Ten protokół szczegółowo opisuje konfigurowalną produkcję i użycie sond fluorescencyjnych do znakowania komórek B specyficznych dla antygenu.
Artykuł metodologiczny
* These authors contributed equally
Ten protokół szczegółowo opisuje konfigurowalną produkcję i użycie sond fluorescencyjnych do znakowania komórek B specyficznych dla antygenu.
Produkcja antygenu fluorescencyjnego jest kluczowym krokiem w identyfikacji komórek B specyficznych dla antygenu. Tutaj szczegółowo opisaliśmy przygotowanie, oczyszczanie i stosowanie czteroramiennych, fluorescencyjnych koniugatów PEG-antygen do selektywnej identyfikacji komórek B specyficznych dla antygenu poprzez intensywne zaangażowanie w pokrewne receptory komórek B. Korzystając z modułowej chemii kliknięć i dostępnych na rynku zestawów chemicznych do fluoroforów, wykazaliśmy wszechstronność przygotowania niestandardowych fluorescencyjnych koniugatów PEG, tworząc odrębne macierze dla białka proteolipidowego (PLP139-151) i insuliny, które są ważnymi autoantygenami w mysich modelach stwardnienia rozsianego i cukrzycy typu 1. Testy opracowano dla każdego koniugatu fluorescencyjnego w odpowiednim modelu choroby przy użyciu cytometrii przepływowej. Macierze antygenowe porównano z monowalentnym autoantygenem w celu ilościowego określenia korzyści płynących z multimeryzacji na szkieletach PEG. Na koniec zilustrowaliśmy użyteczność tej platformy, izolując i oceniając odpowiedzi komórek B antyinsuliny po stymulacji antygenowej ex vivo. Znakowanie limfocytów B specyficznych dla insuliny umożliwiło wzmocnione wykrywanie zmian w kostymulacji (CD86), które w przeciwnym razie zostałyby stłumione w analizie zagregowanych limfocytów B. Podsumowując, raport ten umożliwia produkcję i wykorzystanie fluorescencyjnych matryc antygenowych jako solidnego narzędzia do badania populacji komórek B.
Adaptacyjny układ odpornościowy odgrywa kluczową rolę w postępie lub regresji wielu stanów chorobowych, w tym autoimmunizacji, raka i chorób zakaźnych1. W przypadku szerokich zastosowań, takich jak badanie immunopatologii lub opracowywanie nowych precyzyjnych metod leczenia, często krytyczna jest ocena odpowiedzi limfocytów B i T specyficznych dla antygenu leżących u podstaw progresji choroby2,3,4. Główne tetramery kompleksu zgodności tkankowej (MHC) są szeroko i komercyjnie dostępne do identyfikacji klonów limfocytów T specyficznych dla antygenu5. Te znakowane fluoroforem konstrukty prezentują czterowalentne kompleksy peptyd-MHC, które zachłannie angażują się w pokrewne receptory limfocytów T do zastosowań znakowania, takich jak mikroskopia i cytometria przepływowa.
Antygeny do badania limfocytów B mogą charakteryzować się bardzo zróżnicowanymi masami cząsteczkowymi, ładunkami i rozpuszczalnościami6,7. W przypadku stosowania antygenu monomerycznego jako rozpuszczalnych sond limfocytów B, właściwości fizykochemicznego antygenu mogą nie zostać ustabilizowane poprzez kompleksowanie ze znacznie większą, rozpuszczalną w wodzie cząsteczką streptawidyny lub mogą powodować problemy z rozpuszczalnością jako odczynniki monomeryczne przed koniugacją. Tak więc niektóre białka mają trudności z biokoniugacją i nieoczekiwane wyniki w praktyce7,8. Bezpośrednia koniugacja barwnika fluorescencyjnego może czasami sprawić, że konstrukty staną się nierozpuszczalne w wodzie i lipofilowe. Te bezpośrednie związki antygenu barwnika są podatne na niespecyficzne osadzanie w błonach komórkowych, co zakłóca analizy specyficzne dla antygenu7,8,9. Niektóre strategie przezwyciężyły wyzwania związane z rozpuszczalnością poprzez sprzężenie antygenu i fluoroforów z innymi grupami funkcyjnymi. Na przykład Cambier i wsp. zastosowali biotynylowaną insulinę w jej natywnej postaci, aby zaangażować się w receptory komórek B specyficznych dla insuliny (BCR) przed dodaniem streptawidyny znakowanej fluoroforem w sposób stopniowy10. Chociaż podejście to umożliwiło ocenę limfocytów B, które wiążą się z insuliną monomeryczną z wysoką rozdzielczością, wymagane były dwa etapy znakowania. Uogólniony protokół przygotowania gotowych do użycia sond limfocytów B na bazie polimerów, który można łatwo zintegrować z powszechnymi procedurami znakowania przeciwciał fluorescencyjnych, byłby korzystny dla dalszego rozwoju badań nad komórkami B w chorobie.
W tym protokole szczegółowo opisujemy produkcję i wykorzystanie fluorescencyjnych matryc antygenowych (FAA) do uogólnionego i jednoetapowego znakowania komórek B specyficznych dla antygenu do eksperymentów mikroskopowych i cytometrii przepływowej (Rysunek 1). Rozpuszczalne macierze antygenowe (SAgAs) zostały wykorzystane w ciągu ostatniej dekady jako immunoterapie specyficzne dla antygenu ukierunkowanego na limfocyty B przeciwko chorobom autoimmunologicznym11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22. SAgA wykorzystują wyświetlanie antygenu wielowartościowego na elastycznych, polimerowych szkieletach, aby zachłannie angażować receptory komórek B i wywoływać efekty immunomodulacyjne, chociaż ich specyficzność antygenowa zapewnia kolejną okazję do sondowania interesujących komórek B po sprzężeniu z klasą fluoroforową23. Polimerowe szkielety tworzące SAgAs nadają rozpuszczalność w wodzie całej biomakrocząsteczce i mogą tłumić czasami ekstremalne cechy antygenu, które zakłócają generowanie sondy i specyficzność barwienia6,24. Na platformę SAgA przeszczepiliśmy liczne antygeny o różnej wielkości i złożoności za pomocą modułowej chemii kliknięć, co sprzyja stosowaniu małych epitopów peptydowych i pełnych białek14,18. W tym miejscu pokazujemy FAA jako solidne narzędzia do znakowania limfocytów B specyficznych dla antygenu, które mogą być stosowane równolegle z typowym znakowaniem przeciwciał fluorescencyjnych. Przygotowaliśmy i oceniliśmy FAA składające się z ludzkiej insuliny do znakowania komórek B w transgenicznym mysim modelu cukrzycy typu 1 (VH125), a także FAA, które zawierały białko proteolipidowe 139-151 (PLP), epitop peptydowy dla eksperymentalnego autoimmunologicznego zapalenia mózgu i rdzenia (EAE), mysiego modelu stwardnienia rozsianego. Naszym zamiarem przy stosowaniu tych modeli chorób było zademonstrowanie wszechstronności tej platformy, zarówno w zakresie modułowej substytucji stosowanych antygenów, jak i wykonalności stosowania zarówno z epitopami peptydowymi (PLP), jak i pełnymi białkami (insulina). Protokół ten został przedstawiony z myślą o dostępności, bez konieczności posiadania rozległej wiedzy specjalistycznej w zakresie biokoniugacji. Odczynniki, a także metody syntezy i oczyszczania, są zaprojektowane tak, aby były wszechstronne i łatwe do wdrożenia w większości laboratoriów badawczych zajmujących się chemią, biologią molekularną lub immunologią.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Wszystkie procedury na zwierzętach przedstawione w tej pracy zostały zatwierdzone przez Instytucjonalny Komitet ds. Opieki i Użytkowania Zwierząt na Uniwersytecie Kansas.
1. Synteza macierzy antygenowej (4–6 dni)
2. Koniugacja fluoroforu (1-2 dni)
3. Charakterystyka FAA (2–4 godziny)
4. Opracowanie testu za pomocą miareczkowania FAA (3–5 h)
UWAGA: Przedstawiono zastosowanie FAA do cytometrii przepływowej, ale te same kroki mogą być zmodyfikowane do użycia w innych formatach, takich jak immunohistochemia czy mikroskopia fluorescencyjna. W przypadku stosowania FAA dla nowego formatu należy wykonać nowy test optymalizacyjny. Mieszane lub izolowane populacje komórek można uzyskać za pomocą metod przetwarzania krwi lub narządów limfatycznych23,29. Nie zaleca się zbierania poprzez trawienie enzymatyczne tkanek, ponieważ markery powierzchniowe komórek mogą zostać zrzucone.
5. Analiza miareczkowania FAA i optymalizacja dawki etykietowania (1–2 h)
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Oczyszczona wydajność insulinoalkinu (Rysunek 2, górny panel), określona na podstawie masy, zazwyczaj wahała się od 50 do 65%. Plony mniejsze niż 40% były prawdopodobnie spowodowane zanieczyszczeniem wody w bezwodnym DMSO i/lub hydrolizą propargilowego estru NHS. W przypadku multimeryzacji antygenu (Rysunek 1B), oczyszczona wydajność tablicy antygenów insulinowych (Rysunek 2, środkowy panel) wahała się od 60 do 75%, a analiza SDS-PAGE potwierdziła, że głównym pr...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Opracowaliśmy protokół (rysunek 1) w celu skonstruowania niestandardowych FAA do identyfikacji limfocytów B specyficznych dla antygenu, upraszczając generowanie sond limfocytów B dla trudnych celów antygenowych. Wybraliśmy 4-ramienne polimery PEG z końcowymi grupami azydkowymi jako łatwy substrat do budowy FAA, ponieważ PEG nadaje rozpuszczalność w wodzie, podczas gdy funkcjonalne uchwyty azydkowe umożliwiają proste reakcje koniugacji na klik33. Zdefiniowana liczba fu...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
CJB jest współzałożycielem Orion Bioscience, Inc., firmy udzielającej licencji na technologię SAgA w celu badania jej zastosowań terapeutycznych. Niniejszy raport opiera się na pracach wspieranych przez National Science Foundation Graduate Research Program w ramach grantu nr 1946099. Wszelkie opinie, ustalenia, wnioski lub zalecenia wyrażone w tym materiale są opiniami autorów i niekoniecznie odzwierciedlają poglądy National Science Foundation.
Dziękujemy Colette Worcester za pomoc w zbieraniu danych. Praca ta była wspierana przez Fundację PhRMA (JDG), Program Stypendialny dla Absolwentów Narodowej Fundacji Nauki (KDA) oraz przez granty NIH R21AI143407, R21AI144408 i DP5OD023118.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| 1,1,3,3-tetramethylguanidine | Alfa Aesar | AAA12314AC | |
| 12 M kwas solny | Fisher Chemical | A508-4 | |
| 12% Prefabrykowane żele białkowe Mini-PROTEAN TGX, 10-dołkowe, 30 ul | Bio-Rad | 4561043 | |
| 20 kDa 4-ramienny azyd PEG | Jenkem USA | A7185-1 | |
| 3,5 kDa MWCO rurki do dializy (regenerowana celuloza) | Fisher Scientific | 25-152-10 | |
| Acetonitryl, klasa HPLC | Fisher Chemical | A998-4 | |
| Alexa Fluor 647 przeciwciało anty-mysie CD19 | BioLegend | 115522 | |
| bezwodny dimetylosulfotlenek | ACROS Organics | AC610420010 | |
| chlorek baru | ACROS Organics | 203135000 | |
| Brilliant Blue G-250 Dye | Fisher BioOdczynniki | BP100-50 | |
| Cell Prime r-insulina | EMD Millipore | 4512-01 | Rekombinowana insulina ludzka do syntezy insuliny FAA |
| Siarczan miedzi (II) pentahydrat | ACROS Organics | AC197722500 | |
| dimetylosulfotlenek | Fisher Chemical | S67496 | |
| izomer izotiocyjanianu fluoresceiny (FITC) 1 | Sigma-Aldrich | F7250-1G | |
| Lodowaty kwas octowy | Fisher Chemical | A38-212 | |
| Glicerol | ACROS Organics | 15892-0010 | |
| Glicyna | Fisher Chemical | G46-500 | |
| homopropargyl-PLP | Biomatik | NA | em>Niestandardowa synteza (sekwencja: homopropargyl-HSLGKWLGHPDKF; czystość: 97,29%) |
| jod | Sigma-Aldrich | 207772-100G | |
| Metanol, klasa HPLC | Fisher Chemical | A452-4 | |
| NHS-Rhodamine (ester sukcymidylowy 5/6-karboksy-tetrametylo-rodaminy), mieszany izomer | Thermo Scientific | 46406 | Dostępny na rynku analog estru NHS Rhodamine-B stosowanego w bibułce |
| PE/Cyjanine7 przeciwciało anty-mysie CD3 | BioLegend | 100220 | |
| jodek potasu | Sigma-Aldrich | 30315 | |
| propargyl N-hydroksysukcynimid | ester Sigma-Aldrich | 764221 | |
| askorbinian sodu | Sigma-Aldrich | A7631 | |
| biowęglan sodu | Sigma-Aldrich | S5761-1KG | |
| dodecylosiarczan sodu | Fisher BioReagents | BP166-100 | |
| Sód fosforan monobasic monohydrat | Fisher Chemical | S468-500 | |
| kwas trifluorooctowy | Sigma-Aldrich | 302031-10x1mL | |
| Tris base | Fisher BioReagents | BP152-500 | |
| Tris(3-hydroksypropylotriazolylo)amina | ClickChemTools | 1010-1000 | |
| xBridge BEH C18 3,5 um, kolumna 4,6 x 150 mm | 186003034 | Wody | |
| xBridge BEH C18 5um Kolumna przygotowawcza OBD, 19 x 250 mm | Woda | 186004021 |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Poproś o pozwolenie na ponowne wykorzystanie tekstu lub ilustracji tego artykułu JoVE
Poproś o pozwolenie