$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Trichogramma spp. to grupa parazytoidów jaj, które są szeroko wykorzystywane jako wysoce skuteczne środki kontroli biologicznej przeciwko szerokiemu spektrum szkodników Lepidopteran w ekosystemach rolniczych i leśnych na całym świecie1,2,3,4. Zastosowanie masowo hodowanego Trichogramma zapewnia przyjazne dla środowiska podejście do zrównoważonego zarządzania szkodnikami5,6,7. Zrozumienie biologii molekularnej os Trichogramma dostarcza cennych informacji na temat zwiększania wydajności masowej hodowli i wydajności polowej tych środków kontroli biologicznej8,9poprzez badanie metodologii regulacji genów i edycji genomu10.
Od czasu odkrycia w 1998 roku specyficznej interferencji genetycznej za pośrednictwem dwuniciowego RNA (dsRNA) u Caenorhabditis elegans, metoda interferencji RNA (RNAi) przekształciła się w niezbędny zestaw narzędzi genetycznych do badania mechanizmów regulacyjnych organizmów poprzez tłumienie ekspresji docelowych genów11. Eksperymenty RNAi stały się standardową metodologią szeroko stosowaną do badania funkcji genów u wielu gatunków owadów12,13. Niemniej jednak manipulacja RNAi stanowi ogromne wyzwanie u wielu gatunków parazytoidów, szczególnie wśród tych należących do endopasożytniczej rodziny Chalcidoidea14,15,16. Metoda RNAi została udokumentowana na co najmniej 13 gatunkach parazytoidów14,15,16,17,18,19. Wśród nich podejście RNAi zostało kompleksowo przeprowadzone na osach Nasonia i ma zastosowanie na wszystkich etapach rozwoju, w tym na zarodkach, larwach, poczwarkach i osobnikach dorosłych14,15,16. Warto zauważyć, że osy Nasonia są ektoparazytoidami, a ich potomstwo rozwija się w przestrzeni śródmiąższowej między poczwarką gospodarza a poczwarką, co umożliwia ich hodowlę in vitro i sprawia, że tolerują niektóre zabiegi, takie jak mikroiniekcja. W przeciwieństwie do os Nasonia, osobniki Trichogramma przechodzą cały swój rozwój embrionalny, larwalny i poczwarkowy wewnątrz jaja gospodarza. Warstwa w stadiach zarodka i larwy (która może utrudniać przepuszczalność dsRNA), podatność na uszkodzenia i trudności w przetrwaniu in vitro stanowią poważne przeszkody20,21,22. Dodatkowo, niewielki rozmiar osobników Trichogramma, około ~0,5 mm długości dorosłego osobnika lub poczwarki, sprawia, że manipulacja nimi jest niezwykle skomplikowana20,21,22.
W niniejszym badaniu przedstawiamy kompleksową procedurę przeprowadzania eksperymentów z interferencją RNA (RNAi) u Trichogramma denrolimi Matsumura. Procedura ta obejmuje następujące procedury: (1) projektowanie i syntezę dwuniciowego RNA (dsRNA), (2) mikroiniekcję poczwarek T. denrolimi, (3) przeszczepienie i inkubację in vitro tych poczwarek oraz (4) wykrywanie knockdownu genu docelowego za pomocą analizy RT-qPCR. Docelowym genem wybranym do eksperymentu RNAi jest homologia łańcucha ciężkiego ferrytyny (Ferhch). FerHCH, białko wiążące żelazo, zawiera centrum ferroksydazy obdarzone zdolnościami przeciwutleniającymi, ułatwiającymi utlenianie Fe2+ do Fe3+. Odgrywa niezastąpioną rolę we wzroście i rozwoju różnych organizmów poprzez utrzymanie równowagi redoks i homeostazy żelaza. Wyczerpanie FerHCH może powodować nadmierną akumulację żelaza, co prowadzi do nieodwracalnego uszkodzenia tkanek i często prowadzi do znaczących zmian fenotypowych, w tym wad wzrostu, deformacji i śmiertelności23,24. Badanie to oferuje przewodnik krok po kroku dotyczący przeprowadzania RNAi u T. denrolimi, który będzie nieoceniony w badaniu funkcji genów w szerszym kontekście os Trichogramma.