Kroki krytyczne
Optymalizacja trzech kroków znacznie zwiększy sukces tego protokołu. Po pierwsze, w kroku 1.5, oszczędzaj klej samoprzylepny nałożony na szkiełko nakrywkowe. Jeśli doda się zbyt dużo kleju adhezyjnego, poczwarki mogą zostać zakopane w grubej warstwie zestalonego kleju klejącego, co uniemożliwi rozwarstwienie, a jeśli zakryje samo notum, klej zasłania światło z próbki. Po drugie, podczas kroków 2.3-2.6 upewnij się, że usunięto tylko górną kopułę notum, wykluczając jak największą część tkanki bocznej. Jeśli zostanie dołączona, tkanka boczna zostanie ściśnięta podczas montażu i spowoduje, że środek nacięcia wygina się do wewnątrz, często umieszczając go poza odległością roboczą obiektywów o dużej aperturze numerycznej. Po trzecie, na etapie czyszczenia 2.9 należy zachować szczególną ostrożność, aby nie uszkodzić nabłonka jednowarstwowego. Jeśli w tkance brakuje dużych części lub nie można wykryć żadnego sygnału, ten krok może być winny.
Rozwiązywanie problemów
Problem 1: Po zamontowaniu poczwarka odchodzi od taśmy dwustronnej podczas sekcji. Jest to częsty problem, szczególnie dla początkujących. Najlepszym lekarstwem jest upewnienie się, że zewnętrzna strona pudełka poczwarki jest całkowicie sucha/wolna od resztek jedzenia. Wyjmowanie jedzenia za pomocą kleszczy i pozostawienie etui do wyschnięcia na powietrzu przez 10-15 minut pomoże przykleić się do taśmy. Alternatywnie użyj niedominującej ręki i pary kleszczy, aby przytrzymać poczwarki przy taśmie podczas sekcji. Jeśli problem będzie się powtarzał, nałożenie małej kropli lakieru do paznokci o pojemności 5-10 μl na podstawę tylnego końca etui i pozostawienie go do stwardnienia na ogół zapewnia wystarczającą przyczepność nawet dla najbardziej nierozsądnych poczwarek.
Problem 2: Notum zapada się podczas kroku 2.3 lub początkowe naruszenie powłoki nie jest płynne. Jeśli powłoka jest trudna do złamania, może być za dużo kleju z etapów unieruchomienia. Umieszczenie wypreparowanych poczwarek w mniej adhezyjnym kleju poprawi ten problem. Ponadto upewnij się, że nożyczki do mikrodysekcji są ostre. nożyczki nie będą w stanie przeciąć powłoki i mają tendencję do powodowania jej zapadania się do środka. Gdy hemolimfa wyleje się z poczwarek, upewnij się, że jedno z ostrzy tnących może wejść do poczwarki, nie powodując deformacji nacięcia. Jeśli nacięcie zapadnie się, a ostrze nie wejdzie w poczwarkę, kontynuuj cięcie, aż ostrze wejdzie w poczwarkę.
Problem 3: W kroku 2.4 nożyczki chwytają lub przeciągają powłokę. Jeśli nożyczki zaczynają chwytać lub ciągnąć powłokę, często pomaga przełączenie się na przeciwną stronę poczwarki i przystąpienie do "poluzowania" powłoki. Dalsze nożyczki do mikrodysekcji utrudnią uzyskanie czystych cięć przez powłokę i należy użyć zaostrzonych nożyczek.
Problem 4: Próbka zostaje przypadkowo zassana podczas barwienia (kroki 3.1-3.6). Wypreparowane notum jest trudne do zobaczenia, ponieważ jest przezroczyste. Pomocne może być umieszczenie ciemnoniebieskiego lub czarnego arkusza pod szkiełkiem nakrywkowym, aby zapewnić kontrast (dobrze sprawdza się stary stojak na końcówki do pipet). Dodatkowo wszystkie zmiany roztworu mogą być wykonywane pod mikroskopem preparacyjnym.
Problem 5: Nie wykryto żadnego sygnału/wykryto niejednolity sygnał. Po wykluczeniu problemów związanych z plamami, jeśli nie zostanie wykryty żaden sygnał lub jest on niejednolity, prawdopodobnie winowajcą jest krok 2.9 (czyszczenie). Brak lub niejednolity sygnał może pochodzić z uszkodzenia i usunięcia tkanki nabłonkowej podczas czyszczenia. I odwrotnie, słaby sygnał może być spowodowany okluzją z pasm mięśniowych / komórek tłuszczowych, jeśli nie zostaną one usunięte, ponieważ mogą ograniczyć dyfuzję barwników i przeciwciał do notum w stosunku do otaczającej tkanki. Jeśli tkanka jest uszkodzona, najlepszym rozwiązaniem jest delikatniejsza podczas czyszczenia. Jeśli natomiast plama jest widoczna, ale niejednolita, zaleca się zwiększenie wigoru/czasu poświęconego na etap czyszczenia, aby usunąć jak najwięcej mięśni i tkanki tłuszczowej. Co więcej, wydłużenie czasu trwania plamy może pomóc rozwiązać ten problem dzięki lepszemu czyszczeniu.
Problem 6: Tkanka notum ma zniekształcony/pomarszczony wygląd podczas obrazowania. Wypaczanie i marszczenie tkanki pochodzi z dwóch źródeł. Po pierwsze, ściśnięcie wycięcia podczas montażu spowoduje jego wygięcie i wypaczenie. Najlepszym rozwiązaniem jest usunięcie jak największej ilości tkanek bocznych, tak aby kopuła była jak najkrótsza i mogła zmieścić się między przekładkami szkiełka nakrywkowego. Po drugie, jeśli notum zostanie wygięte podczas sekcji, to zagięcie to nie wyprostuje się podczas montażu, dlatego należy zachować szczególną ostrożność, aby nie wypaczyć notum podczas sekcji. Przypadkowe zgięcie notum jest najczęstsze podczas odcinania powłoki od reszty poczwarek. Kuszące jest, aby nożyczki preparacyjne były ustawione pod kątem w stosunku do poczwarek, zamiast trzymać je w płaszczyźnie próbki jak poczwarki. Jednak nożyczki ustawione pod kątem powodują, że powłoka wygina się do góry podczas cięcia, zamiast pozostać płaska.
Istniejące metody, ograniczenia i przyszłe zastosowania
Wang i wsp.20 opisali porównywalny protokół preparacyjny do izolacji nabłonka poczwarki. Technika ta wymaga, aby poczwarka pozostała w swoim etui i została szybko przecięta skalpelem. Protokół ten jest niekompatybilny z wcześniej obrazowanymi próbkami na żywo, ponieważ obrazowanie na żywo wymaga usunięcia dużej części koperty poczwarki. Ponieważ poczwarki nie są sztywne, bisekcja poczwarki poza obudową zniekształciła tkankę, inspirując stworzenie tego protokołu. Opisana tutaj technika pozwala na izolację i utrwalenie notum i może być wykorzystana jako pierwszy krok dla szerokiej gamy innych metod, takich jak kriosekcja, hybrydyzacja in situ lub mikroskopia elektronowa.
Ta technika ma pewne ograniczenia. Po pierwsze, preparowanie, utrwalanie i barwienie notum jest bardziej czasochłonne niż obrazowanie na żywo fluorescencyjnie znakowanych białek w notum, co wymaga jedynie prostej sekcji w celu usunięcia przypadku poczwarki 9,23. Po drugie, w porównaniu z sekcjami innych tkanek Drosophila, ta sekcja jest trudniejsza ze względu na cienką, delikatną tkankę i hydrofobowy naskórek. Aby po prostu uwidocznić białka w nabłonku Drosophila, łatwiej jest przeprowadzić immunohistochemię na utrwalonych zarodkach, krążkach skrzydeł larw lub jajnikach. Jednak ta technika pozwala na połączenie mocy obrazowania na żywo z utrwalaniem i barwieniem, co czyni ją potężnym narzędziem po opanowaniu.
Technika preparacji/fiksacji ma pewne zalety w porównaniu z obrazowaniem na żywo. Struktury podstawowe (wewnętrzne) można lepiej rozwiązać za pomocą widoku podstawowego (ryc. 5L,J). Co najważniejsze, obrazowanie na żywo jest ograniczone do fluoroforów, które muszą być dostarczane genetycznie, co często wymaga długotrwałych schematów krzyżowania genetycznego. W przeciwieństwie do tego, obecny protokół pozwala na zastosowanie barwienia, immunohistochemii i innych technik, które wymagają sekcji i utrwalenia. To znacznie zwiększa liczbę sygnałów sondowanych w tkance, jednocześnie potencjalnie skracając czas oczekiwania na wyniki eksperymentalne.