Postęp różnicowania, liczba i morfologia makrofagów
Przedstawione wyniki pochodzą z różnicowania ludzkiej linii iPSC SFCi5, która została opisana i wykorzystana w wielu badaniach8,9,10,26. Proces różnicowania iPSC w kierunku makrofagów można było monitorować za pomocą mikroskopii optycznej. Kolonie iPSC, ciała embrionalne (EBs), komórki hematopoetyczne w zawiesinie oraz dojrzałe makrofagi różniły się morfologicznie (Rycina 2A). Morfologię dojrzałych makrofagów potwierdzono dodatkowo poprzez barwienie preparatów cytospinowych po odwirowaniu. Makrofagi pochodzące z iPSC były duże, posiadały pojedyncze małe jądra o owalnym kształcie oraz obfitą cytoplazmę zawierającą liczne pęcherzyki (Rycina 2B).
Pierwsze 2 tygodnie zbiorów komórek hematopoetycznych w zawiesinie (dni 16–28) z jednej pełnej płytki 6-dołkowej z ciałami zarodkowymi (EB) zawierały średnio 2,59 x 106 ± 0,54 komórek. Po 28. dniu uzyskano średnio 4,64 x 106 ± 0,94 komórek w zawiesinie z jednej płytki 6-dołkowej z EB. Od 80. dnia liczba komórek w zawiesinie zaczęła spadać w miarę jak EB ulegały wyczerpaniu (Rysunek 2C). Zaleca się przerwanie protokołu różnicowania po spadku liczby prekursorów poniżej 3 x 106 na jeden zbiór z płytki 6-dołkowej z EB.
Ekspresja markerów powierzchniowych makrofagów pochodzących z iPSC
Cytometria przepływowa pozostaje najczęstszą metodą stosowaną do oceny fenotypu ludzkich makrofagów. Strategia bramkowania w celu oceny ekspresji markerów powierzchniowych komórek polega na wyodrębnieniu głównej populacji komórek przy użyciu parametrów fizycznych, takich jak wielkość i ziarnistość, a następnie wyodrębnieniu pojedynczych komórek, a następnie komórek żywych (Rycina 3A). Dojrzałe makrofagi pochodzące z iPSC powinny wykazywać ekspresję markera linii CD45 oraz markera dojrzewania makrofagów 25F9 i być negatywne pod kątem markera monocytów/niedojrzałych makrofagów CD93. Jest to zgodne z naszymi obserwacjami (Rycina 3A). Makrofagi pochodzące z iPSC były również pozytywne pod kątem mieloidalnych markerów linii CD1b, CD14, CD43, CD64, CD15, CD163 oraz CD169 (Rycina 3B). Wykazano ich pozytywność dla markera immunomodulującego CD86, a niewielka ich część w stanie naiwnym wykazywała ekspresję receptorów chemokin CX3CR1, CCR2, CCR5 i CCR8 (Rycina 3B). Wykresy zostały opracowane na podstawie danych wcześniej opublikowanych przez nasz zespół badawczy8.
Fagocytoza i polaryzacja makrofagów pochodzących z iPSC
Jedną z kluczowych cech makrofagów w obronie gospodarza i homeostazie tkankowej jest ich zdolność do fagocytozy patogenów, komórek apoptotycznych oraz szczątków komórkowych27. Tempo fagocytozy jest ściśle powiązane ze specyficznymi stanami fenotypowymi28. Aby ocenić zdolność fagocytarną iPSC-DM, zastosowano podejście oparte na systemie obrazowania wysokotreściowego8,9,1, wykorzystując mikroskop PerkinElmer Operetta oraz biopartykuły pHrodo Zymosan (konjugaty z barwnikiem wrażliwym na pH). Biopartykuły nie wykazywały fluorescencji po dodaniu do kultur (Rysunek 4A), lecz świeciły na jaskrawozielono w kwasowym pH wewnątrzkomórkowym (Rysunek 4B). Mikroskop Operetta do obrazowania na żywo został ustawiony tak, aby wykonywać zdjęcia co 5 min po dodaniu kulek przez łączny czas 175 min. Następnie w platformie Columbus wykorzystano wysokoprzepustowy i bezstronny potok analizy obrazów w celu ilościowego określenia aktywności w postaci frakcji fagocytarnej, która reprezentuje proporcję komórek, które uprzednio sfagocytowały kulki, oraz indeksu fagocytarnego, będącego miarą liczby kulek pochłoniętych przez każdą komórkę.
Makrofagi mogą reagować i zmieniać swój fenotyp w zależności od sygnałów środowiskowych. Aby ocenić ich zdolność do reakcji i zmian pod wpływem bodźców środowiskowych, iPSC-DMs można traktować LPS i IFNg, IL4 lub IL10. Po 48 h traktowania zmieniły one fenotyp, określany tutaj odpowiednio jako M (LPS + IFNg), M (IL4) i M (IL10)29. Analiza ekspresji genów jest użytecznym narzędziem do badania stanu polaryzacji makrofagów. Po stymulacji LPS i IFNg makrofagi zwiększyły ekspresję mRNA genów CD40, VCAM1 oraz TNFA (Rycina 5A). Po stymulacji IL4 komórki zwiększyły ekspresję mRNA genów CD68, CD84 oraz MRC1 (Rycina 5B). Po stymulacji IL10 iPSC-DMs zwiększyły ekspresję MRC1 (Rycina 5B). W odniesieniu do fagocytozy, makrofagi traktowane LPS + IFNg lub IL4 wykazały znacznie niższy odsetek komórek fagocytujących w porównaniu z makrofagami naiwnymi. iPSC-DMs traktowane IL10 wykazały zwiększony odsetek komórek fagocytujących oraz wyższy indeks fagocytyczny (Rycina 5C–E).

Rycina 1: Schematyczne podsumowanie różnicowania iPSC w dojrzałe funkcjonalne makrofagi. Schemat wykonany w programie BioRender. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 2: Różnicowanie iPSC w makrofagi oraz liczba i morfologia iPSC-DM. (AObrazy w jasnym polu uzyskane z (od lewej do prawej): kolonii iPSC, ciał embrionalnych (EB), zebranych komórek w zawiesinie oraz dojrzałych makrofagów. Pasek skali = 100 μm. (B) Obraz preparatów cytospinowych makrofagów barwionych zestawem Kwik-diff. Pasek skali = 25 μm. (C) Liczba zebranych komórek w zawiesinie na jeden zbiór z jednej płytki 6-dołkowej z ciałami zarodkowymi (EB). Wykres przedstawia średnią ± SEM (n = 6 biologicznie niezależnych eksperymentów). Proszę kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej figury.

Rysunek 3: Fenotyp markerów powierzchniowych makrofagów. (A) Strategia bramowania dla analizy dojrzałych makrofagów pochodzących z iPSC. Wyselekcjonowano pojedyncze, żywe komórki, a następnie przeanalizowano ekspresję markerów powierzchniowych CD45, CD93 i 25F9. Bramy dla markerów powierzchniowych wyznaczono przy użyciu kontroli FMO (fluorescence minus one). (B) Reprezentatywne histogramy z cytometrii przepływowej dla pojedynczych barwień iPSC-DM (kolor niebieski) oraz kontroli izotypowych (kolor szary) dla markerów linii komórkowych i mieloidalnych, markerów immunomodulacyjnych, markerów dojrzewania oraz receptorów chemokin. Wykresy są reprezentatywne dla n = 5 biologicznie niezależnych eksperymentów dla wszystkich markerów linii komórkowych i mieloidalnych, z wyjątkiem CD105 i CD206 (n = 3); markerów dojrzewania (n = 5); markerów immunomodulacyjnych (n = 3) oraz receptorów chemokin (n = 3). Wykresy wykorzystują dane opublikowane wcześniej8. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej figury.

Rycina 4: Badania polaryzacji i fagocytozy komórek iPSC-DM. Reprezentatywne obrazy iPSC-DM (A) bezpośrednio po dodaniu kulek Zymosan pHrodo green oraz (B) 175 min po dodaniu kulek. Kolor niebieski reprezentuje jądra komórkowe; kolor czerwony reprezentuje cytoplazmę komórek. Kolor zielony reprezentuje pochłonięte kulki (Pasek skali = 20 μm). (C) Odsetek makrofagów fagocytujących i (D) indeks fagocytyczny/intensywność zielonej fluorescencji na jeden fagocytujący makrofag w czasie w stanie naiwnym (n = 6 niezależnych biologicznie eksperymentów). Wykresy przedstawiają wartość średnią, a słupki oznaczają SEM. Wykresy zawierają wcześniej opublikowane dane8. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej figury.

Rysunek 5: Ocena stanów polaryzacji iPSC-DM. Względna kwantyfikacja analiz RT-PCR naiwnych i spolaryzowanych iPSC-DM w celu oceny ekspresji (A) M(LPS+IFNϒ); (B) geny związane z M(IL4) i M(IL10) (n = 6 biologicznie niezależnych eksperymentów; jednoczynnikowa analiza wariancji ANOVA i test wielokrotnych porównań Holm-Sidak. Grupy spolaryzowane porównywano statystycznie wyłącznie z grupą naiwną). Wykresy przedstawiają wartość średnią, a słupki błędów reprezentują odchylenie standardowe. ND na wykresach = transkrypty nie wykryto. Dane dla tych wykresów zostały opublikowane wcześniej8. (C) Reprezentatywne obrazy iPSC-DM 175 min po dodaniu kulek pHrodo z iPSC-DM traktowanych (od lewej do prawej): brakiem cytokin, LPS+IFN-Y, IL-4 oraz IL-10 (Pasek skali = 20 μm). (D) Odsetek makrofagów fagocytujących i (E) indeks fagocytarny/intensywność zielonego sygnału na jeden fagocytujący makrofag w grupach makrofagów naiwnych i spolaryzowanych 175 min po dodaniu kulek (n = 12 biologicznie niezależnych eksperymentów, jednoczynnikowa analiza wariancji ANOVA i test post-hoc wielokrotnych porównań Holma-Sidaka. Grupy spolaryzowane porównywano statystycznie wyłącznie z grupą naiwną). Wykresy przedstawiają wartość średnią, a słupki błędów reprezentują odchylenie standardowe (*p < 0,05, **p < 0,01, ***p < 0,01, ****p < 0.0001). Prosimy kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.