RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
pl_PL
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Ten protokół demonstruje prostą i solidną metodę badania dynamiki wzrostu aksonów in situ i stożka wzrostu. Opisano w nim, w jaki sposób przygotować ex vivo fizjologicznie istotne ostre wycinki mózgu i przedstawiono przyjazny dla użytkownika potok analizy.
Podczas rozwoju neuronów, aksony poruszają się po środowisku korowym, aby dotrzeć do swoich końcowych miejsc docelowych i ustanowić połączenia synaptyczne. Stożki wzrostu - struktury czuciowe znajdujące się na dystalnych końcach rozwijających się aksonów - wykonują ten proces. Badanie struktury i dynamiki stożka wzrostu ma kluczowe znaczenie dla zrozumienia rozwoju aksonów i interakcji z otaczającym ośrodkowym układem nerwowym (OUN), które umożliwiają mu tworzenie obwodów nerwowych. Ma to zasadnicze znaczenie przy opracowywaniu metod reintegracji aksonów z obwodami neuronalnymi po urazie w badaniach podstawowych i kontekstach przedklinicznych. Dotychczasowe ogólne zrozumienie dynamiki stożków wzrostu opiera się przede wszystkim na badaniach neuronów hodowanych w dwóch wymiarach (2D). Chociaż niewątpliwie ma to fundamentalne znaczenie dla obecnej wiedzy na temat dynamiki strukturalnej stożków wzrostu i reakcji na bodźce, badania 2D błędnie przedstawiają fizjologiczne trójwymiarowe (3D) środowisko, z którym spotykają się stożki wzrostu neuronów w nienaruszonej tkance OUN. Niedawno zastosowano żele kolagenowe w celu przezwyciężenia niektórych z tych ograniczeń, umożliwiając badanie rozwoju neuronów w 3D. Jednak zarówno syntetyczne środowiska 2D, jak i 3D nie mają wskazówek sygnalizacyjnych w tkance OUN, które kierują rozszerzaniem i odnajdywaniem ścieżki rozwijających się aksonów. Protokół ten zapewnia metodę badania aksonów i stożków wzrostu przy użyciu organotypowych wycinków mózgu, w których rozwijające się aksony napotykają fizjologicznie istotne wskazówki fizyczne i chemiczne. Łącząc precyzyjnie dostrojoną elektroporację in utero i ex utero w celu rzadkiego dostarczania fluorescencyjnych reporterów wraz z mikroskopią superrozdzielczą, protokół ten przedstawia metodologiczną linię produkcyjną do wizualizacji dynamiki aksonów i stożków wzrostu in situ. Ponadto dołączono szczegółowy opis zestawu narzędzi do analizy danych z obrazowania długoterminowego i żywych komórek.
Neurony to wysoce spolaryzowane komórki, które reprezentują podstawową jednostkę obliczeniową w układzie nerwowym. Odbierają i emitują informacje, które opierają się na podziałach na miejsca wejściowe i wyjściowe: odpowiednio dendryty i aksony1. Podczas tworzenia aksony rozszerzają się, poruszając się w niewiarygodnie złożonym środowisku, aby dotrzeć do celu. Nawigacja w aksonach jest kierowana przez stożek wzrostu, strukturę czuciową znajdującą się na końcu rozwijającego się aksonu. Stożek wzrostu jest odpowiedzialny za wykrywanie sygnałów środowiskowych i przekształcanie ich w dynamiczną reorganizację przestrzenną swojego cytoszkieletu2,3. Powstałe w ten sposób reakcje morfomechaniczne instruują stożek wzrostu, aby wysunął się lub wycofał z sygnału wyzwalającego, co prowadzi do określonych manewrów aksonów.
Obecne zrozumienie dynamiki rozciągania aksonów i wzrostu wynika z badań oceniających wzrost aksonów na dwuwymiarowych (2D) podłożach2,4,5,6,7. Te pionierskie badania zidentyfikowały wyrafinowane wzajemne oddziaływanie między stożkami wzrostu a podłożami wzrostu i ujawniły uderzające różnice w zależności od cech podłoża, takich jak przyczepność i sztywność8,9. Na podstawie tych spostrzeżeń postawiono hipotezę, że zewnątrzkomórkowe sygnały środowiskowe dyktują wzrost aksonów, przy czym cytoszkielet stożka wzrostu wykonuje ten wzrost2,10,11,12. Warto zauważyć, że neurony mogą rozszerzać aksony w podłożach nieadhezyjnych (np. polilizyna, poliornityna)13. Co więcej, sztywność podłoża może wpływać na szybkość wzrostu aksonów niezależnie od kompleksów adhezyjnych komórek8. W związku z tym badanie dynamiki stożków wzrostu w samych substratach 2D nie może dokładnie modelować równowagi sił, które powstają w wyniku interakcji aksonalnych stożków wzrostu z fizjologicznie istotnymi środowiskami trójwymiarowymi (3D), takimi jak te występujące in vivo.
Aby przezwyciężyć ograniczenia testów 2D, wzrost aksonów i dynamika stożków wzrostu zostały zbadane w matrycach 3D8,9. Macierze te stanowią bardziej fizjologiczny kontekst, a jednocześnie pozwalają na badanie wewnętrznych mechanizmów wzrostu aksonów w komórce. Umożliwia badanie stożka wzrostu w sposób jednokomórkowy w różnych warunkach i zabiegach farmakologicznych9. W takich środowiskach 3D aksony wykazywały wyraźną dynamikę cytoszkieletu i rosły szybciej niż te obserwowane w neuronach hodowanych w 2D9. Te eleganckie badania wykazały wpływ dodatkowego wymiaru na reorganizację cytoszkieletu stożka wzrostu, a w konsekwencji na jego zachowanie.
Pomimo oczywistych zalet prezentowanych przez matryce 3D w porównaniu z powierzchniami 2D we wspieraniu natywnego rozwoju neuronów i wzrostu aksonów, pozostają one uproszczonym syntetycznym rusztowaniem, które nie jest w stanie odzwierciedlić złożoności dynamiki obserwowanej w tkance ośrodkowego układu nerwowego (OUN). W tym przypadku dostarczanie plazmidów reporterowych za pomocą elektroporacji ex utero i in utero połączono z organotypową hodowlą plastrów mózgu i obrazowaniem in situ w super rozdzielczości w celu analizy dynamiki stożków wzrostu w kontekście fizjologicznym. Metodologia ta pozwala na wizualizację rozwijających się aksonów przy jednoczesnym doświadczaniu trójwymiarowości środowisk in vivo i złożoności ich składu fizykochemicznego. Na koniec opisano przyjazne dla użytkownika procedury pomiaru wzrostu aksonów i dynamiki stożków wzrostu przy użyciu powszechnie licencjonowanego i publicznie dostępnego oprogramowania.
Eksperymenty na zwierzętach muszą być zgodne z odpowiednimi przepisami instytucjonalnymi i federalnymi. W protokole tym wykorzystano embrionalne samice myszy C57BL / 6JRj w dniu 15,5 i 12,5 (E15,5 i E12,5). Doświadczenia przeprowadzono zgodnie z ustawą o dobrostanie zwierząt Krajowej Agencji Ochrony Środowiska Nadrenii Północnej-Westfalii (Landesamt für Natur, Umwelt und Verbraucherschutz (LANUV)).
1. Przygotowanie plazmidów do iniekcji
2. Przygotowanie roztworów
3. Przygotowanie stanowiska chirurgicznego
4. Ekstrakcja zarodków
5. Elektroporacja ex utero (EUE)
6. Elektroporacja in utero (IUE)
7. Ekstrakcja mózgu i osadzenie w agarozie
UWAGA: Zaleca się wykonanie następujących kroków pod mikroskopem preparacyjnym dla lepszej precyzji. Uniknięcie uszkodzenia mózgu ma kluczowe znaczenie dla powodzenia zabiegu.
8. Organotypowa kultura plastrów
UWAGA: Oczyść wibratom i otaczające go powierzchnie etanolem o stężeniu 70%-96%, aby uniknąć zanieczyszczenia plasterków. Konfiguracja stacji roboczej z wibratomem (patrz tabela materiałów) jest pokazana w
9. Immunohistochemia
10. Akwizycja obrazowania
UWAGA: Niezależnie od podejścia do dostarczania DNA (IUE lub EUE), wycinki były analizowane w tym samym przedziale wieku rozwojowego (E17.5-E18.5). IUE pozwala neuronalnym przodkom dzielić się i rozwijać przez kolejne dwa dni in vivo. Z drugiej strony EUE pozwala na śledzenie wczesnych zdarzeń rozwojowych.
11. Analiza danych
Pokazane są reprezentatywne wyniki uzyskane za pomocą opisanej metody workflow. W niniejszej demonstracji wykorzystano myszy E15.5, chociaż protokół ten można łatwo dostosować do praktycznie wszystkich grup wiekowych embrionalnych, od E11 do późnego E17. W niniejszym protokole elektroporacja ex utero (EUE; Rysunek 2A, 2C-I) lub elektroporacja in utero (IUE; Rysunek 2B,C i 2J-Q) zostały użyte do dostarczenia plazmidów do neuronów progenitorowych wyściełających boczne komory. Te progenitory są źródłem przyszłych neuronów projekcyjnych kory mózgowej (CPN)15,16. Mieszanki plazmidowe przygotowano w celu stymulowania rzadkiej, specyficznej dla neuronów ekspresji ukierunkowanej na błonę (Lyn)-mNeonGreen (Figura 1A) lub wzmocnionej LifeAct (E)GFP (Figura 1B) w celu oceny ogólnego zachowania i dynamiki aktyny odpowiednio w stożkach wzrostu. Ponadto uwzględniono mieszankę plazmidów mającą na celu znakowanie pojedynczych neuronów za pomocą turbo(t)-RFP lub zoanthus sp. (Zs) zielonego białka fluorescencyjnego (ZsGreen) (Figura 1C). Ułatwia to monitorowanie zachowania stożków wzrostu z niezależnych sąsiednich neuronów.
Sekcja mózgu z elektroporowanych embrionów jest kluczowym krokiem, który musi być starannie wykonany, aby uzyskać wysokiej jakości plastry, zachowując natywną strukturę mózgu. Narzędzia do preparacji i wibratom zostały wcześniej przygotowane i starannie wysterylizowane etanolem (Rysunek 3A,B). Następnie głowy embrionów poddanych elektroporacji zostały starannie wypreparowane i pobrano mózgi. Pokazano tu reprezentatywną sekcję mózgów z embrionów poddanych EUE w E15 (Ryc. 3C-F) i E12.5 (Ryc. 3G-J). Mózgi są natychmiast zamykane w matrycy agarozowej, krojone w plastry i umieszczane na wkładkach membrany PTFE w naczyniu z dolnej szklanki w celu inkubacji (Rysunek 3K-M).
Stan zdrowia wycinków mózgu jest istotnym punktem dla kontroli, aby zapewnić wiarygodne wyniki. Codziennie przeprowadzana była kontrola wzrokowa pod kątem wszelkich zanieczyszczeń. Dodatkowo, po sfinalizowaniu hodowli, wycinki mózgu są utrwalane i poddawane immunohistochemii. Tutaj 4′,6-diamidino-2-fenyloindol (DAPI) został użyty do kontrolowania ogólnej organizacji komórkowej i barwienia wimentyny w celu ujawnienia organizacji gleju; w szczególności rusztowanie promieniste glejowe (RG). Zazwyczaj pomyślnie wyhodowane wycinki mózgu pochodzące z IUE lub EUE wykazują normalną dystrybucję komórkową, jak ujawniono za pomocą DAPI i nieco zorganizowanej tablicy RG z wierzchołkowo zorientowanymi procesami kontaktowymi z pial17 (Rysunek 4A,B odpowiednio). Od czasu do czasu obserwuje się wyraźne zaburzenia w rusztowaniu RG w hodowanych wycinkach mózgu, zwłaszcza w tych pochodzących z elektroporacji EUE (Rysunek 4C). Wycinki mózgu ze skrajnie zdezorganizowanym rusztowaniem RG wykazują upośledzoną migrację neuronów i wadliwy wzrost aksonów (nie pokazano). W związku z tym kontrolowanie rusztowania RG jest łatwą metodą post-hodowlaną do sortowania danych uzyskanych z wiarygodnych wycinków mózgu.
Wycinki mózgu pochodzące z IUE lub EUE z mieszanką plazmidu eksprymującego Lyn-mNeonGreen powodują podobnie rzadkie znakowanie neuronów. Reprezentatywny piramidalny CPN wyrażający Lyn-mNeonGreen i dynamiczne zachowanie jego stożka wzrostu jest pokazany jako przykład (Rysunek 5A i Dodatkowe wideo 1, u góry po lewej). Ponadto neurony znakowano za pomocą plazmidu wyrażającego sondę aktynową w celu analizy dynamiki aktyny w aksonalnych stożkach wzrostu in situ (Figura 5B i dodatkowe wideo 1, na dole po lewej). Eksperymenty in situ przeprowadzono również z podwójnym projektem plazmidu Cre/Dre z ekspresją fluoroforu (Rysunek 1C i Dodatkowe wideo 1, po prawej). Fluorofory tRFP lub ZsGreen w tym plazmidzie mogą być specyficznie i indywidualnie aktywowane odpowiednio przez rekombinazy Dre lub Cre w sąsiednich neuronach (Ryc. 5C). Ten eksperymentalny zestaw pozwala na równoległą analizę stożków wzrostu z neuronów kontrolnych z sąsiednimi zmodyfikowanymi neuronami (dowolna utrata lub zysk funkcji). Pozwala to uniknąć zmienności wynikającej z używania różnych wycinków do testowania warunków kontrolnych i eksperymentalnych.
Przeanalizowano kimografy wygenerowane z nagranego filmu, z których można łatwo uzyskać dynamiczne parametry wzrostu, takie jak aktywność wystająca w czasie i długość wzrostu (Rysunek 6A). Zauważ, że prosta regulacja rozdzielczości czasowej filmu poklatkowego pozwala na pomiar prędkości wydłużania aksonów przez 2 godziny (Rysunek 6A). Co więcej, zmienność objętości stożka wzrostu w czasie - miara ogólnej dynamicznej aktywności stożka wzrostu - może być łatwo uzyskana, w tym przypadku za pomocą licencjonowanego oprogramowania (Rysunek 6B i Rysunek 6E,F). Można to wykorzystać do oceny szybkości bieżni aktynowej i równowagi filopodiów/lamellipodiów podczas eksploracji stożków wzrostu.

Rysunek 1: Schematy plazmidów używanych w protokole. (A) pCAG-lox-STOP-lox-Lyn-mNeonGreen. (B) p-Tub-alfa-1-LifeAct-GFP. (C) pCAG-lox-rox-STOP-rox-tRFP-pA-lox-ZsGreen-pA. Istotne informacje dotyczące składników plazmidu i pochodzenia fluoroforu znajdują się w pudełkach. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Przebieg pracy elektroporacji ex utero i in utero myszy E15.5. (A) Ustawienie stanowiska chirurgicznego do elektroporacji ex utero. (B) Ustawienie stanowiska chirurgicznego do elektroporacji in utero. (C) Rogi macicy wyciągnięte na zewnątrz jamy brzusznej znieczulonej myszy. (D) Ekstrakcja zarodka z worka macicy. (E) Ofiarowanie zarodka poprzez całkowite przecięcie rdzenia kręgowego przez nacięcie ukośne; Zauważ, że uniknięto ścięcia. (F) Umieszczenie zarodka w posiadaczu i wstrzyknięcie mieszaniny DNA/Fast Green do lewej komory bocznej. (G,H) Umieść głowę zarodka między platynowymi elektrodami pęsety z katodą (czerwona strzałka) nad korą pod kątem 60°. (I) Umieszczenie ramion zarodka (czarne strzałki) na zewnątrz posiadacza, aby zapobiec przesuwaniu się zarodka podczas zabiegu. (J) Rotacja zarodka wewnątrz worka macicy w celu odsłonięcia głowy. (K,L) Wstrzyknięcie mieszaniny DNA/Fast Green do bocznych komór zarodka przez ścianę macicy. (M) Umieść głowę zarodka między platynowymi elektrodami pęsety z katodą (czerwona strzałka) nad korą pod kątem 60°. (N) Zszyte nacięcie mięśnia za pomocą biegnącego szwu blokującego. (O) Zszyte nacięcie skóry za pomocą przerwanego szwu. (P) Zabezpieczenie rany za pomocą klipsów chirurgicznych do ran i dezynfekcja za pomocą betadyny. (Q) Umieszczenie myszy w klatce regeneracyjnej ze światłem ocieplającym dalekiej podczerwieni. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 3: Ekstrakcja mózgów E15.5 i E12.5 oraz procedura hodowli plastrów organotypowych. (A) Narzędzia używane do procedury ekstrakcji mózgu. (B) Założenie stacji hodowli organotypowych. (C-F) Ekstrakcja mózgu E15.5. (G-J) Ekstrakcja E12.5 mózgu. Przerywane linie podkreślają miejsce nacięć. Czerwone strzałki wskazują kierunek ciągnięcia kleszczami. (K) Umieszczenie mózgu w 3-centymetrowym naczyniu zawierającym 3% niskotopliwej agarozy, pozostawiając 1-2 mm odstępy między agarozą pod mózgiem. (L) Pobranie wycinka mózgu o grubości 150 μm. (M) Umieszczenie wycinków mózgu na wkładkach membrany PTFE unieruchomionych w naczyniu o średnicy 35 mm za pomocą filmu parafinowego (niebieska strzałka). Oznaczenie czerwoną gwiazdką oznacza pobranie danego wycinka mózgu z wibratomu (L) i jego przeniesienie do membrany PTFE (M). Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 4: Zachowana radialna struktura komórek glejowych w zdrowych warstwach organotypowych. Konfokalne obrazy wycinków mózgu E17.5 ujawniające macierz RG (wimentyna; zielony) i ogólna organizacja komórek (DAPI; magenta) po IUE (A) i EUE (B, C). Zwróć uwagę na silne zakłócenia w tablicy RG, które mogą czasami wynikać z EUE (C). Powiększenia odpowiadają czerwonym kropkowanym ramkom na głównym rysunku: podziałka skali, 10 μm. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 5: Wizualizacja in situ dynamiki stożka wzrostu w ostrych warstwach organotypowych. Panie przewodniczący, panie i panowie! Neurony i odpowiadające im stożki wzrostu oznaczone odpowiednio Lyn-mNeonGreen i LifeAct-GFP. Czerwona gwiazda oznaczająca stożek wzrostu neuronu wyrażającego Lyn-mNeonGreen. Niebieska gwiazdka oznaczająca stożek wzrostu neuronu wyrażającego LifeAct-GFP. (C) Sąsiednie neurony znakowane podwójnym systemem plazmidowym zawierającym tRFP (magenta) i ZsGreen (zielony) oraz odpowiadające im stożki wzrostu. Stożki wzrostu sfotografowane (po prawej) znajdowały się poza uchwyconym kadrem (po lewej), uzyskane wkrótce po uzyskaniu stożka wzrostu w trybie poklatkowym; podziałka skali, 5 μm. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 6: Analiza szybkości wzrostu aksonów i objętości stożka wzrostu. (A) Śledzenie aksonów na neuronie wyrażającym Lyn-mNeonGreen (na górze) i odpowiadającym mu kymografie (poniżej) wygenerowanym za pomocą ImageJ. (B) Rekonstrukcja filmu stożka wzrostu ze stosem z użyciem oprogramowania do analizy obrazu (u góry) i tego samego stożka wzrostu podświetlonego za pomocą narzędzia do pomiaru powierzchni (poniżej). (C) Wykresy przedstawiające zmiany prędkości wzrostu w czasie dla kilku aksonów. (D) Średnia prędkość wzrostu aksonów jest określona ilościowo w (C). (E) Wykres przedstawiający zmiany objętości stożka wzrostu w czasie. (F) Średnia objętość stożków wzrostu jest określana ilościowo w (E); Podziałka skali, 5 μm. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 7: Migracja promieniowa i polaryzacja neuronów piramidowych w korze mózgowej. Diagram ilustrujący rozwój neuronów kory piramidowej (różowy) migrujących promieniście ze strefy komory rozrodczej (VZ) w kierunku powierzchni pia. Kierując się radialnymi procesami glejowymi (szary), migrujące spolaryzowane neurony ustanawiają proces wiodący, przyszły dendryt i proces końcowy, przyszły akson, które kontynuują rozciąganie się w dół w kierunku strefy pośredniej (IZ). Przerywane czerwone pola reprezentują obszary kory mózgowej, w których zobrazowano stożki wzrostu. Szczególnie w IZ, strefie podkomorowej (SVZ) lub łączeniu wiązek aksonów (zielony). Ilustracja została stworzona za pomocą narzędzia internetowego BioRender.com. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.
| Plazmid | Stężenie (μg/μL) | Przeznaczenie |
| pCAG-lox-STOP-lox-Lyn-mNeonGreen | 0,25 | pkt.Znakowanie białka błonowego (Lyn) |
| + | + | |
| p-Wanna-alfa-1-iCre | 0,08 | pkt.|
| p-Tub-alfa-1-LifeAct-GFP | 0,125 | pkt.Znakowanie aktyny nitkowatej (F-aktyny) w stożkach wzrostu |
| pCAG-lox-rox-STOP-rox-tRFP-lox-Lyn-ZsGreen | 1 | Niezależne oznaczanie dwóch populacji sąsiadujących ze sobą neuronów |
| + | + | |
| p-Wanna-alfa-1-iCre | 0,004 | |
| + | + | |
| p-Wanna-alfa-1-DRE | 0,2 | pkt.
Tabela 1: Lista plazmidów używanych w Protokole. Nazwa, stężenie i przeznaczenie każdego użytego plazmidu.
Dodatkowe wideo 1: Wizualizacja in situ dynamiki stożka wzrostu w ostrych warstwach organotypowych. Dynamika wzrostu stożków oznaczonych Lyn-mNeonGreen (u góry po lewej) i LifeAct-GFP (u dołu po lewej). Sąsiednie stożki wzrostu są różnie oznaczone podwójnym systemem plazmidowym zawierającym tRFP (magenta; u góry po prawej) i ZsGreen (zielony; u dołu po prawej). Interwał obrazowania, 2,5 s. Podziałka liniowa, 5 μm. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Autorzy nie mają nic do ujawnienia.
Ten protokół demonstruje prostą i solidną metodę badania dynamiki wzrostu aksonów in situ i stożka wzrostu. Opisano w nim, w jaki sposób przygotować ex vivo fizjologicznie istotne ostre wycinki mózgu i przedstawiono przyjazny dla użytkownika potok analizy.
Chcielibyśmy podziękować Marii Eugenii Bernis za sfotografowanie zabiegów. Dziękujemy również Emily Burnside, Emily Handley, Thorben Pietralla, Maxowi Schelskiemu i Sinie Stern za przeczytanie i omówienie manuskryptu. Jesteśmy wdzięczni naszym znakomitym asystentkom technicznym, Jessice Gonyer, Blanci Randel i Anh-Tuan Pham. Doceniamy cenne wsparcie ze strony zakładu mikroskopów świetlnych i zakładu dla zwierząt DZNE. Prace te były wspierane przez Deutsche Forschungsgesellschaft (DFG), Międzynarodową Fundację Badań nad Paraplegią (IRP) oraz Wings for Life (przy FB). F.B. jest członkiem klastra doskonałości ImmunoSensation2, SFB 1089 i 1158 oraz laureatem Nagrody Rogera De Spoelbercha.
| Adson Kleszcze | Fine Science Tools | 11006-12 | |
| Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A21202 | Goat Anti-Mouse |
| Alexa Fluor 647 | Invitrogen | A21236 | Goat Anti-Mouse |
| Anti-Vimentin przeciwciało | sigma-Aldrich | V2258-.2ML | Mysz monoklonalna, klon LN-6, płyn wodobrzuszny |
| Suplement B27 | ThermoFisher Scientific | 17504044 | |
| Betadine | B. Braun | 3864154 | |
| Biozym Sieve GP Agarose | Biozyme | 850080 | |
| Braunol, Sprü hflasche | B. Braun | 3864073 | |
| Buprenorfina (Temgesic) | GEHE Pharma | 345928 | |
| DAPI | sigma-Aldrich | D9542 | |
| Ściągacz elektrod DMZ | Zeitz | NA | |
| Elektryczna maszynka do golenia | Andes | NA | Model ProClip UltraEdge Super 2-Speed |
| Enrofloksacyna (Baytril) | Bayer | 3543238 | 2,5% (wt/vol) |
| Końcówki do pipet do mikroładowarek Eppendorf | FischerScientific | 10289651 | |
| Fast Green FCF | Sigma-Aldrich | F7252-5G | Zawartość barwnika > 85 % |
| Płodowa surowica bydlęca | ThermoFisher Scientific | 10500064 | |
| Fiji 2.1.0 | NIH | NA | https://imagej.net/software/fiji/downloads |
| Drobne nożyczki | Fine Science Tools | 14058-09 | ToughCut/Straight/9cm |
| FluoroDish Naczynie do hodowli komórkowych | World Precision Instruments | FD5040-100 | |
| Fluoromount Wodne medium | montażowe sigma-Aldrich | F4680-25ML | |
| Glukoza | MedPex | 3705391 | Suplement 5% |
| GlutaMAX | ThermoFisher Scientific | 35050061 | |
| Glycine | Sigma-Aldrich | G8898 | |
| HBSS | Life Technologies | 14025092 | wapń, magnez, bez czerwieni fenolowej |
| Surowica dla koni | Pan-Biotech | P30-0711 | |
| Imaris 9.7.2 | Bitplane | NA | https://imaris.oxinst.com/products/imaris-for-neuroscientists |
| Isoflurane | Virbac | NA | |
| Sól fizjologiczna rozwiązanie | B. Braun | 8609261 | 0.90% |
| Leica VT1200 S wibratome | Leica | 14048142066 | |
| LSM 880 z Airyscan | Myszy Zeiss | NA | |
| Metacam | Venusberg 8890217 | 5 mg/ml | |
| Janvier | Labs | NA | C57BL/6JRj |
| Kleszcze Micro-Adson | Narzędzia do nauki | 11018-12 | |
| Słoik do przechowywania mikropipet | World Precision Instruments | E210 | 16.16.27 |
| Microsoft Excel | Microsoft | NA | https://www.microsoft.com/en-us/microsoft-365/p/excel/cfq7ttc0k7dx?activetab=pivot:overviewtab |
| Millicell Cell Culture Insert | EMD Millipore | PICM0RG50 | 30 mm, hydrofilowy PTFE, 0.4 &mikro; m |
| Łyżki perforowane Moria | Fine Science Tools | 10370-18 | |
| Moria Spoon | Fine Science Tools | 10321-08 | |
| Neurobasal Medium, minus czerwień fenolowa | ThermoFisher Scientific | 12348017 | |
| Suplement Neuropan-2 | Pan-Biotech | P07-11010 | |
| Normalna surowica kozia | Abcam | ab138478 | |
| Olsen-Hegar Uchwyt na igły z nożyczkami | Fine Science Tools | 12002-12 | |
| p-Tub-alpha-1-Dre | Addgene | 133925 | |
| p-Tub-alpha-1-iCre | Addgene | 133924 | |
| p-Tub-alpha-1-LifeAct-GFP | Addgene | 175437 | |
| Parafilm | VWR | 52858-000 | |
| Paraformaldehyd | sigma-Aldrich | P6148 | |
| PBS | Sigma-Aldrich | P3813-10PAK | |
| pCAG-lox-rox-STOP-rox-tRFP-lox-Lyn-ZsGreen | Addgene | 175438 | |
| pCAG-lox-STOP-lox-Lyn-mNeonGreen | Addgene | 175257 | |
| Penicylina-Streptomycyna | ThermoFisher Scientific | 15140122 | |
| Zestaw dysz PicoNozzle v2 | World Precision Instruments | 5430-ALL | |
| Platynowa pęseta | Aparat Harvard | 45-0487 | 1 mm / 3 mm |
| Zestaw QIAGEN Maxi | QIAGEN | 12162 | |
| Odblaskowe zamykanie ran Clip | World Precision Instruments | 500344-10 | 7 mm |
| Sekundenkleber Pattex Mini Trio | Lyreco | 4722659 | |
| System elektroporacji fali prostokątnej ECM830 | Harvard Aparat | W3 45-0052 | |
| Sterylna gaza | Braun Askina | 9031216 | |
| Sterylna lubrykantna maść do oczu | Bayer Vital | PZN1578675 | |
| Sterylne rękawice chirurgiczne | Sempermed | 14C0451 | |
| Sacharoza | Roth | 4621.2 | |
| Supramid 5-0 jedwabne szwy chirurgiczne | B. Braun | NA | |
| Cienkościenne szklane kapilary | World Precision Instruments | TW100-4 | |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | X100 | |
| Nożyczki sprężynowe Vannas | Fine Science Tools | 15000-03 | |
| i mikro;-Slide 8 Well Szklane dno | Ibidi | 80827 |