Oportunistyczne pobieranie wewnątrznowotworowych składników odżywczych z przestrzeni zewnątrzkomórkowej (ie) zostało niedawno uznane za kluczową cechę charakterystyczną metabolizmu nowotworowego1. Jednym z tych ważnych składników jest ATP, ponieważ stężenie ieATP jest od 103 do 104 razy wyższe niż w tkankach prawidłowych, mieszcząc się w zakresie od kilkuset µM do niskich wartości mM2,3,4,5. Jako kluczowa cząsteczka energetyczna i sygnałowa, ATP odgrywa centralną rolę w metabolizmie komórkowym w komórkach nowotworowych i zdrowych6,7,8. Zewnątrzkomórkowe ATP jest zaangażowane nie tylko we wzrost komórek nowotworowych, ale promuje również oporność na leki9. Niedawno zidentyfikowano wcześniej nieznane funkcje ATP, takie jak aktywność hydrotropowa, co sugeruje udział ATP w chorobach, takich jak choroba Alzheimera10. W rzeczywistości wydaje się, że nasze zrozumienie ATP i jego funkcji w komórkach nowotworowych, zdrowych oraz innych komórkach chorobowo zmienionych jest dalekie od pełnego. Jednak ze względu na niestabilność ATP i wysoki wskaźnik jego obrotu w komórkach, monitorowanie przemieszczania się ATP przez błonę komórkową do wnętrza komórki jest trudne pod względem technicznym.
Aby rozwiązać ten problem i wypełnić lukę badawczą w tym obszarze, opracowano metodę, w której niehydrolizowalny fluorescencyjny ATP (NHF-ATP) (Rysunek 1) został wykorzystany jako substytut do wizualizacji internalizacji ATP oraz obserwacji wewnątrzkomórkowej lokalizacji przestrzennej zinternalizowanego ATP, zarówno in vitro, jak i in vivo11,12. Wykazano, że NHF-ATP może zastąpić endogenny ATP w badaniach nad transportem ATP przez błony komórek zwierzęcych, zarówno w liniach komórek nowotworowych, jak i w tkance guza ludzkiego ksenoprzeszczepionej myszom z niedoborem odporności11,12. Ponadto podanie komórkom inhibitorów makropinocytozy zablokowało internalizację eATP, co sugeruje, że wewnątrzkomórkowy pobór eATP odbywa się poprzez mechanizm makropinocytozy9,11,12. Niniejszy protokół umożliwia immunologiczne współoznaczenie białek specyficznych dla danej komórki, a tym samym identyfikację typu komórek internalizujących NHF-ATP. Dzięki zastosowaniu ksenoprzeszczepów guzów in vivo oraz mikroskopii o wysokiej rozdzielczości, NHF-ATP można wizualizować przestrzennie w całej próbce tkanki, a nawet w obrębie pojedynczej komórki. Metody te pozwalają również na analizę ilościową, taką jak określenie procentowego poboru komórkowego, liczby pęcherzyków makropinocytycznych oraz kinetyki internalizacji. W niniejszej pracy szczegółowo opisano, w jaki sposób NHF-ATP, stosowany samodzielnie lub w połączeniu z fluorescencyjnymi dekstranami jako markerami endocytozy13,14,15,16, może być wykorzystywany w różnych układach eksperymentalnych do badania internalizacji ATP oraz jego lokalizacji wewnątrzkomórkowej po wniknięciu do komórek.

Rycina 1: Struktury niehydrolizowalnego fluorescencyjnego ATP oraz fluorescencyjnego dekstranu o wysokiej masie cząsteczkowej znakowanego tetrametylorodaminą. (A) Struktura NHF-ATP. (B) Schematyczne przedstawienie HMWFD. Skróty: ATP = trifosforan adenozyny; NHF-ATP = niehydrolizowalny fluorescencyjny ATP; TMR = tetrametylorodamina; HMWFD = fluorescencyjny dekstran o wysokiej masie cząsteczkowej. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tej ryciny.