Strategie mające na celu poprawę hodowli bakterii beztlenowych z przewodu pokarmowego kurczaka

Harshita Naithani; Bibiana Rios-Galicia; Amélia Camarinha Silva; Jana Seifert

doi:10.3791/66570

Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.

Artykuł metodologiczny

Strategie mające na celu poprawę hodowli bakterii beztlenowych z przewodu pokarmowego kurczaka

2.4K wyświetleń

⸱

DOI:

10.3791/66570

⸱

10 maja 2024

Harshita Naithani¹^,² , Bibiana Rios-Galicia¹^,² , Amélia Camarinha Silva¹^,² , Jana Seifert¹^,²

¹Institute of Animal Science, University of Hohenheim, ²HoLMiR - Hohenheim Center for Livestock Microbiome Research, University of Hohenheim

W tym artykule

Podsumowanie

Protokół przedstawia dwie metodologie poprawy izolacji beztlenowych bakterii jelitowych. Pierwszy z nich koncentruje się na izolacji różnych bakterii przy użyciu różnych pożywek hodowlanych. Drugi koncentruje się na etapach uprawy określonej grupy drobnoustrojów, ewentualnie asymilując mio-inozytol, aby w pełni zrozumieć jego znaczenie ekologiczne.

Streszczenie

Przewód pokarmowy (GIT) kurczaka to złożony ekosystem zawierający biliony mikrobów, które odgrywają kluczową rolę w fizjologii gospodarza, trawieniu, wchłanianiu składników odżywczych, dojrzewaniu układu odpornościowego i zapobieganiu intruzji patogenów. Aby zapewnić optymalne zdrowie i produktywność zwierząt, konieczne jest scharakteryzowanie tych mikroorganizmów i zrozumienie ich roli. Podczas gdy przewód pokarmowy drobiu zawiera rezerwuar mikroorganizmów o potencjalnych zastosowaniach probiotycznych, większość różnorodności pozostaje niezbadana. Aby lepiej zrozumieć różnorodność mikroorganizmów niehodowanych, konieczne są wspólne wysiłki na rzecz wprowadzenia tych mikroorganizmów do hodowli. Izolacja i hodowla mikroorganizmów kolonizujących przewód pokarmowy pozwala uzyskać powtarzalny materiał, w tym komórki, DNA i metabolity, oferując nowy wgląd w procesy metaboliczne w środowisku. Bez hodowli rola tych organizmów w ich naturalnym środowisku pozostaje niejasna i ograniczona do poziomu opisowego. Naszym celem jest wdrożenie strategii hodowli mających na celu poprawę izolacji różnorodnych drobnoustrojów beztlenowych z przewodu pokarmowego kurcząt, wykorzystując multidyscyplinarną wiedzę z zakresu fizjologii zwierząt, żywienia zwierząt, metagenomiki, biochemii pasz i nowoczesnych strategii hodowli. Ponadto naszym celem jest wdrożenie odpowiednich praktyk w zakresie pobierania próbek, transportu i przygotowywania pożywek, o których wiadomo, że wpływają na powodzenie izolacji. Odpowiednie metodologie powinny zapewniać stałe środowisko beztlenowe, optymalne warunki atmosferyczne, odpowiednią temperaturę inkubacji gospodarza oraz zaspokojenie szczególnych wymagań żywieniowych zgodnie z jego specyficznymi potrzebami. Stosując te metodologie, hodowla nie tylko przyniesie powtarzalne wyniki izolacji, ale także ułatwi procedury izolacji, sprzyjając w ten sposób kompleksowemu zrozumieniu skomplikowanego ekosystemu mikrobiologicznego w przewodzie pokarmowym kurcząt.

Wprowadzenie

Odrodzenie hodowli w badaniu mikroorganizmów uzupełniło spostrzeżenia z badań metagenomicznych, dostarczając materiału do testowania hipotez metabolicznych, które wcześniej były tylko częściowo opisane i skwantyfikowane. Hodowla bakterii jelitowych dostarcza materiału do podtrzymania przyszłych badań nad interakcjami między mikroorganizmami a gospodarzem, ułatwia ukierunkowane badania kolonizacji i ulepsza badania interakcji molekularnych¹^,²^,³. Zdobyta wiedza na temat mikroorganizmów przewodu pokarmowego przyczyniła się do poprawy żywienia i dobrostanu zwierząt, wpływając na ....