Opisane tutaj metody dotyczą substancji, które są funkcjonalnie zdefiniowane jako lipidy morskie. Definicja ta opiera się na ich podatności na ekstrakcję ciecz-ciecz w niepolarnych rozpuszczalnikach organicznych i zapewnia wygodną metodę ich oddzielania od innych substancji w matrycy wodnej. Ich hydrofobowy charakter ułatwia ich izolację od wody morskiej lub próbek biologicznych, a także ich wzbogacanie oraz usuwanie soli i białek.
Pomiar zawartości lipidów i ich składu w organizmach morskich od dziesięcioleci cieszy się dużym zainteresowaniem w ekologii sieci pokarmowej, żywieniu w akwakulturze i nauce o żywności. Lipidy są uniwersalnymi składnikami organizmów żywych, działającymi jako niezbędne cząsteczki w błonach komórkowych, jako główne źródła biodostępnej energii, zapewniając izolację termiczną i wyporność oraz służąc jako cząsteczki sygnałowe. Chociaż procedury oznaczania lipidów w innych dziedzinach zostały dobrze opisane, ich stosowanie z próbkami morskimi często wymaga modyfikacji w celu dostosowania do warunków terenowych, a także do typu próbki1.
Dla próbek wody morskiej, pierwszym krokiem zazwyczaj jest rozdzielenie na funkcjonalnie zdefiniowane frakcje 'rozpuszczone' i 'cząstkowe', zwykle przez filtrację (Krok 1 Protokołu). Frakcja cząstek stałych jest tym, co jest zatrzymywane przez filtr, a wielkość porów jest ważna przy definiowaniu cut-off2. Często, gdy pobieramy próbki cząstek stałych, chcielibyśmy odnieść stężenia lipidów do całkowitych stężeń masowych, w którym to przypadku w tym celu należy pobrać oddzielną, mniejszą próbkę (np. 10 ml) (krok 1 protokołu, uwaga). Aby uzyskać dokładne określenie masy, ważne jest, aby na końcu filtracji dodać mrówczan amonu (35 g/l).
Filtrat wody morskiej z większej próbki powinien wynosić od 250 ml do 1 litra, w zależności od typu próbki i jest poddawany ekstrakcji ciecz-ciecz w lejku separatora (krok 2 protokołu). Hydrofobowy charakter lipidów oznacza, że można je oddzielić od innych związków przez ekstrakcję w rozpuszczalniku niepolarnym, takim jak chloroform. Powstaje system dwuwarstwowy, w którym lipidy rozdzielają się na warstwę organiczną, podczas gdy składniki rozpuszczalne w wodzie pozostają w warstwie wodnej.
Próbki cząstek stałych na filtrze, lub próbki biologiczne są ekstrahowane za pomocą zmodyfikowanej ekstrakcji Folch et al. 3, również z udziałem chloroformu (Krok 3 protokołu). Ponownie powstaje układ organiczno-wodny, w którym lipidy dzielą się na fazę organiczną, podczas gdy cząsteczki rozpuszczalne w wodzie pozostają w fazie wodnej, a białka są wytrącane. W rzeczywistości, w przypadku ciał stałych, większość laboratoriów stosuje pewną odmianę procedury Folch et al. extraction3 obejmującej chloroform i metanol. W przypadku filtrów pierwszym krokiem jest homogenizacja w 2 ml chloroformu i 1 ml metanolu.
Podczas ekstrakcji należy zachować ostrożność w celu ochrony lipidów przed modyfikacją chemiczną lub enzymatyczną, poprzez przechowywanie próbek i rozpuszczalników na lodzie w celu zmniejszenia hydrolizy wiązań estrowych lub utleniania podwójnego wiązania węgiel-węgiel. Tkanki i lipidy komórkowe są dość dobrze chronione przez naturalne przeciwutleniacze i przez podział na przedziały4; Jednak po homogenizacji próbek zawartość komórek jest łączona, co sprawia, że lipidy są bardziej podatne na zmiany chemiczne lub enzymatyczne. Niektóre lipidy, takie jak większość steroli, są bardzo stabilne, podczas gdy inne, takie jak te zawierające wielonienasycone kwasy tłuszczowe, są bardziej podatne na utlenianie chemiczne. Inne, takie jak sterole ze sprzężonymi wiązaniami podwójnymi, są podatne na utlenianie katalizowane przez light5. Po ekstrakcji lipidy są znacznie bardziej podatne na utlenianie chemiczne, a próbki powinny być przechowywane w gazie obojętnym, takim jak azot. Delikatny strumień azotu byłby również używany do zagęszczania ekstraktów.
Po koncentracji, lipidy byłyby zwykle oznaczane ilościowo w dużych ilościach, ponieważ są ważnym składnikiem ekosystemów morskich, dostarczając wysoką koncentrację energii, ponad dwukrotnie większą niż kJ/g węglowodanów i białek. Niezmiennie byłyby one następnie określane ilościowo jako poszczególne składniki: kompleksowa analiza lipidów zazwyczaj obejmuje podział na prostsze kategorie, zgodnie z ich naturą chemiczną. W związku z tym pełna analiza obejmuje pomiar całkowitej liczby lipidów, klas lipidów i poszczególnych związków.
Całkowita zawartość lipidów może być określona na podstawie sumy indywidualnie zmierzonych klas lipidów oddzielonych metodą chromatografii6. Ekstrakt z lipidów morskich może zawierać kilkanaście klas ze źródeł biogennych i antropogennych. Duża różnorodność struktur lipidowych oznacza, że można uzyskać wiele informacji, określając poszczególne grupy struktur. Klasy lipidów pojedynczo lub w określonych grupach były używane do sygnalizowania obecności pewnych typów organizmów, a także ich stanu fizjologicznego i aktywności2. Są one również wykorzystywane jako wskaźnik pochodzenia materiału organicznego, w tym rozpuszczonej materii organicznej (DOM), a także zanieczyszczeń hydrofobowych.
Triacyloglicerole, fosfolipidy i sterole należą do ważniejszych klas lipidów biogennych. Pierwsze dwa są biochemicznie powiązane, ponieważ posiadają szkielet glicerolu, do którego estryfikowane są dwa lub trzy kwasy tłuszczowe (Rysunek 1). Triacyloglicerole wraz z estrami wosku są bardzo ważnymi substancjami magazynującymi, podczas gdy inne klasy lipidów zawierające kwasy tłuszczowe, takie jak diacyloglicerole, wolne kwasy tłuszczowe i monoacyloglicerole, są na ogół drugorzędnymi składnikami. Wolne kwasy tłuszczowe są obecne w niższych stężeniach w organizmach żywych, ponieważ te nienasycone mogą być toksyczne7. Sterole (zarówno w postaci wolnej, jak i estryfikowanej) oraz alkohole tłuszczowe zaliczane są również do lipidów mniej polarnych, natomiast glikolipidy i fosfolipidy są lipidami polarnymi. Lipidy polarne mają grupę hydrofilową, która pozwala na tworzenie dwuwarstw lipidowych znajdujących się w błonach komórkowych. Wolne sterole są również składnikami strukturalnymi błony, a w stosunku do triacylogliceroli zapewniają stan lub indeks odżywczy (TAG : ST), który jest szeroko stosowany8. W stosunku do fosfolipidów (ST : PL) mogą być używane do wskazania wrażliwości roślin na sól: wyższe wartości utrzymują integralność strukturalną i zmniejszają przepuszczalność błony9. Odwrotność tego stosunku (PL : ST) badano w tkankach małży podczas adaptacji do temperatury10.
Klasy lipidów morskich mogą być rozdzielone za pomocą chromatografii cienkowarstwowej (TLC) na prętach pokrytych żelem krzemionkowym (krok 4 protokołu), a następnie wykryte i określone ilościowo przez detekcję płomieniowo-jonizacyjną (FID) w automatycznym skanerze FID. TLC/FID stała się rutynowo stosowana w próbkach morskich, ponieważ szybko dostarcza danych o synoptycznej klasie lipidów z małych próbek, a poprzez sumę wszystkich klas otrzymuje wartość dla całkowitych lipidów. TLC/FID został poddany ocenie zapewnienia jakości (QA) i stwierdzono, że spełnia standardy wymagane do spójnej kalibracji zewnętrznej, niskiej liczby ślepych prób i precyzyjnej analizy powtórzeń11. Współczynniki zmienności (CV) lub względne odchylenia standardowe wynoszą około 10%, a całkowite dane lipidowe skanera FID wynoszą zwykle około 90% danych uzyskanych za pomocą metod grawimetrycznych i innych2. Grawimetria daje wyższe lipidy całkowite, prawdopodobnie dlatego, że skaner FID mierzy tylko związki nielotne, a także w wyniku możliwego włączenia materiału nielipidowego do pomiarów grawimetrycznych.
Informacje dostarczane przez analizę klas lipidów są szczególnie użyteczne w połączeniu z oznaczeniami kwasów tłuszczowych jako pojedynczych jednostek lub steroli, lub tych dwóch w połączeniu. Pierwszym krokiem w kierunku tych analiz jest uwolnienie wszystkich składowych kwasów tłuszczowych wraz ze sterolami w ekstraktach lipidowych (krok 5 protokołu). Duża różnorodność struktur i funkcji lipidów oznacza, że znalazły one szerokie zastosowanie w badaniach ekologicznych i biogeochemicznych oceniających zdrowie ekosystemów oraz stopień, w jakim wpłynęły na nie czynniki antropogeniczne i lądowe. Zostały one wykorzystane do pomiaru biosyntezy substancji mających wartość pokarmową dla fauny morskiej, a także do wskazania jakości próbek wody. Pomiar lipidów w próbkach rdzeni osadów pomaga wykazać wrażliwość osadów na zmiany w użytkowaniu gruntów przez człowieka w pobliżu granicy lądowo-morskiej.
Podstawowym narzędziem do identyfikacji i ilościowego oznaczania poszczególnych związków lipidowych tradycyjnie była chromatografia gazowa (GC) z FID. Jednak przed analizą związki te stają się bardziej lotne w wyniku derywatyzacji. Kwasy tłuszczowe są uwalniane w obecności katalizatora kwasowego (H2SO4) z klas lipidów acylowych (Rysunek 1). W chemii organicznej grupa acylowa (R-C = O) jest zwykle pochodząca z kwasu karboksylowego (R-COOH). Następnie są one ponownie estryfikowane do estrów metylowych kwasów tłuszczowych (FAME), co zapewnia lepszą separację na kolumnach GC (krok 5 protokołu).