Method Article

Zastosowanie inteligentnego, wysokowydajnego systemu badania wrażliwości na środki przeciwdrobnoustrojowe/przesiewowego fagów oraz wskaźnika Lar oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe

DOI:

10.3791/64785

⸱

July 21st, 2023

 ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  , 
1Shandong Key Laboratory of Animal Disease Control and Breeding, Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences, P.R. China, Key Laboratory of Livestock and Poultry Multi-omics of MARA, 2Department of Genetic and Genomes Biology, University of Leicester, 3College of Veterinary Medicine, Nanjing Agricultural University

In This Article

Summary

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Tutaj przedstawiamy zasadę, strukturę i instrukcję inteligentnego, wysokoprzepustowego systemu testowania wrażliwości na środki przeciwdrobnoustrojowe/przesiewowego fagów. Jego zastosowanie ilustruje przykład Salmonelli wyizolowanej z drobiu w Shandong w Chinach. Obliczany jest indeks Lar, a jego znaczenie w ocenie oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe jest szczegółowo omawiane.

Abstract

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Aby poprawić skuteczność testów wrażliwości na środki przeciwdrobnoustrojowe (AST) i wysokoprzepustowych badań przesiewowych fagów dla opornych bakterii oraz zmniejszyć koszty wykrywania, opracowano inteligentny, wysokoprzepustowy system przesiewowy AST/, w tym 96-punktowy inokulator matrycowy, konwerter akwizycji obrazu i odpowiednie oprogramowanie, zgodnie z kryteriami AST i punktami granicznymi oporności (R) sformułowanymi przez Clinical & Laboratory Standards Institute (CLSI). AspAT i statystyki rozkładu minimalnego stężenia hamującego (MIC) (od R/8 do 8R) 1500 szczepów Salmonelli wyizolowanych od drobiu w Shandong w Chinach w stosunku do 10 środków przeciwdrobnoustrojowych przeprowadzono za pomocą inteligentnego, wysokowydajnego systemu badań przesiewowych AST/fagów. Wskaźnik Lar, oznaczający "mniej antybiozy, mniejsza oporność i resztkowość aż do małej antybiozy", uzyskano poprzez obliczenie średniej ważonej każdego MIC i podzielenie przez R. Podejście to zwiększa dokładność w porównaniu z wykorzystaniem rozpowszechnienia oporności do scharakteryzowania stopnia oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe (AMR) wysoce opornych szczepów. W przypadku szczepów Salmonelli z wysokim opornością na środki przeciwdrobnoustrojowe fagi lityczne zostały skutecznie przesiane z biblioteki fagów przez ten system, a następnie obliczono i przeanalizowano widmo lizy. Wyniki pokazały, że inteligentny, wysokowydajny system badań przesiewowych AST/fagów jest sprawny, dokładny, wysoce wydajny, niedrogi i łatwy w utrzymaniu. W połączeniu z weterynaryjnym systemem monitorowania oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe firmy Shandong system ten nadawał się do badań naukowych i klinicznego wykrywania oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe.

Introduction

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Ponieważ środki przeciwbakteryjne są powszechnie stosowane do zapobiegania bakteryjnym chorobom zakaźnym, oporność na środki przeciwdrobnoustrojowe (AMR) stała się globalnym problemem zdrowia publicznego1. Zwalczanie oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe jest obecnie główną misją monitorowania oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe patogenów epidemiologicznych oraz synergistycznego leczenia wrażliwymi środkami przeciwdrobnoustrojowymi i bakteriofagami litycznymi2.

Badanie wrażliwości na środki przeciwdrobnoustrojowe in vitro (AST) jest podstawą monitorowania terapii i wykrywania poziomu oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe. Jest to ważna część farmakologii przeciwdrobnoustrojowej i kluczowa podstawa leków klinicznych. Instytut Standardów Klinicznych i Laboratoryjnych (CLSI) Stanów Zjednoczonych oraz Europejski Komitet ds. Badań Wrażliwości na Środki Przeciwdrobnoustrojowe (EUCAST) sformułowały i zrewidowały międzynarodowe kryteria AspAT oraz stale modyfikowały i uzupełniały metody AspAT i wartości graniczne w celu określenia wartości MIC jednej określonej kombinacji "organizm-środek przeciwdrobnoustrojowy" jako wrażliwej (S), opornej (R) lub pośredniej (I)3, 4.

Od 1980 do 1990 roku, automatyczne instrumenty do rozcieńczania mikrobulionu zostały szybko opracowane i zastosowane w praktyce klinicznej, czego przykładami są Alfred 60AST, VITEK System, PHOENIXTM i Cobasbact5,6,7. Jednak instrumenty te były drogie, wymagały kosztownych materiałów eksploatacyjnych, a ich zakresy wykrywania zostały zaprojektowane dla klinicznych leków dla pacjentów5,6,7. Z tych powodów nie nadają się do weterynaryjnych badań klinicznych i wykrywania dużych ilości wysoce odpornych szczepów. W tym badaniu opracowano inteligentny, wysokowydajny system przesiewowy AST/, w tym 96-punktowy inokulator matrycowy (Rysunek 1), konwerter akwizycji obrazu ( Rysunek 2) i odpowiednie oprogramowanie 8, do przeprowadzania AST dla partii szczepów bakterii przeciwko wielu czynnikom przeciwdrobnoustrojowym jednocześnie metodą rozcieńczania agaru. Co więcej, system został również wykorzystany do wykrywania i analizowania wzorców lizy fagów przeciwko bakteriom opornym na środki przeciwdrobnoustrojowe9, a fagi lityczne zostały skutecznie wybrane z biblioteki fagów. Stwierdzono, że system ten jest wydajny, niedrogi i łatwy w obsłudze.

figure-introduction-1
Rysunek 1: Schemat strukturalny 96-punktowego inokulatora matrycowego. 1: Płytka szpilki do szczepienia; 2: Operator komórkowy; 3: Blok nasienny; 4: Inkubowana płytka; 5: Podstawa; 6: Uchwyt operacyjny; 7: Kołek ograniczający. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

figure-introduction-2
Rysunek 2: Schemat strukturalny konwertera akwizycji obrazu. 1: Powłoka; 2: Ekran wyświetlacza; 3: Pomieszczenie do akwizycji obrazu; 4: Podstawa płyty detekcyjnej; 5: Tablica detekcyjna w magazynie i poza nim; 6: Tablica sterownicza; 7: Urządzenie do konwersji akwizycji obrazu; 8: Źródło światła; 9: Skaner obrazu. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Protocol

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Szczepy Salmonelli użyte w tym badaniu zostały pobrane od drobiu w Shandong, Chiny, po uzyskaniu zgody Komitetu ds. Bezpieczeństwa Biologicznego Instytutu Nauk o Zwierzętach i Medycyny Weterynaryjnej, Akademii Nauk Rolniczych Shandong, Chiny.

1. Zastosowanie inteligentnego systemu AST o wysokiej przepustowości8

  1. Przygotowanie inokulum
    1. Inkubować organizm kontroli jakości Escherichia coli i 93 szczepy Salmonella do badania na obecność AspAT na płytkach agarowych Muellera-Hintona (MHA) przez 16-18 godzin w temperaturze 37 °C3.
    2. Przygotuj inokulum każdego szczepu tak, aby odpowiadało normie mętności 0,5 McFarlanda w oparciu o metodę określoną w normie CLSI 3, a następnie rozcieńczyć 10 razy.
    3. Umieścić 200 μl sterylnej normalnej soli fizjologicznej w poziomym basenie 1st basenie (A1) płytki 96-dołkowej jako kontrolę ujemną, dwie zawiesiny organizmu do kontroli jakości w poziomych 2. i 3. dołku (A2 i A3) odpowiednio jako kontrolę dodatnią i kontrolę jakości. Dodać 200 μl rozcieńczonych zawiesin inokulum każdej badanej plamy do odpowiednich 93 dołków w 96-dołkowym bloku nasiennym.
  2. Przygotowanie przeciwbakteryjnej płytki agarowej
    1. Ustaw zakresy stężeń różnych testowanych środków przeciwbakteryjnych zgodnie z zakresem obliczeń wskaźnika Lar (od 0,125R do 8R). Stężenia wahają się od zakresu kontroli jakości lub 0,0625R (w zależności od dolnego zakresu) do 8R.
      UWAGA: Jeśli liczba Lar nie zostanie obliczona, zakres stężeń antybiotyku można ustawić zgodnie z potrzebami AspAT.
    2. Wykonać schemat podwojenia rozcieńczenia log2 dla roztworu antybiotyku, zaczynając od odpowiedniego stężenia podstawowego w oparciu o metodę rozcieńczania agaru określoną w normie CLSI3.
    3. Wysterylizuj szklane butelki o pojemności 50 ml zawierające 18 ml podłoża agarowego Muellera-Hintona. Dodać 2 ml odpowiednich rozcieńczeń roztworu przeciwdrobnoustrojowego do 18 ml stopionej pożywki schłodzonej do temperatury 45-50 °C, dokładnie wymieszać i przelać do płytek w komorze bezpieczeństwa biologicznego.
    4. Pozostawić agar do zestalenia się w temperaturze pokojowej (RT), pozostawić szczelinę pod pokrywką inkubowanych płytek i przedmuchać, aby wysuszyć powierzchnię agaru przed zaszczepieniem.
    5. Oznaczyć rodzaje środków przeciwdrobnoustrojowych i ich stężenia na odwrocie inkubowanych płytek. Ułożyć wiele inkubowanych płytek każdego środka przeciwdrobnoustrojowego w stosie w kolejności log2-podwajającej rozcieńczenie.
    6. Przygotuj dwie wolne od leków płytki agarowe jako kontrole dla każdego środka przeciwdrobnoustrojowego.
  3. Etapy inokulacji dla inokulatora z matrycą 96 punktów
    1. Zamontuj autoklawowaną płytkę szpilki do inokulacji na wsporniku 96-punktowego inokulatora matrycowego w szafie bezpieczeństwa biologicznego.
    2. Przygotowany blok nasienny z przetestowanymi szczepami i płytką inkubowaną z agarem należy umieścić na nośniku ruchomym, z takim samym kątem ustawienia dla dwóch płytek.
    3. Popchnij nośnik mobilny tak, aby blok wysiewu znalazł się bezpośrednio pod płytką kołka do zaszczepiania.
    4. Naciśnij uchwyt roboczy, przesuń płytkę szpilki do zaszczepiania w dół i skieruj 96 kołków do inokuli w 96 dołkach bloku nasiennego.
    5. Zwolnij uchwyt roboczy z elementem sterującym, a następnie zresetuj płytkę kołka zaszczepiającego pod działaniem sprężyny.
    6. Naciśnij uchwyt operacyjny 2-3 razy, aby dobrze wymieszać każdy inokulum i zanurzyć. Popchnąć i przesunąć płytkę nośną tak, aby inkubowana płytka znajdowała się bezpośrednio pod płytką kołka do zaszczepiania.
    7. Naciśnij uchwyt roboczy, przesuń płytkę szpilki do zaszczepiania w dół i zatrzymaj się na 1-2 sekundy, aby kołki do zaszczepiania całkowicie zetknęły się z powierzchnią inkubowanej płytki.
    8. Zwolnij uchwyt roboczy. Na tym kończy się jedna inokulacja. Załóż kolejną inkubowaną płytkę i kontynuuj cykl, aż jedna grupa przeciwdrobnoustrojowych płytek agarowych zostanie zakończona.
    9. Wymień kolejną płytkę szpilki do inokulacji i blok nasienny, a następnie zaszczepij kolejną grupę badanych szczepów. Cykl, aż wszystkie inokulacje zostaną zakończone.
      UWAGA: Najpierw zaszczepij kontrolną płytkę agarową (bez środka przeciwdrobnoustrojowego), następnie płytkę w kolejności stężenia leku od niskiego do wysokiego, a na końcu drugą kontrolną płytkę agarową, aby upewnić się, że nie ma zanieczyszczenia ani przeniesienia środka przeciwdrobnoustrojowego. Objętość zaszczepiania zależy od objętości naturalnego osadzania się każdej szpilki wynoszącej około 2 μl.
  4. Inkubacja przeciwdrobnoustrojowych płytek agarowych
    1. Inkubować zaszczepione przeciwbakteryjne płytki agarowe w temperaturze pokojowej, aż wilgoć z plamek inokulum zostanie wchłonięta przez agar.
    2. Odwrócić płytki i inkubować je przez 16-20 godzin w temperaturze 37 °C dla badanych szczepów, aby upewnić się, że niezahamowane bakterie tworzą kolonie.
  5. Akwizycja obrazów i statystyka danych
    1. Kliknij dwukrotnie system akwizycji obrazu AST z matrycą 96 punktów, aby otworzyć program.
    2. Kliknij Informacje testowe na pasku zadań. Kliknij Nowy, aby utworzyć nowe zadanie testowe i wypełnij informacje zgodnie z podpowiedziami, w tym kod, nazwę, źródło, bakterie, liczbę szczepów, antybiotyki i gradient.
    3. Kliknij Zbieranie danych > Zdjęcie > element testowy, aby wybrać nowo utworzone zadanie. Kliknij Antybiotyki, aby wybrać nazwę antybiotyku, a następnie kliknij Gradient, aby wybrać początkowe stężenie tego antybiotyku.
    4. Kliknij Połącz, aby połączyć się z konwerterem akwizycji obrazu.
    5. Umieść odpowiednie inkubowane płytki na podstawie płytki detekcyjnej z brakującym kątem z prawej strony w celu orientacji i wepchnij do konwertera akwizycji obrazu.
    6. Kliknij Kolekcję, aby uzyskać obrazy. Gradient antybiotyku automatycznie przeskoczy do następnego gradientu. Umieść kolejno następną płytkę i kontynuuj klikanie Kolekcja, aż płytki z tym antybiotykiem zostaną zebrane.
    7. Kliknij Antybiotyki i wybierz następny zestaw inkubowanych płytek. Kliknij Gradient, aby wybrać gradient początkowy i przejść do następnej rundy zbierania obrazów.
    8. Po skompletowaniu wszystkich kolekcji kliknij Prześlij. Program automatycznie rozpozna liczbę białych pikseli sformatowanych w każdym punkcie inokulacji na obrazach, określi, czy dochodzi do tworzenia kolonii i przekonwertuje obrazy na wartości MIC.
    9. Kliknij Zapytanie, aby uzyskać wszystkie wyniki MIC szczepów przeciwko badanym antybiotykom.
      UWAGA: Inteligentny, wysokowydajny system AST nadaje się do określania MIC dużych partii szczepów bakteryjnych. Proces testowania, w tym przygotowanie, inokulacja, inkubacja i odczyt wyników, trwa 3 dni. Rodzaje antybiotyków i zakresy wykrywania MIC można ustawić zgodnie z odpowiednimi potrzebami, a główne materiały eksploatacyjne można ponownie wykorzystać.
  6. Obliczanie wskaźnika Lar
    1. Określ dokładnie indeks gibona za pomocą wzoru: figure-protocol-1, gdzie:
      MICi: minimalne stężenie hamujące.
      Zakres rozkładów MIC od MIC-3 do MIC3 reprezentuje szeregowe podwójne stężenia wyśrodkowane na R: 0,125R, 0,25R, 0,5R, R, 2R, 4R i 8R,
      figure-protocol-2 wynosi 2i, a zakres i wynosi od -3 do 3,
      R: punkty graniczne oporności bakterii na środki przeciwdrobnoustrojowe standaryzowane przez CLSI.
      f: rozkład częstotliwości mikrofonu.
      UWAGA: Ogólny indeks Lar jest średnią arytmetyczną wszystkich indeksów Lar. Po obliczeniu indeksu Lar zaokrąglij końcową wartość do dwóch cyfr znaczących po przecinku dziesiętnym.

2. Inteligentny, wysokowydajny system badań przesiewowych fagów9

  1. Przygotowanie bloku nasiennego faga i dwuwarstwowych płytek inkubacyjnych zawierających bakterie.
    1. Użyj metody dwuwarstwowego agaru10 lub metody hodowli płynnej11 do wytwarzania różnych fagów. Rozcieńczyć do odpowiedniego stężenia równoległego o mianie 1 x 104-5 pfu/ml i dodać 200 μl inokulum fagowego do 96-dołkowego bloku nasiennego.
    2. Wykonać dwuwarstwowe płytki z bakteriami (10 ml dolnego podłoża agarowego [agar 12 g/L] i 6 ml górnej pożywki semiagarowej [6 g/L] ze 100 μl bakterii [0,5 McFarlanda]) do testu.
    3. Wykonaj dwuwarstwową płytkę inkubacyjną dla każdego szczepu, który ma być testowany. Pozostaw szczelinę pod pokrywką dwuwarstwowej płytki i przedmuchaj, aby wysuszyć powierzchnię agaru w komorze bezpieczeństwa biologicznego.
  2. Test przesiewowy
    1. Umieścić przygotowany blok nasienny faga i dwuwarstwową płytkę na ruchomym nośniku 96-punktowego inokulatora matrycowego i przenieść wszystkie inokulatory fagowe na powierzchnię półagarową. Kontynuuj cykle, aż wszystkie badane szczepy zostaną ukończone.
    2. Pozostawić zaszczepione dwuwarstwowe płytki w temperaturze pokojowej, aż wilgoć z plamek inokulum zostanie całkowicie wchłonięta przez pół-agar
      3. .
    3. Odwrócić płytki i inkubować w odpowiednich warunkach dla badanych szczepów przez 4-6 godzin, aby upewnić się, że powstały wyraźne plamy lityczne.
  3. Analizowanie danych
    1. Uzyskaj i zapisz obraz wyniku eksperymentu każdej płytki dwuwarstwowej za pomocą konwertera akwizycji obrazu (kroki 1.5.4-1.5.6).
    2. Zapisz liczbę i morfologie różnych kształtów plam w arkuszu kalkulacyjnym na podstawie uzyskanych obrazów i oblicz odpowiednie proporcje różnych rodzajów fagów.

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Results

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Zgodnie z protokołem inteligentnego systemu AST o wysokiej przepustowości, jego zastosowanie zostało zilustrowane na przykładzie Salmonelli z drobiu w Shandong w Chinach.

Wzrost szczepów Salmonelli na płytkach agarowych z ampicyliną (R 32 μg/ml) w stężeniach od 2 do 256 μg/ml określonych przez konwerter akwizycji obrazu jest pokazany w Rysunek 3. Pozioma1 studzienka A1 stanowiła kontrolę ujemną i nie wykazywała wzrostu kolonii; A2 i A3 były szcz...

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Discussion

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Metoda rozcieńczania agaru jest dobrze ugruntowana i szeroko stosowana. Zasada działania wysokoprzepustowego systemu AST była zgodna z metodą rozcieńczania agaru. Jednym z kluczowych etapów w ramach protokołu był dokładny, wysokowydajny transfer 96 inokulantów za jednym razem, który wykonywano wiele razy z rzędu. Aby wykonać ten krytyczny krok, piny 96-punktowego inokulatora matrycowego były jednolite i bardzo gładkie. Naturalnym osadzaniem się każdej szpilki była objętość około 2 μl, która agregowała się w małe kropelki...

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Disclosures

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Yuqing Liu i in. złożyli chińskie patenty na 96-punktowy inokulator matrycowy i konwerter akwizycji obrazu oraz ich zastosowania (numer patentu ZL 201610942866.3 i numer patentu ZL 201910968255.X).

Acknowledgements

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Ta praca była wspierana przez Narodowy Kluczowy Projekt Badawczo-Rozwojowy (2019YFA0904003); Nowoczesny system rolno-przemysłowy w prowincji Shandong (SDAIT-011-09); Projekt Optymalizacji Platformy Współpracy Międzynarodowej (CXGC2023G15); Główne zadania innowacyjne w dziedzinie nauk rolniczych i technologii innowacyjnego projektu Akademii Nauk Rolniczych w Shandong, Chiny (CXGC2023G03).

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
96 dobrze  płytka hodowlanaPekin lanjieke Technology Co., Ltd11510
96-punktowy system akwizycji obrazu AST z matrycąNauk o Zwierzętach i Medycynie Weterynaryjnej, Akademia Nauk Rolniczych w ShandongAutorskie oprogramowanie Prawa autorskie
96-punktowy inokulator matrycowy Instytut Nauk o Zwierzętach i Medycyny Weterynaryjnej, Shandong Academy of Agricultural SciencesN/AOpatentowany produkt
AgarQingdao hi tech Park Przemysłowy Haibo Biotechnology Co., LtdHB8274-1
Amikacin Shanghai McLean Biochemical Technology Co., LtdA857053
AmoksycylinaShanghai McLean Biochemical Technology Co., LtdA822839
AmpicillinShanghai McLean Biochemical Technology Co., LtdA830931
Waga analitycznaSartoriusBSA224S
Automatyczne oprogramowanie obliczeniowe dla indeksu Lar oporności na środki przeciwdrobnoustrojoweInstytut Nauk o Zwierzętach i Medycyny Weterynaryjnej, Akademia Nauk Rolniczych w ShandongAutorskie prawa autorskie
Bakterie Salmonella strainsInstytut Nauk o Zwierzętach i Medycynie Weterynaryjnej, Shandong Academy of Agricultural SciencesN/APochodzenie zwierzęce
Oporność na bakterie System zarządzania certyfikacją indeksu Lar V1.0Instytut Nauk o Zwierzętach i Medycyny Weterynaryjnej, Akademia Nauk Rolniczych w ShandongAutorskie prawa autorskie
CeftiofurShanghai McLean Biochemical Technology Co., LtdC873619
CiprofloxacinShanghai McLean Biochemical Technology Co., LtdC824343
Kwas klawulanowyShanghai McLean Biochemical Technology Co., LtdC824181
Czysty stół roboczySprzęt do oczyszczania Suzhou Co., LtdSW-CJ-2D Siarczan
kolistynyShanghai McLean Biochemical Technology Co., LtdC805491
Płytka hodowlanaInstytut Nauk o Zwierzętach i Medycyny Weterynaryjnej, Akademia Nauk Rolniczych w ShandongNie dotyczyOpatentowany produkt
DoksycyklinaShanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd
EnrofloksacynaShanghai McLean Biochemical Technology Co., LtdE809130
Filtr 0,22 i mu; mMilliporeSLGP033RB
FlorfenicolShanghai McLean Biochemical Technology Co., LtdF809685
GentamycynaShanghai McLean Biochemical Technology Co., LtdG810322
Szklana butelka 50 mlXuzhou Qianxing Glass Technology Co., LtdQX-7
detekcji rezystancji o wysokiej przepustowości V1.0Instytut Nauk o Zwierzętach i Medycyny Weterynaryjnej, Akademia Nauk Rolniczych w ShandongAutorskie prawa autorskie
Konwerter akwizycji obrazuInstytut Nauk o Zwierzętach i Medycyny Weterynaryjnej, Shandong Academy of Agricultural SciencesNie dotyczyOpatentowany produkt
MeropenemShanghai McLean Biochemical Technology Co., LtdM861173
AgarMueller-HintonQingdao hi tech Park przemysłowy Haibo Biotechnology Co., LtdHB6232
szalka Petriego 60 mm x 15 mmQingdao Jindian sprzęt biochemiczny Co., Ltd16021-1
szalka Petriego 90 mm x 15 mmQingdao Jindian biochemical equipment Co., Ltd16001-1
Salmonella fagiInstytut Nauk o Zwierzętach i Medycynie Weterynaryjnej, Akademia Nauk Rolniczych w ShandongNie dotyczy
inkubatora wytrząsarkiShanghai Minquan Instrument Co., LtdMQD-S2R
TurbidymetrShanghai XingBai Biotechnology Co., LtdF-TC2015
biblioteczny Varms V1.0Instytut Nauk o Zwierzętach i Medycynie Weterynaryjnej, Akademia Nauk Rolniczych w ShandongPrawa
Pionowa para wysokociśnieniowa sterylizatorSzanghaj Fabryka instrumentów medycznych Shen'anLDZX-75L
System zarządzania testami odporności na patogenyweterynaryjne Instytut Nauk o Zwierzętach i Medycynie Weterynaryjnej, Akademia Nauk Rolniczych w ShandongAutorskie prawa autorskie
Platforma monitorowania chmur odporności weterynaryjnej i kontroli fagów V1.0Instytut Nauk o Zwierzętach i Medycyny Weterynaryjnej, Akademia Nauk Rolniczych w ShandongAutorskie prawa autorskie
Instytut do oprogramowaniado oprogramowaniaD832390 System do oprogramowania System autorskie do oprogramowania do oprogramowania do oprogramowania

References

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Ramanan, L., et al. Antimicrobial resistance-the need for global solutions. The Lancet Infectious Diseases. 13 (12), 1057-1098 (2013).
  2. Xiaonan, Z., Qing, Z., Thomas, S. P., Yuqing, L., Martha, R. J. C. inPhocus: Perspectives of the application of bacteriophages in poultry and aquaculture industries based on Varms in China. PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 2 (2), 69-74 (2021).
  3. CLSI. Performance Standards for Antimicrobial Disk Susceptibility Tests. CLSI document M100. , M100 32nd edition, Clinical and Laboratory Standards Institute, Wayne, PA . (2022).
  4. Yuqing, L., et al. Antimicrobial Sensitivity Testing Standard of EUCAST. , China Standards Press, Beijing. (2017).
  5. Barnini, S., et al. A new rapid method for direct antimicrobial susceptibility testing of bacteria from positive blood cultures. BMC Microbiology. 16 (1), 185-192 (2016).
  6. Höring, S., Massarani, A. S., Löffler, B., Rödel, J. Rapid antimicrobial susceptibility testing in blood culture diagnostics performed by direct inoculation using the VITEK®-2 and BD PhoenixTM platforms. European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. 38 (3), 471-478 (2019).
  7. Dupuis, G. Evaluation of the Cobasbact automated antimicrobial susceptibility testing system. European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. 4 (2), 119-122 (1985).
  8. A system of bacterial antimicrobial resistance detection and its operation method. China Patent. , ZL 201610942866.3 (2019).
  9. A high throughput test plate for screening bacteriophage of zoonotic pathogens and its application. China Patent. , ZL 201910968255.X (2022).
  10. Adams, M. H. Bacteriophages. , Interscience Publishers, New York. (1959).
  11. Nair, A., Ghugare, G. S., Khairnar, K. An appraisal of bacteriophage isolation techniques from environment. Microbial Ecology. 83 (3), 519-535 (2022).
  12. Shandong veterinary antibiotic resistance system. , http://www.varms.cn (2023).
  13. Ming, H., et al. Comparison of the results of 96-dot agar dilution method and broth microdilution method. Chinese Journal of Antibiotics. 43 (6), 729-733 (2018).
  14. Laxminarayan, R., Klugman, K. P. Communicating trends in resistance using a drug resistance index. BMJ Open. 1 (2), e000135(2011).
  15. Chen, Y., et al. Assessing antibiotic therapy effectiveness against the major bacterial pathogens in a hospital using an integrated index. Future Microbiology. 12, 853-866 (2017).
  16. Ciccolini, M., Spoorenberg, V., Geerlings, S. E., Prins, J. M., Grundmann, H. Using an index-based approach to assess the population-level appropriateness of empirical antibiotic therapy. Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 70 (1), 286-293 (2015).
  17. Yanbo, L., et al. Preliminary application of inoculation system for high-throughput drug susceptibility test. China Poultry. 42 (6), 52-57 (2020).

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Tags

Antimicrobial Sensitivity TestingPhage ScreeningHigh Throughput SystemLar IndexAntimicrobial ResistanceMinimum Inhibitory ConcentrationSalmonella Strains96 Dot MatrixImage AcquisitionDouble Layer Agar

Related Articles