Seryjna skaningowa mikroskopia elektronowa (SBF-SEM) pozwala na gromadzenie setek do tysięcy seryjnie rejestrowanych obrazów ultrastrukturalnych, oferując niespotykany dotąd trójwymiarowy widok mikroanatomii tkanek. Chociaż w ostatnich latach SBF-SEM odnotował gwałtowny wzrost stosowania, aspekty techniczne, takie jak odpowiednie przygotowanie tkanek i parametry obrazowania, mają kluczowe znaczenie dla powodzenia tej metody obrazowania. Ten system obrazowania korzysta ze zautomatyzowanego charakteru urządzenia, które pozwala na pozostawienie mikroskopu bez nadzoru podczas procesu obrazowania, z możliwością automatycznego zbierania setek obrazów w ciągu jednego dnia. Jednak bez odpowiedniego przygotowania tkanek ultrastruktura komórkowa może zostać zmieniona w taki sposób, że można wyciągnąć błędne lub wprowadzające w błąd wnioski. Ponadto obrazy są generowane poprzez skanowanie powierzchni blokowej próbki biologicznej zatopionej w żywicy, co często wiąże się z wyzwaniami i kwestiami, którymi należy się zająć. Nagromadzenie elektronów w bloku podczas obrazowania, znane jako "ładowanie tkanki", może prowadzić do utraty kontrastu i niemożności docenienia struktury komórkowej. Co więcej, zwiększenie natężenia/napięcia wiązki elektronów lub zmniejszenie prędkości skanowania wiązki może zwiększyć rozdzielczość obrazu, ale może to mieć również niefortunny efekt uboczny w postaci uszkodzenia bloku żywicy i zniekształcenia kolejnych obrazów w serii obrazowania. W tym miejscu przedstawiamy rutynowy protokół przygotowania próbek tkanek biologicznych, który zachowuje ultrastrukturę komórkową i zmniejsza obciążenie tkanek. Zapewniamy również rozważania dotyczące obrazowania w celu szybkiego uzyskania wysokiej jakości obrazów seryjnych przy minimalnym uszkodzeniu bloku tkankowego.