Przerzuty do mózgu są poważną konsekwencją raka piersi dla kobiet, ponieważ te nowotwory są trudne do leczenia i wiążą się ze słabymi wynikami klinicznymi. Przedkliniczne mysie modele wzrostu raka piersi z przerzutami do mózgu (BCBM) są przydatne, ale są drogie i trudno jest śledzić żywe komórki i inwazję komórek nowotworowych w miąższu mózgu. Przedstawiono tutaj protokół dla kultur ex vivo wycinków mózgu od myszy ksenoprzeszczepionych zawierających wstrzykiwane doczaszkowo podlinie klonalne raka piersi poszukujące mózgu. MDA-MB-231BR komórki oznaczone lucyferazyą zostały wstrzyknięte wewnątrzczaszkowo do mózgów samic myszy Nu/Nu, a po powstaniu nowotworu, mózgi zostały wyizolowane, pokrojone i hodowane ex vivo. Wycinki guza zobrazowano w celu identyfikacji komórek nowotworowych wyrażających lucyferazy oraz monitorowania ich proliferacji i inwazji w miąższu mózgu przez okres do 10 dni. Ponadto protokół opisuje zastosowanie mikroskopii poklatkowej do obrazowania wzrostu i inwazyjnego zachowania komórek nowotworowych po leczeniu promieniowaniem jonizującym lub chemioterapią. Odpowiedź komórek nowotworowych na leczenie można zobrazować za pomocą mikroskopii obrazowania na żywo, pomiaru intensywności bioluminescencji i wykonywania histologii na wycinku mózgu zawierającym komórki BCBM. W związku z tym ten model warstwowy ex vivo może być użyteczną platformą do szybkiego testowania nowych środków terapeutycznych samodzielnie lub w połączeniu z promieniowaniem w celu identyfikacji leków spersonalizowanych w celu celowania w przerzutowy wzrost mózgu raka piersi u danej pacjentki w mikrośrodowisku mózgu.