UWAGA: Schemat postępowania dla tej metody przedstawiono na Rysunku 1.

Rysunek 1Etapy zoptymalizowanego protokołu inokulacji z wykorzystaniem odseparowanych pochw liści kukurydzy. Przygotowanie zawiesiny zarodników, inokulacja pochwy liściowej oraz przygotowanie próbek do mikroskopii żywych komórek zostały zaznaczone na zielono (A), fioletowy (B), i pomarańczowy (C) pola, odpowiednio. Utworzone przy użyciu BioRender.com. Prosimy o kliknięcie tutaj, aby wyświetlić większą wersję tej figury.
1. Materiał roślinny i grzybowy
- Wzrost roślin
- Hoduj siewki kukurydzy (patrz Tabela materiałów) w szklarni (14 h światła/27 °C i 10 h ciemności/2 °C) w pojemnikach SC10 (patrz Tabela materiałów). Jako podłoże wzrostowe stosuj mieszankę składającą się z trzech części komercyjnej ziemi doniczkowej (patrz Tabela materiałów) i dwóch części sterylizowanej parowo ziemi wierzchniej.
- Podlewaj siewki przez 2 min za pomocą systemu nawadniania nadziemnego raz dziennie, rano.
- Zabierz siewki w stadium V2, odcinając je na poziomie gleby. Stadium wzrostu V2 jest osiągane, gdy siewki mają od 5 do 10 cm wysokości i posiadają dwa widoczne liście kołnierzykowe21.
- Zawiń rośliny w wilgotny ręcznik papierowy i umieść je w plastikowej torbie w celu transportu do laboratorium do dalszej obróbki.
- Kultury grzybowe
- Reaktywuj przechowywane w krzemionce kultury zapasowe grzybów w warunkach aseptycznych2, rozsypując około 50 granulek zakażonej krzemionki na odpowiednią pożywkę agarową. Aby uniknąć zmian morfologicznych i utraty patogenności, przeprowadzaj pasaż szczepów nie więcej niż 3 razy po reaktywacji. Do hodowli C. graminicola rutynowo stosuje się agar ziemniaczany z glukozą (PDA; patrz Tabela materiałów), natomiast do S. maydis stosuje się agar owsiany (OA; patrz Tabela materiałów).
- Aby przygotować PDA do hodowli zapasów grzybowych, zawieś 19,5 g komercyjnie przygotowanego liofilizowanego PDA w 50 mL wody dejonizowanej (DI). Aby przygotować OA, gotuj 36 g komercyjnie przygotowanego liofilizowanego OA w wodzie DI przez 15-30 min, przefiltruj przez trzy warstwy gazy i uzupełnij filtrat wodą DI do objętości 50 mL. Pożywki wysterylizuj w autoklawie.
- W przypadku pracy ze szczepami transformantami, wzbogacić stopione, schłodzone pożywki o odpowiedni antybiotyk (np. hygromycinę B, genetycynę). Końcowe stężenia hygromycyny lub genetycyny w 50 mL pożywki wynoszą odpowiednio 250 µg/mL i 10 µg/mL.
- Inkubuj kultury w optymalnych warunkach do momentu wykształcenia się sporulującej grzybni. Colletotrichum graminicola i S. maydis rosną dobrze w temperaturze 23 °C przy ciągłym świetle fluorescencyjnym i naturalnej wilgotności powietrza. Sporulacja następuje w 7 dniu po inokulacji (dai) dla S. maydis lub w 14 dai dla C. graminicola.
2. Inokulacje pochwy liściowej
- Montaż jednostki filtra z wełny szklanej
- Używając nożyc do ciężkich prac lub sekatora, odciąć nakrętkę oraz około 0,5 mm z konicznego dna probówki do mikrocentryfugi o pojemności 1,5 mL (patrz Tabela materiałów).
- Umieścić kawałek wełny szklanej (około 0,5 cm x 0,5 cm; patrz Tabela materiałów) wewnątrz odciętej probówki tak, aby zakrywał otwór centralny, jak pokazano na Rysunku 2.
- Podczas cięcia wełny szklanej należy nosić rękawice, ponieważ szkło borokrzemianowe może powodować podrażnienia.
- Przygotowanie statywów wspierających pochewki liściowe
- Rozciąć płytkę PCR z 96 dołkami bez obramowania (patrz Tabela materiałów) na sześć dwukolumnowych statywów wspierających (8 x 2 dołki), jak pokazano na Rysunku 3A.
- Odwrócić dwukolumnowe statywy tak, aby koniczne dna dołków były skierowane do góry, a płaskie góry do dołu (Rysunek 3B).
- Umieścić każdy statyw w szklanej płytce Petri zawierającej zwilżony papier filtracyjny i przykryć ją pokrywką (patrz Tabela materiałów). Jednostka ta pełni funkcję małej komory wilgotności dla pochewek.
- Przygotowanie inokulum
- Dla każdego szczepu grzyba umieścić jedną zmontowaną jednostkę filtra z wełny szklanej w nienaruszonej sterylnej probówce do mikrocentryfugi o pojemności 1,5 mL, jak pokazano na Rysunku 2. Ta druga pełni funkcję probówki zbiorczej.
- Opisać probówki.
- Zebrać konidia z kultur sporulujących, najpierw zalewając każdą płytkę 3-4 mL sterylnej wody DI. W niektórych przypadkach może być potrzebne więcej wody, aby wytworzyć warstwę cieczy na powierzchni kolonii. W tym systemie środki zwilżające nie są konieczne.
- Oddzielić zarodniki od agaru, używając sterylnego tłuczka z koniczną końcówką (patrz Tabela materiałów), aby równomiernie zeskrobać je z całej płytki.
- Aseptycznie nanieść 1 mL zawiesiny zarodników na jednostkę filtra z wełny szklanej i pozwolić zarodnikom spłynąć grawitacyjnie do probówki zbiorczej.
- Centryfugować probówki zbiorcze zawierające przefiltrowane zawiesiny zarodników przy 3 50 x g przez 5 min. Zarodniki powinny utworzyć osad na dnie probówki do mikrocentryfugi.
UWAGA: Centryfugowanie zarodników C. graminicola przy prędkościach wyższych niż zalecane skutkuje znaczną utratą żywotności.
- Odlać ciecz do autoklawowalnego pojemnika, dodać 1 mL sterylnej wody DI i delikatnie wymieszać, aby resuspendować osad zarodników. Centryfugować zgodnie z krokiem 2.3.6.
- Przemyć zarodniki 3x, aby usunąć jakąkolwiek macierz konidialną, która może zawierać autoinhibitory ograniczające kiełkowanie lub penetrację.
- Po trzecim przemyciu dodać 300-50 µL sterylnej wody DI, aby resuspendować zarodniki do kwantyfikacji.
- Użyć hemocytometru pod mikroskopem złożonym przy powiększeniu 100x, aby określić stężenie zarodników. Barwienie zarodników przed liczeniem nie jest konieczne.
- Przygotować zawiesinę o stężeniu 5 x 105 zarodników/mL przy użyciu sterylnej wody DI.
UWAGA: Zawiesinę zarodników C. graminicola można przechowywać w temperaturze pokojowej nie dłużej niż przez 4 h przed gwałtowną utratą żywotności. Chłodzenie konidiów nie zwiększa ich żywotności.
- Inokulacja pochewek
- Przed inokulacją roślin szczepami grzybów sprawdzić odpowiednie praktyki i procedury bezpieczeństwa biologicznego.
- Usunąć pochewkę z pierwszego prawdziwego liścia siewek V2, przesuwając paznokciem wzdłuż nakładającego się brzegu pochewki i delikatnie oddzielając ją od pędu. Przed próbą usunięcia należy poluzować pochewkę z obu stron pędu.
- Przeciąć odzyskane pochewki liściowe na segmenty o długości 3-5 cm. Przed inokulacją nie jest konieczna dezynfekcja powierzchniowa pochewek.
- Bardzo delikatnie rozwinąć każdy segment, aby odsłonić wewnętrzną (adaksjalną) warstwę epidermy.
- Podczas przygotowywania pochewek do inokulacji, pozostałe wycięte pochewki należy trzymać owinięte w wilgotny ręcznik papierowy, aby uniknąć wysychania.
- Nanieść 20 µL zawiesiny zarodników grzyba na powierzchnię wewnętrzną w centrum fragmentu pochewki, bezpośrednio nad żyłką środkową, jak pokazano na Rysunku 4.
- Umieścić zinokulowane pochewki liściowe poziomo, z żyłką środkową u dołu, w statywie wewnątrz szklanej płytki Petri zawierającej zwilżony papier filtracyjny, jak pokazano na Rysunku 5.
- Każdy statyw mieści do siedmiu pochewek. Zinokulować co najmniej pięć pochewek na szczep, aby zrekompensować utratę powtórzeń, która może wystąpić podczas przygotowania próbek lub inkubacji.
- Umieścić małe komory wilgotności w przezroczystym pudełku do przechowywania wyłożonym zwilżonym papierem do kiełkowania (patrz Tabela materiałów).
- Przykryć pudełko pokrywką. Inkubować pudełko w temperaturze 23 °C przy ciągłym oświetleniu przez zamierzony czas, który zależy od gatunku grzyba i obserwowanych stadiów jego rozwoju. Podsumowanie przebiegu czasowego dla pochewek kukurydzy zinokulowanych C. graminicola znajduje się w Tabeli 1.
- Codziennie sprawdzać pochewki pod kątem oznak/objawów choroby i utrzymywać wilgoć papieru do kiełkowania oraz papieru filtracyjnego. Pochewki liściowe mogą być utrzymywane do 6 dni bez widocznej śmierci komórek roślinnych lub degradacji w przypadku braku inokulacji.

Rysunek 2Przygotowanie jednostki filtrującej z wełny szklanej. (A) Do probówki do mikrocentryfugi nr 1, z usuniętym stożkowym dnem, umieszcza się kulkę z wełny szklanej o wymiarach 0,5 cm x 0,5 cm. (B-C) Następnie rurkę filtrującą umieszcza się w probówce do mikrocentryfugi 2, tworząc w ten sposób złożoną jednostkę filtrującą do przygotowania zawiesiny zarodników. Utworzono w BioRender.com. Prosimy kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 3Metoda wycinania nieobramowanej płytki PCR z 96 studniami. (A) płytka PCR pocięta na sześć stojaków wspierających, 8 x 2 dołki. Przykład pojedynczego wspornika przedstawiono w (B). pochwy liściowe ułożono poziomo na podłożu. Utworzono w BioRender.com. Aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny, kliknij tutaj.

Rycina 4Metoda inokulacji pochwy. Pojedyncza kropla inokulum naniesiona bezpośrednio na powierzchnię adaksjalną fragmentu pochwy. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 5Metoda inkubacji w osłonce. Zaszczepione pochwy liściowe umieszczone poziomo w stojaku wspierającym wewnątrz szklanej płytki Petri z nawilżonym papierem filtrowacyjnym. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.
3. Mikroskopia żywych komórek
- Przygotowanie próbek do mikroskopii
- Delikatnie opłucz fragmenty pochwy liści sterylną wodą destylowaną (DI), aby usunąć nieprzylegające zarodniki lub powierzchowny wzrost grzybni.
- Umieść pochwę na czystym szkiełku przedmiotowym (zobacz Tabelę Materiałów) powierzchnią adaksjalną (wewnętrzną) fragmentu pochwy skierowaną w dół, a powierzchnią abaksjalną (zewnętrzną) do góry.
- Użyj nowej jednostronnej żyletki (zobacz Tabelę Materiałów), aby odciąć około 1 cm z końców pochwy i usunąć większość tkanki blaszki liściowej po obu stronach nerwu głównego.
- Trzymaj żyletkę pod kątem 90° względem pochwy, aby zeskrobać tkankę z abaksjalnej strony nerwu głównego i odsłonić warstwę epidermalną na powierzchni adaksjalnej powyżej miejsca inokulacji. Staraj się zachować jednolita grubość. Po zeskrobaniu pochew liściowych nie zaleca się dalszego przycinania, ponieważ może to uszkodzić próbkę.
- Upewnij się, że zeskrobane sekcje nie są większe niż 1 cm x 1 cm. Unikaj naciskania na środek pochwy podczas tego procesu. Podczas pracy z pochwami inokulowanymi różnymi zawiesinami zarodników, zdezynfekuj rękawiczki i wymień żyletkę pomiędzy próbkami.
- Przygotuj czyste szkiełko przedmiotowe. Podnieś sekcję pochwy za jedną krawędź i ostrożnie przenieś ją na nowe szkiełko. Inokulowana powierzchnia (adaksjalna) pochwy powinna znajdować się na górze, najbliżej obiektywu. Montuj sekcje delikatnie, aby uniknąć uszkodzenia struktur grzyba.
- Nanieś 60 µL sterylnej wody DI na sekcję i nałóż szkiełko nakrywkę o wymiarach 24 mm x 60 mm (zobacz Tabelę Materiałów). Rób to powoli, aby uniknąć powstania pęcherzyków powietrza.
- Przed przystąpieniem do mikroskopii zabezpiecz szkiełko nakrywkowe bezbarwnym lakierem do paznokci (zobacz Tabelę Materiałów), nakładając małą kroplę na każdą krawędź, a następnie łącząc krople pędzelkiem do lakieru, aby stworzyć szczelną uszczelkę.
UWAGA: Niniejszy protokół dla pochwy można stosować z barwnikami cytologicznymi, np. 4′,6-diamidino-2-fenylindolem (DAPI), czerwienią neutralną lub błękitem trypanu, lub do obserwacji plazmolizy komórkowej w celu oceny żywotności komórek roślinnych. W przypadku barwienia pochwy lub testów plazmolizy komórkowej nie zabezpieczaj szkiełka nakrywkowego.
- W przypadku testów plazmolizy dodaj roztwór hipertoniczny (0,75 M sacharozy lub 1 M chlorku sodu) do jednej krawędzi szkiełka nakrywkowego i użyj złożonej, niepozostawiającej kłaczków chusteczki papierowej, aby wciągnąć roztwór przez próbkę do przeciwległej krawędzi szkiełka nakrywkowego. W przypadku barwienia zastosuj podobną metodę w celu aplikacji roztworu barwiącego.
- Mikroskopia szerokopolowa
- Po zamontowaniu pochew liściowych na szkiełkach przedmiotowych, sprawdź ich kolonizację grzybową za pomocą szerokopolowego mikroskopu świetlnego przy powiększeniu 40x.
- Aby szczegółowo obserwować struktury grzybowe, użyj obiektywu imersyjnego wodnego zamiast olejowego, co zapewni lepszą jakość obrazu próbek. Aberracja sferyczna wynikająca z niedopasowania współczynników załamania światła może powodować degradację obrazu. Obiektywy wodne są dostępne zarówno dla szerokopolowych mikroskopów świetlnych , jak i mikroskopów konfokalnych.
- Aby określić wzglzną ilość kolonizacji na jedną pochwę, policz liczbę zainfekowanych komórek kukurydzy z każdego miejsca penetracji grzyba, używając szerokopolowego mikroskopu świetlnego przy powiększeniu 10x. Takie ilościowe określenie jest odpowiednim etapem przesiewowym przed jakimikolwiek analizami statystycznymi porównującymi szczepy, traktowania i/lub stadia rozwojowe.
- Konfokalna mikroskopia laserowa
- W celu obserwacji białek fluorescencyjnych w tkankach kukurydzy podczas rozwoju transgenicznych szczepów grzybów, dostosuj podstawowe parametry akwizycji obrazu. Określ optymalne ustawienia wzbudzenia/emisji na podstawie wybranego markera fluorescencyjnego.
UWAGA: Podczas analizy fuzji fluorescencyjnych zbudowanych z białek wydzielanych preferowany jest obiektyw wodny 60x. Nowoczesne mikroskopy konfokalne posiadają wysoko skorygowane obiektywy imersyjne wodne, aby uniknąć artefaktów i aberracji kształtu.
- Jeśli planowane jest obrazowanie żywych komórek z białkami fluorescencyjnymi, użyj nietransformowanych szczepów grzybów jako kontroli autofluorescencji. Użyj następujących parametrów akwizycji obrazu, aby uchwycić dynamikę grzyb-gospodarz na odwróconym mikroskopie konfokalnym i dla białka fluorescencyjnego mCherry. Ustaw moc lasera do 5%, wysokie napięcie (HV) 450-60 w zależności od poziomu ekspresji, wzmocnienie (gain) 1,375 X, offset 3%, współczynnik zoomu optycznego 1 dla analizy do pięciu komórek kukurydzy na sekcję oraz współczynnik zoomu optycznego 2-5 dla pojedynczych strzępek.
UWAGA: Wysokorozdzielcze obrazy konfokalne Z-stack dostarczają danych trójwymiarowych i lepszego wglądu w interakcje w czasie rzeczywistym między gospodarzem a patogenem.
- Do ilościowego określania intensywności fluorescencji odpowiadającej wydzielanym białkom fuzyjnym, użyj oprogramowania do analizy obrazu od producenta mikroskopu konfokalnego lub programu do przetwarzania obrazów, takiego jak ImageJ, który można bezpłatnie pobrać z internetu. Zapoznaj się z instrukcją obsługi, aby uzyskać szczegółowe informacje na temat sposobu ilościowego określania sygnałów fluorescencyjnych.