Ten protokół zapewnia metodę pierwotnej izolacji mysich limfocytów T i mikroskopii poklatkowej migracji limfocytów T w określonych warunkach środowiskowych z analizą ilościową.
Artykuł metodologiczny
Ten protokół zapewnia metodę pierwotnej izolacji mysich limfocytów T i mikroskopii poklatkowej migracji limfocytów T w określonych warunkach środowiskowych z analizą ilościową.
Adaptacyjna odpowiedź immunologiczna zależy od zdolności limfocytów T do migracji przez krew, limfę i tkankę w odpowiedzi na patogeny i ciała obce. Migracja limfocytów T jest złożonym procesem, który wymaga koordynacji wielu sygnałów wejściowych ze środowiska i lokalnych komórek odpornościowych, w tym chemokin, receptorów chemokinowych i cząsteczek adhezyjnych. Ponadto na ruchliwość limfocytów T wpływają dynamiczne otaczające sygnały środowiskowe, które mogą zmieniać stan aktywacji, krajobraz transkrypcyjny, ekspresję cząsteczek adhezyjnych i inne. In vivo złożoność tych pozornie powiązanych ze sobą czynników utrudnia rozróżnienie poszczególnych sygnałów, które przyczyniają się do migracji limfocytów T. Protokół ten zapewnia szereg metod, od izolacji limfocytów T po analizę wspomaganą komputerowo w celu oceny migracji limfocytów T w czasie rzeczywistym w bardzo specyficznych warunkach środowiskowych. Warunki te mogą pomóc w wyjaśnieniu mechanizmów regulujących migrację, poprawiając nasze zrozumienie kinetyki limfocytów T i dostarczając silnych dowodów mechanistycznych, które są trudne do uzyskania za pomocą eksperymentów na zwierzętach. Głębsze zrozumienie interakcji molekularnych, które wpływają na migrację komórek, jest ważne dla opracowania ulepszonych środków terapeutycznych.
T limfocyty T są głównymi efektorami adaptacyjnej, specyficznej dla antygenu odpowiedzi immunologicznej. Na poziomie populacji limfocyty T są niejednorodne, składają się z podzbiorów komórkowych o odrębnych wyspecjalizowanych funkcjach. Co ważne, limfocyty T CD8+ są głównymi cytolitycznymi efektorami układu odpornościowego, które bezpośrednio eliminują zakażone lub dysfunkcyjne komórki1.
Dojrzałe limfocyty T CD8+ znajdują się w tkance i krążą we krwi i limfie w poszukiwaniu antygenów. Podczas infekcji limfocyty T mają antygeny we krwi lub tkance i szybko spływają do śledziony lub najbliższego drenującego węzła chłonnego, aby rozpocząć produktywną odpowiedź immunologiczną. W obu przypadkach limfocyty T zostają aktywowane, ulegają ekspansji klonalnej i opuszczają układ limfatyczny, aby dostać się do krwi, jeśli jeszcze tam nie są. Podczas tego procesu sygnalizacja wewnątrzkomórkowa zapewnia regulację w dół limfatycznych receptorów naprowadzających i regulację w górę licznych receptorów integryny i chemokin, niezbędnych do migracji specyficznej dla tkanki2. Ostatecznie ukierunkowana migracja limfocytów T do miejsc infekcji jest napędzana przez zbieżne sygnały środowiskowe, które obejmują sygnalizację integryny i chemokin.
Chemokiny można ogólnie podzielić na dwie główne klasy: (1) sygnały homeostatyczne, które są niezbędne do różnicowania, przeżycia i podstawowej funkcji, oraz (2) sygnały zapalne, takie jak CXCL9, CXCL10 i CCL3, które są wymagane do chemotaksji. Ogólnie rzecz biorąc, chemokiny tworzą gradient sygnału, który napędza migrację kierunkową, znaną jako chemotaksja, oprócz aktywacji wyrażenia integryny1. Chemotaksja jest precyzyjnie regulowana i bardzo wrażliwa, a limfocyty T są zdolne do reagowania na niewielkie zmiany gradientu, które mogą prowadzić je w określonym kierunku lub miejscu.
Oprócz tych czynników związanych z limfocytami T, na migrację wpływa również skład i gęstość macierzy zewnątrzkomórkowej (ECM). ECM składa się z gęstej sieci białek, w tym kolagenu i proteoglikanów, które stanowią rusztowanie dla adhezyjnych receptorów integrynowych na limfocytach T. Integryny to zróżnicowana rodzina białek transbłonowych, z których każde ma wysoce wyspecjalizowane domeny wiążące i dalsze efekty sygnalizacyjne. Dynamiczna ekspresja receptorów integrynowych na powierzchni limfocytu T umożliwia szybką adaptację do zmieniającego się środowiska3. Co ważne, integryny łączą ECM i wewnątrzkomórkowe sieci aktynowe cytoszkieletu, które współpracują ze sobą w celu wytworzenia siły napędowej wymaganej do ruchu limfocytów T.
Podsumowując, wzorce migracji różnią się w zależności od fenotypu komórki odpornościowej lub sygnałów środowiskowych. Te złożone procesy biologiczne są ściśle regulowane przez ekspresję cytokin, chemokin i integryn na powierzchni limfocytów T, otaczających komórek i lokalnej, zakażonej tkance. In vivo te mechanizmy migracji mogą być złożone i mogą wynikać z kilku sygnałów addytywnych4. Ze względu na tę złożoność ustalenie związku przyczynowo-skutkowego między pozornie powiązanymi zmiennymi może być niemożliwe. Aby temu zaradzić, istnieje kilka podejść in vitro do badania określonych aspektów migracji limfocytów T, takich jak odpowiedź na określone sygnały chemokiny i interakcja między integrynami komórek T a białkami wiążącymi ECM. Protokół ten dotyczy metod izolacji i aktywacji mysich limfocytów T CD8 +, z testami migracji in vitro w przestrzeni dwuwymiarowej i narzędziami do analizy obliczeniowej do analizy migracji określonych limfocytów T. Metody te są korzystne dla użytkownika, ponieważ nie wymagają skomplikowanych materiałów ani urządzeń, jak w przypadku niektórych innych testów migracji komórek opisanych w literaturze. Dane dotyczące migracji komórek wygenerowane za pomocą tych metod mogą dostarczyć dowodów na odpowiedzi immunologiczne w uproszczony sposób, który umożliwia dalsze, świadome badania in vivo.
Protokoły dotyczące zwierząt zostały zatwierdzone przez Uniwersytecki Komitet ds. Zasobów Zwierzęcych na Uniwersytecie w Rochester. Myszy w tym badaniu były trzymane w wolnej od patogenów przestrzeni w ośrodku dla zwierząt Uniwersytetu w Rochester. W niniejszym badaniu wykorzystano samce/samice myszy C57BL/6 w wieku 6-12 tygodni (15-30 g). Izolację tkanek myszy można przeprowadzić na blacie stołu w rękawiczkach zakrywających ręce i masce na twarz zakrywającej nos i usta lub w komorze bezpieczeństwa biologicznego. Wszystkie hodowle komórkowe i przygotowanie płytek muszą być przeprowadzone w komorze bezpieczeństwa biologicznego. Odczynniki i sprzęt używany w tym badaniu są wymienione w Tabeli Materiałów.
1. Oczyszczanie i aktywacja limfocytów T CD8+
2. Podnoszenie aktywowanych limfocytów T CD8+
3. Przygotowanie szklanego naczynia
4. Przygotowanie komórek
5. Mikroskopia poklatkowa
6. Wspomagana programowo analiza migracji limfocytów T
Potwierdzenie aktywacji limfocytów T można przeprowadzić za pomocą cytometrii przepływowej, analizując zwiększoną ekspresję CD69 i CD44, które są kanonicznymi markerami aktywacji w mysich limfocytach T6. Dodatkowo, czystość populacji limfocytów T można określić za pomocą cytometrii przepływowej dla limfocytów T CD3+ CD8+. Metoda ta pozwala uzyskać populację limfocytów T CD8+ na poziomie >90 %.
Migrację limfocytów T można oceniać za pomocą programów do śledzenia komórek wspomaganych oprogramowaniem, które są zarówno powtarzalne, jak i konfigurowalne zgodnie z potrzebami badacza. Niektóre podstawowe parametry wykorzystywane do określania efektów eksperymentalnych obejmują prędkość komórki (długość migracji w określonym czasie, aby określić, jak szybko porusza się komórka), przemieszczenie (odległość migracji w linii prostej od punktu startowego do końcowego, aby określić, jak daleko migruje komórka), długość ścieżki (odległość migracji, całkowita długość drogi migracji, aby określić, jak daleko migruje komórka) oraz indeks meandrowania (MI przyjmuje wartości od 0 do 1 i określa stopień liniowości migracji, gdzie 1 = linia prosta). Parametry te są stosowane do oceny różnic w migracji naiwnych i aktywowanych limfocytów CD8+ T pełzających po szkle powleczonym ICAM-1 w obecności CXCL12 (Rysunek 1). W aktywowanych limfocytach CD8+ T zaobserwowano zwiększoną średnią prędkość, przemieszczenie oraz indeks meandrowania w porównaniu z komórkami naiwnymi, co wskazuje na zwiększoną zdolność migracyjną aktywowanych limfocytów T. Podobnie, za pomocą tych metod można wyjaśnić wpływ różnych chemokin na wzorce migracji komórkowej. Na przykład aktywowane limfocyty CD8+ T wykazują zwiększoną migrację w obecności CXCL12, ale nie w obecności CCL2 lub CCL22, a migracja wzrasta w sposób zależny od dawki aż do stężenia nasycenia (Rysunek 2). Ponadto wspomagane oprogramowaniem śledzenie komórek umożliwia charakterystykę migracji poszczególnych komórek, co pozwala na zrozumienie wpływu pojedynczych ligandów na zachowanie limfocytów T. Reprezentatywne ścieżki komórek przedstawiono na Rysunku 3.
Wzięte razem, dane te potwierdzają skuteczność obecnych metod, wykazując, że możliwe jest (1) śledzenie migracji komórek na poziomie pojedynczej komórki oraz (2) rozróżnienie różnic w migracji CD8+ limfocyty T w zależności od stanu aktywacji oraz w obecności różnych chemokin i cząsteczek adhezyjnych. Analiza ta jest krytycznym krokiem w rozpracowywaniu złożonych mechanizmów sygnalizacyjnych i dostarczaniu informacji dla ukierunkowanych in vivo eksperymenty, które mogą w dalszym stopniu wyjaśnić biologiczny wkład konkretnych sygnałów w sposób specyficzny dla danego typu komórek.

Rysunek 1: Analizy in vitro migracji naiwnych i aktywowanych limfocytów T CD8+ . Naiwne lub aktywowane CD3/CD28 mysie limfocyty T CD8+ migrowały na podłożu z ICAM-1 oraz CXCL12 przez 10 min. Prędkość, przemieszczenie i indeks meandrowania migracji komórek przeanalizowano za pomocą mikroskopii time-lapse oraz programu Volocity. Każda grupa obejmuje 36 pojedynczych limfocytów T (średnia ± SEM). Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 2: Testy in vitro migracji aktywowanych limfocytów T CD8+ zależnej od chemokin. Aktywowane CD3/CD28 mysie limfocyty T CD8+ poddano migracji na ICAM-1 w obecności wskazanych chemokin. W polu widzenia określono stosunek liczby komórek przemieszczających się na odległość ponad 50 µm w ciągu 20 min (procent całkowitej liczby komórek). W pojedynczym teście przeanalizowano >10 komórek (n = 3 testy na grupę, średnia ± SEM). Nieparzysty t-test, *p< 0.05 w porównaniu z kontrolą. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tej ryciny.

Rysunek 3: Ścieżki migracji aktywowanych limfocytów T CD8+ na ICAM-1 oraz CXCL12 przez 20 min. Każda kolorowa linia wskazuje ścieżkę migracji poszczególnych limfocytów T w kierunku od punktu wyjścia komórki do punktu przeciwległego. W tym konkretnym teście 24 z 38 komórek przemieściły się na znaczącym dystansie (przynajmniej na odległość równą szerokości komórki według naszej definicji). Limfocyty T migrowały na różne odległości, co wskazuje, że każda komórka znajdowała się w innym stanie aktywacji lub primingu. Wszystkie migrujące komórki poruszały się w różnych kierunkach przy założeniu, że powierzchnia była pokryta jednorodnie. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.
Zrozumienie biologicznego wpływu zbieżnych sygnałów in vivo jest trudne i niełatwe do zinterpretowania. Przedstawione w niniejszym dokumencie protokoły zapewniają rozsądną metodę zrozumienia migracji limfocytów T w ściśle określonych i biologicznie istotnych warunkach. Warunki te można określić według uznania badacza, a protokoły można modyfikować w celu dopasowania do potrzeb różnych populacji limfocytów T, statusu aktywacji i fenotypu komórki. Co więcej, wiele ligandów i receptorów można badać za pomocą tych zdefiniowanych procedur blokujących przeciwciała 7,8 i szkła powlekanego ligandem 8,9,10. Technika ta była również kluczową platformą do opracowania zmodyfikowanych komórek odpornościowych11,12.
Ważne kroki w protokole obejmują izolację wtórnej tkanki limfatycznej, aktywację limfocytów T, powlekanie szklanych naczyń obrazowych i analizę danych. Dla niedoświadczonego oka węzły chłonne osadzone w tkance mogą być trudne do zidentyfikowania i usunięcia. Można to przezwyciężyć dzięki praktyce. Po wyizolowaniu i oczyszczeniu limfocytów T, etap aktywacji powoduje powstawanie lepkich komórek, które, jeśli nie są odpowiednio podniesione, mogą skutkować niską wydajnością. Można tego uniknąć dzięki obfitemu i starannemu myciu studni. Szklane naczynia muszą być odpowiednio pokryte interesującym ligandem i umyte przed dodaniem komórek. Zapewni to dostęp do solidnej warstwy białka, do której komórki będą mogły przylegać, a jednocześnie zapewni, że nadmiar odczynnika nie zakłóci biologii. Wiązanie powierzchniowe białka A-szkła i wiązanie białka Fc-A w fizjologicznym pH i stężeniu soli są wystarczająco silne, aby oprzeć się zmywaniu podczas delikatnego nalewania i dekantacji buforu. Białka resztkowe, jeśli występują, w pożywce nie powodują żadnej toksyczności, mimo że mogą zakłócać interakcję komórek ze związanymi ligandami, jeśli niezwiązane ligandy są w wysokich stężeniach. Wykluczamy taką możliwość, kilkakrotnie spłukując powlekane szkło. Wreszcie, istnieje wiele przyjaznych dla użytkownika komercyjnych i niekomercyjnych programów, które pozwalają naukowcom wykryć nawet subtelne różnice w zachowaniach i morfologiach komórek. Nie można przecenić znaczenia ręcznego upewniania się o analizowanych wynikach w celu wykluczenia błędów, które może popełnić oprogramowanie.
Metody oczyszczania i aktywacji limfocytów T mogą być modyfikowane w celu dopasowania do potrzeb badacza w celu uzyskania właściwego stanu komórki i fenotypu do podsumowania obserwacji in vivo. Różne typy i stany komórek mogą być wykorzystywane do rozwiązywania różnych mechanizmów infekcji i odpowiedzi immunologicznej 7,8,9,10,11,13, w tym do rozwiązywania problemów z zachowaniem naiwnych i pamięciowych limfocytów T oraz różnych aspektów odpowiedzi pamięciowej, takich jak torowanie i rekrutacja, w warunkach specyficznych dla tkanek 14. Metoda ta może być stosowana do kohodowli z różnymi typami komórek, aby lepiej zrozumieć interakcje komórkowe, w tym czasy i czas trwania kontaktu komórka-komórka 7,9, prezentację antygenu 9,13 i zabijanie komórek docelowych6. Dodatkowe reportery i znaczniki mogą być używane do oceny struktur subkomórkowych7, granulek15, apoptozy6 i innych.
Protokół jest doskonałym narzędziem do prowadzenia dodatkowych eksperymentów in vivo opartych na obserwacjach w uproszczonych i wysoce zdefiniowanych warunkach. Chociaż ocena ruchliwości komórek in vitro może być wysoce redukcyjna, jest to ważny krok w rozbijaniu złożonych aktywności biologicznych. Dzięki wynikom tych eksperymentów badacze mogą podejść do pracy in vivo w bardziej fizjologicznie istotny i ukierunkowany sposób.
Prostota tej metody stanowi również jej główne ograniczenie; Chociaż wszystkie wyniki są reprezentatywne dla działań in vivo, można je dodatkowo potwierdzić, na przykład za pomocą mikroskopii wielofotonowej w obrębie układu przyżyciowego. Opisana w niniejszym dokumencie metoda jest jedną z najprostszych, która jest w pełni dostępna dla laboratoriów badawczych z mikroskopem jasnego pola i/lub mikroskopem epifluorescencyjnym z kamerą cyfrową zintegrowaną z systemem mikroskopu lub oddzielnie umieszczoną na obiektywie lunety. Z drugiej strony, istnieje więcej możliwości zaawansowanej analizy migracji komórek odpornościowych in vitro. Po pierwsze, komórki odpornościowe są często napędzane przez gradienty chemokiny w systemie biologicznym. Analizę zachowań komórek odpornościowych w gradientach chemokiny można przeprowadzić na kilka sposobów. Jedną z prostych metod jest użycie specjalnie zaprojektowanego szkiełka (patrz Tabela materiałów). Ten system studni kanałowej, którego dno pokryte jest ligandami integryny, umożliwia analizę migracji komórek odpornościowych w statycznym gradiencie chemokin. Inne proste testy chemotaksji komórek odpornościowych obejmują mikroskopię poklatkową migracji komórek do końcówki mikropipety, która uwalnia chemokiny16, w teście agarozy17 i komorze Zigmonda18. Do bardziej wyrafinowanego testu migracji w kontrolowanych gradientach chemokiny wymagane są niestandardowe szkiełka z mikroprzepływowymi generatorami gradientu19,20. Po drugie, komórki odpornościowe mogą migrować w unikalnych warunkach fizycznych przy użyciu różnych mechanizmów, czasami bez stosowania zależnej od integryny adhezji do ligandów. Test migracji in vitro w jednym wymiarze może być wykonany z powłoką liganda integryny lub bez niej i odtwarza ruchliwość komórek odpornościowych w naczyniach włosowatych21,22. Inną opcją jest test migracji komórek w przestrzeni trójwymiarowej23,24 w celu zbadania mechanizmów leżących u podstaw migracji śródmiąższowej komórek25,26. Ogólnie rzecz biorąc, przedstawiliśmy proste, powtarzalne i wiarygodne metody badania dynamicznych zdarzeń migracji komórkowej.
Autorzy oświadczają, że wszystkie badania i przygotowanie manuskryptu zostały przeprowadzone przy braku jakichkolwiek powiązań handlowych lub finansowych, które mogłyby być interpretowane jako potencjalny konflikt interesów.
Dziękujemy byłym i obecnym członkom Kim Lab, którzy przyczynili się do rozwoju tych protokołów na przestrzeni czasu. Reprezentatywne dane były możliwe dzięki P01 AI102851/AI/NIAID NIH HHS/Stany Zjednoczone oraz P01 HL018208/HL/NHLBI NIH HHS/Stany Zjednoczone. Publikacja ta była możliwa częściowo dzięki grantowi o numerze T32 GM135134 przyznanemu przez Institutional Ruth L. Kirschstein National Research Service Award.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Naczynie 10 cm | Corning | 353003 | lub odpowiednik |
| 15 ml rurka stożkowa | ThermoFisher | 339650 | lub odpowiednik |
| 1x DPBS | Gibco | 14190144 | bez wapnia i bez magnezu |
| 6-dołkowa płytka bez powłoki TC | Corning | 3736 | lub odpowiednik |
| 70 &mikro; m sitko do komórek | FisherScientific | 352350 | lub równoważny |
| bufor lizujący ACK | ThermoFisher | A1049201 | lub równoważny |
| Wirówka Allegra 6KR | ThermoScientific | sorvall 16R z wirnikiem tx400 3655 i wiadrem | lub odpowiednik |
| Beta merkaptoetanol | Sigma | M3148 | lub równoważny |
| CellTrace Violet | ThermoFisher | C34571 | Lub równoważna |
| Wirówka | ThermoScientific | Sorvall ST 16R | lub równoważna |
| Kolagen (IV) | Corning | 354233 | lub równoważna |
| Naczynie do hodowli DeltaT o grubości 17 mm szkło przezroczyste | Bioptechs | 04200417C | |
| Dynabeads Sheep anty-Rat IgG | Invitrogen | 11035 | |
| DynaMag 15 Magnet | ThermoFisher Scientific | 12301D | lub odpowiednik |
| Zestaw do izolacji limfocytów T myszy Easy sep | Komórka macierzysta | 19851 | |
| FBS | SigmaAldrich | F2442-500ML | lub odpowiednik |
| Fibronectin | SigmaAldrich | 10838039001 | lub odpowiednik |
| Fidżi | http://fiji.sc/ | weblink | |
| Kostki filtracyjne | Nikon lub Olympus | ||
| GK1.5 | ATCC | TIB-207 | |
| HEPES | ThermoFisher | 15630080 | lub równoważna |
| kamera CCD HQ | CoolSNAP | lub odpowiednik | |
| ImageJ | http://imagej.nih.gov/ij/h | weblink | |
| Wtyczka automatycznego śledzenia ImageJ http://imagej.net/TrackMate | weblink | ||
| ImageJ ręczne śledzenie | https://imagej.nih.gov/ij/plugins/track/track.html | weblink | |
| L-15 | Różne | Zobacz materiały | Medium Przepis: Leibovitz' s L-15 pożywka bez czerwieni fenolowej (Gibco) uzupełniona 1-5 g/L glukozy |
| Pożywka L-15 firmy Liebovitz, bez czerwieni fenolowej | Jednorazowa | ||
| Luer Lok | Fisher Scientific | 14-955-459 | lub równoważna |
| Pożywka do separacji limfocytów | Corning | 25-072-CI | lub równoważna |
| M5/114 | ATCC | TIB-120 | |
| MEM Aminokwasy endogenne | ThermoFisher | 11140050 | lub odpowiednik |
| System ogrzewania mikroskopu | Okolab | okolab.com | Dostępne niestandardowe wzory |
| Suwak Millicell EZ | Millipore | C86024 | |
| Mysz Mojosort CD8+ Naï Zestaw do izolacji limfocytów T | Biolegend | 480043 | |
| Mouse E-kadheryna | R& Systemy D | 8875-EC-050 | lub równoważne |
| Zestaw do chirurgicznego rozwarstwiania myszy | Fisher Scientific | 13-820-096 | lub równoważne |
| elementy NIS | Oprogramowanie firmy Nikon | ||
| non-TC 24wp | Corning | 353047 | lub równoważne |
| Penicylina-streptomycyna | ThermoFisher | 15140122 | lub równoważne |
| Białko A | ThermoFisher Scientific | lub równoważny | |
| R9 | Various | See Materials | Medium Receptura: RPMI 1640x uzupełniony o 10% FBS, 1% antybiotykowo-przeciwgrzybicze (Gibco), 20 mM bufor HEPES (Gibco), 1% MEM Non-Essential Amino Acids (Gibco), 50 μ M β-merkaptoetanol (Sigma-Aldrich) |
| Rekombinowana chimera mysz ICAM-1 Fc | R& Systemy D | 796-IC-050 | lub równoważne |
| Mysz rekombinowana IL2 | Biolegend | 575410 | lub równoważna |
| RPMI 1640x | ThermoFisher | 11875093 | lub równoważne |
| kołki T | Fisher Scientific | S99385 | lub równoważny |
| TE2000-U | mikroskop Nikon | lub równoważny | |
| Różne rekombinowane mysie chemokiny | R& D lub | równoważne | |
| VCAM-1 Fc chimera | R& D systems | 643-VM-050 | lub równoważne |
| oprogramowanie | Volocity | PerkinElmer |