$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Przewód pokarmowy (GI) to złożony układ narządów, biorąc pod uwagę jego liczne funkcje, typy komórek gospodarza (np. nabłonkowe, immunologiczne, zrębowe, itp.), a także biliony mikrobów. W świetle tej złożoności choroby przewodu pokarmowego często wiążą się ze współdziałaniem wszystkich tych czynników. Na przykład choroby zapalne jelit (IBD) są związane z cyklami zapalenia i remisji w przewodzie pokarmowym, obejmującymi aktywację komórek zapalnych, dysbiozę i naprawę nabłonka1,2,3,4,5,6,7. Posiadanie odpowiednich systemów modelowych do badania IBD i innych stanów zapalnych przewodu pokarmowego ma kluczowe znaczenie dla wyjaśnienia patogenezy choroby. Istnieje kilka modeli do badania patogenezy IBD, w tym genetycznie modyfikowanych myszy i stosowania substancji chemicznych, takich jak siarczan sodu dekstranu (DSS) u gryzoni8,9,10. Do ograniczeń tych modeli należy niezdolność do precyzyjnej kontroli indukcji stanu zapalnego, a także trudności w ocenie gojenia się ran. Alternatywne metody naśladowania aspektów patogenezy IBD mogą okazać się przydatne w opracowywaniu terapii.
Biopsje szczypienne pod kontrolą kolonoskopową u myszy oferują użyteczny system modelowy do badania patogenezy reakcji zapalnej, gojenia się ran, a także interakcji gospodarz-mikrob w okrężnicy. Podejście to zostało po raz pierwszy użyte jako narzędzie eksperymentalne w 2009 roku, które wykazało jego użyteczność do badania ostrej reakcji zapalnej i gojenia się ran w gut11. W kolejnych badaniach wykorzystano tę technikę do oceny roli różnych szlaków sygnałowych, a także mikrobioty jelitowej, w gojeniu się ran okrężnicy11,12,13,14,15,16,17,18. Niedawno nasza grupa wykorzystała ten model do zbadania znaczenia sygnalizacji sfingozyno-1-fosforanu i bakterii w ostrej odpowiedzi na uszkodzenie okrężnicy19. Chociaż jest to przydatne, przeprowadzanie biopsji szczyptowych pod kontrolą kolonoskopii u myszy i ocena późniejszych zmian w tkankach może być technicznie trudne. Na przykład perforacja jelita może wystąpić po indukcji urazu, a zapewnienie spójnych pomiarów łożyska rany za pomocą seryjnej kolonoskopii może być trudne. Ponadto prawidłowe ułożenie tkanki okrężnicy w celu uwidocznienia łożyska rany do analiz histologicznych lub immunohistochemicznych może być trudne. Chociaż istnieją pewne informacje na temat tych metod18,20, dokładny opis tych technik wraz z pomocami wizualnymi obiecuje zwiększyć niezawodność i szerszą użyteczność tego modelu. W tym miejscu przedstawiamy szczegółową metodę przeprowadzania biopsji szczyptowych pod kontrolą kolonoskopii u myszy, śledzenia zamykania się rany w czasie i przygotowania tkanki do przeprowadzenia analiz histologicznych i molekularnych łożyska rany. Stworzenie standardowej metody przeprowadzania tych technik może rozszerzyć zastosowanie tego modelu do badania wcześniej niezbadanych mediatorów, które są potencjalnie ważne dla zapalenia przewodu pokarmowego i gojenia się ran.