Tolerancja termiczna jest kluczem do przetrwania i funkcjonowania organizmów1,2. Ponieważ planeta nadal się ociepla z powodu antropogenicznej emisji dwutlenku węgla, coraz większą uwagę zwraca się na określanie i stosowanie limitów termicznych3. Różne punkty końcowe, takie jak śmiertelność, niepowodzenie w rozwoju i utrata mobilności, zostały wykorzystane do określenia zarówno górnych, jak i dolnych limitów termicznych4. Te limity termiczne są często uważane za wskaźnik zastępczy niszy termicznej organizmu. Informacje te są z kolei wykorzystywane do identyfikacji gatunków, które są bardziej podatne na globalne ocieplenie, a także do przewidywania przyszłego rozmieszczenia gatunków i wynikających z tego interakcji między gatunkami3,5,6,7. Jednak określenie limitów termicznych, zwłaszcza dla małych organizmów planktonowych, może być trudne.
Dla organizmów planktonowych, szczególnie stadiów larwalnych bezkręgowców morskich, limit termiczny może być określony poprzez przewlekłe narażenie. Przewlekłą ekspozycję uzyskuje się poprzez hodowlę larw w kilku temperaturach przez dni lub tygodnie i określenie temperatury, w której zmniejsza się przeżywalność larw i/lub tempo rozwoju8,9,10. Jednak takie podejście jest dość czasochłonne i wymaga dużych inkubatorów oraz doświadczenia w hodowli larw (zobacz odniesienie11 dla dobrego wprowadzenia do hodowli larw bezkręgowców morskich).
Alternatywnie, ostre narażenie na stres termiczny może być użyte do określenia limitów termicznych. Często to podejście do oznaczania polega na umieszczaniu małych fiolek z larwami w suchych kąpielach o kontrolowanej temperaturze12,13,14, wykorzystując funkcje gradientu termicznego w termocyklerach PCR15,16, lub umieszczając szklane fiolki/probówki do mikrowirówek wzdłuż gradientu termicznego generowanego przez zastosowane ogrzewanie i chłodzenie na końcach dużych bloków aluminiowych za pomocą Otwory, w których fiolki dobrze pasują17,18,19. Typowe suche kąpiele generują jedną temperaturę; W związku z tym wiele jednostek musi być eksploatowanych jednocześnie, aby ocenić wydajność w zakresie temperatur. Termocyklery generują gradient, ale mieszczą tylko niewielką objętość próbki (120 μl) i wymagają starannych manipulacji. Podobnie jak termocyklery, duże bloki aluminiowe tworzą liniowe i stabilne gradienty temperatury. Oba podejścia można połączyć z regresją logistyczną lub probitową w celu obliczenia temperatury śmiertelnej dla 50% procent populacji (LT50)12,20,21. Jednak użyte bloki aluminiowe miały długość ~100 cm; Taka wielkość wymaga dużej przestrzeni laboratoryjnej oraz dostępu do specjalistycznych frezarek sterowanych numerycznie do wiercenia otworów. Wraz z użyciem dwóch kąpieli wodnych klasy badawczej w celu utrzymania docelowej temperatury, koszt finansowy montażu zestawu jest wysoki.
Dlatego ta praca ma na celu opracowanie alternatywnego sposobu generowania stabilnego, liniowego gradientu temperatury z dostępnymi na rynku częściami. Taki produkt musi zajmować niewielką powierzchnię i powinien być łatwy do wykorzystania w eksperymentach z narażeniem organizmów planktonowych na ostry stres termiczny. Protokół ten został opracowany z wykorzystaniem zooplanktonu o wielkości <1 mm jako organizmów docelowych, dlatego został zoptymalizowany pod kątem użycia probówki mikrowirówkowej o pojemności 1,5 lub 2 ml. Większe organizmy badawcze będą wymagały pojemników większych niż używane probówki mikrowirówkowe o pojemności 1,5 ml oraz powiększonych otworów w aluminiowych blokach.
Oprócz zwiększenia dostępności aparatury eksperymentalnej, ta praca ma na celu uproszczenie procesu przetwarzania danych. Podczas gdy komercyjne oprogramowanie statystyczne zapewnia procedury do obliczania LT50 przy użyciu regresji logistycznej lub probitowej, koszt licencji jest nietrywialny. Dlatego łatwy w użyciu skrypt, który opiera się na programie statystycznym o otwartym kodzie źródłowym R22, sprawi, że analiza danych będzie bardziej dostępna.
Ten protokół pokazuje, jak można wytworzyć kompaktowy blok ciepła z dostępnych na rynku części i zastosować go do wystawienia zooplanktonu (larw piaskowego ekscentrycznego Dendrastera) na ostry stres cieplny, aby określić ich górną granicę termiczną.