Segmentacja metameryczna organizmów jest powszechnie występująca w przyrodzie. Powtarzalne struktury są niezbędne dla funkcjonowania organów bocznych, takich jak kręgi, mięśnie, nerwy, naczynia, kończyny lub liście w planie budowy ciała1. W wyniku takich fizjologicznych i geometrycznych ograniczeń symetrii osiowej większość typów Bilateria – takich jak pierścienice, stawonogi i strunowce – wykazuje segmentację tkanek embrionalnych (np. ektodermy, mezodermy) wzdłuż osi przednio-tylnej.
Zarodki kręgowców sekwencyjnie dzielą mezodermę paraksjalną wzdłuż głównej osi ciała na somity, charakteryzujące się gatunkowymi odstępami czasowymi, liczbą oraz rozkładem wielkości. Pomimo takiej stabilności między poszczególnymi zarodkami w obrębie jednego gatunku, segmentacja somitów jest zróżnicowana pomiędzy gatunkami kręgowców. Segmentacja zachodzi w szerokim zakresie odstępów czasowych (od 25 min u danio przebrzmiałego do 5 h u ludzi), rozmiarów (od ~20 µm w somitach ogonowych u danio przebrzmiałego do ~200 µm w somitach tułowia u myszy) oraz liczebności (od 32 u danio przebrzmiałego do ~300 u węża kukurydzianego)2. Co ciekawsze, zarodki ryb mogą rozwijać się w szerokim zakresie temperatur (od ~20,5 °C do 34 °C w przypadku danio przebrzmiałego), zachowując nienaruszone somity z prawidłowym rozkładem wielkości poprzez kompensację zarówno odstępów segmentacyjnych, jak i szybkości elongacji osiowej. Poza tymi interesującymi cechami, danio przebrzmiały pozostaje użytecznym organizmem modelowym do badania segmentacji u kręgowców ze względu na zewnętrzny, synchroniczny i przejrzysty rozwój licznych zarodków z jednego miotu, a także dostępność narzędzi genetycznych. Z punktu widzenia mikroskopii niekorzystne jest to, że zarodki ryb kostnoszkieletowych rozwijają się na masywnym, sferycznym żółtku, co powoduje rozciąganie i zaokrąglanie gastrulującej tkanki wokół niego (Ryc. 1A). W niniejszym artykule przedstawiamy metodę spłaszczonej hodowli 3-D eksplantu tkanki ogonów danio przebrzmiałego. Ten system eksplantu omija ograniczenia sferycznego kształtu masy żółtka, umożliwiając wysokorozdzielcze obrazowanie na żywo zarodków ryb w celu badania wzorca formowania somitów.

Rysunek 1: System eksplantacji w komorze szkiełka dla embrionów zebrafish. (A) Embriony zebrafish mają zalety w obrazowaniu na żywo, takie jak przejrzystość gastrulującej tkanki embrionalnej (kolor niebieski), jednak tkanka ta formuje się wokół masywnej, sferycznej masy żółtka (kolor żółty), co uniemożliwia obrazowanie o wysokiej rozdzielczości w bliskiej odległości od obiektywu w nienaruszonych embrionach. Eksplanty ogona można wypreparować, zaczynając od cięcia nożem mikrosurgicalnym (kolor brązowy) w tkance przedniej części somitów (kolor czerwony) i kontynuując na granicy z żółtkiem w części tylnej. (B) Wypreparowane eksplanty ogona można umieścić na szkiełku nakrywkowym (kolor jasnoniebieski) w orientacji grzbietowo-brzusznej, utrzymując tkankę nerwową (kolor jasnoszary) na górze, a strunę grzbietową (kolor ciemnoszary) na dole. Prosimy kliknąć tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tego rysunku.