Prezentowany tutaj jest skuteczny protokół szybkiej perfuzji krwi do przygotowania próbek tkanek od afrykańskich żab szponiastych do badań transkryptomicznych i proteomicznych.
Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.
Artykuł metodologiczny
Prezentowany tutaj jest skuteczny protokół szybkiej perfuzji krwi do przygotowania próbek tkanek od afrykańskich żab szponiastych do badań transkryptomicznych i proteomicznych.
Xenopus od ponad 100 lat są potężnymi organizmami modelowymi do zrozumienia rozwoju i chorób kręgowców. W tym miejscu zdefiniowano protokół szybkiej perfuzji krwi w Xenopus, mający na celu konsekwentne i drastyczne zmniejszenie ilości krwi we wszystkich tkankach. Perfuzję przeprowadza się poprzez włożenie igły bezpośrednio do komory serca i pompowanie heparynizowanego roztworu soli fizjologicznej buforowanej fosforanem (PBS) przez układ naczyniowy. Zabieg można wykonać w około 10 minut na zwierzę. Krew jest zdominowana przez kilka bardzo obfitych białek i typów komórek, co powoduje liczne problemy, ponieważ białka te maskują większość innych cząsteczek i typów komórek. Powtarzalna charakterystyka dorosłych tkanek Xenopus za pomocą proteomiki ilościowej i transkryptomiki pojedynczych komórek przyniesie korzyści dzięki zastosowaniu tego protokołu przed pobraniem próbek narządów. Protokoły pobierania próbek tkanek są określone w dokumentach towarzyszących. Procedury te mają na celu standaryzację praktyk stosowanych w Xenopus dla osób różnej płci, wieku i stanu zdrowia, w szczególności X. laevis i X. tropicalis.
Perfuzja całego ciała jest rutynowo wykonywana w celu zachowania i utrwalenia1,2,3,4,5,6. Procedury te odbywają się jednak w tempie, które ogranicza liczbę świeżych próbek, które można pobrać na zwierzę. Celem tej pracy jest opracowanie skutecznego protokołu perfuzji krwi w Xenopus, przy czym priorytetem jest szybkość techniki. Protokół zajmuje mniej niż 10 minut na zwierzę w przypadku X. tropicalis i mniej niż 15 minut na zwierzę X. laevis. Drugorzędnymi priorytetami są łatwość replikacji i wykorzystanie łatwo dostępnego sprzętu, tak aby wysokiej jakości próbki mogły być szeroko udostępniane między laboratoriami Xenopus.
Żaby Xenopus są szeroko wykorzystywane w badaniach biomedycznych do badania podstawowych procesów biologicznych i patologicznych zachodzących u różnych gatunków. Ten czworonóg ma bliższe ewolucyjne pokrewieństwo ze ssakami niż inne modele wodne, ma płuca, trójkomorowe serce i kończyny z palcami. Społeczność międzynarodowa skutecznie wykorzystuje Xenopus do głębszego zrozumienia chorób u ludzi poprzez dogłębne modelowanie chorób i analizę molekularną funkcji genów związanych z chorobą. Liczne zalety Xenopus jako modelu zwierzęcego sprawiają, że są one nieocenionymi narzędziami do badania molekularnych podstaw rozwoju i chorób człowieka; Do zalet tych należą: duży rozmiar oocytów i zarodków, wysoka płodność, łatwość utrzymania, szybki rozwój zewnętrzny i łatwość manipulacji genomem. Szacuje się, że Xenopus ma ~80% zidentyfikowanych genów chorób u ludzi7.
W porównaniu do popularnych modeli ssaków, Xenopus jest szybkim, opłacalnym modelem, z łatwością eliminacji morfolino i dostępnością wydajnych transgeników i ukierunkowanych mutacji genów za pomocą CRISPR8. Ilościowa spektrometria mas i transkryptomika pojedynczych komórek zostały z powodzeniem zastosowane do zarodków Xenopus9,10, ale niedawny atlas komórek z Xenopus laevis pokazuje, że skład większości tkanek jest zdominowany przez typy komórek krwi11. Dzięki opracowaniu techniki, która wykrwawia tkankę w szybkim tempie i użyciu schłodzonych pożywek, perfuzja ma minimalny wpływ na świeżość próbki. Jest to szczególnie ważne w zastosowaniach, w których celem jest profilowanie fizjologicznie niezakłóconej ekspresji mRNA lub białka.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Wszystkie eksperymenty zostały przeprowadzone zgodnie z zasadami i przepisami Harvard Medical School IACUC (Institutional Animal Care and Use Committee) (IS 00001365_3).
UWAGA: Chociaż opisana podstawowa metoda eutanazji jest uważana za akceptowalną technikę eutanazji przez Amerykańskie Stowarzyszenie Lekarzy Weterynaryjnych12, nie stwierdzono, aby prowadziła do ustania bicia serca13. Nie zapobiega temu nawet często stosowana wtórna metoda podwójnego wbijania, podobnie jak usunięcie serca ze zwierzęcia. Wykrwawienie znieczulonych zwierząt jest uważane za humanitarną i skuteczną metodę udanej eutanazji12. Ponieważ utrzymanie świeżych tkanek poprzez eutanazję jest celem tego protokołu, korzystne jest, aby serce nadal biło przez pierwotną eutanazję z MS-222, a perfuzja sama w sobie jest wtórną metodą eutanazji poprzez wykrwawienie.
1. Przygotowanie
2. Perfuzja
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Po pomyślnej perfuzji wszystkie tkanki (z wyjątkiem wątroby u pigmentowanych Xenopus) będą wyraźnie jaśniejsze i mniej nasycone krwią. Główne naczynia krwionośne staną się mniej widoczne (Rysunek 10), a tkanki (z wyjątkiem wątroby) będą wypłukiwać się czysto w buforze po pobraniu próbek. Choć pomyślne wykonanie protokołu można ostatecznie potwierdzić jedynie na podstawie jakości danych z próbek tkanek odkrwawionych, w tabeli rozwiązywania problemów (Tabela 1 oraz
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Protokół ten opisuje tradycyjne techniki preparacji w celu uzyskania dostępu do jamy celomicznej. Inne techniki są również dopuszczalne, pod warunkiem, że powodują minimalne uszkodzenia tkanek, serce jest dostępne, a płuca i żołądek są widoczne. Podobnie, większość wymienionych narzędzi preparacyjnych można łatwo zastąpić porównywalnymi przedmiotami.
Chociaż podjęto próby optymalizacji skuteczności tej procedury, wyniki mogą się różnić w zależności od doświadczenia i zmienności między poszczeg...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Autorzy deklarują brak sprzecznych interesów.
Ta praca była wspierana przez OD031956 grantowe NIH OD R24 i HD073104 grantowe NICHD R01. Dziękujemy Darcy Kelly za pomocne dyskusje i wstępny wkład w ten protokół. Chcielibyśmy również podziękować Samancie Jalbert, Jill Ralston i Wilowi Ratzanowi za ich pomoc i wsparcie, a także naszym trzem anonimowym recenzentom za ich opinie.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| 5x Szkło powiększające z oświetleniem LED i podstawą | amazon.com | B08QJ6J8P1 światło nie może wytwarzać ciepła | |
| Jednorazowe pipety przesyłowe | VWR | em>414004-036 | |
| Kleszcze preparacyjne drobno spiczaste | Fisher Scinetific | 08-875 | |
| Nożyczki preparacyjne ostre, proste 6,5" | VWR | 76457-374 | |
| Taca preparcyjna | Fisher Scinetific | 14-370-284 | arkusze styropianu są akceptowalną alternatywą |
| pojemnik do eutanazji | US Plastic | Item 2860 | alternatywnych nieprzezroczystych pojemników dopuszczalne |
| pokrywy pojemnika do eutanazji | US Plastic | Item 3047 | |
| Drobne szpilki preparacyjne | Living Systems Oprzyrządowanie | PIN-#3 | |
| Igły podskórne ogólnego zastosowania, 22 G | Fisher Scientific | 14-826-5A | do X. laevis |
| Igły podskórne ogólnego zastosowania, 25 G | Fisher Scientific | 14-826AA | do X. tropicalis |
| Heparyna, błona | śluzowa jelit świńNożyczki | 37-505-410MG | |
| 6" | vwr | 470018-938 | nożyczki do irysów są akceptowalną alternatywą |
| Adapter Luer-to-Barb męski Luer z pierścieniem blokującym | amazon.com B09PTX6M2Z | rozmiar będzie zależał od węża używanej pompy | |
| Uchwyt na igły Mayo-Hegar | Fisher Scinetific | 08-966 | są akceptowalną alternatywą |
| MS-222: Syncaina (dawniej trikaina) | Pentair AES | TRS1 | |
| PBS 1x | Corning | 21-040-CV | |
| Perystaltyczna pompa dozująca ciecz 5– 100 ml/min | amazon.com | B07PWY4SM6 | dowolna pompa perystaltyczna zdolna do pompowania 5-10 ml / min jest dopuszczalna |
| Kamień do ostrzenia | VWR | 470150-112 | opcjonalnie; do matowienia igieł |
| Wodorowęglan sodu, proszek, USP | Fisher Scientific | 18-606-333 | |
| Kleszczyki do próbek, ząbkowane | VWR | 82027-442 | |
| Kołki teowe do preparowania | Fisher Scinetific | S99385 | |
| Ultracienkie krótkie strzykawki insulinowe, 31 G | VWR | BD328438 | |
| Przecinaki do drutu, 6-calowe ultra ostre i mocne boczne maszynki do strzyżenia | amazon.com B087P191LP |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.