces hodowli tkankowej często trwa do 3 miesięcy, aby wytworzyć rośliny. To, co czyni przedstawioną tutaj metodę istotną, to fakt, że jest ona wolna od modzeli, wydajna, szybka i pozwala na regenerację roślin T0 w mniej więcej o połowę krótszym czasie. Wydaje się również, że jest mniej zależny od genotypu i dlatego może być skuteczny dla większości publicznie dostępnych inbredów 8,11.
Chociaż wszystkie kroki powinny być skutecznie przestrzegane, konieczne jest prawidłowe przygotowanie podłoża wzrostowego. Składniki pożywek wzrostowych muszą być dodawane na odpowiednich etapach, zarówno przed, jak i po autoklawie, aby zapewnić, że materiał roślinny otrzyma odpowiednie stężenie chemikaliów. Zapewni to, że wrażliwe związki, takie jak antybiotyki, nie ulegną rozkładowi. Ważne jest również, aby materiał roślinny był umieszczany na odpowiednim podłożu wzrostowym na każdym etapie, jak wskazano w protokole. Nieumieszczenie materiału na odpowiednim podłożu wzrostowym może spowodować śmierć materiału. Ponadto należy unikać umieszczania na płytkach zbyt wielu zarodków lub rozwijających się tkanek. Podczas gdy umieszczenie dwukrotnie większej liczby kawałków tkanek może zaoszczędzić na kosztach chemikaliów i szalek Petriego (a nawet miejsca w inkubatorze), wzrost tkanki w przepełnionych płytkach może zostać poważnie zahamowany. Podczas wykonywania infekcji należy upewnić się, że gęstość optyczna zawiesiny Agrobacterium jest odpowiednia. Jeśli gęstość zawiesiny bakteryjnej jest zbyt niska, prawidłowa infekcja może nie wystąpić.
Jakość materiałów wyjściowych ma zasadnicze znaczenie dla sukcesu w protokołach transformacji. Uszy używane do sekcji zarodków muszą być zdrowe, co oznacza, że roślina, która je produkuje, jest zdrowa. Muszą również posiadać odpowiedni zestaw nasion i być wolne od szkodników i chorób. Nie należy również używać starego Agrobacterium . Talerz "matka" nie powinien mieć więcej niż 2 tygodnie. Po tym momencie należy nałożyć nową "matkę" na płytkę, aby rozpocząć nowe eksperymenty.
Chociaż wykazano, że metoda ta jest mniej zależna od genotypu, nie można zakładać, że wszystkie linie będą równie skuteczne. Nadal mogą występować różnice między liniami, a także różnice w sukcesie w zależności od używanej konstrukcji. Zmienność między uchami jest również nieunikniona podczas pracy z niedojrzałymi zarodkami, więc idealnie byłoby, gdyby eksperymenty wykorzystywały wiele uszu, aby to uwzględnić. W tej pracy najlepiej wypadł wsobny W22, z ponad ~14% częstotliwością transformacji, a następnie B73 i Mo17 (~4% każdy). Lowe i wsp.8 poinformowali o użyciu protokołu QuickCorn do transformacji B73 i Mo17. W tej pracy częstości transformacji wahały się od 9%-50% dla B73 i 15%-35% dla Mo17.
Jedną z możliwości niższych częstotliwości przemian dla B73 i Mo17 zaobserwowanych w tej pracy można przypisać sezonowym wahaniom jakości ucha. Kolejną różnicą między tą pracą a pracą Lowe'a i wsp.8 jest to, że użyto tu różnych konstrukcji wektorowych. W pracy Lowe'a geny morfogenne nie zostały usunięte z przekształconych roślin, ale raczej wyciszone rozwojowo w późniejszych stadiach. W tej pracy geny morfogenne zostały usunięte 8 dni po zakażeniu. Możliwe, że witaminy B73 i Mo17 mogą potrzebować dłuższej obecności Bbm/Wus2 do rozwoju zarodków somatycznych.
Za pomocą tej metody istnieje możliwość uzyskania nietransgenicznych roślin ucieczkowych, insercji multimerycznych i niewyciętych transgenów. Rośliny te nie będą miały zauważalnie różniącego się fenotypu, więc wykrywanie za pomocą PCR jest wymagane w celu ustalenia, czy roślina jest transgeniczna. Aby to osiągnąć, można zastosować startery PCR w obszarze wyciętym i startery flankujące wycięty obszar. Wiele niezależnych przemian może również wytwarzać rośliny z tego samego niedojrzałego zarodka, co utrudnia określenie całkowitego współczynnika odzysku niezależnego transformantu. Naszym standardem było obliczenie współczynnika przemian na podstawie pobrania próbki z jednej rośliny z każdego niedojrzałego zarodka, który wytworzył rośliny, i podzielenia tego przez liczbę zainfekowanych zarodków. Ta metoda prawie na pewno zaniża rzeczywistą liczbę niezależnych zdarzeń odzyskanych jako sadzonki. Dyskryminacja między niezależnymi zdarzeniami z tego samego zarodka wymaga sekwencjonowania regionów granicznych wokół transgenów, a to będzie zbyt kosztowne i czasochłonne w przypadku większości zastosowań; Chociaż mogą wystąpić przypadki, w których te dane są przydatne.
Ta metoda transformacji kultur tkankowych okazała się bardzo skuteczna, ale nadal mogą wystąpić problemy. Jeśli materiał roślinny nie reaguje, możliwe, że występuje problem z konkretną linią wsobną, co sugeruje, że zmienne, takie jak skład podłoża wzrostowego i czas podhodowli, wymagają dostosowania. Kolejną zmienną jest prawidłowy projekt wektora i dokładna konstrukcja wektora, jeśli oryginalny wektor zostanie zmieniony. Mogą również wystąpić problemy z wrażliwością imazapyru, ponieważ niektóre linie są bardziej wrażliwe niż inne, a stężenie imazapyru może wymagać dostosowania, aby uzyskać pomyślnie przekształcone rośliny.
W ciągu ostatnich 30 lat protokoły hodowli tkankowej i transformacji kukurydzy zmieniły się i rozwinęły; Uważa się, że ten skrócony protokół przyczyni się do dalszego postępu. Ta metoda jest skuteczna w środowisku akademickim, ponieważ jest mniej czasochłonna niż tradycyjne metody. Ponadto nie wymaga wysoko wykwalifikowanych operatorów, co czyni ją bardziej podatną na powszechną dystrybucję w porównaniu z tradycyjnymi metodami. W przyszłości metoda ta może być łączona z nowymi technologiami, takimi jak inżynieria genomu.