W niniejszej pracy opisaliśmy solidny protokół, który umożliwia badaczom generowanie homogenicznych organoidów kory mózgowej pochodzących z hPSC, naśladujących obszar kory mózgu człowieka in vivo w ciągu 1-3 miesięcy hodowli. Kolonie hPSC są najpierw hodowane w pożywce różnicującej w celu wytworzenia kolonii neuroektodermalnych, które mogą następnie służyć do formowania sferoidów neuronalnych. Sferoidy te są następnie osadzane w macierzy błony podstawnej i utrzymywane przez dłuższy czas w celu wytworzenia organoidów, które mogą być wykorzystane do modelowania starzenia się neuronów (schemat protokołu przedstawiono na Rysunku 1). Warto zauważyć, że hodowanie tych organoidów w ultra-niepowlekanych płytkach 24-dołkowych wywołuje stres komórkowy i promuje fenotypy związane ze starzeniem się w ciągu 13 tygodni hodowli in vitro. Organoidy wytworzone zgodnie z tym protokołem mogą być również utrzymywane w bioreaktorach z mieszadłem w celu optymalnego wzrostu i różnicowania komórek neuronalnych płytki korowej lub na granicy faz powietrze-ciecz.
W pierwszej kolejności kolonie hPSC hoduje się przez 1 dzień przed różnicowaniem w kierunku neuroektodermy. Kluczowe jest, aby kolonie hPSC osiągnęły jedynie 20%-30% konfluencji i były najwyższej możliwej jakości: w formie zwartej, płaskiej monowarstwy, bez zanieczyszczenia kolonii komórkami zróżnicowanymi (Rycina 2A,B). Pluripotencję kolonii hPSC należy potwierdzić poprzez ekspresję markerów takich jak NANOG (Rycina 2C). Następnie zwalidowane kolonie hPSC poddaje się działaniu pożywki do różnicowania neuroektodermalnego N2 z dodatkiem SB-431542 i LDN 193189. Po 3 dniach utrzymania w tej pożywce kolonie hPSC powinny zróżnicować się w kolonie neuroektodermalne i przestać wykazywać charakterystyczną dla hPSC morfologię zwartej, płaskiej monowarstwy (Rycina 2B); zamiast tego komórki przyjmą wydłużony, kolumnowy kształt (Rycina 2B). Komórki te będą również negatywne pod kątem markerów pluripotencji, takich jak NANOG (Rycina 2C).
Na tym etapie kolonie neuroektodermalne są odlepiane enzymatycznie za pomocą dispazy, a każda zdrowa i pomyślnie odlepiona kolonia może samoorganizować się i tworzyć młody sferoid neuronalny (Rysunek 2D, Wideo dodatkowe 1). Tylko zdrowe i czyste kolonie neuroektodermalne odlepią się w czasie określonym dla aktywności dispazy; wszystkie pozostałe kolonie należy zignorować, ponieważ doprowadziłyby one do powstania sferoidów gorszej jakości. Dzięki codziennej ekspozycji na FGF2 w pożywce N2, komórki macierzyste neuronów (SOX2+) w tych sferoidach (Rysunek 2D, dzień 1) będą proliferować i tworzyć znaczną liczbę rozet neuronalnych (Rysunek 2D, dzień 4). Rozety te będą wykazywać ekspresję białka ZO1 (markera połączeń szczelnych i nabłonkowych) w komórkach zlokalizowanych w centrum rozet oraz wzdłuż zewnętrznej krawędzi sferoidu, co demonstruje polaryzację apikalno-bazalną sferoidu (Rysunek 2D, dzień 4). Metoda trójwymiarowego obrazowania całych sferoidów została opisana wcześniej13. Codzienna inspekcja sferoidów powinna wykazać powstanie ciasnej, ciemnej krawędzi zewnętrznej i jasnej peryferii sferoidów, co stanowi warstwę neuroepithelialną. Warstwa ta powinna być wystarczająco uformowana po 3-4 dniach, osiągając przybliżoną średnicę 500 µm, po czym sferoidy można zatopić w matrycy podstawowej. Jeśli warstwa ta nie jest obecna lub jest słabo uformowana, oznacza to, że sferoidy nie są wystarczająco rozwinięte, aby kontynuować procedurę. Zaleca się odczekać kolejny dzień w celu zaobserwowania zmian, jednak jeśli nie nastąpi poprawa, należy odrzucić te sferoidy.
Reprezentatywny obraz w polu jasnym sferoidów po 3 dniach hodowli przedstawiono na Rysunku 2D. Do osadzenia w macierzy podstawowej wybierane są sferoidy z gęstą warstwą neuroepithelialną, które nie zlały się z sąsiednimi sferoidami, posiadają półprzezroczystą tkankę i wykazują formowanie rozet neuralnych. Po osadzeniu sferoid będzie szybko proliferował i zacznie pączkować: pojawią się węzły zwartej tkanki, rozszerzające się na zewnątrz z głównego ciała sferoidu. Jest to widoczne między 1. a 3. tygodniem w macierzy podstawowej i można to zaobserwować w wielu liniach komórkowych (Rysunek 3A). Analiza ilościowa osadzonych sferoidów potwierdza obecność komórek nabłonkowych w maksymalnie 100% sferoidów w trzech różnych liniach komórkowych, co potwierdza homogeniczność i powtarzalność oczekiwaną od tego protokołu (Rysunek 3B). Ilościowe oznaczenie średnicy organoidów podczas różnicowania in vitro dodatkowo potwierdza powtarzalność w różnych liniach hPSC (Rysunek 3C). Jeśli pączkowanie nie występuje, sferoidy nie rozwijają się prawidłowo i powinny zostać odrzucone. Po osadzeniu sferoidów w macierzy ich rozwój postępuje, a sferoidy są odtąd nazywane organoidami. Barwienie immunofluorescencyjne potwierdza również obecność komórek progenitorowych neuronów (PAX6) oraz markerów warstw korowych barwionych przeciwciałami CTIP2 i SATB2 w organoidach z wyraźną warstwowością (Rysunek 3D,E). Warstwowość ta jest obserwowalna w różnych punktach czasowych utrzymywania organoidów (Rysunek 3D,E). Metoda immunohistochemii tkanek została opisana wcześniej14.
Jednym z możliwych zastosowań tych organoidów jest badanie wpływu procesów związanych ze starzeniem się neuronów na mózg. Aby to zbadać, pomyślnie wygenerowane organoidy są pobierane w wielu różnych punktach czasowych w celu wykonania skrawków i barwienia na standardowe molekularne biomarkery starzenia, takie jak beta-galaktozydaza związana ze starzeniem oraz p21. Rysunek 4A przedstawia reprezentatywny obraz barwienia organoidów na beta-galaktozydazę związaną ze starzeniem w 4. i 13. tygodniu po osadzeniu w macierzy błony podstawnej. Pomiędzy 4. a 13. tygodniem obserwuje się wyraźny wzrost obecności beta-galaktozydazy związanej ze starzeniem, co sugeruje, że w tym czasie hodowli doszło do starzenia się komórek, które jest uznanym czynnikiem starzenia się organizmu. Barwienie immunofluorescencyjne organoidów w 13. tygodniu potwierdziło obecność innego markera starzenia, p21, współbarwionego z markerem dojrzałych neuronów korowych (CTIP2), co pokazano na Rysunku 4B. Należy jednak zauważyć, że obecność p21 jest markerem zatrzymania cyklu komórkowego i sama w sobie nie stanowi definitywnego markera starzenia; aby jednoznacznie zidentyfikować komórki jako starzejące się, zaleca się wykrycie innych markerów starzenia, takich jak p16 oraz czynniki SASP (fenotyp wydzielniczy związany ze starzeniem).

Rysunek 1: Schemat generowania powtarzalnych organoidów kory mózgu. Schematyczny przebieg procedury eksperymentalnej w celu wytworzenia organoidów kory mózgu z hPSC hodowanych w pośrodku bez fibroblastów (feeder-free). Schemat przedstawia sześć etapów różnicowania hPSC z hodowli 2D w trójwymiarowe, wzorowane na strukturze płytki korowej ludzkie tkanki w formie organoidów. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Generowanie sferoidów neuronalnych pochodzących z kolonii neuroektodermalnych hPSC. (A) Reprezentatywne obrazy ludzkich PSC wykazujących optymalne (biały znacznik) oraz zróżnicowane kolonie (biały krzyżyk). Pasek skali: 200 µm, powiększenie 4x. (B) Reprezentatywny obraz kolonii neuroektodermalnej pochodzącej z hPSC po 3 dniach traktowania podwójnymi inhibitorami SMAD. Pasek skali: 200 µm, powiększenie 4x. (C) Kolonie ludzkich PSC zostały zróżnicowane w kierunku kolonii neuroektodermalnych. Obrazy przedstawiają barwienie kolonii PSC (w dniu 1.) i neuroektodermalnych (w dniu 3.) przeciwciałami przeciwko SOX2 (czerwony), NANOG (zielony); wszystkie jądra zostały przeciwbarwione Hoechst 33342 (niebieski). Pasek skali: 40 µm, powiększenie 100x. (D) Obrazy przedstawiające etapy rozwoju sferoidów korowych mózgu w czasie hodowli in vitro w świetle przechodzącym oraz preparaty całych sferoidów immunobarwionych przeciwko SOX2 (czerwony) w dniu 1. i podwójnie immunobarwionych przeciwko SOX2 (czerwony) oraz ZO1 (zielony) w dniu 4. Pasek skali obrazu w świetle przechodzącym wynosi 500 µm, powiększenie 4x; paski skali na dolnych obrazach wynoszą 40 µm, powiększenie 20x. Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 3: Charakterystyka organoidów kory mózgowej pochodzących z różnych linii hPSC. (A) Reprezentatywne obrazy organoidów kory mózgowej pochodzących z ludzkich linii iPSC G22, WTC i EU79 hodowanych przez 3 tygodnie in vitro. Pasek skali na wszystkich obrazach wynosi 500 µm, powiększenie 2x. (B) Procenty skutecznej generacji organoidów kory mózgowej w 3. tygodniu różnicowania in vitro w różnych liniach hPSC (G22, WTC i EU79). N = 3. Dane przedstawiono jako średnia ± odchylenie standardowe. (C) Wykresy słupkowe przedstawiające wzrost organoidów kory mózgowej (na podstawie średnicy średniej) w 1. i 3. tygodniu różnicowania in vitro w różnych liniach ludzkich pluripotencjalnych komórek macierzystych (G22, WTC i EU79). N = 3. Dane przedstawiono jako średnia ± odchylenie standardowe. (D) Reprezentatywne obrazy przekrojów 6- i 9-tygodniowych organoidów kory mózgowej pochodzących z hPSC G22, poddanych immunobarwieniu na marker strefy komorowej PAX6 (czerwony) i płytki korowej CTIP2 (zielony). Wszystkie przekroje zbarwiono przeciwbarwnikiem Hoechst 33342 (niebieski). Pasek skali = 140 µm, powiększenie 20x. W oznacza tydzień. (E) Reprezentatywne obrazy przekrojów 10- i 13-tygodniowych organoidów kory mózgowej pochodzących z hPSC WTC, poddanych immunobarwieniu na marker IV warstwy korowej SATB2 (zielony). Wszystkie przekroje zbarwiono przeciwbarwnikiem Hoechst 33342 (niebieski). Obraz z 10. tygodnia: pasek skali = 50 µm, powiększenie 40x. Obraz z 13. tygodnia: pasek skali = 150 µm, powiększenie 40x. W oznacza tydzień. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tej ryciny.

Rysunek 4: Charakterystyka starzenia w organoidach korowych mózgu pochodnych z hPSC. (A) Reprezentatywne obrazy przekrojów ludzkich organoidów korowych mózgu pochodnych z hPSC WTC hodowanych przez 4 i 13 tygodni in vitro i barwionych SA-β-gal. Pasek skali = 500 µm, pasek skali na powiększonych obrazach = 250 µm, powiększenie 4x. Przerywana ramka wskazuje obszar powiększonego obrazu. (B) Reprezentatywne obrazy przekrojów 13-tygodniowych organoidów korowych mózgu pochodnych z ludzkich hPSC EU79, poddanych immunobarwieniu na neurony korowe CTIP2 (zielony) i p21 (czerwony). Wszystkie przekroje przeciwbarwiono Hoechst 33342 (niebieski). Pasek skali = 25 µm, pasek skali na powiększonych obrazach = 10 µm, powiększenie 40x. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.
| Składniki pożywki | Stężenie |
| Mieszanina nutrientów DMEM/F-12 10x 500 ml (DMEM/F-12) | |
| suplement N2 5 ml (100x) | z dodatkiem 1% |
| Suplement B 27 10 ml | Uzupełnione do 2% |
| Roztwór nieessentialnych aminokwasów do pożywki MEM (100x) | Uzupełniony do 1% |
| penicylina-streptomycyna (10 000 j.m./ml) | Uzupełnione do 1% |
| 2-merkaptoetanol 50 ml (1000x) | z dodatkiem 0,1% |
Tabela 1: Pożywka N2. Tabela zawiera listę odczynników wymaganych do przygotowania pożywki N2.
| Składniki pożywki | Stężenie |
| DMEM Nutrient mix F12 10x 500 mL (DMEM/F-12) | Pożywka DM przygotowana w stosunku 1:1 DMEM/F12 i pożywki Neurobasal |
| Neurobasal Medium |
| N2 Supplement 5 mL (100x) | Dodatek 0,5% |
| B 27 Supplement 10 mL | Dodatek 1% |
| MEM Non-Essential Amino Acids Solution (100x) | Dodatek 1% |
| GlutaMAX Supplement 100x | Dodatek 1% |
| Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Dodatek 1% |
| Insulin Solution Human Recombinant | 12.5 µL na 50 mL pożywki |
| 2-Mercaptoethanol 50 mL (1000x ) | 17.5 µL na 50 mL pożywki |
Tabela 2: Pożywka różnicująca (DM). W tabeli wymieniono odczynniki niezbędne do przygotowania pożywki różnicującej.
Wideo uzupełniające 1. Obrazowanie na żywo konwersji indukowanych 2D arkuszy/kolonii hNEct w struktury 3D pod wpływem bFGF. Indukowane kolonie hNEct zostały delikatnie odseparowane od naczynia za pomocą dispazy, zgodnie z powyższym opisem, i przeniesione na 6-dołkową płytkę hodowlaną o niskim powinowactwie (low attachment). 2D kolonie hNEct przekształciły się w 3D sferoidy hNEct w ciągu 12 h. Obrazy seryjne rejestrowano co 5 min. Pasek skali = 100 µm. Kliknij tutaj, aby pobrać to wideo.