Chociaż powszechnie stosowane w społeczności neuronaukowej, preparaty do wycinania mózgu mają również kilka wad. Na przykład połączenia wejściowe i wyjściowe z obszarami zainteresowania mózgu nie są już połączone w wycinku mózgu. Co więcej, po wyizolowaniu tkanka zaczyna z czasem powoli ulegać degradacji, a proces ten może zmienić warunki fizjologiczne wycinka mózgu. Ten temat jest szczególnie niepokojący, ponieważ większość zapisów wycinków mózgu trwa od kilku minut do godzin, co skutkuje długimi dniami eksperymentalnymi z nagraniami wykonywanymi na tkance, która została wyizolowana do 6-8 godzin przed rozpoczęciem eksperymentu. Co więcej, płyn mózgowo-rdzeniowy i krążenie krwi zostają przerwane podczas przygotowywania plastrów, co może prowadzić do braku ważnych związków endogennych w wycinku mózgu. A co najbardziej oczywiste, sama procedura krojenia może spowodować mechaniczne uszkodzenie tkanek, które może zagrozić uzyskanym wynikom. Jednak rzeczywiste korzyści płynące z preparatów typu brain slice nadal przeważają nad ich wadami, dlatego stanowią one wysoko cenioną i stosowaną technikę w badaniach neurobiologicznych.
Ostre wycinki mózgu w hipokampie stanowią potężną, a zatem szeroko stosowaną technikę badania procesów neuronalnych od poziomu molekularnego do złożonych badań obwodów mózgu. Opiera się to na idealnej neuroanatomii hipokampa, którą można łatwo zachować w preparacie plastrów18. W związku z tym wycinki mózgu hipokampa są wykorzystywane w wielu różnych projektach naukowo-badawczych, w tym w badaniach przesiewowych leków17, badaniach właściwości neuronalnych i synaptycznych związanych z funkcjami poznawczymi40,41 oraz badaniach patologicznych stanów mózgu 14,42,43. Jednak szerokie spektrum różnych zastosowań powoduje również szeroką gamę dostępnych protokołów przygotowania plastrów, które mogą różnić się różnymi parametrami, takimi jak m.in. warunki rozwarstwienia i orientacja płaszczyzny cięcia. W związku z tym należy określić dokładne pytanie badawcze projektu naukowego, aby wybrać odpowiedni protokół przygotowania plastrów.
Rozdrabniacz tkanek jest jedną z najstarszych technik stosowanych w celu przygotowania wycinków mózgu z hipokampa44,45. Do głównych zalet tej metody przygotowania należy niski koszt rozdrabniacza oraz szybkie i łatwe użycie46. Jednak rozdrabniacze tkanek powodują naprężenia mechaniczne, które powodują zmiany morfologiczne i śmierć komórki47. Dla porównania, wibratom jest dość drogim urządzeniem, a czas przygotowania plastra znacznie się wydłuża, co może mieć wpływ na jakość plastra. Jednak wibratom zwykle oferuje łagodniejszy sposób oddzielania plastrów od tkanki i pozwala utrzymać mózg w przyjemnym chłodzie i dotlenieniu przez całą procedurę izolacji, poprawiając w ten sposób właściwości plasterków46. Dlatego kilka grup standardowo stosuje tę technikę i opracowało protokoły przygotowania ostrych wycinków mózgu hipokampa za pomocą wibratomu 16,30,48. Podczas gdy niektóre protokoły zawierają tylko kilka szczegółów dotyczących samego krojenia, ale raczej koncentrują się na konkretnym zastosowaniu takiego przygotowania plastrów48, inne zawierają szczegółowe protokoły krojenia, które różnią się płaszczyzną cięcia lub innymi szczegółami protokołu (np. osadzanie agarozy lub roztwory do odzysku plastrów) podane w tym artykule27,30.
Opisany tutaj protokół przedstawia prostą metodę przygotowania wysokiej jakości ostrych poziomych wycinków mózgu myszy z hipokampa z młodych zwierząt. Protokół jest szczególnie przydatny do zachowania ścieżki perforacyjnej (przyśrodkowej i bocznej), która przedstawia szlak wejściowy hipokampa, który wystaje z kory śródwęchowej do hipokampa 8,49,50. Strzałkowe, czołowe, a także izolowane preparaty przekroju poprzecznego hipokampa nie zachowują prawidłowo ścieżki perforacji, która pochodzi głównie z warstw II i V kory śródwęchowej i rzutuje na kilka obszarów w obrębie hipokampa18. Ze względu na anatomiczne umiejscowienie kory śródwęchowej w stosunku do hipokampa, poziome wycinki mózgu są niezbędne w celu utrzymania w pełni nienaruszonych włókien ścieżki perforacji w preparacji plastra31. Dodatkowo, poziome krojenie idealnie zachowuje omszałe włókna, które wystają z zakrętu zębatego do neuronów CA3 w hipokampie 9,30,50. Dlatego ta metoda przygotowania ma dużą wartość dla badań, które badają szlaki wejściowe hipokampa i procesy związane z DG. Ponadto protokół ten pozwala na zbadanie ścieżki pobocznej Schaffera50. Jednak preparaty krzyżowe i koronalne z wycinków mózgu są częściej stosowane podczas badania projekcji włókien CA3 do CA1, prawdopodobnie ze względu na ich nieco szybszy czas przygotowania, który może zwiększyć szansę na uzyskanie wysokiej jakości plastrów. Niemniej jednak, poziome preparaty warstw hipokampa stanowią potężne narzędzie badawcze, ponieważ pozwalają na zachowanie i zbadanie wszystkich szlaków włókien hipokampa w obrębie jednej półkuli warstwowej. Może to być szczególnie przydatne, gdy badane są odpowiedzi obwodów, na przykład w zapisach testów wieloelektrodowych.
Głównym problemem podczas przygotowywania plasterków mózgu jest prawidłowa konserwacja tkanki mózgowej. Osiąga się to poprzez kilka krytycznych etapów naszego protokołu, w tym szybką preparację, ciągłe i wystarczające natlenienie i chłodzenie tkanki oraz ochronę tkanki mózgowej za pomocą ochronnej metody cięcia roztworem do krojenia o niskiej zawartości sodu i wysokiej zawartości sacharozy39,51. Pomimo faktu, że opisany tutaj protokół daje wskaźnik sukcesu około 90%, potencjalnie dodatkowe kroki ochronne mogą być wymagane podczas pracy z tkankami pochodzącymi ze starszych lub genetycznie zróżnicowanych zwierząt lub podczas próby zachowania określonej populacji komórek. Opisano już kilka metod ochrony wrażliwych preparatów tkanki mózgowej. Metody te obejmują stosowanie roztworów do krojenia na bazie NMDG w celu zmniejszenia przenikania sodu52, stosowanie wysokich poziomów magnezu w roztworze do krojenia w celu zablokowania aktywności receptora NMDA53 oraz przedłużone stosowanie roztworów ochronnych również w okresie rekonwalescencji23. Wszystkie te środki spowodują zmniejszenie ekscytotoksyczności. Ponadto perfuzja przezsercowa z lodowatymi roztworami ochronnymi ACSF jest często stosowana i konieczna podczas pracy ze starszymi zwierzętami27.
Ostre wycinki mózgu w hipokampie są idealnie dopasowane i szeroko stosowane do badań elektrofizjologicznych z powodów takich jak sygnały o dużej amplitudzie, które można uzyskać ze stosunkowo grubego (300–500 μm) ostrego wycinka mózgu, co gwarantuje wysoki stosunek sygnału do szumu11. Standardowo stosowane zastosowania elektrofizjologiczne obejmują zewnątrzkomórkowe zapisy pola i wewnątrzkomórkowe zapisy całych komórek w trybie cęgów napięciowych lub prądowych. W celu uzyskania wysokiej jakości danych elektrofizjologicznych, zdrowie plastra jest sprawą pierwszorzędną i może być zagwarantowane poprzez ścisłe przestrzeganie przedstawionego protokołu. Ponieważ jednak przygotowanie plastrów jest bardzo czułą techniką, przed rozpoczęciem każdego eksperymentu należy rutynowo przeprowadzać kontrolę jakości. Kilka parametrów może być wykorzystywanych do kontroli jakości wycinka i są standardowo oceniane za pomocą krzywych wejścia-wyjścia oraz bazowych nagrań fEPSP lub EPSC19. Niemniej jednak należy zauważyć, że nieoptymalne właściwości elektrofizjologiczne mogą wynikać z błędów eksperymentalnych, takich jak ustawienie elektrody, orientacja, a nawet uszkodzenie, i nie reprezentują wyłącznie zdrowia przygotowanego plastra. Dlatego zaleca się przeprowadzenie dodatkowych kontroli jakości, takich jak prosta wizualizacja i ocena komórek pod obiektywem 40x lub barwienie jądra DAPI. Takie kontrole jakości mogą być wykorzystane do potwierdzenia stałego stanu plastrów przez kilka sesji przygotowania plastrów.
Mikrofluorymetria wapnia jest rzadziej stosowaną techniką badania wycinków mózgu w hipokampie. Jednak technika ta ma dodatkową wartość w stosunku do standardowych zewnątrzkomórkowych i wewnątrzkomórkowych zapisów elektrod, ponieważ pozwala na wizualizację i ilościowe określenie wewnątrzkomórkowych strumieni wapnia, które mają duże znaczenie w sygnalizacji neuronalnej i synaptycznej. Zmiany wewnątrzkomórkowych stężeń wapnia biorą udział w uwalnianiu pęcherzyków neuroprzekaźników, generowaniu potencjału postsynaptycznego, regulacji plastyczności synaptycznej i przewodnictwie nerwów aksonalnych 54,55,56. Jako ilustrację tej techniki (ryc. 4) użyliśmy dostępnego na rynku barwnika wapniowego. Nie ulega wątpliwości, że traktowanie wycinków tkanek barwnikami wapniowymi może powodować trudności, takie jak wydłużenie czasu eksperymentu, a także nieefektywne obciążenie niżej położonych komórek neuronalnych. Jednak różne warianty tej techniki mogą być wykorzystane do obejścia tych wyzwań technicznych. Na przykład możliwe jest połączenie pomiarów wapnia i zapisów klamer w wycinkach hipokampa. W ten sposób barwnik fluorescencyjny wapnia może zostać załadowany do określonej komórki za pomocą pipety krostowej, co pozwala na pomiary dynamiki wapnia w jednej konkretnej komórce będącej przedmiotem zainteresowania57. Alternatywnie, można zastosować genetycznie zmodyfikowane zwierzęta wykazujące ekspresję wskaźnika wapnia, GCaMP58, w całym mózgu lub napędzane przez specyficzny dla komórki promotor. Co ciekawe, tkanka mózgowa zwierząt z GCaMP z bezpośrednim łącznikiem z białkiem będącym przedmiotem zainteresowania może dostarczyć możliwości określenia wzorca ekspresji neuronalnej lub zbadania udziału w iskrach i falach wapniowych.
Podsumowując, dostarczamy wytyczne dotyczące skutecznego przygotowania zdrowych i żywotnych poziomych wycinków mózgu hipokampa od myszy do zapisów elektrofizjologicznych i obrazowych. Ta metodologia jest bardzo przydatna w dostępie do zmian neurologicznych, które zachodzą w patologiach mózgu opisanych w zakręcie zębatym.