W przypadku roślin kwitnących bardzo wczesne etapy rozmnażania płciowego są prawdopodobnie najważniejsze. Na poziomie interakcji pyłek – znamię podejmowane są decyzje molekularne, które określają "zgodność" oddziałujących partnerów. Takie decyzje, jeśli są podejmowane prawidłowo, pozwalają uniknąć marnotrawstwa zasobów, które mogłyby mieć wpływ na sprawność reprodukcyjną21. Tak więc, pozwolenie tylko zgodnemu pyłkowi na zapłodnienie jest jednym z ważnych elementów utrzymania dobrze przystosowanych genotypów, a tym samym ewolucyjnego sukcesu gatunków. Badania przeprowadzone na roślinie modelowej A. thaliana były niezwykle cenne dla pogłębienia naszego zrozumienia tego procesu. Szereg badań przeprowadzonych w ciągu ostatnich kilku dekad ujawniło obecność czynników w okrywie pyłkowej, które działają w pierwszym "punkcie kontrolnym" zgodności, w którym pyłek uzyskuje dostęp do wody stygmatycznej, aby umożliwić nawodnienie pyłku13. Pomimo tych pierwszych spostrzeżeń na temat mechanizmów regulujących zgodność znamion pyłku, nadal istnieje wiele luk w naszym zrozumieniu tego procesu. Do tej pory żadne mutanty ligandów przenoszonych przez pyłek ani receptorów stygmatycznych wpływających na uwodnienie pyłku nie mogą całkowicie zablokować kompatybilnego zapylenia, co sugeruje obecność innych nieodkrytych determinantów uwodnienia pyłku. Dzięki możliwości łatwej obserwacji interesującego nas fenotypu, opisany tutaj test biologiczny uwodnienia pyłku jest jedną z najprostszych technik badania potencjalnych mutantów regulujących zapylanie.
Istniejące metodologie pomiaru nawodnienia pyłku często wykorzystują zapylenia masowe i podają mniej punktów czasowych 14,22,23, a zatem mogą pomijać ważne subtelne fenotypy profilu nawodnienia. Na przykład badanie przeprowadzone przez Wang i wsp.13, wraz z pracami nad innymi mutantami białek płaszcza pyłkowego w naszym laboratorium (niepublikowane obserwacje), ujawniło intrygujące różnice w profilach nawodnienia między mutantami. Takie subtelne różnice mogą stanowić ważne wskazówki dotyczące mechanizmów regulacyjnych leżących u podstaw zgodnego zapylania.
Opisana tutaj metoda koncentruje się na pozyskiwaniu stosunkowo niewielkiej liczby pomiarów między liniami roślin ze mutantami a WT, z naciskiem na precyzję metodologiczną w celu zmniejszenia zmienności w zbiorach danych. Chociaż metoda ta jest wysoce powtarzalna (jak pokazano na rysunku 7), zakładając, że temperatura i wilgotność są odpowiednio kontrolowane, ważne jest zebranie danych dotyczących nawodnienia dla prawie równej liczby WT i zmutowanego pyłku w tym samym dniu, aby jeszcze bardziej zmniejszyć potencjał zmienności. W razie potrzeby dane można następnie łączyć z różnych dni. Ponadto wybór odpowiednich roślin kontrolnych WT ma kluczowe znaczenie dla prawidłowej interpretacji wyników nawodnienia. W przypadku biorcy pyłku ta sama linia roślin powinna być używana do otrzymywania zarówno ziaren pyłku WT, jak i zmutowanych.
Na przykład, używamy męskiej sterylnej linii roślinnej pA9-barnazy, która jest również przedstawiona w protokole wideo, jako biorcy pyłku zarówno dla WT (kontrolnego), jak i zmutowanego (eksperymentalnego) pyłku podczas badania zmutowanych linii pyłku T-DNA (takich jak mutant "KD" opisany na rycinie 8). Należy unikać mieszania danych z takiej męskiej sterylnej linii, które nie muszą być wykastrowane, z danymi zebranymi z ręcznie wykastrowanej linii kontrolnej, ponieważ te stygmaty prawdopodobnie będą zachowywać się inaczej. Podobnie, wykastrowane linie mutantów powinny być używane w połączeniu z wykastrowaną linią WT (kontrolną), gdy tylko jest to możliwe. Taką samą ostrożność należy zachować również przy rozważaniu tła genetycznego badanych roślin. Podczas gdy najpopularniejsze kolekcje mutantów T-DNA zostały wygenerowane na tle Col-0, inne, takie jak kolekcja FLAG z Institut national de la Recherche Agronomique (INRA), są dostępne w tle genetycznym Wassilewskija (WS)24,25. W takich przypadkach zaleca się użycie linii instalacji WT danego ekotypu jako elementów sterujących.
Chociaż tutaj skupiliśmy się na uwodnieniu pyłku w ciągu pierwszych 10 minut interakcji pyłek i znamię, metodę tę można również dostosować do profili nawodnienia, które obejmują dłuższy okres czasu. Kluczową cechą protokołu jest to, że kwiaty pozostają przyczepione do rośliny macierzystej – opublikowane protokoły zazwyczaj wymagają wycięcia słupka i umieszczenia w pożywce w celu podtrzymania tkanki na czas trwania eksperymentu 14,18,26. Chociaż nie ma bezpośrednich dowodów sugerujących, że takie podejście częściowo in vivo wpływa na uwodnienie pyłku lub rzeczywiście zmienia regulację tego procesu in vivo, można sobie wyobrazić, że wycięcie kwiatów z rośliny rodzicielskiej może mieć wpływ na zapylanie. W ten sposób protokół ten zapewnia prawdziwe środowisko in vivo do badania interakcji pyłek i znamię, w którym zachowana jest integralność strukturalna rośliny.
Przenoszenie pojedynczych ziaren pyłku do "dziewiczych" brodawek stygmatycznych jest prawdopodobnie jedną z najtrudniejszych operacji opisanych w tym protokole. Nierzadko zdarza się, że skupiska ziaren pyłku są przenoszone w wyniku błędu. Jednak prawdopodobieństwo wystąpienia tego zjawiska można znacznie zmniejszyć, upewniając się, że na kleszczach znajduje się tylko jedna warstwa pyłku (ryc. 3A) (lub nawet tylko pojedyncze ziarno pyłku; Ryc. 5) i/lub wykorzystując ziarna pyłku, które są już zorientowane w taki sposób, że "wystają" z innych na czubku kleszczy. Odkryliśmy, że doświadczony operator może z powodzeniem zakończyć transfer pojedynczego pyłku do komórki brodawki stygmatycznej w ciągu około 3 minut i zarejestrować dane dla maksymalnie pięciu ziaren pyłku w ciągu 1 godziny. W ten sposób w ciągu 2-4 dni można zgromadzić wystarczającą ilość danych do miarodajnej analizy statystycznej badanych linii roślin.
Błąd ludzki jest potencjalnie największym źródłem zmienności w analizie zestawów danych pochodzących z badań wykorzystujących ten protokół. Na przykład definicja "granicy pyłku" podczas analizy obrazu sprowadza się do oceny indywidualnego badacza. W związku z tym istnieje możliwość, że pomiary wykonane przez różnych badaczy, nawet na tym samym zbiorze danych, mogą generować różnice. Tam, gdzie to możliwe, pojedynczy badacz powinien przeprowadzać pomiary, aby zminimalizować błędy próbkowania. Ponadto sprzężenie analizy zbiorów danych dotyczących WT i mutantów przez tego samego operatora neguje potencjalnie subiektywną definicję "granicy pyłku" i zmienności międzyoperatorskiej.
Podsumowując, opisano wyrafinowaną, ale dokładną metodę pomiaru profili uwodnienia pyłku w organizmie modelowym A. thaliana . Wykazaliśmy, że wykorzystując ten protokół, można łatwo uzyskać wysoce spójne dane dotyczące nawodnienia pyłku dla A. thaliana . Trzy niezależne partie danych dotyczących zapyleń WT uzyskanych w różnych dniach wykazały stałe małe odchylenia wynoszące <3% we wszystkich punktach czasowych (Rysunek 7 i Tabela Uzupełniająca S1). Chociaż przedstawiony tutaj test biologiczny jest nieco bardziej złożony niż większość istniejących protokołów, rozdzielczość generowanych danych jest lepsza i odpowiednia do identyfikacji i charakterystyki nowych mutantów, które wpływają na szlaki regulujące kompatybilne zapylanie.