Ten protokół demonstruje obrazowanie dekstranu w żywych komórkach za pomocą ciągłego wychwytu i odwróconych obrazów w celu optymalizacji wizualizacji marszczenia, dojrzewania makropinosomów oraz analizy znakowania dekstranu i innych komórek.
Artykuł metodologiczny
Ten protokół demonstruje obrazowanie dekstranu w żywych komórkach za pomocą ciągłego wychwytu i odwróconych obrazów w celu optymalizacji wizualizacji marszczenia, dojrzewania makropinosomów oraz analizy znakowania dekstranu i innych komórek.
Makropinocytoza to wysoce konserwatywny, ale wciąż nie do końca zrozumiały proces, który jest niezbędny do pobierania i przyjmowania płynów, składników odżywczych w fazie płynnej i innych materiałów w komórkach. Dramatyczne wydłużenie falban powierzchni komórki, ich zamknięcie w celu utworzenia makropinosomów i dojrzewanie zinternalizowanych makropinosomów są kluczowymi zdarzeniami w tym szlaku, które mogą być trudne do uchwycenia przy użyciu konwencjonalnego obrazowania konfokalnego opartego na śledzeniu bolusa fluorescencyjnego ładunku. Dekstrans fluorescencyjny jest powszechnie stosowany eksperymentalnie jako markery fazy płynnej dla makropinosomów i innych szlaków endocytarnych. Metoda przyjęta przez laboratorium w celu optymalizacji obrazowania wychwytu dekstranu polega na wykorzystaniu obrazowania na żywo komórek skąpanych w wysokich stężeniach fluorescencyjnego dekstranu w pożywce, przy czym nieznakowane komórki pojawiają się w reliefie (jako czarne). Potargania komórek są podkreślone, aby uwidocznić zamknięcie falbany, a zinternalizowane makropinosomy pojawiają się jako fluorescencyjne wakuole we wnętrzu komórki. Ta metoda jest optymalna do wizualizacji cech makropinosomów i pozwala na łatwą segmentację i kwantyfikację. W artykule opisano podwójne znakowanie szlaków z dektransem o różnych rozmiarach oraz koekspresję sond lipidowych i fluorescencyjnych białek błonowych w celu oznaczenia makropinosomów i innych endosomów. Zademonstrowano również wykrywanie zinternalizowanego dekstranu na poziomie ultrastrukturalnym za pomocą korelacyjnej mikroskopii świetlnej i elektronowej (CLEM). Te procesy komórkowe można obrazować przy użyciu wielu modalności obrazowania na żywo, w tym w 3D. Podsumowując, podejścia te optymalizują obrazowanie makropinosomów dla wielu różnych ustawień i systemów eksperymentalnych.
Większość typów komórek kręgowców dzieli wrodzoną zdolność do nieselektywnego pobierania płynu z poprzednikami w całej ewolucji, począwszy od jednokomórkowej ameby1. Ten wysoce konserwatywny proces wchłaniania przez makropinocytozę (duże picie) jest wykorzystywany przez ameby głównie do pozyskiwania składników odżywczych1, podczas gdy w komórkach kręgowców może podobnie być drogą dostarczania składników odżywczych w stresie i jest wykorzystywany przez komórki odpornościowe do pobierania próbek i nadzoru środowisk tkankowych2. Makropinocytoza ma cechy, które odróżniają ją od innych form endocytozy, w tym charakterystyczne, duże (>0,2 mm średnicy) makropinosomy podobne do wakuolarów, nieselektywny charakter wychwytu płynów i substancji rozpuszczonych oraz towarzyszące im obszary błony plazmatycznej, które są oportunistycznie internalizowane do makropinosomów3. Nieselektywny charakter tego wychwytu oznacza, że sortowanie i recykling muszą odbywać się szybko, aby uratować niezbędne rozpuszczalne i plazmatyczne białka błonowe poprzez recykling ich z powrotem na powierzchnię komórki. Znaczna część materiału pobranego do makropinosomów jest przeznaczona do degradacji w lizosomach i jest kierowana do szlaków endo/lizosomalnych poprzez dojrzewanie makropinosomów i fuzję z innymi endosomami. Białka błony komórkowej mogą być również zawracane z powrotem na powierzchnię komórki z makropinosomów. Istnieje duże zainteresowanie dziedziną nowotworów w celu zrozumienia procesu makropinocytozy, która jest aktywowana w komórkach rakowych i pomaga utrzymać ich odżywianie i proliferację2,4,5,6. Makropinocytoza występuje zarówno konstytutywnie, jak i może być dalej indukowana po stymulacji za pośrednictwem receptora w komórkach odpornościowych, gdzie makropinosomy sygnalizują receptor gospodarza, przyczyniają się do przetwarzania endo/lizosomalnego w celu prezentacji antygenu i stanowią portal wejściowy dla różnych wirusów, bakterii i innych patogenów3,7.
Makropinosomy mają niewiele charakterystycznych lub unikalnych markerów. Najłatwiej je zidentyfikować podczas ich tworzenia u podstawy dramatycznych, bogatych w aktynę zmarszczek powierzchni komórek, które zbliżają się do pochłonięcia płynu8. Natychmiast po zamknięciu F-aktyna wokół makropinosomów ulega depolimeryzacji, a same makropinosomy ulegają dynamicznym zmianom związanym z homo- i heterotypową fuzją, kanalikami i skurczem9. Makropinosomy są również trudne do zidentyfikowania na poziomie ultrastrukturalnym, ponieważ nie mają charakterystycznych powłok ani innych cech i wyglądają po prostu jako wakuole o różnych rozmiarach. Bez ostatecznych markerów błonowych, makropinosomy są najłatwiej i najbardziej tradycyjnie definiowane przez ich płynny ładunek, który eksperymentalnie odbywa się poprzez użycie dekstranu fluorescencyjnego. Dekstran jest złożonym polisacharydem pochodzącym z glukozy, który może być sprzężony z dużą gamą markerów fluorescencyjnych lub gęstych elektronów i dodawany do pożywki w celu wychwytu przez komórki lub perfundowany w celu wychwytu w tkankach. Co więcej, dekstran o dużej masie cząsteczkowej (MW) (70 kDa) jest obecnie uważany za ładunek selektywny pod względem wielkości dla makropinosomów, ponieważ nie dostaje się do innych, mniejszych pęcherzyków endocytarnych i stał się najczęstszą etykietą makropinocytozy10,11. Obserwowanie makropinocytozy zazwyczaj polega na inkubacji komórek za pomocą impulsu fluorescencyjnego dekstranu i użyciu stałych lub żywych komórek do obrazowania fluorescencyjnego w celu wyświetlenia bolusa znakowania dekstranu wewnątrz komórek w makropinosomach. Ze względu na ich duży rozmiar, nieznakowane makropinosomy można również oglądać w niektórych typach komórek za pomocą kontrastu fazowego lub mikroskopii jasnego pola, w której makropinosomy pojawiają się jako duże białe puste wakuole. Pewne informacje kontekstowe są uzyskiwane z obrazów kontrastu fazowego komórek, a obrazy te można następnie dodatkowo nałożyć na obrazy fluorescencyjne, aby zobrazować fluorescencyjny wychwyt dekstranu12,13. Dextrans o różnych rozmiarach i różnych etykietach może być używany do monitorowania wchłaniania płynów do wielu szlaków komórkowych i endocytarnych10,14,15 i dekstran mogą być stosowane do hodowli komórkowych lub perfundowane myszom w celu obrazowania przyżyciowego16 lub nawet wstrzykiwane do embrionów much17 do obrazowania na żywo.
Niektóre z trudności związanych z używaniem dekstranu do śledzenia makropinosomów obejmują jego wyciek z makropinosomów po utrwaleniu lub przepuszczalności komórek, jego rozcieńczony lub trudny do wykrycia poziom w komórkach, które nie wykonują agresywnej makropinocytozy, oraz jego dynamiczne rozmieszczenie i dyspersję wewnątrz komórek podczas dojrzewania makropinosomów3. Problemy te nasilają się w większości eksperymentów, które mają na celu śledzenie wychwytu pojedynczego impulsu dekstranu dodanego do komórek, a następnie zmytego.
Zamiast tego, ten artykuł opisuje zalety stosowania fluorescencyjnego dekstranu do komórek i pozostawiania go w pożywce podczas obrazowania na żywo, aby rejestrować ciągły pobór do komórek. Wzmacnia to sygnał dekstranu w makropinosomach i kolejnych endosomach, pokazując cały szlak dojrzewania. Oglądanie znakowanych makropinosomów na tle nieznakowanego (czarnego) wnętrza komórek, jako odwrotnego ustawienia o wysokim kontraście, ujawnia wszystkie cechy makropinosomów i odwrotnie, na zewnątrz komórek, wysoce fluorescencyjne podłoże podkreśla dynamiczne marszczenie powierzchni komórki. Metoda ta opisuje obrazowanie dekstranu na żywo w mikroskopowym obrazowaniu konfokalnym oraz w celu jego wykrycia po utrwaleniu komórki za pomocą korelacyjnej mikroskopii świetlnej i elektronowej (CLEM). Zawarte tutaj obrazowanie przeprowadzono na różnych typach komórek, aby wykazać szerokie zastosowanie tych podejść, w tym aktywowanych makrofagów i komórek mikrogleju, gdzie makropinocytoza jest bardzo aktywna i szybka, oraz w komórkach nowotworowych, w których makropinocytoza jest stosunkowo mniej obfita.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
1. Przygotowanie komórek na naczyniach ze szklanym dnem o średnicy 35 mm (Dzień 0)
2. Transfekcja plazmidu fluorescencji DNA (Dzień 1) - Opcjonalnie
UWAGA: Różne fluorescencyjnie znakowane białka i sondy mogą być wyrażane przejściowo lub stabilnie w sklonowanych liniach komórkowych, aby specyficznie oznaczyć falbany aktynowe i kompartmenty w szlaku endocytarnym, takie jak wczesne endosomy, późne endosomy lub lizosomy.
3. Wizualizacja pęcherzyków endocytarnych i makropinosomów (Dzień 2)
UWAGA: Fluorescencyjny dektrans (Dextran Alexa Fluor 488/647 przy 10 kDa MW, i Dextran Oregon Green 488/Tetramethylrhodamine przy 70 kDa MW, anionowy, utrwalany lizyną) o różnych masach cząsteczkowych są używane do monitorowania wychwytu fazy płynnej do szeregu szlaków endocytarnych14. 70 kDa dekstran dla makropinosomów i 10 kDa dla wszystkich szlaków.
4. Korelacyjne światło i mikroskopia elektronowa (CLEM) (Dzień 3) - Opcjonalnie
5. Przetwarzanie i wizualizacja danych (Dzień 4)
UWAGA: FIDŻI - pakiet do analizy obrazów o otwartym kodzie źródłowym - jest używany do wizualizacji i analizy33.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Podejście polegające na obrazowaniu nieoznakowanych żywych komórek zanurzonych w wysokim stężeniu fluorescencyjnego dekstranu ma kilka zalet w porównaniu z konwencjonalnymi technikami obrazowania do śledzenia makropinocytozy. Prezentując obrazy w reliefie, ciała komórek wydają się czarne i pozwalają na lepszą wizualizację dramatycznej powierzchni komórki marszczącej się na jasnym, fluorescencyjnym tle, po której następuje internalizacja w fazie płynnej makropinosomów wypełnionych dekstranem TMR (70 kDa), jak pokazano na ...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
W artykule opisano warianty bardziej tradycyjnych sposobów znakowania dekstranem do śledzenia makropinocytozy, w oparciu o obrazowanie na żywo komórek zanurzonych w sposób ciągły w fluorescencyjnym dekstranie (dekstranach) i wizualizację wychwytu na czarnym tle nieznakowanych komórek. Zoptymalizowany protokół zapewnia środki do rozróżniania różnych pęcherzyków wewnątrzkomórkowych i umożliwia przestrzenno-czasowe śledzenie wielu makropinocytotycznych i endocytarnych ładunków i białek. Metoda zanurzania komórek w pożywce z...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Autorzy deklarują brak sprzecznych interesów finansowych.
Autorzy dziękują Tatianie Khromykh za jej fachową pomoc techniczną. Obrazowanie fluorescencyjne przeprowadzono w mikroskopii IMB z wykorzystaniem Cancer Ultrastructure and Function Facility finansowanego przez Australian Cancer Research Foundation; Mikroskopię elektronową przeprowadzono w Centrum Mikroskopii i Mikroanalizy Uniwersytetu Kalifornijskiego. Finansowanie uzyskano od Narodowej Rady Zdrowia i Badań Medycznych Australii (JLS APP1176209) oraz Australijskiej Rady ds. Badań Naukowych (DP180101910). NDC jest wspierany jako CZI Imaging Scientist przez grant o numerze 2020-225648 z Chan Zuckerberg Initiative DAF, funduszu doradczego Silicon Valley Community Foundation. YH był wspierany przez stypendium doktoranckie rządu australijskiego i finansowanie z Yulgilbar Alzheimer Research Program. Z-JX był wspierany przez stypendium Chińskiej Akademii Nauk.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| 2% Sondy molekularne tetratlenku osmu | ProSciTech | EMS19192 | |
| 647-transferyny | , Invitrogen | Komórki T23366 | |
| BV2 | Prezent uprzejmie przekazany nam przez dr Liviu Bodea (Queensland Brain Institute) | - | |
| CpG (klasa B) B | Zintegrowane technologie DNA | Na zamówienie | |
| Dekstran Alexa Fluor 488 przy 10 kDa MW | Life Technology Australia Pty Ltd | D22910 | |
| Dekstran Alexa Fluor 647 przy 10 kDa MW | Life Technology Australia Pty Ltd | D22914 | |
| Dextran Oregon Green 488 przy 70 kDa MW | Life Technology Australia Pty Ltd | D1818 | |
| Dekstran Tetrametylorodamina przy 70 kDa MW | Life Technology Australia Pty Ltd | D7173 | |
| Pożywka DMEM z pirogronianem sodu i L-glutaminą | Gibco Invitrogen | #11995 | |
| Surowica cielęca płodu | Interpath Services Pty Ltd | SFBS-F | |
| Wodny roztwór aldehydu glutarowego, klasa EM 25% | ProSciTech | C002 | |
| Jeol 1011 | |||
| Gibco Invitrogen | 25030081 | ||
| Lipofectamine 2000 | Gibco Invitrogen | 11668019 | |
| MatTek Naczynie szklane z dnem 35 mm, siatka niepowlekana | MatTek Corporation | P35G-2-14-CGRD | |
| Naczynia szklane MatTek 35 mm niepowlekane | MatTek Corporation | P35G-1.5-14C | |
| MDA-MB 231 ogniw | ATCC | HTB-26 | |
| Opti-MEM o obniżonej surowicy | Thermo Fisher Scientific | 31985088 | |
| Plazmid mCherry-2XFYVE | Prezent uprzejmie przekazany nam przez dr Frederica Meuniera (University of Queensland) | - | |
| Plazmid mCherry-PLCδ-PH | Prezent uprzejmie przekazany nam przez dr Frederica Meuniera (University of Queensland) | - | |
| Raw264.7 komórki | ATCC | TIB-71 | |
| RPMI medium 1640, bez L-glutaminy | Gibco Invitrogen | #21870 | |
| Ultrapure LPS | Jomar Life Research Pte Ltd | TLR-3PELPS | |
| Octan uranylu | ProSciTech | C079 | |
| Odwrócony mikroskop konfokalny LSM880 | Zeiss Zeiss | - |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Poproś o pozwolenie na ponowne wykorzystanie tekstu lub ilustracji tego artykułu JoVE
Poproś o pozwolenie