W niniejszej pracy opisaliśmy niezawodny protokół, który pozwala badaczom na generowanie jednorodnych organoidów kory mózgowej pochodnych z hPSC, naśladujących ludzki region kory mózgowej in vivo w ciągu 1-3 miesięcy hodowli. Kolonie hPSC są najpierw hodowane w mediach różnicujących w celu wytworzenia kolonii neuroektodermalnych, które mogą następnie posłużyć do formowania sferoidów neuralnych. Sferoidy te są następnie osadzane w macierzy błony podstawnej i utrzymywane przez dłuższy czas w celu wytworzenia organoidów, które mogą być wykorzystane do modelowania starzenia się neuronów (schemat protokołu przedstawiono na Rysunku 1). Warto zauważyć, że hodowanie tych organoidów w niepowlekanych płytkach 24-dołkowych wywołuje stres komórkowy i promuje fenotypy związane ze starzeniem się w ciągu 13 tygodni hodowli in vitro. Organoidy uzyskane zgodnie z tym protokołem mogą być również utrzymywane w bioreaktorach z mieszadłem dla optymalnego wzrostu i różnicowania komórek neuralnych płyty korowej lub na granicy faz powietrze-ciecz.
W pierwszej kolejności kolonie hPSC hoduje się przez 1 dzień przed różnicowaniem w kierunku neuroektodermy. Kluczowe jest, aby kolonie hPSC osiągnęły stopień konfluencji wynoszący jedynie 20%-30% i charakteryzowały się najwyższą możliwą jakością: powinny tworzyć zwartą, płaską monowarstwę bez komórek zróżnicowanych zanieczyszczających kolonie (Rysunek 2A,B). Pluripotencję kolonii hPSC należy potwierdzić poprzez ekspresję markerów takich jak NANOG (Rysunek 2C). Zwalidowane kolonie hPSC poddaje się następnie działaniu pożywki do różnicowania neuroektodermalnego N2 z dodatkiem SB-431542 i LDN 193189. Po 3 dniach hodowli w tej pożywce kolonie hPSC powinny zróżnicować się w kolonie neuroektodermalne i przestać wykazywać morfologię zwartej płaskiej monowarstwy typową dla hPSC (Rysunek 2B); zamiast tego komórki przybiorą wydłużony, kolumnowy kształt (Rysunek 2B). Komórki te będą również negatywne pod kątem markerów pluripotencji, takich jak NANOG (Rysunek 2C).
Na tym etapie kolonie neuroektodermalne są enzymatycznie odrywane za pomocą dyspazy, a każdej zdrowej i pomyślnie oddzielonej kolonii pozwala się na samoorganizację i utworzenie młodego sferoidu neuronalnego (Rycina 2D, Wideo uzupełniające 1). Tylko zdrowe, czyste kolonie neuroektodermalne oddzielą się w czasie określonym dla aktywności dyspazy; wszystkie pozostałe kolonie należy zignorować, ponieważ doprowadzą one do powstania sferoidów gorszej jakości. Dzięki codziennej ekspozycji na FGF2 w pożywce N2, komórki macierzyste neuronów (SOX2+) w tych sferoidach (Rycina 2D, dzień 1) będą proliferować i tworzyć znaczną liczbę rozetek neuronalnych (Rycina 2D, dzień 4). Rozetki te będą wykaziwać ekspresję białka ZO1, markera połączeń ścisłych i nabłonkowych, w komórkach zlokalizowanych w centrum rozetek oraz wzdłuż zewnętrznej krawędzi sferoidu, co wykazuje polarność apikalno-bazalną sferoidu (Rycina 2D, dzień 4). Metoda obrazowania 3D sferoidów w całości została opisana wcześniej13. Codzienna inspekcja sferoidów powinna wykazać formowanie się szczelnej, ciemnej krawędzi zewnętrznej i jasnej peryferii sferoidów, co stanowi warstwę neuroepithelialną. Warstwa ta powinna być w pełni uformowana po 3-4 dniach, osiągając przybliżoną średnicę 50 µm; w tym czasie sferoidy można zatopić w macierzy podstawnej. Jeśli warstwa ta nie występuje lub jest słabo wykształcona, sferoidy nie są wystarczająco rozwinięte, aby kontynuować procedurę. Zaleca się odczekać kolejny dzień w celu zaobserwowania jakichkolwiek zmian, jednak jeśli nie zostaną one zauważone, sferoidy te należy odrzucić.
Reprezentatywny obraz w polu jasnym sferoidów po 3 dniach hodowli przedstawiono na Rysunku 2D. Do zatopienia w macierzy podstawowej wybiera się sferoidy z ciasną warstwą neuroepitelialną, które nie zrosły się z sąsiednimi sferoidami, mają półprzezroczystą tkankę i wykazują tworzenie rozet neuronalnych. Po zatopieniu sferoidy będą szybko proliferować i zaczną pączkować: pojawią się węzły zwartej tkanki, rozszerzające się na zewnątrz z głównego ciała sferoidu. Jest to widoczne między 1. a 3. tygodniem w macierzy podstawowej i można to zaobserwować w wielu liniach komórkowych (Rysunek 3A). Analiza ilościowa zatopionych sferoidów potwierdza obecność komórek nabłonkowych w upอยู่ do 10% sferoidów w trzech różnych liniach komórkowych, co potwierdza homogenność i powtarzalność oczekiwaną w tym protokole (Rysunek 3B). Kvantyfikacja średnicy organoidów podczas różnicowania in vitro dodatkowo potwierdza powtarzalność w różnych liniach hPSC (Rysunek 3C). Jeśli pączkowanie nie następuje, oznacza to, że sferoidy nie rozwijają się prawidłowo i powinny zostać usunięte. Po zatopieniu sferoidów w macierzy ich rozwój postępuje, a sferoidy są odtąd nazywane organoidami. Barwienie immunofluorescencyjne potwierdza również obecność komórek progenitorowych neuronów (PAX6), a także markerów warstw korowych barwionych za pomocą CTIP2 i SATB2 w organoidach z wyraźnym warstwowaniem (Rysunek 3D,E). Warstwowanie to jest obserwowalne w różnych punktach czasowych utrzymywania organoidów (Rysunek 3D,E). Metoda immunohistochemii tkanek została opisana wcześniej14.
Jedną z możliwych aplikacji tych organoidów jest badanie wpływu procesów związanych ze starzeniem się neuronów na mózg. W tym celu pomyślnie wygenerowane organoidy pobiera się w wielu różnych punktach czasowych w celu wykonania przekrojów i barwienia na standardowe molekularne biomarkery starzenia, takie jak beta-galaktozydaza związana ze starzeniem oraz p21. Rysunek 4A przedstawia reprezentacyjny obraz barwienia beta-galaktozydazy związanej ze starzeniem w organoidach 4 i 13 tygodni po osadzeniu w macierzy błony podstawnej. Między 4. a 13. tygodniem obserwuje się wyraźny wzrost obecności beta-galaktozydazy związanej ze starzeniem, co sugeruje, że w tym czasie hodowli nastąpiło starzenie komórkowe, będące uznanym czynnikiem starzenia się organizmu. Barwienie immunofluorescencyjne organoidów w 13. tygodniu potwierdziło obecność innego markera starzenia, p21, współoznaczonego z markerem dojrzałych neuronów korowych (CTIP2), co przedstawiono na Rysunku 4B. Należy jednak zauważyć, że obecność p21 jest markerem zatrzymania cyklu komórkowego i sama w sobie nie stanowi definitywnego markera starzenia; w celu jednoznacznej identyfikacji komórek jako starzejące się zaleca się wykrycie innych markerów starzenia, takich jak p16 oraz czynniki SASP (fenotyp sekrecyjny związany ze starzeniem).

Rycina 1: Schemat generowania powtarzalnych organoidów kory mózgu. Schematyczny przebieg procedury eksperymentalnej służącej do generowania organoidów kory mózgu z hPSC hodowanych w medium bez warstwy feeder. Schemat przedstawia sześć kroków różnicowania 2D hPSC w 3D wzorowane ludzkie tkanki płyty korowej w organoidach. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 2: Generowanie sferoidów neuronalnych pochodzących z kolonii neuroektodermalnych hPSC. (A) Reprezentatywne obrazy ludzkich PSC wykazujące kolonie optymalne (biały znacznik) i zróżnicowane (biały krzyżyk). Pasek skali: 20 µm, powiększenie 4x. (B) Reprezentatywny obraz kolonii neuroektodermalnej pochodzącej z hPSC po 3 dniach traktowania podwójnym inhibitorem SMAD. Pasek skali: 200 µm, powiększenie 4x. (C) Kolonie ludzkich PSC poddano różnicowaniu w kierunku kolonii neuroektodermalnych. Obrazy przedstawiają barwienie kolonii PSC (w dniu 1.) i neuroektodermalnych (w dniu 3.) przeciwciałami przeciwko SOX2 (czerwony), NANOG (zielony); wszystkie jądra przeciwbarwiono Hoechst 3342 (niebieski). Pasek skali: 40 µm, powiększenie 10x. (D) Obrazy przedstawiające etapy rozwoju sferoidów kory mózgu w czasie hodowli in vitro w świetle przechodzącym oraz preparaty całych sferoidów poddanych immunobarwieniu na SOX2 (czerwony) w dniu 1. oraz podwójnemu immunobarwieniu na SOX2 (czerwony) i ZO1 (zielony) w dniu 4. Pasek skali na obrazie w świetle przechodzącym wynosi 50 µm, powiększenie 4x; paski skali na dolnych obrazach wynoszą 40 µm, powiększenie 20x. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 3: Charakterystyka korowych organoidów mózgu pochodnych z różnych linii hPSC. (A) Reprezentatywne obrazy korowych organoidów mózgu pochodnych z ludzkich linii iPSC G22, WTC i EU79 hodowanych przez 3 tygodnie in vitro. Pasek skali na wszystkich obrazach wynosi 500 µm, powiększenie 2x. (B) Procenty udanej generacji korowych organoidów mózgu w 3. tygodniu różnicowania in vitro w różnych liniach hPSC (G2, WTC i EU79). N = 3. Dane przedstawiono jako średnia ± odchylenie standardowe. (C) Wykresy słupkowe przedstawiające wzrost korowych organoidów mózgu (na podstawie średnicy średniej) w 1. i 3. tygodniu różnicowania in vitro w różnych liniach ludzkich pluripotencjalnych komórek macierzystych (G2, WTC i EU79). N = 3. Dane przedstawiono jako średnia ± odchylenie standardowe. (D) Reprezentatywne obrazy przekrojów 6- i 9-tygodniowych korowych organoidów mózgu pochodnych z hPSC G2, poddanych immunobarwieniu na PAX6 strefy komorowej (czerwony) i CTIP2 płyty korowej (zielony). Wszystkie przekroje przeciwbarwiono Hoechst 342 (niebieski). Pasek skali = 140 µm, powiększenie 20x. W oznacza tydzień. (E) Reprezentatywne obrazy przekrojów 10- i 13-tygodniowych korowych organoidów mózgu pochodnych z hPSC WTC, poddanych immunobarwieniu na SATB2 warstwy IV kory (zielony). Wszystkie przekroje przeciwbarwiono Hoechst 3342 (niebieski). Obraz z 10. tygodnia: pasek skali = 50 µm, powiększenie 40x. Obraz z 13. tygodnia: pasek skali = 150 µm, powiększenie 40x. W oznacza tydzień. Aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku, kliknij tutaj.

Rycina 4: Charakterystyka starzenia się w korowych organoidach mózgu pochodzących z hPSCs. (A) Reprezentatywne obrazy przekrojów ludzkich korowych organoidów mózgu pochodzących z hPSCs WTC, hodowanych przez 4 i 13 tygodni in vitro i barwionych metodą SA-β-gal. Pasek skali = 50 µm, pasek skali na powiększeniach = 250 µm, powiększenie 4x. Przerywana ramka wskazuje obszar powiększony. (B>) Reprezentatywne obrazy przekrojów 13-tygodniowych korowych organoidów mózgu pochodzących z ludzkich hPSCs EU79, poddanych immunobarwieniu na neurony korowe CTIP2 (zielony) i p21 (czerwony). Wszystkie przekroje zostały przebarwione Hoechst 342 (niebieski). Pasek skali = 25 µm, pasek skali na powiększeniach = 10 µm, powiększenie 40x. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.
| Składniki pożywek | Stężenie |
| Mieszanka nutrientów DMEM/F-12 10x 50 ml (DMEM/F-12) | |
| Suplement N2 5 mL (10x) | z dodatkiem 1% |
| Suplement B 27 10 ml | Uzupełnione do 2% |
| Roztwór nieessentialnych aminokwasów do MEM (10x) | Z dodatkiem 1% |
| Penicylina-streptomycyna (10 0 J/ml) | Z dodatkiem 1% |
| 2-merkaptoetanol 50 ml (10x) | Uzupełnione do stężenia 0,1% |
Tabela 1: Pożywka N2. Tabela zawiera odczynniki niezbędne do przygotowania pożywki N2.
| Składniki pożywki | Stężenie |
| Mieszanka nutrientów DMEM/F-12 10x 50 ml (DMEM/F-12) | Pożywkę DM przygotowuje się w stosunku 1:1 z pożywek DMEM/F12 oraz Neurobasal. |
| Pożywka Neurobasal |
| dodatek N2 5 mL (100x) | Uzupełnione do stężenia 0,5% |
| Suplement B 27 10 ml | Uzupełniono o 1% |
| Roztwór nieistotnych aminokwasów MEM (100x) | Uzupełniono o 1% |
| Suplement GlutaMAX 10x | uzupełnione do stężenia 1% |
| Penicylina-streptomycyna (10 00 J/ml) | Uzupełniony o 1% |
| Roztwór insuliny rekombinowanej ludzkiej | 12.5 µL dla 50 ml pożywki |
| 2-merkaptoetanol 50 mL (10x) | 17.5 µL dla 50 ml pożywki |
Tabela 2: Pożywka różnicująca (DM). Tabela zawiera listę odczynników niezbędnych do przygotowania pożywki różnicującej.
Film uzupełniający 1. Obrazowanie na żywo konwersji indukowanych 2D arkuszy/kolonii hNEct do formy 3D pod wpływem bFGF. Indukowane kolonie hNEct zostały delikatnie odseparowane od naczynia za pomocą dyspazy zgodnie z powyższym opisem i przeniesione do 6-dołkowej płytki hodowlanej o niskim przywieraniu. Kolonie hNEct 2D przekształciły się w sferoidy hNEct 3D w ciągu 12 h. Obrazy seryjne były rejestrowane co 5 min. Pasek skali = 10 µm. Kliknij tutaj, aby pobrać ten film.